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Schistosoma mansoni
cluster # 8729 cluster # 8729       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8729#0 length = 322 sequences # 7  

consensusID : consensus_8729#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 322
fasta sequence
                              [GTATTCTGACTAGGGTGTCGCAAAGTTGTTGTGCTTGTATAAAACAAACATAATTTCAAATCCATTTGTCTGTGTTATCTTGGACGAACACACCGCTGATGAGTCCTAATGTTAGATCGAAACAGCTGTTCTGCGTTACATGGTGTCATTGATTTACCTAATTAGCTTTAGTTGACGATGAAAGTTATATGAAAACACAGTCTAGAGTTTTTCATAAAACTAATTCCAGCACTTAAAGTGATCAGTACTTTCCAAATGTTATTAGCTTTATAATAGATGGAATTTGGCTAGTATCGGATTCTAGGACGTAAGTTTTGTCGCA]

[+] EMBL CD124684             [GTATTCTGACTAGGGTGTCGCAAAGTTGTTGTGCTTGTATAAAACAAACATAATTTCAAATCCATTTGTCTGTGTTATCTTGGACGAACACACCGCTGATGAGTCCTAATGTTAGATCGAAACAGCTGTTCCGCGTTGCATGGTGTCATTGATTTACCTAATTAGCTTTAGTTGACGATGAAAGTTATATGAAAACACAGTCTAGAGTTTTTCATAAAACTAATTCCAGCACTTAAAGTGATCAGTACTTTCCGAATGTTATTAGCTTTATAATAGATGGAATTTGGCTAGTATCGGATTCTAGGACGTAAGTTTTGTCGCA]
[+] EMBL CD124561             [GTATTCTGACTAGGGTGTCGCAAAGTTGTTGTGCTTGTATAAAACAAACATAATTTCAAATCCATTTGTCTGTGTTATCTTGGACGAACACACCGCTGATGAGTCCTAATGTTAGATCGAAACAGCTGTTCTGCGTTACATGGTGTCATTGATTTACCTAATTAGCTTTAGTTGACGATGAAAGTTATATGAAAACACAGTCTAGAGTTTTTCATAAAACTAATTCCAGCACTTAAAGTGATCAGTACTTTCCAAATGTTATTAGCTTTATAATAGATGGAATTTGGCTAGTATCGGATTCTAGGACGTAAGTTTTGTCGCA]
[+] EMBL CD124653             [GTATTCTGACTAGGGTGTCGCAAAGTTGTTGTGCTTGTATAAAACAAACATAATTTCAAATCCATTTGTCTGTGTTATCTTGGACGAACACACCGCTGATGAGTCCTAATGTTAGATCGAAACAGCTGTTCTGCGTTACATGGTGTCATTGATTTACCTAATTAGCTTTAGTTGACGATGAAAGTTATATGAAAACACAGTCTAGAGTTTTTCATAAAACTAATTCCAGCGCTTAAAGTGATCAGTACTTTCCAAATGTTATTAGCTTTATAATAGATGGAATTTGGCTAGTATCGGATTCTAGGACGTAAGTTTTGTCGCA]
[+] EMBL CD124680             [GTATTCTGACTAGGGTGTCGCAAAGTTGTTGTGCTTGTATAAAACAAACATAATTTCAAATCCATTTGTCTGTGTTATCTTGGACGAACACACCGCTGATGAGCCCTAATGTTAGATCGAAACAGCTGTTCTGCGTTACATGGTGTCATTGATTTACCTAATTAGCTTTAGTTGACGATGAAAGTTATATGAAAACACAGTCTAGAGTTTTTCATAAAACTAATTCCAGCACTTAAAGTGATCAGTACTTTCCAAATGTTATTAGCTTTATAATAGATGGAATTTGGCTAGTATCGGATTCTAGGACGTAAGTTTTGTCGCA]
[+] EMBL CD124594             [GTATTCTGACTAGGGTGTCGCAAAGTTGTTGTGCTTGTATAAAACAAACATAATTTCAAATCCATTTGTCTGTGTTATCTTGGACGAACACACCGCTGATGAGTCCTAATGTTAGATCGAAACAGCTGTTCTGCGTTACATGGTGTCATTGATTTACCTAATTAGCTTTAGTTGACGATGAAAGTTATATGAAAACACAGTCTAGAGTTTTTCATAAAACTAATTCCAGCACTTAAAGTGATCAGTACTTTCCAAATGTTATTAGCTTTATAATAGATGGAATTTGGCTAGTATCGGATTCTAGGACGTAAGTTTTGTCGCA]
[+] EMBL CD124647             [GTATTCTGACTAGGGTGTCGCAAAGTTGTTGTGCTTGTATAAAACAAACATAATTTCAAATCCATTTGTCTGTGTTATCTTGGACGAACACACCGCTGATGAGTCCTAATGTTAGATCGAAACAGCTGTTCTGCGTTACATGGTGTCATTGATTTACCTAATTAGCTTTAGTTGACGATGAAAGTTATATGAAAACACAGTCTAGAGTTTTTCATAAAACTAATTCCAGCACTTAAAGTGATCAGTACTTTCCAAATGTTATTAGCTTTATAATAGATGGAATTTGGCTAGTATCGGATTCTAGGACGTAAGTTTTGTCGCA]
[+] EMBL CD124731             [GTATTCTGACTAGGGTGTCGCAAAGTTGCTGTGCTTGTATAAAACAAACATAATTTCAAATCCATTTGTCTGTGTTATCTTGGACGAACACACCGCTGATGAGTCCTAATGTTAGATCGAAACAGCTGTTCTGCGTTACATGGTGTCATTGATTTACCTAATTAGCTTTAGTTGACGATGAAAGTTATATGAAAACACAGTCTAGAGTTTTTCATAAAACTAATTCCAGCACTTAAAGTGATCAGTAC TTCCAAATGTTATTAGCTTTATAATAGATGGAATTTGGCTAGTATCGGATTCTAGGACGTAAGTTTTGTCGCA]


>consensus_8729#0 GTATTCTGACTAGGGTGTCGCAAAGTTGTTGTGCTTGTATAAAACAAACATAATTTCAAA TCCATTTGTCTGTGTTATCTTGGACGAACACACCGCTGATGAGTCCTAATGTTAGATCGA AACAGCTGTTCTGCGTTACATGGTGTCATTGATTTACCTAATTAGCTTTAGTTGACGATG AAAGTTATATGAAAACACAGTCTAGAGTTTTTCATAAAACTAATTCCAGCACTTAAAGTG ATCAGTACTTTCCAAATGTTATTAGCTTTATAATAGATGGAATTTGGCTAGTATCGGATT CTAGGACGTAAGTTTTGTCGCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)