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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8758#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 726 fasta sequence
[ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTT-AGATG-TATGTCTTAACCTTTTTGATCATATAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTATACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGTTTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGAAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTCTTACTC]
[+] EMBL CD143571 [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTAATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTTNAGATG TATGT ]
[+] EMBL CD143468 [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTNTACTTTACTAAT ]
[+] EMBL CD143561 [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGCTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTCTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTCGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTNTACTTTACTAA ]
[+] EMBL CD143465 [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAG TTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACT ]
[-] EMBL CD143433 [ TTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTT AGATGTTATGTCTTAACCTTTTTGATCATCTAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTATACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGTTTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGAAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTCTTACTC]
[-] EMBL CD143550 [ AAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTT AGATGTTATGTCTTAACCTTTTTGATCATATAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTATACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGTTTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGGAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTCTTACTC]
[-] EMBL CD143466 [ ATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAGTGATCATTATCACTATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTT AGATGTTATGCTTTAACCTTTTTGATCATATAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTATACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGTTTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGAAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTCTTACTC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||