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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8705#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 969 fasta sequence
[AGATATCATATTATTGCTACTAGGATCAACTTGACTCATGTCAGAATCTACAGGATTGATTAGTACAGGAGAAACGAAAGGAAGCCCCGAAGCTGGAGGTCGATGAGGACTTGGACTGTAACTGATATTAGTCGCAGGAATATGCTGCATAGTTAGCGATGGAGACAAACTTTTGGCACATATACTACTAGCTGAGTGAACTTGAGATTCAGAATGACTGATTGGAATCGATGGTTTAACAGGACCACTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTACATGTCTCAAATAAGGATTGACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGCTGCATGAAAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGGCGATGTAGGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGAGGTTGTATTTGTAGTCNAAGTGACTGATTCACTTATTGTGCAACCAGATTGCAATATCTTGGGATGTTGATAAGATGTATTGTTTATATTACTGTTTACGTAGATGTTATTATTAAACGGCAACTGAGC]
[+] EMBL CD124156 [AGATATCATATTATTGCTACTAGGATCAACTTGACTCATGTCAGAATCTACAGGATTGATTAGTACAGGAGAAACGAAAGGAAGCCCCGAAGCTGGAGGTCGATGAGGACTTGGACTGTAACTGATATTAGTCGCAGGAATATGCTGCATAGTTAGCGATGGAGACAAACTTTTGGCACATATACTACTAGCTGAGTGAACTTGAGATTCAGAATGACTGATTGGAATCGATGGTTTAACAGGACCACTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTACATGTCTCAAATAAGGATTGACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGCTGCATGAAAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGGCGATGTAGGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTAC ]
[-] EMBL CD124102 [ GATATCATATTATTGCTACTAGGATCATCTTGACTCATGTCAGAATCTTCAGGATTGATTAGTACAGGAGAAACGAAAGGAAGCCCCGAAGCTGGAGGTCGATGAGGACTTGGTCTGTAACTGATATTAGTCGCAGGAATATGCTGCATAGTTAGCGATGGAGACAAACTTTTGGCACATATCATACTAGCTGAGTGAACTTGAGATTCAGAATGGCTGATTGGAATCGATGGTTTAACAGGTCCCCTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTTCATGTCTCAAATAAGGATTGACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGCTGCATGAAATAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAGCAGGATTAGCTTACGGTTAGACAGAAGAATTTCGTCCAAGTATAACTGCCGATGTAGGTGGAGCTGGAGCGTTTCAATCAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTTCC ]
[+] EMBL CD187881 [ GAACTTGAGATTCAGAATGACTGATTGGAATCGATGGTTTAACAGGACCACTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTACATGTCTCAAATAAGGATTGACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGCTGCATGAAAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGGCGATGTANGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGT ]
[-] EMBL CD090023 [ AGAGCTGCATGANAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGGCGATGTAGGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGAGG ]
[-] EMBL CD124150 [ GTAATCTGAGGATGACTAGTACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATGTGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATG ]
[+] EMBL CD152554 [ GTACCGTTAGTTACGAGTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTAGTATATTTACCACATGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATACTACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGAGGTTGTATTTGTAGTCNAAGTGACTGATTCACTTATTGTGCAACCAGATTGCAATATCTTGGGATGTTGATAAGATGTATTGTTTATATTACTGTTTACGTAGATGTTATTATTAAACGGCAACTGAGC]
[+] EMBL CD146034 [ TATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTAGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGAGGTTGTATTTGTAGTCGAAGTGACTGATTCACTTATTGTGCAACCAGATTGCAATATCTTGG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||