These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8892#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 810 fasta sequence [TCGGTACCGGACGCA-TCACAGTATAT-ATTTAGAAAGAG---AATCACAAATGGAACCTTATTCATGGA-TTCTACAATTCAAATTGGTCCAGAGAGAAGACAAACTTATTTAACACAAGAACTTCATGTTAATGGAATAGAAAATAAAGCAAATTTACAAACTGGACAGATTGAGTTTCAAGCTGAAAGTATCATGAAAAAACCTATTGGTCCAGATGTTTGTCCATCTGGTTTTGAATTGAATCAAGCTAGAATTACTGGGACAAGTATTAGATTACAAAGAAGACGAGATTATTGTAAAGATGTAGACGAATGTGCTTTTCCAAATATGAATAAATGTGATCATGTATGTAAAAACACTGTACCATACTATACATGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGTATTGATATTGATGAATGCGCTATAAGTGGAAATAATGAAACTATTTGTTCATATGGACAAAGATGTATTAATACTCATGGAAGTTATGAATGTAAACATGTTTGTGGACCAGGTTTAAAAGAAAATCCTATAACGAATCGTTGTGAAGATATTGATGAATGCCAAACTGCACCAGGTATTTGTGGACTACATACGTGTGTGAATACCTTTGGAGGTTATCAATGTATTTGTTTACCTGGTTACAAACGGATTGGTGAAATATGTCAAGATATTGATGAATGCCTATCTGGAGCTTACCAATGTGGTGAAAATGAACGATGCGTAAATATACCGGGCAGTTTTCGTTGTCAACCTACATGTCCCCAAGGATACCGTGCGATTGGTACACCT] [+] EMBL CD064356 [TCGGTACCGGACGCA TCACAGTATAT ATTTAGAAAGAG AATCACAAATGGAGCCTTATTCATGGA TTCTACAATTCAAATTGGTCCAGAGAGAAGACAAACTTATTTAACACAAGAACTTCATGTTAATGGAATAGAAAATAAAGCAAATTTACAAACTGGACAGATTGAGTTTCAAGCTGAAAGTATCATGAAAAAACCTATTGGTCCGGATGTTTGTCCATCTGGTTTTGAATTGAATCAAGCTAGAATTACTGGGACAAGTATTAGATTACAAAGAAGACGAGATTATTGTAAAGATGTAGACGAATGTGCTTTTCCAAATATGAATAAATGTGATCATGTATGTAAAAACACTGTACCATACTATACATGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGTA ] [+] EMBL CD137175 [ caagaGCATTCACAGTATATAATTTAGAAAGAGAAAAATCACAAATGGAACCTTATTCATGGATTTCTACAATTCAAATTGGTCCAGAGAGAAGACAAACTTATTTAACACAAGAACTTCATGTTAATGGAATAGAAAATAAAGCAAATTTACAAACTGGACAGATTGAGTTTCAAGCTGAAAGTATCATGAAAAAACCTATTGGTCCAGATGTTTGTCCATCTGGTTTTGAATTGAATCAAGCTAGAATTACTGGGACAAGTATTAGATTACAAAGAAGACGAGATTATTGTAAAGATGTAGACGAATGTG ] [-] EMBL CD064109 [ TTTAGAAAGAGAAAAATCACAAATGGAACCTTATTCATGGATTTCTACAATTCAAATTGGTCCAGAGAGAAGACAAACTTATTTAACACAAGAACTTCATGTTAATGGAATAGAAAATAAAGCAAATTTACAAACTGGACAGATTGAGTTTCAAGCTGAAAGTATCATGGAAAAACCTATTGGTCCAGATGTTTGTCCATCTGGTTTTGAATTGAATCAAGCTAGAATTACTGGGACAAGTATTAGATTACAAAGAAGACGAGATTATTGTAAAGATGTAGACGAATGTGCTTTTCCAAATATGAATAAATGTGATCATGTATGTAAAAACACTGTACCATACTATACATGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGTAT ] [+] EMBL CD168714 [ GAAAAAACCTATTGGTCCAGATGTTTGTCCATCTGGTTTTGAATTGAATCAAGCTAGAATTACTGGGACAAGTATTAGATTACAAAGAAGACGAGATTATTGTAAAGATGTAGACGAATGTGCTTTTCCAAATATGAATAAATGTGATCATGTATGTAAAAACACTGTACCATACTATACATGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGTATTGATATTGATGAATGCGCTATAAGTGGAAATAATGAAACTATTTGTTCATATGGACAAAGATGTATTAATACTCATGGAAGTTATGAATGTAAACATGTTTGTGGACCAGGTTTAAAAGAAAATCCTATAACGAATCGTTGTGAAGATATTGATGAATGCCAAACTGCACCAGGTATTTGT ] [+] EMBL CD187988 [ TGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGTATTGATATTGATGAATGCGCTATAAGTGGAAATAATGAAACTATTTGTTCATATGGACAAAGATGCATTAATACTCATGGAAGTTATGAATGTAAACATGTTTGTGGACCAGGTTTAAAAGAAAATCCTATAACGAATCGTTGTGAAGATATTGATGAATGCCAAACTGCACCAGGTACTTGTGGACTACATACGTGTGTGAATACCTTTGGAGGTTATCAATGTATNTGTTTACCTGGTTACAAACGGATTGGTGAAATATGTCAAGATATTGATGAATGCCTATCTGGAGCTTACCAATGTGGTGAAAATGAACGATGCGTAAATATACCGGGCAGTTTTCGTTGTCAACCTACATGTCCCCAAGGATACCGTGCGATTGGTACACCT] [+] EMBL CD187989 [ TGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGTATTGATATTGATGAATGCGCTATAAGTGGAAATAATGAAACTATTTGTTCATATGGACAAAGATGCATTAATACTCATGGAAGTTATGAATGTAAACATGTTTGTGGACCAGGTTTAAAAGAAAATCCTATAACGAATCGTTGTGAAGATATTGATGAATGCCAAACTGCACCAGGTACTTGTGGACTACATACGTGTGTGAATACCTTTGGAGGTTATCAATGTATTTGTTTACCTGGTTACAAACGGATTGGTGA ] [+] EMBL CD189660 [ TGTATTAATACTCATGGAAGTTATGAATGTAAACATGTTTGTGGACCAGGTTTAAAAGAAAATCCTATAACGAATCGTTGTGAAGATATTGATGAATGCCAAACTGCACCAGGTATTTGTGGACTACATACGTGTGTGAATACCTTTGGAGGTTATCAATGTATTTGTTTACCTGGTTACAAACGGATTGGTGAAATATGTCAAGATATTGATGAATGTCTATCTGGAGCTTACCAATGTGGTGAAAATGAACGATG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||