Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8783 cluster # 8783       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8783#0 length = 711 sequences # 7  

consensusID : consensus_8783#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 711
fasta sequence
                              [TGTCTGATCGTTGGCGCCGCGCGATCACCGTGGGTGAGGAGGTTCACTTGGGCTCAGCAGCGCCCAACGTGAGTGTAAGGAGGAGTGATGTCAGTTCGACTCGTGGTTACTGACGATCATCCGATCATGAGGCAGGCTCTTGCCGGCTATTTCTCTCGTGTTGAGGAGATGGAAGTTGTCGGCCAGGCCACTAATGGTCGTGAAGCCGTTGAGCTTGTTGATCAGCTATTGCCCGACGTTGTCCTTATGGACCTCAAGATGCCTGAAATGGACGGTCTCACAGCTACCCGAATGATCGTCTCGCGCCATCCTTCGGTCCGTGTTGTTGCCCTGACGACTTTTGCTCGTCGGGATATCGTCGTTGAGGCCATCCTTGCTGGTGCTGCCGGATACCTTCTGAAGGAATCTGAGCCGGAGGCCGTTATCGCAGGGGTTCGCGCTGTCATGGCAGGTCAAGTGACA-GTGTCTCCGGAGATTG-CCCGAGGTGTTGTTGA-GGTC-TTTTCAGCTCGGCCCTGTGGT-GGGGGGTCTCATCAGATTGATTTGACTCCGGTGAAATTGTCTGATGCTGATGACGACGTTCTGAAGCTTCTCGCCGAAGGGTTGTCGAACGCTGCCATCGCAGATGAACTATGTCTCAGCGAGTCCGCGGTTAAGCAGCGTCTTGGTCATCTAGCAAAGAAACTGGGAGTGCGTAGTCGTCTTGAGGTTCTC]

[+] EMBL CD143606             [TGTCTGATCGTTGGCGCCGCGCGATCACCGTGGGTGAGGAGGTTCACTTGGGCTCAGCAGCGCCCAACGTGAGTGTAAGGAGGAGTGATGTCAGTTCGACTCGTGGTTACTGACGATCATCCGATCATGAGGCAGGCTCTTGCCGGCTATTTCTCTCGTGTTGAGGAGATGGAAGTTGTCGGCCAGGCCACTAATGGTCGTGAAGCCGTTGAGCTTGTTGATCAGCTATTGCCCGACGTTGTCCTTATGGACCTCAAGATGCCTGAAATGGACGGTCTCACAGCTACCCGAATGATCGTCTCGCGCCATCCTTCGGTCCGTGTTGTTGCCCTGACGACTTTTGCTCGTCGGGATATCGTCGTTGAGGCCATCCTTGCTGGTGCTGCCGGATACCTTCTGAAGGAATCTGAGCCGGAGGCCGTTATCGCAAGGGTTCGCGCTGTCATG                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD070594             [TGTCTGATCGTTGGCGCCGCGCGATCACCGTGGGTGAGGAGGTTCACTTGGGCTCAGCAGCGCCCAACGTGAGTGTAAGGAGGAGTGATGTCAGTTCGACTCGTGGTTACTGACGATCATCCGATCATGAGGCAGGCTCTTGCCGGCTATTTCTCTCGTGTTGAGGAGATGGAGGTTGTCGGCCAGGCCACTAATGGTCGTGAAGCCGTTGAGCTTGTTGATCAGCTATTGCCCGACGTTGTCCTTATGGACCTCAAGATGCCTGAAATGGACGGTCTCACAGCTACCCGAATGATCGTCTCGCGCCATCCTTCGGTCCGTGTTGTTGCCCTGACGACTTTTGCTCGTCGGGATATCGTCGTTGAGGCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD070583             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GAAGGAATCTGAGCCGGAGACCGTTATCGCAGGGGTTCGCGCTGTCATGGCAGGTCAAGTGACA GTGTCTCCGGAGATTG CCCGAGGTGTTGTTGA GGTC TTTTCAGCTCGGCCCTGTGGT GGGGGGTCTCATCAGATTGATTTGACTCCGGTGAAATTGTCTGATGCTGATGACGACGTTCTGAAGCTTCTCGCCGAAGGGTTGTCGAACGCTGCCATCGCAGATGAACTATGTCTCAGCGAGTCCGCGGTTAAGCAGCGTCTTGGTCATCTAGCAAAGAAACTGGGAGTGCGTAGTCGTCTTGAGGTTCTC]
[-] EMBL CD070643             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGTTATCGCAGGGGTTCGCGCTGTCATGGCAGGTCAAGTGACA GTGTCTCCGGAGATTG CCCGAGGTGTTGTTGA GGTCTTTTTCAGCTCGGCCCTGTGGTGGGGGGGTCTCATCAGATTGATTTGACTCCGGTGAAATTGTCTGATGCTGATGACGACGTTCTGAAGCTTCTCGCCGAAGGGTTGTCGAACGCTGCCATCGCAGATGAACTATGTCTCAGCGAGTCCGCGGTTAAGCAGCGTCTTGGTCATCTAGCAAAGAAACTGGGAGTGCGTAGTCGTCTTGAGGTTCTC]
[-] EMBL CD070707             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTTATCGCGGGGGTTCGCGCTGTCATGGCAGGTCAAGTGACA GTGTCTCCGGAGATTG CCCGAGGTGTTGTTGA GGTC TTTTCAGCTCGGCCCTGTGGT GGGGGGTCTCATCAGATTGATTTGACTCCGGTGAAATTGTCTGATGCTGATGACGACGTTCTGAAGCTTCTCGCCGAAGGGTTGTCGAACGCTGCCATCGCAGATGAACTATGTCTCAGCGAGTCCGCGGTTAAGCAGCGTCTTGGTCATCTAGCAAAGAAACTGGGAGTGCGTAGTCGTCTTGAGGTTCTC]
[-] EMBL CD070638             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCGCAGGGGTTCGCGCTGTCATGGCAGGTCAAGTGACAGGTGTCTCCGGAGATTGCCCCGAGGTGTTGTTGAGGGTC TTTTCAGCTCGGCCCTGTGGT GGGGGGTCTCATCAAATTGATTTGACTCCGGTGAAATTGTCTGATGCTGATGACGACGTTCTGAAGCTTCTCGCCGAAGGGTTGTCGAACGCTGCCATCGCAGATGAACTATGTCTCAGCGACTCCGCGGTTAAGCAGCGTCTTGGTCATCTAGCAAAGAAACTGGGAGTGCGTAGTCGTCTTGAGGTTCTC]
[-] EMBL CD070597             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGTCGAACGCTGCCATCGCAGATGAACTATGTCTCAGCGAGTCCGCGGTTAAGCAGCGTCTTGGTCATCTAGCAAAGAAACTGGGAGTGCGTAGTCGTCTTGAGGTTCTC]


>consensus_8783#0 TGTCTGATCGTTGGCGCCGCGCGATCACCGTGGGTGAGGAGGTTCACTTGGGCTCAGCAG CGCCCAACGTGAGTGTAAGGAGGAGTGATGTCAGTTCGACTCGTGGTTACTGACGATCAT CCGATCATGAGGCAGGCTCTTGCCGGCTATTTCTCTCGTGTTGAGGAGATGGAAGTTGTC GGCCAGGCCACTAATGGTCGTGAAGCCGTTGAGCTTGTTGATCAGCTATTGCCCGACGTT GTCCTTATGGACCTCAAGATGCCTGAAATGGACGGTCTCACAGCTACCCGAATGATCGTC TCGCGCCATCCTTCGGTCCGTGTTGTTGCCCTGACGACTTTTGCTCGTCGGGATATCGTC GTTGAGGCCATCCTTGCTGGTGCTGCCGGATACCTTCTGAAGGAATCTGAGCCGGAGGCC GTTATCGCAGGGGTTCGCGCTGTCATGGCAGGTCAAGTGACAGTGTCTCCGGAGATTGCC CGAGGTGTTGTTGAGGTCTTTTCAGCTCGGCCCTGTGGTGGGGGGTCTCATCAGATTGAT TTGACTCCGGTGAAATTGTCTGATGCTGATGACGACGTTCTGAAGCTTCTCGCCGAAGGG TTGTCGAACGCTGCCATCGCAGATGAACTATGTCTCAGCGAGTCCGCGGTTAAGCAGCGT CTTGGTCATCTAGCAAAGAAACTGGGAGTGCGTAGTCGTCTTGAGGTTCTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)