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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8829#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 584 fasta sequence
[CCGGTATGTTATTAAGTACATCAACCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTTTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATTTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGTGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTATGCCGACTTTGTCATCACTGAAGATTCTGATCTATTATTATTTGGATGTAGACAGGTTGTATTCAAACTTGATTTATCGGGATCTGGGGTTCTTGTAGCAGCCGCATCGGGTATATGTGAATGTTGTGGAATTCCTGCTAGTCAATTTACTGAATCGAAATTTAGGTATATGGGTATTATGGCTGGCTGTGACTATTTTAGTGGAATTCCAGGCATAGGATTAAACACTGCTGCTAAAATATTACGTCAGACCCGCATAACAN]
[-] EMBL CD181836 [CCGGTATGTTATTAAGTACATCAGCCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTCTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATTTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGTGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTAT ]
[+] EMBL CD124744 [ CGGTATGTTATTAAGTACATCAACCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTTTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATTTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGTGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGGAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTATGCCGACTTTGTCATCACTGAAGATTCTGATCTATTATTATTTGGATGTAGACAGGTTGTATTCAAACTTGATTTATCGGGATCTGGGGTTCTTGTAGCAGCCGCATCGGGTATATGTGAATGTTGTGGAATTCCTGCTAGTCAATTTACTGAATCGAAATTTAGGTATATGGGTATTATGGCTGGCTGTGACTATTTTAGTGGAATTCCAGGCATAGGATTAAACACTGCTGCTAAAATATTACGTCAGACCCGCATAACAN]
[+] EMBL CD163876 [ CGGTATGTTATTAAGTACATCAACCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTTTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATTTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGCGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTA ]
[-] EMBL CD163866 [ GGTATGTTATTAAGTACATCAACCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTTTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATTTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGTGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGCGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTAT ]
[-] EMBL CD163824 [ GGTATGTTATTAAGTACATCAACCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTTTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATTTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGTGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTAT ]
[-] EMBL CD181831 [ TAAGTACATCAACCTCATGAAGTCATGTAATGTTAAACCAATCCTTGTCTTTGACGGCTCAGATTTGCCATCCAAGGCTGAAACGGATCTAAAACGTCGAGAGACCAAGGAGTTAAATCGAAAGAAAGCTGCAGAATATCTAATGAAGGGAGATAAAGCAGCTGCACAGGAGTGTTTCGAAAGGTCCGTGTTTGTCACTTCTGAAATGGCGTACGAGGTTCTTCGAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGATTGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAACTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTAT ]
[-] EMBL CD138401 [ GAGCTGCTCGTAACATGGGTGTTGAATGCGTTGTCGCACCATATGAAGCAGATGCTCAGCTAGCGTATCTTAATCGAACGGGTTATGCCGACTTTGTCATCACTGAAGATTCTGATCTATTATTATTTGGATGTAGACAGGTTGTATTCAAACTTGATTTATCGGGATCTGGGGTTCTTGTAGCAGCCGCATCGGGTATATGTGAATGTTGTGGAATTCCTGCTGGTCAATTTACTGAATCGAAATTTAGGTATATGGGTATTATGGCTGGCTGTGACTATTTTAGTGGAATTCCTGGCATAGGATTAAACACTGCTGCTA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||