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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8686#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 554 fasta sequence
[GTACGAAACCACATTCACC-ATATATTTGGAATTTTTATTTT-GAAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTTCGACAAATGGTTTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAAAGCAAAATAATAAGTACGCCGGATTCAAATGGTTATTTTTCCTTGTAAACCGTGTTTACTAGTATTTATATTCTGTAACATTGATAACTTATCAAGAATGTACTAAATTGACAAACGAATTAATTCAATACCATACTTTAGAC]
[+] EMBL CD082188 [GTACGAAACCACATTCACC ATATATTTGGAATTTTTATTTT GTAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTTCGACAAATGGTTTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAAAGCAAAATAATAAGTACGCCGGATTCAAATGGTTATTTTTCCTTGTAAACCGTGTTTACTAGTATTTATATTCTGTAACATTGATAACTTATCAAGAATGTACTAAATTGACAAACGAATTAATTCAATACCATACTTTAGA ]
[-] EMBL CD075802 [ ACATTCACCNATATATTTGGAATTTTTATTTT GAAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTTTGGATTTCGACAAATGGTTTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAAAGCAAAATAATAAGTACGCCGGATTCAAATGGTTATTTTTCCTTGTAAACCGTGTTTACTAGTATTTATATTCTGTAACATTGATAACTTATCAAGAATGTACTAAATTGACAAACGAATTAATTCAATACCATACTTTAGAC]
[+] EMBL SMAA69217 [ ACC ATATATTTGGAATTTTTATTTT GAAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGAT ]
[+] EMBL AI438709 [ nATATTTGGAATTTTTATTTT GAAAGAAATATGAGTAACTCAATACTAATTACGCTAATTATAATACTAATTTTTTCTCAAATAATTTATGCGGGCGTTGGCTTTAAAAACCGTC ]
[+] EMBL AI618786 [ TTTTATTTTCGGAAGAAATATGAATAACTCAATACTAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTT ]
[+] EMBL CD061989 [ TAATTACACTAATTATAATACTAATTTATTCTCAAATAATTAATGCAGGCGTTGACTTTAAAAAACGTCGACAAATGGATGGTGTTGGTTTGCGTACCAAAATGAATCATTTTAAGAGTTATGATGAGATTCTCCAACATCCTTTTGATTTTCATTTACACGGAATAGACTCGAAAATCTTTGATGAGTTCCTAAAATATATTATTGACGGGTTTCTGGATTTCGACAAATGGTTTGAAGTTATCATATAACAGTTCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAA ]
[+] EMBL CD061566 [ GACAAATGG TTG AGTTATCATATAACAG TCCAGTGTGATTCGGTGGTCGGAAGTAACCTCCTTTTTATTCAGTACATCATATTAACTAATTCGATATTACCAAAAACAGAAAAAATAA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||