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Schistosoma mansoni
cluster # 8703 cluster # 8703       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8703#0 length = 847 sequences # 7  
consensusID : consensus_8703#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 847
fasta sequence 
                              [CACGTACCCGGACCTTGTAACTTTCAGAGGACATTGGGACATACTGAAATCTGTGTGCGTTACCTATCTCTGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTACATGTCGCTCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTCGTA-CTGAAATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATACTCCATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTATCAAATGATACCAGTTCAGATTCGGAACTTGACGATAATGCTTCTTCACCAATCGAAAATATATCAACTTTTATATCACTCGTTCTGGGACTGTTTGCAGTTCTTTTGGTTCTCTGGAAAGTAGCTGTGGTTATGTTTTTTGGAAGTTTGTCATCTGGTGAAAGAGTATCCCTTTCTAAGTCTCTTTTTCGTTTTGTTCTTTTCCATTTTATCATACTTTCCGGGGCAATTAATCCTTCTCGACTGACAAGTCTGTTGGGATGGCTTTGTTGGTTCGGTATTCTTGGTGTGTTGCACATGTTAACATCTGTGGCTTCTTCCAGATGTAACCAAATGTCGGCTTCTGGTGCCGTCAACATGCGTCAGTGGGTGCGGATGTACTGTATGTTTATAATCATTTCTTTTGCAAATTGGTACTTGCTTAAAGCCGGTTTGGAAAACTGTT]

[+] EMBL CD162474             [CACGTACCCGGACCTTGTAACTTTCAGAGGACATTGGGACATACTGAAATCTGTGTGCGTTACCTATCTCTGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTACATGTCGCTCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTCGTA CTGAAATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATACTCCATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTATCAAATGATACCAGTTCAGATTCGGAACTTGACGATAATGCTTCTTCACCAATCGAAAATATATCAACTTTTATATCACTCGTTCTGGGACTGTTTGCAGTTCTTTTGGTTCTCTGGAAAGTAGCTGTGGTTATGTTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD189098             [                   ACTTTCAGAGGACATTGGGACATACTGAAATCTGT    GTTACCTATCTCTGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTACATGTCGCTCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTCGTA CTGAAATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATACTCCATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD201568             [                                   GGGACATACTGAAATCTGTGTGCGTTACCTATCTCTGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTACATGTCGCCCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTCGTA CTGAAATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATACTCCATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTATCAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD190279             [                                   GGGACATACTGAAATCTGTGTGCGTTACCTATCTATGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTACATGTCGCTCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTTGTA CTGTAATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATAGTCCATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD133508             [                                                      GTGCGTTACCTATCTCTGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTACATGTCGCTCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTCGTA CTGAAATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATACTCCATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD161624             [                                                                                                                                             AAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTGGTACCTGACATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTCCTTGAGTCCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD189575             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGTTCTTTTGGTTCTCTGGAAAGTAGCTGTGGTTATGTTTTTTGGAAGTTTGTCATCTGGTGAAAGAGTATCCCTTTCTAAGTCTCTTTTTCGTTTTGTTCTTTTCCATTTTATCATACTTTCCGGGGCAATTAATCCTTCTCGACTGACAAGTCTGTTGGGATGGCTTTGTTGGTTCGGTATTCTTGGTGTGTTGCACATGTTAACATCTGTGGCTTCTTCCAGATGTAACCAAATGTCGGCTTCTGGTGCCGTCAACATGCGTCAGTGGGTGCGGATGTACTGTATGTTTATAATCATTTCTTTTGCAAATTGGTACTTGCTTAAAGCCGGTTTGGAAAACTGTT]




>consensus_8703#0
CACGTACCCGGACCTTGTAACTTTCAGAGGACATTGGGACATACTGAAATCTGTGTGCGT
TACCTATCTCTGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTAC
ATGTCGCTCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAAT
CGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGT
TGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTCGTACTGAAATT
TGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATACTC
CATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTATCAAATGATACCAGTTCA
GATTCGGAACTTGACGATAATGCTTCTTCACCAATCGAAAATATATCAACTTTTATATCA
CTCGTTCTGGGACTGTTTGCAGTTCTTTTGGTTCTCTGGAAAGTAGCTGTGGTTATGTTT
TTTGGAAGTTTGTCATCTGGTGAAAGAGTATCCCTTTCTAAGTCTCTTTTTCGTTTTGTT
CTTTTCCATTTTATCATACTTTCCGGGGCAATTAATCCTTCTCGACTGACAAGTCTGTTG
GGATGGCTTTGTTGGTTCGGTATTCTTGGTGTGTTGCACATGTTAACATCTGTGGCTTCT
TCCAGATGTAACCAAATGTCGGCTTCTGGTGCCGTCAACATGCGTCAGTGGGTGCGGATG
TACTGTATGTTTATAATCATTTCTTTTGCAAATTGGTACTTGCTTAAAGCCGGTTTGGAA
AACTGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)