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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8701#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1371 fasta sequence
[ATTGATTTATTGTACTTCAAAAATTCAAATGTTTTCTCATTTACAATAATAGGGAAGACTTTTTTAATTGGGATATACAGGAAATTATACAAAGCCAAAACTTTTTGTTCCAATCGCCTGTAACAGTTTGTCACGCAATATGTGCCTTGATGAATATAGTGGTAAGTAGAGACGTGAAATACAAGTGTTAGCAGATGGAAGATGATGGTCGTCGGGTGGCTTAATTGTGATTGAAGGCATAGGCTGAAATCCTTGAGCACTGGCAGGGAGAGTTGGACTTGATGTCCAGAAGTACAATAAATCTTGACGTTGCTTCATATCCATACTGCGAACGGTACACCAAAACCACTTTTTCAAGCGATTTACCAAATTCGTGTTATCACAGCTTTTGGTCACATCTATATTTGATCCTGTACCTGTTTCGTCTACGAAAGTTGTATATCCAGATAGCACATCAACATCTATATCTCCAGTTCCGTTTAAAAGTAAACGCAAATCTTCAGCAGTTAGCCCATCCAAAGCATTTCGAGGTAGAACATCAAACACACCTTGTCGGAGTTGCTCCAGTGGTTCCTGAACTGCTATTTTCATTTTGAATTCTGTGTACTTTTTGACAAATTCAAATACATTACTTTCATTAACCTCAACTTCATCTCCACCGGGGACCAAAGCATACAAATAGTCATTTGGTTGACGAACCGCATCTGTGGTTGACAGACCGCCTTCTTCCAGGGCAGGAATAAGTGAGAAGGTTAGGTTGTAA-TCTTCTATGCTTCCCTGAGACTTTGAAAAGTCTTCAGATGTATGCAAAAGTAACTGACGCAACCCCTCAAAAGTAGTGGGGTCGTAAAAAGCAAAATCGTGCCAGTGAACCACGCGACCTAAGATGTATTTAAGTATAGGTCGACTGAAGTGCAAGGGACATGTCTCATTTGTCAGCAAACACAAACCAATTACACGGCCGATACCTCTGTAAATAGAGTAGCGTGCAGCTAATTTAACTGAGTCACATGTTTGATTTGAAGGTAAGTTTATTCCGGGAACGGCTCGTGGGAAATAGTAACCCTGTAAACCAGGTTGCCAGAAAAGAGGGACACGCTCAACATCCTCTGTAATTATTAACTCTGCAATTGTATTTAGTGATGAAGAGATATGTGATTGTTGGTTGACAGACGTA-GAACCTGCAACAGTTAAAGCCACACCTTGCCAATTAACCAAGCGTTCAAGAACAGGATGATTTAAACCAACTGAAGGTGTCCGCGGACGCTCGACTCGGTTCTGCTCATTTGTATCCGACATTGTTATTAAGGCTCGTGCTTCATCAACACGATAACATAAAGCTTCTTCATTTGTTAATAAAA-CTGGGTCCTC]
[+] EMBL CD075789 [ATTGATTTATTGTACTTCAAAAATTCAAATGTTTTCTCATTTACAATAATAGGGAAGACTTTTTTAATTGGGATATACAGGAAATTATACAAAGCCAAAACTTTTTGTTCCAATCGCCTGTAACAGTTTGTCACGCAATATGTGCCTTGATGAATATAGTGGTAAGTAGAGACGTGAAATACAAGTGTTAGCAGATGGAAGATGATGGTCGTCGGGTGGCTTAATTGTGATTGAAGGCATAGGCTGAAATCCTTGAGCACTGGCAGGGAGAGTTGGACTTGATGTCCAGAAGTACAATAAATCTTGACGTTGCTTCATATCCATACTGCGAACGGTACACCAAAACCACTTTTTCAAGCGATTTACCAAATTCGTGTTATCACAGCTTTTGGTCACATCTATATTTGATCCTGTACCTGTTTCGTCTACGAAAGTTGTATATCCAGATAGCACATCAACATCTATATCTCCAGTTCCGTTTAAAAGTAAACGCAAATCTTCAGCAGTTAGCCCATCCAAAGCATTTCGAGGTAGAACATCAAACACACCTTGTCGGAGTTGCTCCAGTGGTTCCTGAACTGCTATTTTCATTTTGAATTCTGTGTACTTTTTGACAAA TCAAATACATTACTTTCATTA ]
[+] EMBL CD076677 [ATTGATTTATTGTACTTCAAAAATTCAAATGTTTTCTCATTTACAATAATAGGGAAGACTTTTTTAATTGGGATATACAGGAAATTATACAAAGCCAAAACTTTTTGTTCCAATCGCCTGTAACAGTTTGTCACGCAATATGTGCCTTGATGAATATAGTGGTAAGTAAAGACGTGAAATACAAGTGTTAGCAAATGGAAAATGATGGTCGTCGGGTGGCTTAATTGTGATTGAAGGCATAGGCTGAAATCCTTGAGCACTGGCAGGGAAAGTTGGACTTGATGTCCAAAAGTACAATAAATCTTGACGTTGCTTCATATCCATACTGGGAACGGGACACCAAAACCACTTTTTCAAGCGATTTACCAAATTCGTGTTATCACAGCTTTTGGTCACATCTATATTTGATCCTGTACCTGTTTCGTCTACGAAAGTTGTATATCCAGATAGCACATCAACATCTATATCTCCAGTTCCGTTTAAAAGTAAACGCAAATCT ]
[+] EMBL CD157470 [ TATATCCAGATAGCACATCAACATCTATATCTCCAGTTCCGTTTAAAAGTAAACGCAAATCTTCAGCAGTTAGCCCATCCAAAGCATTTCGAGGTAGAACATCAAACACACCTTGTCGGAGTTGCTCCAGTGGTTCCTGAACTGCTATTTTCATTTTGAATTCTGTGTACTTTTTGACAAATTCAAATACATTACTTTCATTAACCTCAACTTCATCTCCACCGGGGACCAAAGCATACAAATAGTCATTTGGTTGACGAACCGCATCTGTGGTTGACAGACCGCCTTCTTCCAGGGCAGGAATTAGTGAGAAGGTTAGGTTGTAA TCTTCTAT ]
[-] EMBL CD083103 [ TCATTTTGAATTCTGTGTACTTTNTGACAAATTCAAATACATTACTTTCATTAACCTCAACTTCATCTCCACCGGGGACCAAAGCATACAAATAGTCATTTGGTTGACGAACCGCATCTGTGGTTGACAGACCGCCTTCTTCCAGGGCAGGAATAAGTGAGAAGGTTAGGTTGTAA TCTTCTATGCTTCCCTGAGACTTTGAAAAGTCTTCAGATGTATGCAAAAGTAACTGACGCAACCCCTCAAAAGTAGTGGGGTCGTAAAAAGCAAAATCGTGCCAGTGAACCACGCGACCTAAGATGTATTTAAGTATAGGTCGACTGAAGTGCAAGGGACATGTCTCATTTGTCAGCAAACACAAACCAATTACACGGCCGATACCTCTGTAAATAGAGTAGCGTGCAGCTAATTTAACTGAGTCACATGTTTGATTTGAAGGTAAGTTTATTCCGGGAACGGCTCGTGGGAAATAGTAACCCTGTAAACCAGGTTGCCAGAAAAGAGGGACACGCTCAACATCCTCTGTAATTATTAACTCTGCAATTGTAGTTAGTGATGAAGAGATATGTGATTGTTGGTTGACAGACGTATGAACCTGCnagctt ]
[+] EMBL CD143212 [ CATACAAATAGTCATTTGGTTGACGAACCGCATCTGTGGTTGACAGACCGCCTTCTTCCAGGGCAGGAATAAGTGAGAAGGTTAGGTTGTAA TCTTCTATGCTTCCCTGAGACTTTGAAAAGTCTTCAGATGTATGCAAAAGTAACTGACGCAACCCCTCAAAAGTAGTGGGGTCGTAAAAAGCAAAATCGTGCCAGTGAACCACGCGACCTAAGATGTATTTAAGTATAGGTCGACTGAAGTGCAAGGGACATGTCTCATTTGTCAGCAAACACAAACCAATTACACGGCCGATACCTCTGTAAATAGAGTAGCGTGCAGCTAATTTAACTGAGTCACATGTTTGATTTGAAGGTAAGTTTATTCCGNGAAACGCTCGTGn ]
[-] EMBL CD082173 [ GGAATAAGTGAGAAGGTTAGG TGTAATTCTTCTATGCTTCCCTGAGACTTTGAANAGTCTTCAGATGTATGCAAAAGTAACTGACGCAACCCCTCAAAAGTAGTGGGGTCGTAAAAAGCAAAATCGTGCCAGTGAACCACGCGACCTAAGATGTATTTAAGTATAGGTCGACTGAAGTGCAAGGGACATGTCTCATTTGTCAGCAAACACAAACCAATTACACGGCCGATACCTCTGTAAATAGAGTAGCGTGCAGCTAATTTAACTGAGTCACATGTTTGATTTGAAGGTAAGTTTATTCCGGGAACGGCTCGTGGGAAATAGTAACCCTGTAAACCAGGTTGCCAGAAAAGAGGGACACGCTCAACATCCTCTGTAATTATTAACTCTGCAATTGTATTTAGTGATGAAGAGATATGTGATTGTTGGTTGACAGACGTA GAACCTGCAACAGTTAAAGCCACACCTTGCCAATTAACCAAGCGTTCAAGAACAGGATGATTTAAACCAACTGAAGGTGTCCGCGGACGCTCGACTCGGTTCTGCTCATTTGTATCCGACATTGTTATTAAGGCTCGTGCTTCATCAACACGATAACATAAAGCTTCTTCATTTGTTAATAAAA CTGGGTCCTC]
[-] EMBL CD194764 [ tctGGCTCGTGGGAAATAGTAACCCTGTAAACCAGGTTGCCAGAAAAGGGGGACACGCTCAACATCCTCTGTAATTATTAACTCTGCAATTGTATTTAGTGATGAAGAGATATGTGATTGTTGGTTGACAGACGTA GAACCTGCAACAGTTAAAGCCACACCTTGCCAATTAACCAAGCGTTCAAGAACAGGATGATTTAAACCAACTGAAGGTGTCCGCGGACGCTCGACTCGGTTCTGCTCATTTGTATCCGACATTGTTATTAAGGCTCTTGCTTCATCAACACGATTACATAAAGCTTCTTCATTTGTTAATAAAATCTGAGTg ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||