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Schistosoma mansoni
cluster # 8705 cluster # 8705       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8705#0 length = 969 sequences # 7  

consensusID : consensus_8705#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 969
fasta sequence
                              [AGATATCATATTATTGCTACTAGGATCAACTTGACTCATGTCAGAATCTACAGGATTGATTAGTACAGGAGAAACGAAAGGAAGCCCCGAAGCTGGAGGTCGATGAGGACTTGGACTGTAACTGATATTAGTCGCAGGAATATGCTGCATAGTTAGCGATGGAGACAAACTTTTGGCACATATACTACTAGCTGAGTGAACTTGAGATTCAGAATGACTGATTGGAATCGATGGTTTAACAGGACCACTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTACATGTCTCAAATAAGGATTGACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGCTGCATGAAAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGGCGATGTAGGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGAGGTTGTATTTGTAGTCNAAGTGACTGATTCACTTATTGTGCAACCAGATTGCAATATCTTGGGATGTTGATAAGATGTATTGTTTATATTACTGTTTACGTAGATGTTATTATTAAACGGCAACTGAGC]

[+] EMBL CD124156             [AGATATCATATTATTGCTACTAGGATCAACTTGACTCATGTCAGAATCTACAGGATTGATTAGTACAGGAGAAACGAAAGGAAGCCCCGAAGCTGGAGGTCGATGAGGACTTGGACTGTAACTGATATTAGTCGCAGGAATATGCTGCATAGTTAGCGATGGAGACAAACTTTTGGCACATATACTACTAGCTGAGTGAACTTGAGATTCAGAATGACTGATTGGAATCGATGGTTTAACAGGACCACTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTACATGTCTCAAATAAGGATTGACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGCTGCATGAAAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGGCGATGTAGGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD124102             [ GATATCATATTATTGCTACTAGGATCATCTTGACTCATGTCAGAATCTTCAGGATTGATTAGTACAGGAGAAACGAAAGGAAGCCCCGAAGCTGGAGGTCGATGAGGACTTGGTCTGTAACTGATATTAGTCGCAGGAATATGCTGCATAGTTAGCGATGGAGACAAACTTTTGGCACATATCATACTAGCTGAGTGAACTTGAGATTCAGAATGGCTGATTGGAATCGATGGTTTAACAGGTCCCCTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTTCATGTCTCAAATAAGGATTGACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGCTGCATGAAATAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAGCAGGATTAGCTTACGGTTAGACAGAAGAATTTCGTCCAAGTATAACTGCCGATGTAGGTGGAGCTGGAGCGTTTCAATCAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD187881             [                                                                                                                                                                                                     GAACTTGAGATTCAGAATGACTGATTGGAATCGATGGTTTAACAGGACCACTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTACATGTCTCAAATAAGGATTGACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGCTGCATGAAAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGGCGATGTANGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGT                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD090023             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGAGCTGCATGANAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAATGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGGCGATGTAGGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGTACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGAGG                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD124150             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTAATCTGAGGATGACTAGTACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATGTGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATG                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD152554             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTACCGTTAGTTACGAGTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTTATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTAGTATATTTACCACATGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATACTACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGAGGTTGTATTTGTAGTCNAAGTGACTGATTCACTTATTGTGCAACCAGATTGCAATATCTTGGGATGTTGATAAGATGTATTGTTTATATTACTGTTTACGTAGATGTTATTATTAAACGGCAACTGAGC]
[+] EMBL CD146034             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAACATTAGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGCAGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGATGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGAGGTTGTATTTGTAGTCGAAGTGACTGATTCACTTATTGTGCAACCAGATTGCAATATCTTGG                                                                   ]


>consensus_8705#0 AGATATCATATTATTGCTACTAGGATCAACTTGACTCATGTCAGAATCTACAGGATTGAT TAGTACAGGAGAAACGAAAGGAAGCCCCGAAGCTGGAGGTCGATGAGGACTTGGACTGTA ACTGATATTAGTCGCAGGAATATGCTGCATAGTTAGCGATGGAGACAAACTTTTGGCACA TATACTACTAGCTGAGTGAACTTGAGATTCAGAATGACTGATTGGAATCGATGGTTTAAC AGGACCACTACAACCCCGATTATCAAGAAACTGTTGAGCTACATGTCTCAAATAAGGATT GACCTGTGTATCTGTTGTATTATCATTAAGGTTACGTCTCATATTAGAACCATTAAGAGC TGCATGAAAGAGTGCAATAGCAACAGAAGGTTCCACATTACCACCTAGCCGATCGATTAA TGTTTGCAAAACAGGATTAGCTAACGGTGAAACAGAAGAATTTCGACCAAGTATAACTGG CGATGTAGGTGGAGGTGGAGCGTTTGAAACAGTTCTTGATGTAATCTGAGGATGACTAGT ACCGTTAGTTACGATTGGTGTTGAAGGTGGAACAAATGACTGTTTTGTTGTGCATATGTT ATTATTTTGTTGAGAATGAGACACCAAAGAGGAGTGTTGTGAAATTGGTGTCGGGGTAAC ATTTGTATATTTACCACAAGAAGCGAATACAGGTGCAGTATTCAATGATTGATCGCATGC AGTACTAATAATACTACTACTATTACTAGTAATAGTACTATTAGTAACTGTAGTAACCGA TGCTAAATGTGGTCTCATGGGTGCAGACTCCATTGCCGTTTGTAAAGGATAAAGTTGAGA GGTTGTATTTGTAGTCNAAGTGACTGATTCACTTATTGTGCAACCAGATTGCAATATCTT GGGATGTTGATAAGATGTATTGTTTATATTACTGTTTACGTAGATGTTATTATTAAACGG CAACTGAGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)