These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8732#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1378 fasta sequence [TGTGATTTGTTGCATGAGCCAGTCGTTTTTATTTGATTTACTGAGTGCCTACGTTATACGTAATGGTGAAGTTCGATGTTCTTCTTACTTTCGGTGAATGGATGCGTCTGGGGAAACTTTCAGAGAGCATCAATCATCTGCAGATTAACCTACAAACTCCTGGATGTCTATTGTACACAAGATATGGCAGTGTTCCTTTCCTTCCTCCAGACGTTTATGAAAAAATAGAGCTATTACCAGAGTTTTCTTTCGCTTGCATGGGTTACGTGGCTGAACGCAGGTTTGCTCTGACGAAGTTCGGTGGTGGTATTGTCAAATTTGCTGGTTTAGGGAAACGTGGTGCGGTCCTATTTCAGTCAGATCCAACTCACTTAGCGATTGTAGCAGCTGTTGATAAATCTTCTGTCCCAGTTTGGACAACCGGTGGACGATTGCAGTTGTCAATCGGGGAATATTATAAATGCAGTAAGGTTGCGTCACCGATAGTATACCAATCGCCAACCGACAACGAAACTTTCCTGTTAGATGTGAATCCAACATTAAAGCGAATTANGAGTTCCGTCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTTATGATCTACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTGTAGTAATTGATGGTGTACTT-CGAGATTTACCTGTATCTTCAG-TTGAAGTCAAAAACTATATCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTCACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCC-TTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCAGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTT-T-CACGTGTTTGCATCACACACGGATGTATATATCTCATTTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTACTAATGATCCACAATTCTCATCAATATTATCGCTTTTTCTCTGATCTTCGTCGGTCTATAGCAGTAAACAAAATTGATTCATTTATTACTCATGTCTCTAACTGGCGTTTTCCTCTTAACATTCTAACTGTTGATAAAACAAATGAGTTCTCAAAAGCACAGTAAATACAGACTATGATGACGTGTAAATCTAT] [+] EMBL CD081918 [TGTGATTTGTTGCATGAGCCAGTCGTTTTTATTTGATTTACTGAGTGCCTACGTTATACGTAATGGTGAAGTTCGATGTTCTTCTTACTTTCGGTGAATGGATGCGTCTGGGGAAACTTTCAGAGAGCATCAATCATCTGCAGATTAACCTACAAACTCCTGGATGTCTATTGTACACAAGATATGGCAGTGTTCCTTTCCTTCCTCCAGACGTTTATGAAAAAATAGAGCTATTACCAGAGTTTTCTTTCGCTTGCATGGGTTACGTGGCTGAACGCAGGTTTGCTCTGACGAAGTTCGGTGGTGGTATTGTCAAATTTGCTGGTTTAGGGAAACGTGGTGCGGTCCTATTTCAGTCAGATCCAACTCACTTAGCGATTGTAGCAGCTGTTGATAAATCTTCTGTCCCAGTTTGGACAACCGGTGGACGATTGCAGTTGTCAATCGGGGAATATTATAAATGCAGTAAGGTTGCGTCACCGATAGTATACCAATCGCCAACCGACAACGAAACTTTCCTGTTAGATGTGAATCCAACATTAAAGCGAATTANGAGTTCCGTCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATG ] [+] EMBL CD117708 [ GGGAATATTATAAATGCAGTAAGGTTGCGTCACCGATAGTATACCAATCGCCAACCGACAACGAAACTTTCCTGTTAGATGTGAATCCAACATTAAAGCGAATTAGGAGTTCCGTCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTTATGATCTACAGCTTCGTCTTCACTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCACGTGTAATAATTGATGGTGTACTTGCGAGATTTACCTGTATCTTCAGNTTGAAa ] [+] EMBL CD094595 [ TCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTTATGATCTACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTGTAGTAATTGATGGTGTACTT CGAGATTTGCCTGTATCTTCAG TTGAAGTCAAAAACTATATCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTCACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCC TTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCAGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTT T CACGTGTTTGCATCACGCACGGATGTATATATCTCATTTGC ] [+] EMBL CD094479 [ TCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTTATGATCTACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTGTAGTAATTGATGGTGTACTT CGAGATTTACCTGTATCTTCAG TTGAAGTCAAAAACTATATCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTCACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCC TTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCGGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGA ] [-] EMBL CD095379 [ TACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTGTAGTAATTGATGGTGTACTT CGAGATTTACCTGTATCTTCAG TTGAAGTCAAAAACTATATCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTCACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCC TTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCAGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTT T CACGTGTTTGCATCACACACGGATGTATATATCTCATCTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTACTAATGATCCACAATTCTCATCAATATTATCGCTTTTTC ] [-] EMBL CD157028 [ CCACGTTNTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACA TGCCTTTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCAGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAAATGTTATGCACGTG TTGCATCACACACGGATGTATATATCTCATTTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTTATAAT ATCCACAATTCTCATCAATATTATCGCTTTTTCT ] [-] EMBL CD064623 [ AAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTT T CACGTGTTTGCATCACACACGGATGTATATATCTCATTTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTACTAATGATCCACAATTCTCATCAATATTATCGCTTTTTCTCTGATCTTCGTCGGTCTATAGCAGTAAACAAAATTGATTCATTTATTACTCATGTCTCTAACTGGCGTTTTCCTCTTAACATTCTAACTGTTGATAAAACAAATGAGTTCTCAAAAGCACAGTAAATACAGACTATGATGACGTGTAAATCTAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||