These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8705#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 969 fasta sequence [AGATATCATATTATTGCTACTAGGATCAACTTGACTCATGTCAGAATCTACAGGATTGATTAGTACAGGAGAAACGAAAGGAAGCCCCGAAGCTGGAGGTCGATGAGGACTTGGACTGTAACTGATATTAGTCGCAGGAATATGCTGCATAGTTAGCGATGGAGACAAACTTTTGGCACATATACTACTAGCTGAGTGAACTTGAGATTCAGAATGACTGATTGGAATCGATGGTTTAACAGGACCACTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTACATGTCTCAAATAAGGATTGACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGCTGCATGAAAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGGCGATGTAGGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGAGGTTGTATTTGTAGTCNAAGTGACTGATTCACTTATTGTGCAACCAGATTGCAATATCTTGGGATGTTGATAAGATGTATTGTTTATATTACTGTTTACGTAGATGTTATTATTAAACGGCAACTGAGC] [+] EMBL CD124156 [AGATATCATATTATTGCTACTAGGATCAACTTGACTCATGTCAGAATCTACAGGATTGATTAGTACAGGAGAAACGAAAGGAAGCCCCGAAGCTGGAGGTCGATGAGGACTTGGACTGTAACTGATATTAGTCGCAGGAATATGCTGCATAGTTAGCGATGGAGACAAACTTTTGGCACATATACTACTAGCTGAGTGAACTTGAGATTCAGAATGACTGATTGGAATCGATGGTTTAACAGGACCACTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTACATGTCTCAAATAAGGATTGACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGCTGCATGAAAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGGCGATGTAGGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTAC ] [-] EMBL CD124102 [ GATATCATATTATTGCTACTAGGATCATCTTGACTCATGTCAGAATCTTCAGGATTGATTAGTACAGGAGAAACGAAAGGAAGCCCCGAAGCTGGAGGTCGATGAGGACTTGGTCTGTAACTGATATTAGTCGCAGGAATATGCTGCATAGTTAGCGATGGAGACAAACTTTTGGCACATATCATACTAGCTGAGTGAACTTGAGATTCAGAATGGCTGATTGGAATCGATGGTTTAACAGGTCCCCTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTTCATGTCTCAAATAAGGATTGACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGCTGCATGAAATAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAGCAGGATTAGCTTACGGTTAGACAGAAGAATTTCGTCCAAGTATAACTGCCGATGTAGGTGGAGCTGGAGCGTTTCAATCAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTTCC ] [+] EMBL CD187881 [ GAACTTGAGATTCAGAATGACTGATTGGAATCGATGGTTTAACAGGACCACTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTACATGTCTCAAATAAGGATTGACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGCTGCATGAAAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGGCGATGTANGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGT ] [-] EMBL CD090023 [ AGAGCTGCATGANAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGGCGATGTAGGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGAGG ] [-] EMBL CD124150 [ GTAATCTGAGGATGACTAGTACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATGTGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATG ] [+] EMBL CD152554 [ GTACCGTTAGTTACGAGTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTAGTATATTTACCACATGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATACTACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGAGGTTGTATTTGTAGTCNAAGTGACTGATTCACTTATTGTGCAACCAGATTGCAATATCTTGGGATGTTGATAAGATGTATTGTTTATATTACTGTTTACGTAGATGTTATTATTAAACGGCAACTGAGC] [+] EMBL CD146034 [ TATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTAGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGAGGTTGTATTTGTAGTCGAAGTGACTGATTCACTTATTGTGCAACCAGATTGCAATATCTTGG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||