cluster # 8792

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Schistosoma mansoni
cluster # 8792 cluster # 8792 Sequences # 7 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8792#0 length = 355 sequences # 7

consensusID : consensus_8792#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 355
fasta sequence

                              [CAATTTGATCTAAACTAAAGATCTCTTATTATCTTTAACGCGGACGAACTGAGCTGGATCGGATGGTTGTTGTTTCACGAACTTCACGCACTGATCCACCGCTACGTTCAACGCTGACAGTTGAACGACTTTTGGCATGAAATCTTCCTAATTGAACTTCAGCTGTGTTGGCACGTTCAGCGGCTTCCTCGAGTTCACTTTGAGCTTTGCGAAATTTCGATAAATTGAGAGCAGCGATTTCCTCAGCTTCTTCAACTTGTCGTTTGTAAACTTTAATCTTGGCTT-GTAATTTTTCGCTAAGATCTTGAAGACGAATTTGATTTTTACGTTCTTCTTCAGTTTGGAA-GACGAGTTC]

[+] EMBL CD092350             [CAATTTGATCTAAACTAGAGATCTCTTATTATCTTTAACGCGGACGAACTGAGCTGGATCGGATGGTTGTTGTTTCACGAACTTCACGCACTGATCCACCGCTACGTTCAACGCTGACAGTTGAACGACTTTTGGCATGAAATCTTCCTAATTGAACTTCAGCTGTGTTGGCACGTTCAGCGGCTTCCTCGAGTTCACTTTGAGCTTTGCGAAATTTCGATAAATTGAGAGCAGCGATTTCCTCAGCTTCTTCAACTTGTCGTTTGTAAACTTTAATCTTGGCTTNGT ATTTTTCGCTAAGATCTTGAAGACGAATTTGATTTTTACGTTCTTCTTCAGTTNGGAANGACGAGT  ]
[+] EMBL CD136037             [CAATTTGATCTAAACTAAAGATCTCTTATTATCTTTAACGCGGACGAACTGAGCTGGATCGGATGGTTGTTGTTTCACGAACTTCACGCACTGATCCACCGCTACGTTCAACGCTGACAGTTGAACGACTTTTGGCATGAAATCTTCCTAATTGAACTTCAGCTGTGTTGGCACGTTCAGCGGCTTCCTCGAGTTCACTTTGAGCTTTGCGAAATTTCGATAAATTGAGAGCAGCGATTTCCTCAGCTTCTTCAACTTGTCGTTTGTAAACTTTAATCTTGGCTT GTAATTTTTCGCGAAGATCTTGAAGACGAATTTGATTTTTACGTTCTTCTTCAGTTTGGAA GACGAGTT ]
[-] EMBL CD136033             [ AATTTGATCTAAACTAAAGATCTCTTATTATCTTTAACGCGGACGAACTGAGCTGGATCGGATGGTTGTTGTTTCACGAACTTCACGCACTGATCCACCGCTACGTTCAACGCTGACAGTTGAACGACTTTTGGCATGAAATCTTCCTAATTGAACTTCAGCTGTGTTGGCACGTTCAGCGGCTTCCTCGAGTTCACTGTGAGCTTTGCGAAATTTCGATAAATTGAGAGCAGCGATTTCCTCAGCTTCCTCAACTTGTCGTTTGTAAACTTTAATCTTGGCTT GTAATTTTTCGCTAAGATCTTGAAGACGAATTTGACTTTTACGTTCTTCTTCAGTTTGGAA GACGAGTTC]
[-] EMBL CD092454             [ AATTTGATCTAAACTAAAGATCTCTTATTATCTTTAACGCGGACGAACTGAGCTGGATCGGATGGTTGTTGTTTCACGAACTTCACGCACTGATCCACCGCTACGTTCAACGCTGACAGTTGAACGACTTTT GCATGAAATCTTCCTAATTGAACTTCAGCTGTGTTGGCACGTTCAGCGGCTTCCTCGAGTTCACTTTGAGCTTTGCGAAATTTCGATAAATTGAGAGCAGCGATTTCCTCAGCTTCTTCAACTTGTCGTTTGTAAACTTTAATCTTGGCTT GTAATTTTTCGCTAAGATCTTGAAGACGAATTTGATTTTTACGTTCTTCTTCAGTTTGGAA GACGAGTTC]
[-] EMBL CD092487             [   TTTGATCT AACT AAGATCTC TATTATC TTAACGCGGACGAACTGAGCTGAATCGGATGGTTGTTGTTTCACGAACTTCACGCACTGATCCACCGCTACGTTCAACGCTGACAGTTGAACGACTTTTGGCATGAAATCTTCCTAATTGAACTTCAGCTGTGTTGGCACGTTCAGCGGCTTCCTCGAGTTCACTTTGAGCTTTGCGAAATTTCGATAAATTGAGAGCAGCGATTTCCTCAGCTTCTTCAACTTGTCGTTTGTAAACCTTAATCTTGGCTT GTAATTTTTCGCTAAGATCTTGAAGACGAATTTGATTTTTACGTTCTTCTTCAGTTTGGAA GACGAGTTC]
[-] EMBL CD136147             [                                                                                                                     CAGTTGAACGACTTTTGGCATGAAATCTTCCTAATTGAACTTCAGCTGTGTTGGCACGTTCAGCGGCTTCCTCGAGTTCACTTTGAGCTTTGCGAAATTTCGATAAATTGAGAGCAGCGATTTCCTCAGCTTCTTCAACTTGTCGTTTGTAAACTTTAATCTTGGCTT GTAATTTTTCGCTAAGATCTTGAAGACGAATTTGATTTTTACGTTCTTCTTCAGTTTGGAA GACGAGTTC]
[-] EMBL CD136117             [                                                                                                                                              TCTTCCTAATTGAACTTCAGCTGTGTTGGCACGTTCAGCGGCTTCCTCGAGTTCACTTTGAGCTTTGCGAAATTTCGATAAATTGAGAGCAGCGATTTCCTCAGCTTCTTCAACTTGTCGTTTGTAAACTTTAATCTTGGCTT GTAATTTTTCGCTAAGATCTTGAAGACGAATATGATTTTTACGTTCTTCTTCAGTTTGGAA GACGAGTTC]




>consensus_8792#0
CAATTTGATCTAAACTAAAGATCTCTTATTATCTTTAACGCGGACGAACTGAGCTGGATC
GGATGGTTGTTGTTTCACGAACTTCACGCACTGATCCACCGCTACGTTCAACGCTGACAG
TTGAACGACTTTTGGCATGAAATCTTCCTAATTGAACTTCAGCTGTGTTGGCACGTTCAG
CGGCTTCCTCGAGTTCACTTTGAGCTTTGCGAAATTTCGATAAATTGAGAGCAGCGATTT
CCTCAGCTTCTTCAACTTGTCGTTTGTAAACTTTAATCTTGGCTTGTAATTTTTCGCTAA
GATCTTGAAGACGAATTTGATTTTTACGTTCTTCTTCAGTTTGGAAGACGAGTTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case