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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8699#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 609 fasta sequence
[TCAAACTCAGTTCGCATAACAATTGGATTGATTACCACTTTATTAGTGGGTTATTTGTCTGATCGATATGGTCGTCGAGCAGCGTTTGGAATTTTATTAATCGGTGAAATTTTGCATGTTGGTATAACTGGTCTTATTGTGTTGTTGAAGCTGAATTTGTGGCTGATTTTAATCCCCGGACTTTTGGAAGCGATTTTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG-AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAA-GGAATTTGAAAGACGCGTGAGCC]
[+] EMBL CD191690 [TCAAACTCAGTTCGCATAACAATTGGATTGATTACCACTTTATTAGTGGGTTATTTGTCTGATCGATATGGTCGTCGAGCAGCGTTTGGAATTTTATTAATCGGTGAAATTTTGCATGTTGGTATAACTGGTCTTATTGTGTTGTTGAAGCTGAATTTGTGGCTGATTTTAATCCCCGGACTTTTGGAAGCGATTTTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTNTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAAATATGGCTGTACCGGAC AACAGC ]
[+] EMBL CD065518 [ TTTTCGGTGGTGGTC TTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGGAAAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGACTGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAA ]
[-] EMBL CD065756 [ TTTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATATTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAATGGAATTTGAAAGACG ]
[-] EMBL CD065489 [ TTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAT GGAATTTGAAAGTTCCGTGAGCC]
[-] EMBL CD128277 [ TTTGGTGGTGGTCTTTTGTCACTCTTTGCTCAGGTTGCCACTATCCAAGTAGACGTTTGTCATCTATCCAAGATGCATTCAAAGGAAAAAACAGATGG AAAAAATGTAAAGTCCTCTGATAAACAAATGTGGATATTATTTACAATTTTTGACGGAATAGCTGCATTATGTGTATCAGCAGGATCACCGATTGGAGGAGCTTTAATCTACCACTATGGATTTCAAGTAGCCATGTTCACATCATTAGGTTTACTCGTTCCAAGCTTAATTTTAATATTCTGTTTACCCGAGACGCATAAAAACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGAC AACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAA ]
[+] EMBL CD128482 [ CGAGACGCATAAAAAC GAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAA ]
[-] EMBL CD128459 [ AATACAGAAGGAAAATAATGGCTGTACCGGACAAACAGCCTATTGATGAAGAAAAGAATGATGATCCAAATGATGATACTCGTAGCATTCAAAt ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||