These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8887#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 979 fasta sequence [CGGTACCCCTTGGCAAGGGTGNNGAAATCAGGAAATATTAACAATAACGCAAATCAATTCAATGAATTAGATGAAGAGGATATTTTGAAAGAAGGTGAAGATGCTCAACTGTCAAATACACCATACCCTCCACAATTAATGCCTGTTTATACACCTGAGTCACTGGAAGATGGTTATGCTCGTTTAACGTTATTATCTAATTTATCTATTCGATCATTTGTGCGAATTACTGATCATGTTTTTACTGTACAGCAATATTGTAATAATACTGTAAATAATGCAAATATAACATCATCGGAATTATTACTTCGTGGTATTAAACGTCATCGTCAACAAATAGCAGCTAAACAAGCTGGTATGCATTTAGTGATTGGTTCAAACTCAACTGCAAGTGATTGTGATCCCCTAGTTCTTATGGATGAATTAAATGCGAATTTATTTAATCTTGTAATTTCATTGATGCCGGAATCTTCTATGTCACCGATGTTTGGTCTACCAGCTAACTGGCCTACTAAAGTTGATTTAAGAACAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCCCATTAGTTGTCCTGATCTTGTAGCACATCTGGAACTGATTCATCGTACTTGCCGTCGAAGATGGGCTGTAAAACGAATTGAAGATAGCTTATCTAATTCTCAGTTACAATTAAATACGGAGTATGTGGGTCGTTTGTGTGTTCTTGAAGAATTGGGTTTTATCGATTCAGCAACACATACTGGTTGTTTGAGTTTAAAAGGTCGAATTGCTTGTGAATTAACAAAAATGGAAGTGTTAATTACTCAACTACTACTTAATGGTTCATTTACTGATTTATCAGCTCCTGATTTGGCAGCTGTTTTATCGTGTTTTGTATTTGAAACACGTT] [+] EMBL CD168142 [CGGTACCCCTTGGCAAGGGTGNNGAAATCAGGAAATATTAACAATAACGCAAATCAATTCAATGAATTAGATGAAGAGGATATTTTGAAAGAAGGTGAAGATGCTCAACTGTCAAATACACCATACCCTCCACAATTAATGCCTGTTTATACACCTGAGTCACTGGAAGATGGTTATGCTCGTTTAACGTTATTATCTAATTTATCTATTCGATCATTTGTGCGAATTACTGATCATGTTTTTACTGTACAGCAATATTGTAATAATACTGTAAATAATGCAAATATAACATCATCGGAATTATTACTTCGTGGTATTAAACGTCATCGTCAACAAATAGCAGCTAAACAAGCTGGTATGCATTTAGTGATTGGTTCAAACTCAACTGCAAGTGATTGTGATCCCCTAGTTCTTATGGATGAATTAAATGCGAATTTATTTAATCTTGTAATTTCATTGATGCCGGAATCTTCTATGTCACCGATGTTTGGTCTACCAGCTAACTGGCCTACTAAAGTTGATTTAAGAACAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTC ] [+] EMBL CD168161 [ AATAACGCAAATCAATTCAATGAATTAGATGAAGAGGATATTTTGAAAGAAGGTGAAGATGCTCAACTGTCAAATACACCATACCCTCCACAATTAATGCCTGTTTATACACCTGAGTCACTGGAAGATGGTTATGCTCGTTTAACGTTATTATCTAATTTATCTATTCGATCATTTGTGCGAATTACTGATCATGTTTTTACTGTACAGCAATATTGTAATAATACTGTAAATAATGCAAATATAACATCATCGGAATTATTACTTCGTGGTATTAAACGTCATCGTCAACAAATAGCAGCTAAACAAGCTGGTATGCATTTAGTGATTGGTTCAAACTCAACTGCAAGTGATTGTGATCCCCTAGTTCTTATGGATGAATTAAATGCGAATTTATTTAATCTTGTAATTTCATTGATGCCGGAATCTTCTATGTCACCGATGTTTGGTCTACCAGCTAACTGGCCTACTAAAGTTGATTTAAGAACAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTC ] [-] EMBL CD167926 [ ATAACGCAAATCAATTCAATGAATTAGATGAAGAGGATATTTTGAAAGAAGGTGAAGATGGTCAACTGTCAAATACACCATACCCTCCACAATTAATGCCTGTTTATACACCTGAGTCACTGGAAGATGGTTATGCTCGTTTAACGTTATTATCTAATTTATCTATTCGATCATTTGTGCGAATTACTGATCATGTTTTTACTGTACAACAATATTGTAATAATACTGTAAATAATGCGAATATAACATCATCGGAATTATTACTTCGTGGTATTAAACGTCATCGTCAACAAATAGCAGCTAAACAGGCTGGTATGCATTTAGTGATTGGTTCAAACTCAACTGCAAGTGATTGTGATCCCCTAGTTCTTATGGATGAATTAAATGCGAATTTATTTAATCTTGTAATTTCATTGATGCCGGAATCTTCTATGTCACCGATGTTTGGTCTACCAGCTAACTGGCCTACTAAAGTTGATTTAAGAACAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCC ] [+] EMBL CD169450 [ GGTCTACCAGCTAACTGGCCTACTAAAGTTGATTTAAGAACAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGCGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCCCATTAGTTGTCCTGATCTTGTAGCACATCTGGAACTGGTTCATCGTACTTGCCGTCGAAGATGGGCTGTAAAACGAATTGAAGATAGCTTATCTAATTCTCAGTTACAATTAAATACGGAGTATGTGGGTCGTTTGTGTGTTCTTGAAGAATTGGGTTTTATCGATTCAGCAACACATACTGGTTGTTTGAGTTTAAAAGGTCGAATTGCTTGTGAATTAACAAAAGTGGAAGTGTTAATTACTCAACTACTACTTAATGGTTCATTAACTGATTTATCAGCTCCTGATTTGGCAGCTGTTTTATCGTGTTTTGTATTTGAAACACGTT] [+] EMBL CD089749 [ ACAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCCCATTAGTTGTCCTGATCTTGTAGCACATCTGGAACTGATTCATCGTACTTGCCGTCGAAGATGGGCTGTAAAACGAATTGAAGATAGCTTATCTAATTCTCAGTTACAATTAAATACGGAGTATGTGGGTCGTTTGTGTGTTCTTGAAGAATTGGGTTTTATCGATTCAGCAACACATACTGGTTGTTTGAGTTTAAAAGGTCGAATTGCTTGTGAATTAACAAAAATGGAAGTGTTAATTACTCAACTACTACTTAATGGTTCATTTACT ] [-] EMBL CD089844 [ CAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCCCATTAGTTGTCCTGATCTTGTAGCACATCTGGAACTGATTCATCGTACTTGCCGTCGAAGATGGGCTGTAAAACGAATTGAAGATAGCTTATCTAATTCTCAGTTACAATTAAATACGGAGTATGTGGGTCGTTTGTGTGTTCTTGAAGAATTGGGTTTTATCGATTCAGCAACACATACTGGTTGTTTGAGTTTAAAAGGTCGAATTGCTTGTGAATTAACAAAAATGGAAGTGTTAATTACTCAACTACTACTTAATGGTTCATTTACTG ] [-] EMBL CD089724 [ CAGCATTGAAATTCAAGGGAATTTCAGAGGAGGATGCTTGTGTGTTTGATGAGCATGCTTTACTCAGTGATGAACTAACAACACCACTTCTAACATCGGTTATTACTCAACGTTTGGCTCCCATTAGTTGTCCTGATCTTGTAGCACATCTGGAACTGATTCATCGTACTTGCCGTCGAAGATGGGCTGTAAAACGAATTGAAGATAGCTTATCTAATTCTCAGTTACAATTAAATACGGAGTATGTGGGTCGTTTGTGTGTTCTTGAAGAATTGGGTTTTATCGATTCAGCAACACATACTGGTTGTTTGAGTTTAAAAGGTCGAATTGCTTGTGAATTAACAAAAATGGAAGTGTTAATTACTCAACTACTACTTAATGGTTCATTTACTG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||