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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8888#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 610 fasta sequence
[AGCCAAGATTCGGCACGAGGACGCTTTTCAAGTGAAAATTATTTATTGACTTTGAGTTCCAGTGGCTTGCCAATAATGATGTTTACTGCATGTGCAATATTTTCCAGCTTTCTTCTCTGTACATACGCTGTGACGCTGGAAGAAGGACTTAAGAACCCTTCCAAGTATATTCGTTATGACACAGCTCCAAATAATACTTGGATTCATGCTCTGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACGCTTACTGGATTTATACTTTGCATACACCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAATCGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCACCAAATTTTTTTAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGATATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]
[+] EMBL CD083187 [AGCCAAGATTCGGCACGAGGACGCTTTTCAAGTGAAAATTATTTATTGACTTTGAGTTCCAGTGGCTTGCCAATAATGATGTTTACTGCATGTGCAATATTTTCCAGCTTTCTTCTCTGTACATACGCTGTGACGCTGGAAGAAGGACTTAAGAACCCTTCCAAGTATATTCGTTATGACACAGCTCCAAATAATACTTGGATTCATGCTCTGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACGCTTACTGGATTTATACTTTGCATACACCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAATCGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCACCAAATTTTTTTAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGATATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]
[-] EMBL CD076761 [ GCTTTTCAAGTGANAATTATTTATTGACTTTGAGTTCCAGTGGCTTGCCAATAATGATGTTTACTGCATGTGCAATATTTTCCAGCTTTCTTCTCTGTACATACGCTGTGACGCTGGAAGAAGGACTTAAGAACCCTTCCAAGTATATTCGTTATGACACAGCTCCAAATAATACTTGGATTCATGCTCTGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACGCTTACTGGATTTATACTTTGCATACACCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAATCGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCACCAAATTTTTTTAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGATATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]
[+] EMBL CD082819 [ tgGGCTTGCCAATAATGATGTTTACTGCATGTGCAATATTTTCCAGCTTTCTTCTCTGTACATACGCTGTGACGCTGGAAGAAGGACTTAAGAACCCTTCCAAGTATATTCGTTATGACACAGCTCCAAATAATACTTGGATTCATGCTCTGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACGCTTACTGGATTTATACTTTGCATACACCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAATCGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCACCAAATTTTTTTAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGATATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTG ]
[-] EMBL CD076408 [ GGCTTGCCAATAATGATGTTTACTGCATGTGCAATATTTTCCAGCTTTCTTCTCTGTACATACGCTGTGACGCTGGAAGAAGGACTTAAGAACCCTTCCAAGTATATTCGTTATGACACAGCTCCAAATAATACTTGGATTCATGCTCTGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACGCTTACTGGATTTATACTTTGCATACACCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAATCGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCACCAAATTTTTTTAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGATATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]
[-] EMBL AA999597 [ TGATTTCTCTTTGCATAACGTACGGTACGCTTACTGGATTTATACTTTGCATACCCCTAGTGGTATACCTATCAGGATCAAAGAAAAATCGTCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTAGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTAGCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTCGGGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCCGGGGATTTTTTAAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGACATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]
[-] EMBL AA999599 [ TCGGCGTTCTGCTTGATAAATCAACTAATTTGTATAAATGCTACATGTAGTTCTTCATGTTAACATTGTATTTTATTACCCATATTTGCCTAATTCATCATATATTTATTC GGGAAACATACATGTTCCAATAGCCAAAACAAACATCATTTCCGGGGGTTTTTTAAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCCCTTATTATGGTAGATGATGACATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]
[-] EMBL AA999605 [ ACATCATTCCCCNAAATTTTTTAAAAATGTCTCAGTGAATAGAAAACTATGTCACTTATTATGGTAGATGATGACATACTGTATAATTTTAATCTATGTTCACATGATTTTCACTGTTAAAATAAGATTTTACATGGATAATATCAGATCATACATAAATATACTGT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||