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Schistosoma mansoni
cluster # 8856 cluster # 8856       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8856#0 length = 1346 sequences # 7  

consensusID : consensus_8856#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1346
fasta sequence
                              [TCGCGTCAGAGAATGATTGATCGTTGGAGGCGGTTTCCTGATCAAGCATCTAAAGTAGCATGTGAAATACATCCATTGGCAAGTCAAGTTGATACCTGTTGGCCACCATCAAATTTTCAATGTTCTCTGTCGGAATTACAAACAGCT-TGTCTCGAAGAACCACCTACTCCGCAAAGATTATGTGTTAGACCGTTGAACACGACTAAACGGTACTATTATTCTTCAGCGACGAAACAATGCAGAGAATTTGAATATGTTCCTGAATGTCATCTCCGAGCGCTTGTTGCAAATCATCCAATTAGTTTAACCCGGAATGTTTTTAAAGATCGAAACAGTTGTGAACAATTGTGTACAAATAAACAAATTCAAGCTGATGCTGTTTGGAATCCGATTGTTAAAAGAGAAACAGAGAAATTACAGCACAGATGTGAGCAGTCATTAATGAAAGGATCTTTGTGTCAGTCGAATAAAAGATCTTATAGCTGGTATTATGATAAACAAATGAATCGATGTATATCTTTTGAATATCTCGGTTGCTATGGTAACGAGAACAATTTTAGATCAGAAAAGGAATGTATCACTCAATGTGTCTACCGCGATAACACTACAAATGATTCAGATCAATTAAATTTGAAAAACGGTATTCAGAAAACATCACTTTTAAATAATACTAATGATAAGTGGATTCAAATGCCTCAAGAATGTCGGTATACACAATGGACAAATTGGTCAAGTTGCAGTACTACATGTGGACAAGGAATTCAGACACGTGTACGTGAACGCATTTCATCAAAATCAGACAACTGCCAAAAAACTTTACCAGAACTTAAACAACAAATGAGTTGTTTACTTAAGGCTTGTTAACTAATAATCACAATTTAGTCATTTCTGAGTTTTTCCATTTTCCTTATACATTTGTTAAAATATTTTTCACAGTTATTCATTACTACTGATCGAGATATACTACTCGAATAAAAACAAATTATAAATGGATAC-TTTTCAATGATGATATTTACATCGAGTTAATAGTTTCGTTTAAGTACATATACTGTGTTTG-TTTTTTTTTCATTTCCAAATAACCTGTCACTTGTTGACGGTTGTTTACTATTTTATAGTATAAAAGGTTATCAATGTTAAATATTAATCTTTGCATTCCGTTGTTAATTATCTAGCATTTGACTCCAAATTTTTCTTTATATTCATCATTAAATTATCCATTTTGTTCTTGTTATTATTGTTAGTATGGCTGCAATAATTAGTATTGTTATTATTGTAAACTATGAAGTGAATGAATCTTTTAAAAAAAGAAATACAACTTTCAACGAAAAAAAAAGTTAAACAAAAAT]

[+] EMBL CD084263             [TCGCGTCAGAGAATGATTGATCGTTGGAGGCGGTTTCCTGATCAAGCATCTAAAGTAGCATGTGAAATACATCCATTGGCAAGTCAAGTTGATACCTGTTGGCCACCATCAAATTTTCAATGTTCTCTGTCGGAATTACAAACAGCT TGTCTCGAAGAACCACCTACTCCGCAAAGATTATGTGTTAGACCGTTGAACACGACTAAACGGTACTATTATTCTTCAGCGACGAAACAATGCAGAGAATTTGAATATGTTCCTGAATGTCATCTCCGAGCGCTTGTTGCAAATCATCCAATTAGTTTAACCCGGAATGTTTTTAAAGATCGAAACAGTTGTGAACAATTGTGTACAAATAAACAAATTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD082264             [                                                                                                                  TTTCAATGTTCTCTGNCTGAATTACGAACAGCTAACCCTCGAAGAACCACCTACTCCGCAAAGATTATGTGTTAGACCGTTGAACACGACTAAACGGTACTATTATTCTTCAGCGACTAAACAATGCAAAGAATTTGAATATGTTCCTGAATGTCATCTCCGAGCGCTTGTTGCTTTTTATCCAATTAGTTTAACCCGGAATGTTTTTAAAGATCGAAACAGTTGTGAACAATTGTGTACAAATAAACAAATTCAAGCTGATGCTGTTTGGAATCCGATTGTTAAAAGAGAAACAGAGAAATTACAGCACAGATGTGAGCAGTCATTAATGAAAGGATCTTTGTGTCAGTCGAATAAAAGATCTTATAGCTGGTATTATGATAAACAAATGAATCGATGTATATCTTTTGAATATCTCGGTTGCTATGGTAACGAGAACAATTTTAGATCAGAAAAGGAATGTATCACTCAATGTGTCTACCGCGATAACACTACAAATGATTCAGATCAATTAAATTTGAAAAACGGTATTCAGAAAACATCACTTTTAAATAATACTAATGATAAGTGGATTCAAATGCCTCAAGAATGTCGGTATACACAATGGACAAATTGG CAAGTTGCAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD079389             [                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCAAATCATCCAATTAGTTTAACCCGGAATGTTTTTAAAGATCGAAACAGTTGTGAACAATTGTGTACAAATAAACAAATTCAAGCTGATGCTGTTTGGAATCCGATTGTTAAAAGAGAAACAGAGAAATTACAGCACAGATGTGAGCAGTCATTAATGAAAGGATCTTTGTGTCAGTCGAATAAAAGATCTTATAGCTGGTATTATGATAAACAAATGAATCGATGTATATCTTTTGAATATCTCGGTTGCTATGGTAACGAGAACAATTTTAGATCAGAAAAGGAATGTATCACTCAATGTGTCTACCGCGATAACACTACAAATGATTCAGATCAATTAAATTTGAAAAACGGTATTCAGAAAACATCACTTTTAAATAATACTAATGATAAGTGGATTCAAATGCCTCAAGAATGTCGGTATACACAATGGACAAATTGGTCAAGTTGCAGTACTACATGTGGACAAGGAATTCAGACACGTGTACGTGAACGCATTTCATCAAAATCAGACAACTGCCAAAAAACTTTACCAGAACTTAAACAACAAATGAGTTGTTTACTTAAGGCTTGTTAACTAATAATCACAATTTAGTCATTTCTGAGTTNTTCCATTNTCCTTATACATTTGTTAAAATATTTTTCACAGTTATTCATTACTACTGATCGAGATATACTACTCGAATANAAACAAATTATAAATGGATACNTTTTC ATGATGATATTTACATCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD073664             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAACATCACTTTTAAATAATACTAATGATAAGTGGATTCAAATGCCTCAAGAATGTCGGTATACACAATGGACAAATTGGTCAAGTTGCAGTACTACATGTGGACAAGGAATTCAGACACGTGTACGTGAACGCATTTCATCAAAATCAGACAACTGCCAAAAAACTTTACCAGAACTTAAACAACAAATGAGTTGTTTACTTAAGGCTTGTTAACTAATAATCACAATTTAGTCATTTTTGAGTTTTTCCATTTTCCTTATACATTTGTTAAAATATTTTTCACAGTTATTCATTACTACTGATCGAGATATACTACTCGAATAAAAACAAATTATAAATGGATAC TTTTCAATGATGATATTTACATCGAGTTAATAGTTTCGTTTAAGTACATATACTGTGTTTG TTTTTTTTTCATTTCCAAATAACCTGTCACTTGTTGACGGTTGTTTACTATTTTATAGTATAAAAGGTTATCAATGTTAAATATTAATCTTTGCATTCCGTTGTTAATTATTTAGCATTTGACTCCAAATTTTTCTTTATATTCATCATTAAATTATCCATTTTGTTCTTGTTATTATTGTTAGTATGGCTGCAATAATTAGTATTGTTATTATTGTAAACTATGGAGTGAATGAATCTTTTAAAAAAAGAAATACAACTTTCAACGAAAAAAAAAGTTAAACAAAAAT]
[-] EMBL CD075871             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AATTGGTCAAGTTGCAGTACTACATGTGGACAAGGAATTCAGACACGTGTACGTGAACGCATTTCATCAAAATCAGACAACTGCCAAAAAACTTTACCAGAACTTAAACAACAAATGAGTTGTTTACTTAAGGCTTGTTAACTAATAATCACAATTTAGTCATTTCTGAGTTTTTCCATTTTCCTTATACATTTGTTAAAATATTTTTCACAGTTATTCATTACTACTGATCGAGATATACTACTCGAATAAAAACAAATTATAAATGGATAC TTTTCAATGATGATATTTACATCGAGTTAATAGTTTCGTTTAAGTACATATACTGTGTTTG TTTTTTTTTCATTTCCAAATAACCTGTCACTTGTTGACGGTTGTTTACTATTTTATAGTATAAAAGGTTATCAATGTTAAATATTAATCTTTGCATTCCGTTGTTAATTATCTAGCATTTGACTCCAAATTTTTCTTTATATTCATCATTAAATTATCCATTTTGTTCTTGTTATTATTGTTAGTATGGCTGCAATAATTAGTATTGTTATTATTGTAAACTATGAAGTGAATGAATCTTTTAAAGAAAGAAATACAACTTTCAA                        ]
[+] EMBL CD166681             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCAAAATCAGACAACTGCCAAAAAACTTTA CAGAACTTAAACAACAAATGAG TGTTTACTTAAGGC TGTTAACTAATAATCACAATTTAGTCATTTCTGAGTTTTTCCATTTTCCTTATACATTTGTTAAAATATTTTTCACAGTTATTCATTACTACTGATCGAGATATACTACTCGAATAAAAACAAATTATAAATGGATAC TTTTCAATGATGATATTTACATCGAGTTAATAGTTTCGTTTAAGTACATATACTGTGTTTGTTTTTTTTTTCATTTCCAAATAACCTGTCACTTGTTGACGGTTGTTTACTATTTTATAGTATAAAAGGTTATCAATGTTAAATATTAATCTTTGCATTCCGTTGTTAATTATCTAGCATTTGACTCCAAATTTTTCTTTATATTCATCATTAAATTATCCATTTGGTTCTTGTTATTATGGTTAGTATGGCTGCAATAATTAGTATGGTTATTATGGTAAACTATGAAG                                                             ]
[-] EMBL CD139754             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCGAGATATACTACTCGAATAAAAACAAATTATAAATGGATAC TTTTCAATGATGATATTTACATCGAGTTAATAGTTTCGTTTAAGTACATATACTGTGTTTG TTTTTTTTTCATTTCCAAATAACCTGTCACTTGTTGACGGTTGTTTACTATTTTATAGTATAAAAGGTTATCAATGTTAAATATTAATCTTTGCATTCCGTTGTTAATTATCTAGCATTTGACTCCAAATTTTTCTTTATATTCATCATTAAATTATCCATTTTGTTCTTGTTATTATTGTTAGTATGGCTGCAATAATTAGTA                                                                                     ]


>consensus_8856#0 TCGCGTCAGAGAATGATTGATCGTTGGAGGCGGTTTCCTGATCAAGCATCTAAAGTAGCA TGTGAAATACATCCATTGGCAAGTCAAGTTGATACCTGTTGGCCACCATCAAATTTTCAA TGTTCTCTGTCGGAATTACAAACAGCTTGTCTCGAAGAACCACCTACTCCGCAAAGATTA TGTGTTAGACCGTTGAACACGACTAAACGGTACTATTATTCTTCAGCGACGAAACAATGC AGAGAATTTGAATATGTTCCTGAATGTCATCTCCGAGCGCTTGTTGCAAATCATCCAATT AGTTTAACCCGGAATGTTTTTAAAGATCGAAACAGTTGTGAACAATTGTGTACAAATAAA CAAATTCAAGCTGATGCTGTTTGGAATCCGATTGTTAAAAGAGAAACAGAGAAATTACAG CACAGATGTGAGCAGTCATTAATGAAAGGATCTTTGTGTCAGTCGAATAAAAGATCTTAT AGCTGGTATTATGATAAACAAATGAATCGATGTATATCTTTTGAATATCTCGGTTGCTAT GGTAACGAGAACAATTTTAGATCAGAAAAGGAATGTATCACTCAATGTGTCTACCGCGAT AACACTACAAATGATTCAGATCAATTAAATTTGAAAAACGGTATTCAGAAAACATCACTT TTAAATAATACTAATGATAAGTGGATTCAAATGCCTCAAGAATGTCGGTATACACAATGG ACAAATTGGTCAAGTTGCAGTACTACATGTGGACAAGGAATTCAGACACGTGTACGTGAA CGCATTTCATCAAAATCAGACAACTGCCAAAAAACTTTACCAGAACTTAAACAACAAATG AGTTGTTTACTTAAGGCTTGTTAACTAATAATCACAATTTAGTCATTTCTGAGTTTTTCC ATTTTCCTTATACATTTGTTAAAATATTTTTCACAGTTATTCATTACTACTGATCGAGAT ATACTACTCGAATAAAAACAAATTATAAATGGATACTTTTCAATGATGATATTTACATCG AGTTAATAGTTTCGTTTAAGTACATATACTGTGTTTGTTTTTTTTTCATTTCCAAATAAC CTGTCACTTGTTGACGGTTGTTTACTATTTTATAGTATAAAAGGTTATCAATGTTAAATA TTAATCTTTGCATTCCGTTGTTAATTATCTAGCATTTGACTCCAAATTTTTCTTTATATT CATCATTAAATTATCCATTTTGTTCTTGTTATTATTGTTAGTATGGCTGCAATAATTAGT ATTGTTATTATTGTAAACTATGAAGTGAATGAATCTTTTAAAAAAAGAAATACAACTTTC AACGAAAAAAAAAGTTAAACAAAAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)