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Schistosoma mansoni
cluster # 8757 cluster # 8757       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8757#0 length = 1341 sequences # 7  

consensusID : consensus_8757#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1341
fasta sequence
                              [CTTCGTACACGTGATGAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGCATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGAATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTTTAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAGTAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCATATAAAATTGCGCACGGTCAATTTCGTTGATGGTAGTGAATACTCATGGCTATGTGAGTCAGAAGAAATGGGTGGAGGGCTGCTGAATATGTTCTGTCCAGGTCTTATTGACCTCGTTTACTTCCTTTCTGGAGGGCTTCAGATAACATCGGTTACGAGTATTGGTCGAACATCCGATAGAGGAACAGACGGTCTAAGTCATCCTATTCGTCATATCTCTGCAGATGACTATGTCACTATAATGGGCGAACTTGGCAAACCACCATTATCAGGATTTCGTAAACCAGTAGTTGTCGTAATCCTTTCAGCAGATATCCCTTTCCCAAGAAATAGGATAAGCAGTCTCCCTGAAGCTCATTTTTATGACAATCATTGTTTCAGACTGGAAATAGAAGTTAATGGATCAACTGGTAGCTTCCTGATTGATGAAGGCAAAAGACGAATTTCATGGACCCCTCGAAAAGCCGTCTCATCAAAGTCTGGTAAACTTAACAACAAATCAGCTCATTCGGACTACGAAAATCACTTCCATGACAAACGACTTGGAAATATGGAGGAATATGAATTAGAAAAAGAGTATATTGAGGACGTATTGGCCAGCCCTAATGGTAGTAACGTGCCTCGAACTCAGGTTCCTACGATGCTAAACATCGATCTCGATGAGGATGGAATAACANNGAATAG-TCATCTACCATTAAAAGACTCATTANATGACTCGAAATCAGTGGAGAGTGCTCANACATCGTATCTATCAGCAACTGGAGAAGCGTGGACAAACTGGATCAGTGGNTTAACCAAAAA]

[+] EMBL CD183647             [CTTCGTACACGTGATGAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGCATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGAATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTTTAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD095043             [          GTGATGAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGCATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGAATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTTTAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATGCAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAGTAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD095303             [               GAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGCATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGAATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTTTAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAGTAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD118253             [                                                                                                                                                                                             AATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGAGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAAGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTGCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD110753             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATGCCCTTAAGCCACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAGTAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCATATAAAATTGCGCACGGTCAATTTCGTTGATGGTAGTGAATACTCATGGCTATGTGAGTCAGAAGAAATGGGTGGAGGGCTGCTGAATATGTTCTGTCCAGGTCTTATTGACCTCGTTTACTTCCTTTCTGGAGGGCTTCAGATAACATCGGTTACGAGTATTGGTCGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD118413             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATATAGAAAGCATCCATATAAAATTGCGCACGGTCAATTTCGTTGATGGTAGTGAATACTCATGGCTATGTGAGTCAGAAGAAATGGGTGGAGGGCTGCTGAATATGTTCTGTCCAGGTCTTATTGACCTCGTTTACTTCCTTTCTGGAGGGCTTCAGATAACATCGGTTACGAGTATTGGTCGAACATCCGATAGAGGAACAGACGGTCTAAGTCATCCTATTCGTCATATCTCTGCAGATGACTATGTCACTATAATGGGCGAACTTGGCAAACCACCATTATCAGGATTTCGTAAACCAGTAGTTGTCGTAATCCTTTCAGCAGATATCCCTTTCCCAAGAAATAGGATAAGCAGTCTCCCTGAAGCTCATTTTTATGACAATCATTGTTTCAGACTGGAAATAGAAGTTAATGGATCAACTGGTAGCTTCCTGATTGATGAAGGCAAAAGACGAATTTCATGGACCCCTCGAAAAGCCGTCTCATCAAAGTCTGGTAAACTTAACAACAAATCAGCTCATTCGGACTACGAAAATCACTTCCATGACAAACGACTTGGAAATATGGAGGAATATGAATTAGAAAAAGAGTATATTGAGGACGTATTGGCCAGCCCTAATGGTAGTAACGTGCCTCGAACTCAGGTTCCTACGATGCTAAACATCGATCTCGATGAGGATGGAATAACANNGAATAG TCATCTACCATTAAAAGACTCATTANATGACTCGAAATCAGTGGAGAGTGCTCANACATCGTATCTATCAGCAACTGGAGAAGCGTGGACAAACTGGATCAGTGGNTTAACCAAAAA]
[-] EMBL CD116600             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAATCACTTCCATGACAATCGTCTTGGAAATATGGAGGAATATGAATTAGAAAAAGAGTATATTGAGGACGTATTGGCCAGCCCTAATGGTAGTAACGTGCCTCGAACTCAGGTTCCTACGATGCTAAACATCGATCTCGATGAGGATGGAATAACA GAAATAGTTCATCTACCATTAAAAGACTCATTAAATGA                                                                                       ]


>consensus_8757#0 CTTCGTACACGTGATGAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGC ATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGA ATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTT TAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAA TCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAA GGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATAT GGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCC TTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAG TAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCA TATAAAATTGCGCACGGTCAATTTCGTTGATGGTAGTGAATACTCATGGCTATGTGAGTC AGAAGAAATGGGTGGAGGGCTGCTGAATATGTTCTGTCCAGGTCTTATTGACCTCGTTTA CTTCCTTTCTGGAGGGCTTCAGATAACATCGGTTACGAGTATTGGTCGAACATCCGATAG AGGAACAGACGGTCTAAGTCATCCTATTCGTCATATCTCTGCAGATGACTATGTCACTAT AATGGGCGAACTTGGCAAACCACCATTATCAGGATTTCGTAAACCAGTAGTTGTCGTAAT CCTTTCAGCAGATATCCCTTTCCCAAGAAATAGGATAAGCAGTCTCCCTGAAGCTCATTT TTATGACAATCATTGTTTCAGACTGGAAATAGAAGTTAATGGATCAACTGGTAGCTTCCT GATTGATGAAGGCAAAAGACGAATTTCATGGACCCCTCGAAAAGCCGTCTCATCAAAGTC TGGTAAACTTAACAACAAATCAGCTCATTCGGACTACGAAAATCACTTCCATGACAAACG ACTTGGAAATATGGAGGAATATGAATTAGAAAAAGAGTATATTGAGGACGTATTGGCCAG CCCTAATGGTAGTAACGTGCCTCGAACTCAGGTTCCTACGATGCTAAACATCGATCTCGA TGAGGATGGAATAACANNGAATAGTCATCTACCATTAAAAGACTCATTANATGACTCGAA ATCAGTGGAGAGTGCTCANACATCGTATCTATCAGCAACTGGAGAAGCGTGGACAAACTG GATCAGTGGNTTAACCAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)