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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8848#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1118 fasta sequence
[CAGTTACTTCATACATCTTAAAAAGGAACGAGGTGCATTTCGTATTTTGTGCGATACTTATGTAACAGAAGATGTTGGTACTGGTGTTGTACACCAAGCTCCCTATTTTGGTGAGGATGATTTTCGTGTGTGTCTGAGAAACGGTATTGTTGGGAAAGATACACCGATGATTTGTCCTGTAAATCCAAACGGTCGATTCACTGATGAAATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGATGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTACAATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAGCTATTCCTACTTGGTTTATTCGTGTTGAACAAATGATTGATCGACTGTTGGCTAACAATGAAAAATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATTGGCTACGTGATGCACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGGTGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAACTGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATCCATGCCGTATGCCCAGATACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAGATTTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATTGGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATGGAATAGTTTTAGCCTCCGATGGACAGAAGATGAGTAAACGCGCTAAAAACTATCCAGATCCAGTTGAAGTTATAAATAAACACGGTGCAGATCCACTACGATTATATTTGATTAATTCACCGGTGGTTCGAGCACAAAATCTACGATTCAGTGAATCTGGTGTACATGAAATTGTAAAAGATGTATTTCTGCCATGGTGTAATGCATTACGATTTTTAATTG]
[-] EMBL CD154933 [CAGTTACTTCATACATCTTAAAAAGGAACGAGGTGCATTTCGTATTTTGTGCGATACTTATGTAACAGAAGATGTTGGTACTGGTGTTGTACACCAAGCTCCCTATTTTGGTGAGGATGATTTTCGTGTGTGTCTGAGAAACGGTATTGTTGGGAAAGATACACCGATGATTTGTCCTGTAAATCCAAACGGTCGATTCACTGATGAAATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGATGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTACAATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAG ]
[-] EMBL CD156416 [ ATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGATGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTACAATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAGCTATTCCTACTTGGTTTATTCGTGTTGAACAAATGATTGATCGACTGTTGGCTAACAATGAAAAATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATTGGCTACGTGATGCACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTG ]
[-] EMBL CD156348 [ ATTAAGGATTTTGCTGGGATGTATGTAAAAGATGCGGATAAGTTTATTTGTCAGAATTTGAAAAAACATGGCAAGTTAGTACATCAAAGTACAATTACTCACAGTTATCCATTTTGTTGGAGGTCAGATACTCCATTAATATACAAAGCTATTCCTACTTGGTTTATTCGTGTTGAACAAATGATTGATCGACTGTTGGCTAACAATGAAAAATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATTGGCTACGTGATGCACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTG ]
[-] EMBL CD159866 [ CGACTGTTGGCTAACAATGAAAAATGTCTATGGGTACCGGATTTTGTACGTGAAGGTAGATTCGCTAATNGGCTACGTGATGCACGTGATTGGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGGTGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAACTGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATCCATGCCGTATGCTCAGATACA TATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAG ]
[+] EMBL CD163065 [ GGGCTGTGTCTAGAAATCGTTTCTGGGGTACACCAATACCAATATGGACAAGTGATGATATGGAAGAAGTGGTTTGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGGTGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAACTGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATCCATGCCGTATGCCCAGATACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAGATTTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATTGGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATGGAATA ]
[+] EMBL CD160180 [ TGTATTGGTTCTATTGGAGAATTGAAACTGTTATCTGGTGTAGAGGTTACGGATTTACACAAAGAATTTGTTGACCCAATCACTATCCCATCATCAACTGGACGAGGTGTTTTACATCGCGTTTCTGAAGTATTTGACTGTTGGTTTGAATCAGGATCCATGCCGTATGCCCAGATACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAGATCTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATTGGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATG ]
[+] EMBL CD178678 [ ACATTATCCATTTGAGAATACAAATGTGTTTCAAGAAGGTTTCCCAGCAGATTTCATCGCTGAAGGTATTGATCAAACACGTGGTTGGTTTTATACATTATTGGTATTATCCACTGCATTATTCGATCAACCGCCATTTCGTAATTTAATTGTTAATGGAATAGTTTTAGCCTCCGATGGACAGAAGATGAGTAAACGCGCTAAAAACTATCCAGATCCAGTTGAAGTTATAAATAAACACGGTGCAGATCCACTACGATTATATTTGATTAATTCACCGGTGGTTCGAGCACAAAATCTACGATTCAGTGAATCTGGTGTACATGAAATTGTAAAAGATGTATTTCTGCCATGGTGTAATGCATTACGATTTTTAATTG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||