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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8774#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 957 fasta sequence
[TGGTATTGAATTAGAACAAGCTGTTGGCAAGAATAATGGTTCTATCAATGGGATACGTTATTTTGATTGTGCTGTTGGTCATGGAATATTTGCACCCATTAGCCGTATACAGAAATTGCCTGCACGACCGAACACACCAAACTTAACTAAACTATCGGATAATTCAACAACGATGACTACATCATTTCATTCGGAGCAAGTTGATGGAGTAGCAGGTAGATCATGGTGTTGTCGTCGTACACCATGGTCTAGTACCACATCACCAATGATTGGACGTGCTGTAATTGGTCGACCACCTCTACCGACAGAATTAGTCAATGCATTGAAAGCTGTTGGACGTGTACCAGCTGAGTCATTCGAAGAACCAGTGTTTTATTTAACTGAAGGAATGCAAGTTTTATGTGCTGGAGAAATTGGTATTGTTCGGTATATTGGTCCAATTACATTTGCTGAAGGTATTTGGCTTGGTATTGAATTACGTAAACCACGTGGACGTCATGATGGATGTGTTGCTGGGCGACGTTATTTCACATGTCGTCCTGGTCATGGTTTATTAGTTCGACCAGCTCGTGTATTTTGTCATGGTATAAATGCTGTCAATCTTCTTCCACCTGCTTTAGCTGAAATAGAACGTCAATTAGCTGTTAAACGTCAAGAGTCAGCAAACAGTTGTAACAACGGTAGCAGTAGAGTATCTTCAACGAATTCAATAACTTCTGATAATGAACAGTCTTCAAAGATTTCATCATAGAATACATTACAGTGAATGGAATATGTTTTTTTTTAATTGGCATTTTGCAACAACCTTTCTTTCTATCCTTACTGTAAACCTCATAGATATGAAATCACTCATCATTATCCCATTCCACCAAAACCCCATTTTTTCTTTTTGTTAAACGCATTTACACTGCTTATCTTCGTTGGTTTTTCAGTCTTCGGTTNTTCTATTCCAAAACA]
[-] EMBL CD171172 [TGGTATTGAATTAGAACAAGCTGTTGGCAAGAATAATGGTTCTATCAATGGGATACGTTATTTTGATTGTGCTGTTGGTCATGGAATATTTGCACCCATTAGCCGTATACAGAAATTGCCTGCACGACCGAACACACCAAACTTAACTAAACTATCGGATAATTCAACAACGATGACTACATCATTTCATTCGGAGCAAGTTGATGGAGTAGCAGGTAGATCATGGTGTTGTCGTCGTACACCATGGTCTAGTACCACATCACCAATGATTGGACGTGCTGTAATTGGTCGACCACCTCTACCGACAGAATTAGTCAATGCATTGAAAGCTGTTGGACGTGTACCAGCTGAGTCATTCGAAGAACCAGTGT ]
[-] EMBL CD159850 [TGGTATTGAAGTAGAACATGCTGTTGGCAAGAATAATGGTTCTATCAATGGGATACGTTATTTTGATTGTGCTGTTGGTCATGGAATATTTGCACCCATTAGCCGTATACAGAAATTGCCTGCACGACCGAACACACCAAACTTAACTAAACTATCGGATAATTCAACAACGATGACTACATCATTTCATTCGGAGCAAGTTGATGGAGTAGCAGGTAGATCATGGTGTTGTCGTCGTACACCATGGTCTAGTACCACATCACCAATGATTGGACGTGCTGTAATTGGTCGACCACCTCTACCGACAGAATTAGTCAATGCATTGAAAGCTGTTGGACGTGTACCAGCTGAGTCATTCGAAGAACCAGTGT ]
[-] EMBL CD171176 [TGGTATTGAATTAGAACAAGCTGTTGGCAAGAATAATGGTTCTATCAATGGGATACGTTATTTTGATTGTGCTGTTGGTCATGGAATATTTGCACCCATTAGCCGTATACAGAAATTGCCTGCACGACCGAACACACCAAACTTAACTAAACTATCGGATAATTCAACAACGATGACTACATCATTTCATTCGGAGCAAGTTGATGGAGTAGCAGGTAGATCATGGTGTTGTCGTCGTACACCATGGTCTAGTACCACATCACCAATGATTGGACGTGCTGTAATTGGTCGACCACCTCTACCGACAGAATTAGTCAATGCATTGAAAGCTGTTGGACGTGTACCAGCTGAGTCATTCGAAGAACCAGCGT ]
[+] EMBL CD065084 [ TTAGTCAATGCATTGAAAGCTGTTGGACGTGTACCAGCTGAGTCATTCGAAGAACCAGTGTTTTATTTAACTGAAGGAATGCAAGTTTTATGTGCTGGAGAAATTGGTATTGTTCGGTATATTGGTCCAATTACATTTGCTGAAGGTATTTGGCTTGGTATTGAATTACGCAAACCACGTGGACCTTATGAT ]
[-] EMBL CD156078 [ TGTACCAGCTGAGTCATTCGAAGAACCAGTGTTTTATTTAACTGAAGGAATGCAAGTTTTATGTGCTGGAGAAATTGGTATTGTTCGGTATATTGGTCCAATTACATTTGCTGAAGGTATTTGGCTTGGTATTGAATTACGTAAACCACGTGGACGTCATGATGGATGTGTTGCTGGGCGACGTTATTTCACATGTCGTCCTGGTCATGGTTTATTAGTTCGACCAGCTCGTGTATTTTGTCATGGTATAAATGCTGTCAATCTTCTTCCACCTGCTTTAGCTGAAATAGAACGTCAATTAGCTGTTAAACGTCAAGAGTCAGCAAACAGTTGTAACA ]
[+] EMBL CD082960 [ agGTTTTATGTGCTGGAGAAATTGGTATTGTTCGGTATATTGGTCCAATTACATTTGCTGAAGGTATTTGGCTTGGTATTGAATTACGTAAACCACGTGGACGTCATGATGGATGTGTTGCTGGGCGACGTTATTTCACATGTCGTCCTGGTCATGGTTTATTAGTTCGACCAGCTCGTGTATTTTGTCATGGTATAAATGCTGTCAATCTTCTTCCACCTGCTTTAGCTGAAATAGAACGTCAATTAGCTGTTAAACGTCAAGAGTCAGCAAACAGTTGTAACAACGGTAGCAGTAGAGTATCTTCAACGAATTCAATAACTTCTGATAATGAACAGTCTTCAAAGATTTCATCATAGAATACATTACAGTGAATGGAATATGTTTTTTTTTAATTGGCATTTTGCAACAACCTTTCTTTCTATCCTTACTGTAAACCTCATAGATATGAAATCACTCATCATTATCCCATTCCACCAAAACCCCATTTTTTCTTTTTGTTAAACGCATTTACACTGCTTATCTTCGTTGGTTTTTCAGTCTTCGGTTNTTCTATTCCAAAACA]
[-] EMBL CD194301 [ CGTCATGATGGATGTGTTGCTGGGCGACGGTATTTCACATGTCGTCCTGGTCATGGTTTATTAGTTCGACCAGCTCGTGTATTTTGTCATGGTATAAATGCTGTCA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||