These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8757#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1341 fasta sequence [CTTCGTACACGTGATGAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGCATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGAATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTTTAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAGTAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCATATAAAATTGCGCACGGTCAATTTCGTTGATGGTAGTGAATACTCATGGCTATGTGAGTCAGAAGAAATGGGTGGAGGGCTGCTGAATATGTTCTGTCCAGGTCTTATTGACCTCGTTTACTTCCTTTCTGGAGGGCTTCAGATAACATCGGTTACGAGTATTGGTCGAACATCCGATAGAGGAACAGACGGTCTAAGTCATCCTATTCGTCATATCTCTGCAGATGACTATGTCACTATAATGGGCGAACTTGGCAAACCACCATTATCAGGATTTCGTAAACCAGTAGTTGTCGTAATCCTTTCAGCAGATATCCCTTTCCCAAGAAATAGGATAAGCAGTCTCCCTGAAGCTCATTTTTATGACAATCATTGTTTCAGACTGGAAATAGAAGTTAATGGATCAACTGGTAGCTTCCTGATTGATGAAGGCAAAAGACGAATTTCATGGACCCCTCGAAAAGCCGTCTCATCAAAGTCTGGTAAACTTAACAACAAATCAGCTCATTCGGACTACGAAAATCACTTCCATGACAAACGACTTGGAAATATGGAGGAATATGAATTAGAAAAAGAGTATATTGAGGACGTATTGGCCAGCCCTAATGGTAGTAACGTGCCTCGAACTCAGGTTCCTACGATGCTAAACATCGATCTCGATGAGGATGGAATAACANNGAATAG-TCATCTACCATTAAAAGACTCATTANATGACTCGAAATCAGTGGAGAGTGCTCANACATCGTATCTATCAGCAACTGGAGAAGCGTGGACAAACTGGATCAGTGGNTTAACCAAAAA] [+] EMBL CD183647 [CTTCGTACACGTGATGAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGCATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGAATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTTTAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATG ] [-] EMBL CD095043 [ GTGATGAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGCATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGAATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTTTAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATGCAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAGTAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCAT ] [+] EMBL CD095303 [ GAATTCTATTAATGCAGTGGTTTGTGGTTGGAATCAAATTACGGCATCTGTAATAAAGATGCTCAGGAGACATAAAGATGTAAATATAATTGGATACTGGTGTGAATCTCCGAATAACCAAATTCATGCGGATGTTGCTGGTATAAAAGTTATTAGTGGGGATTTTAAAGATCTAATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGTGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAGGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAGTAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCA ] [+] EMBL CD118253 [ AATATTAAATAAAGATATACAGTTTTTATTTCTTTGAGATACTCCGGTCAATCAACGCAATCTTTTCTCAATTGTTGATTGCTTGAGCATAAGACAGTCTACTTCGGATAAGGTATTGAAAGACATCCCTCATGTGATTATTCTTCCTCCCGTATCACCTAATTATGATATGGATATGTTGGAGAGAACCAGGATTCGTGTCGGTTTCGCCATGCCCTTAAGACACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTGCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAA ] [-] EMBL CD110753 [ ATGCCCTTAAGCCACCTGCCTTTATCTACACTTTTGTCCACTCACCTTAACTACAAATATAAAGAAATAAAAGCACTCAGTAATTACGAAATTACTCGACTCCCTACACATTGGTTATTAGGAAATATAGAAAGCATCCATATAAAATTGCGCACGGTCAATTTCGTTGATGGTAGTGAATACTCATGGCTATGTGAGTCAGAAGAAATGGGTGGAGGGCTGCTGAATATGTTCTGTCCAGGTCTTATTGACCTCGTTTACTTCCTTTCTGGAGGGCTTCAGATAACATCGGTTACGAGTATTGGTCGAA ] [+] EMBL CD118413 [ AATATAGAAAGCATCCATATAAAATTGCGCACGGTCAATTTCGTTGATGGTAGTGAATACTCATGGCTATGTGAGTCAGAAGAAATGGGTGGAGGGCTGCTGAATATGTTCTGTCCAGGTCTTATTGACCTCGTTTACTTCCTTTCTGGAGGGCTTCAGATAACATCGGTTACGAGTATTGGTCGAACATCCGATAGAGGAACAGACGGTCTAAGTCATCCTATTCGTCATATCTCTGCAGATGACTATGTCACTATAATGGGCGAACTTGGCAAACCACCATTATCAGGATTTCGTAAACCAGTAGTTGTCGTAATCCTTTCAGCAGATATCCCTTTCCCAAGAAATAGGATAAGCAGTCTCCCTGAAGCTCATTTTTATGACAATCATTGTTTCAGACTGGAAATAGAAGTTAATGGATCAACTGGTAGCTTCCTGATTGATGAAGGCAAAAGACGAATTTCATGGACCCCTCGAAAAGCCGTCTCATCAAAGTCTGGTAAACTTAACAACAAATCAGCTCATTCGGACTACGAAAATCACTTCCATGACAAACGACTTGGAAATATGGAGGAATATGAATTAGAAAAAGAGTATATTGAGGACGTATTGGCCAGCCCTAATGGTAGTAACGTGCCTCGAACTCAGGTTCCTACGATGCTAAACATCGATCTCGATGAGGATGGAATAACANNGAATAG TCATCTACCATTAAAAGACTCATTANATGACTCGAAATCAGTGGAGAGTGCTCANACATCGTATCTATCAGCAACTGGAGAAGCGTGGACAAACTGGATCAGTGGNTTAACCAAAAA] [-] EMBL CD116600 [ AAATCACTTCCATGACAATCGTCTTGGAAATATGGAGGAATATGAATTAGAAAAAGAGTATATTGAGGACGTATTGGCCAGCCCTAATGGTAGTAACGTGCCTCGAACTCAGGTTCCTACGATGCTAAACATCGATCTCGATGAGGATGGAATAACA GAAATAGTTCATCTACCATTAAAAGACTCATTAAATGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||