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Schistosoma mansoni
cluster # 8752 cluster # 8752       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8752#0 length = 970 sequences # 7  

consensusID : consensus_8752#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 970
fasta sequence
                              [ATAAAGTAAATAGATTGTCAAATCGATTAAGAAATCAAAAACGAAAAAAAACAACAAAACAAACTGTATATACTACTCATAACTACTACTGGCAAAATTAGTAGTAGTAGAATAATGAAAGAATCCAAAAAAATCTCATTAAATTGATCTTTCACAAATATGATTAAAACGTCTAGCATGATTATAATTATAACTTTGATAACGACAATAACGTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAATTACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATATAGTTAAACGATATTGATAAGCTAATTGACTAAGTAAACGTTCACCACAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAAT-GTA-CATAATGAAG-AAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTCACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGGTCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGTGGTAACCATGAACATATAACACAACCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATTATCGGACCAGTAGAAACACTGCTTGTTGTGGTGGTAGTGATGGTCGGAACAATAGGAAAGATGCCAGAAGAACTACGCAGTAAACCATAGTCACCTCCAGTAAAAGTAATTCTCTCTCTCTAAAAATAGACCGCA]

[+] EMBL CD152451             [ATAAAGTAAATAGATTGTCAAATCGATTAAGAAATCAAAAACGAAAAAAAACAACAAAACAAACTGTATATACTACTCATAACTACTACTGGCAAAATTAGTAGTAGTAGAATAATGAAAGAATCCAAAAAAATCTCATTAAATTGATCTTTCACAAATATGATTAAAACGTCTAGCATGATTATAATTATAACTTTGATAACGACAATAACGTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAATTACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATACAGTTAAACGATATTGATAAGCTAATTGACTAAGTAAACGTTCACCACAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAAT GTA CATAATGAAG AAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD152412             [ATAAAGTAAATAGATTGTCAAATCAATTAAGAAATCAAAAACGAAAAAAAACAACAAAACAAACTGTATATACTACTCATAACTACTACTGGCAAAATTAGTAGTAGTAGAATAATGAAAGAATCCAAAAAAATCTCATTAAATTGATCTTTCACAAATATGATTAAAACGTCTAGCATGATTATAATTATAACTTTGATAACGACAATAACGTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAATTACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATATAGTTAAACGATATTGATAAGCTAATTGACTAAGTAAACGTTCACCTCAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAAT GTA CATAATGAAG AAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD152420             [                                                                                                                                                                                                                    GTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAATTACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATATAGTTAAACGATATTGGTAAGCTAATTGACTAAGTAAACGTTCACCACAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAAT GTA CATAATGAAG AAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAGACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTCACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGGCCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGCGGTA                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD152394             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATGGTACCATAATGAAGAAAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGTAACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAATAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACCATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTCACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGGTCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGTGGTA                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD187543             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTCACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGGTCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCACATGATGGTGGTAACCATGAACATATAACACAACCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATTATCGGACCAGTAGAAACACTGCTT                                                                                                               ]
[-] EMBL CD194001             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TACCATGTAGTCGTGGAATCGTAGTTGTTCGACTTGGCATTGGTCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTCGCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGTGGTAACCATGAACATATAACACAACCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATTATCGGACCAGTAGAAACACTGCTTGTTGTGGTGGTAGTGATGGTCGGAACAATAGGAAAGATGCCAGAAGAACTACGCAGTAAACCATAGTCACCTCCAGTAAAAGTAATTCTCTCTC                 ]
[-] EMBL CD193327             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agTAATACTTGTCATACTATTGCCGCGACGGTCATATGATGGTGGTACCCATGTACATATAACACATCCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATGATCGGACCAGTAGAAACACTGCTTGTTGTGGTGGTAGTGATGGTCGGAACAATAGGAAAGATGCCAGAAGAGGTACGCAGTAATCCATAGTCACCACCAGTAAAAGTAATTCTCTCTCTCTAAAAATAGACCGCA]


>consensus_8752#0 ATAAAGTAAATAGATTGTCAAATCGATTAAGAAATCAAAAACGAAAAAAAACAACAAAAC AAACTGTATATACTACTCATAACTACTACTGGCAAAATTAGTAGTAGTAGAATAATGAAA GAATCCAAAAAAATCTCATTAAATTGATCTTTCACAAATATGATTAAAACGTCTAGCATG ATTATAATTATAACTTTGATAACGACAATAACGTCCATAATAACAATTTGGTTTATTAAT TACATCATTTGGTAATTCATTTGAACATATAGTTAAACGATATTGATAAGCTAATTGACT AAGTAAACGTTCACCACAATGTTTACAAATTAATGAATTACCATTTAATGTACATAATGA AGAAATTGTTGTTGTATTCATATAGTATGTTAAACAATGATTAATAAATGTTGGAATTGT AACACCTTTTGAAGTAAGATAATCATCAAGAATTCTTGTCTCTATACGATTATTCAATAA TAAATTACGAGGTATTGAATTGTATCGAGTCAAATCTTGTACACGAGATAAACAATAACC ATCACATGTTGAACATCCATATGGATTGACTAAAGAACAAAATGTACGCCGGCATACTTC ACATTCTGTTCGATTTATACCATGTAGTTGTGGAATTGTTGTTGTTCGACTTGGCATTGG TCTATTACAACATGTACAATAACAATGCGCTGAGCATTCTTCAATTCTTGGTCCATGGTC GCTAAGAGTAATGCCACTAATACTTGTCATACTATTGCCACGACGGTCATATGATGGTGG TAACCATGAACATATAACACAACCAGCACTCATCGGTAGAGAAGTGGGCATAATTATCGG ACCAGTAGAAACACTGCTTGTTGTGGTGGTAGTGATGGTCGGAACAATAGGAAAGATGCC AGAAGAACTACGCAGTAAACCATAGTCACCTCCAGTAAAAGTAATTCTCTCTCTCTAAAA ATAGACCGCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)