These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8702#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1051 fasta sequence [AACCACCACAGCACAATGTCTTGATGT-CACCTGG--TGGTGTCAATAATAATACTAATCATGGAAGCGTGTATTATGACGGTCATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATTTCTTCTGAGACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGTATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTTTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAATTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTATATATACACCATACATGTTTGTATTTTATATGTGAATAAGTTATGTAAGAAAATCCACACTTATTACTCTGTGTTTCGTCCTAATCTTTCTCTCTACATATATACATGGCTAGCTTATCGGCTTGTTCCTTCTCCTGCCTTTGATCATCTCATATGTGTGTGTTTTAACTAGGAAAAACACATAAATCGATCGCGTATTACAATGAT-TTTATCAT-TATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTTTTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAATTTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCAATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCGTATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATACGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTTTGTG] [+] EMBL CD112144 [AACCACCACAGCACAATGTCTTGATGT CACCTGG TGGTGTCAATAATAATACTAATCATGGAAGCGTGTATTATGACGGTCATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATTTCTTCTGAGACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGTATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTTTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAATTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTA ] [+] EMBL CD180275 [AACCACCACAGCACAATGTTTTGATTTCCACATAGACTCTTGTCAATAATAATACTAATCATGGAAGCGTGTATTATGACGGTCATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATTTCTTCTGAGACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGTATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTCTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTT ] [-] EMBL CD112399 [ CATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATGTCTTCTGTGACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGTATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTTTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAATTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTATATATACACCATACATGTTTGTATTTTATATGTGAATAAGTTATGTAAGAAAATCCACACTTATTACTCTGTGTTTCGTCCTAATCTTTCTCT ] [+] EMBL AI977123 [ CATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTTTAACCAGCATTTCTTTTTGTTTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAATTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTATATATACACCATACATGTTTGTATTTTATATGTGAATAAGTTATGTAAGAAAATCCACACTTATTACTCTGTGTTTCGTCCTAATCTTTCTCTCTACATATATACATGGCTAGCTTATCGGCTTGTTCCTTCTCCTCCCTTTGATCATCTCATATGTGTGTGTTCTAACTAGGGAAAACACATAAATCGATCGCGTACTACAATGAT TTTATCAT TATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATCTATTTGTTTTAATA ] [-] EMBL CD169757 [ GGCTTGTTCCTTCTCCTGCCTTTGATCATCTCATATGTGTGTGTTTTAACTAGGAAAAACACATAAATCGATCGCGTATTACAATGAT TTTATCAT TATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTTTTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAATTTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCAATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCGTATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATACGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTTTGTG] [-] EMBL CD169107 [ GGCTTGTTCCTTCTCCTGCCTTTGATCATCTCATATGTGTGTGTTTTAACTAGGAAAAACACATAAATCGATCGCGTATTACAATGAT TTTATCAT TATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTTTTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAATTTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCAATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCGTATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATACGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTTTGTG] [+] EMBL CD068644 [ GTATTACAATGATGTTTATCATCTATGTGATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTTTTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAATTTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCAATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCGTATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATACGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTATGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||