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Schistosoma mansoni
cluster # 8702 cluster # 8702       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8702#0 length = 1051 sequences # 7  

consensusID : consensus_8702#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1051
fasta sequence
                              [AACCACCACAGCACAATGTCTTGATGT-CACCTGG--TGGTGTCAATAATAATACTAATCATGGAAGCGTGTATTATGACGGTCATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATTTCTTCTGAGACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGTATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTTTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAATTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTATATATACACCATACATGTTTGTATTTTATATGTGAATAAGTTATGTAAGAAAATCCACACTTATTACTCTGTGTTTCGTCCTAATCTTTCTCTCTACATATATACATGGCTAGCTTATCGGCTTGTTCCTTCTCCTGCCTTTGATCATCTCATATGTGTGTGTTTTAACTAGGAAAAACACATAAATCGATCGCGTATTACAATGAT-TTTATCAT-TATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTTTTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAATTTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCAATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCGTATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATACGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTTTGTG]

[+] EMBL CD112144             [AACCACCACAGCACAATGTCTTGATGT CACCTGG  TGGTGTCAATAATAATACTAATCATGGAAGCGTGTATTATGACGGTCATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATTTCTTCTGAGACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGTATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTTTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAATTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD180275             [AACCACCACAGCACAATGTTTTGATTTCCACATAGACTCTTGTCAATAATAATACTAATCATGGAAGCGTGTATTATGACGGTCATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATTTCTTCTGAGACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGTATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTCTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD112399             [                                                                                   CATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATGTCTTCTGTGACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGTATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTTTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAATTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTATATATACACCATACATGTTTGTATTTTATATGTGAATAAGTTATGTAAGAAAATCCACACTTATTACTCTGTGTTTCGTCCTAATCTTTCTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AI977123             [                                                                                                                                                                                                      CATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTTTAACCAGCATTTCTTTTTGTTTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAATTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTATATATACACCATACATGTTTGTATTTTATATGTGAATAAGTTATGTAAGAAAATCCACACTTATTACTCTGTGTTTCGTCCTAATCTTTCTCTCTACATATATACATGGCTAGCTTATCGGCTTGTTCCTTCTCCTCCCTTTGATCATCTCATATGTGTGTGTTCTAACTAGGGAAAACACATAAATCGATCGCGTACTACAATGAT TTTATCAT TATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATCTATTTGTTTTAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD169757             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGCTTGTTCCTTCTCCTGCCTTTGATCATCTCATATGTGTGTGTTTTAACTAGGAAAAACACATAAATCGATCGCGTATTACAATGAT TTTATCAT TATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTTTTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAATTTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCAATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCGTATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATACGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTTTGTG]
[-] EMBL CD169107             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGCTTGTTCCTTCTCCTGCCTTTGATCATCTCATATGTGTGTGTTTTAACTAGGAAAAACACATAAATCGATCGCGTATTACAATGAT TTTATCAT TATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTTTTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAATTTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCAATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCGTATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATACGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTTTGTG]
[+] EMBL CD068644             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTATTACAATGATGTTTATCATCTATGTGATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTTTTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAATTTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCAATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCGTATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATACGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTATGT ]


>consensus_8702#0 AACCACCACAGCACAATGTCTTGATGTCACCTGGTGGTGTCAATAATAATACTAATCATG GAAGCGTGTATTATGACGGTCATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATTTCTTCTGAG ACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGT ATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATT AGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGT TATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTTTGTT TACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAA TTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTATATATACACCATACATGTTTG TATTTTATATGTGAATAAGTTATGTAAGAAAATCCACACTTATTACTCTGTGTTTCGTCC TAATCTTTCTCTCTACATATATACATGGCTAGCTTATCGGCTTGTTCCTTCTCCTGCCTT TGATCATCTCATATGTGTGTGTTTTAACTAGGAAAAACACATAAATCGATCGCGTATTAC AATGATTTTATCATTATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCA TCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTT TTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAAT TTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCA ATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCG TATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATA CGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTTTGTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)