These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8766#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 977 fasta sequence [CATTCTTTCAAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAACTCTATACGATTTTGCAACTCAAGGTACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT-CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATACATCATCATGCATCAAGGCACCTGATGCACCAGAGGAAAGCATTTCCGATCGTGTCTACTTCTTATTTAATAATGTATCAAAAGTGAATGCTAAAGAAAAATCAAATGAATTAGCCACATTGTTATCAAAAGATCGACTTATACCATGGTTTGCCTTTTATCTTGTCAGTAAACGTATCCCGGTTGAACAAACATTTCACGATCTCTTCGCTTTGGTACTTGATCATATTCAAGAAAGAGTACCAAATGTTAGACCTAAAGTTATGTACGAACTTATCAGACATATCAAGTTTATTCTACGTAATATGCGTTTGGAC] [+] EMBL CD085529 [CATTCTTTCAAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAACTCTATACGATTTTGCAACTCAAGGTACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACTCCTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTCTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTCTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAACTTGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTNTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGNTCTTC AACCAA TGATTGCTT ACATTATCAGCTTGCTGATTCGNTGACACC TCGACTAGCTTAAATTTAcc ] [+] EMBL CD085431 [CATTCTTTCAAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAACTCTATACGATTTTGCAACTCAAGGTACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGTAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAAT ] [-] EMBL CD085403 [ ATTCTTTCGAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAGCTCTATGCGATTTTGCAACTCAAGGTACACTTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAGCGATGCTA CGTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATT ] [+] EMBL CD132524 [ gAACTCAAGG ACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATG ] [-] EMBL CD117490 [ ACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATACATCATCATG ] [-] EMBL CD117791 [ ATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATACATCATCATG ] [+] EMBL CD063367 [ CGCTTTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATACATCATCATGCATCAAGGCACCTGATGCACCAGAGGAAAGCATTTCCGATCGTGTCTACTTCTTATTTAATAATGTATCAAAAGTGAATGCTAAAGAAAAATCAAATGAATTAGCCACATTGTTATCAAAAGATCGACTTATACCATGGTTTGCCTTTTATCTTGTCAGTAAACGTATCCCGGTTGAACAAACATTTCACGATCTCTTCGCTTTGGTACTTGATCATATTCAAGAAAGAGTACCAAATGTTAGACCTAAAGTTATGTACGAACTTATCAGACATATCAAGTTTATTCTACGTAATATGCGTTTGGAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||