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Schistosoma mansoni
cluster # 8892 cluster # 8892       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8892#0 length = 810 sequences # 7  

consensusID : consensus_8892#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 810
fasta sequence
                              [TCGGTACCGGACGCA-TCACAGTATAT-ATTTAGAAAGAG---AATCACAAATGGAACCTTATTCATGGA-TTCTACAATTCAAATTGGTCCAGAGAGAAGACAAACTTATTTAACACAAGAACTTCATGTTAATGGAATAGAAAATAAAGCAAATTTACAAACTGGACAGATTGAGTTTCAAGCTGAAAGTATCATGAAAAAACCTATTGGTCCAGATGTTTGTCCATCTGGTTTTGAATTGAATCAAGCTAGAATTACTGGGACAAGTATTAGATTACAAAGAAGACGAGATTATTGTAAAGATGTAGACGAATGTGCTTTTCCAAATATGAATAAATGTGATCATGTATGTAAAAACACTGTACCATACTATACATGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGTATTGATATTGATGAATGCGCTATAAGTGGAAATAATGAAACTATTTGTTCATATGGACAAAGATGTATTAATACTCATGGAAGTTATGAATGTAAACATGTTTGTGGACCAGGTTTAAAAGAAAATCCTATAACGAATCGTTGTGAAGATATTGATGAATGCCAAACTGCACCAGGTATTTGTGGACTACATACGTGTGTGAATACCTTTGGAGGTTATCAATGTATTTGTTTACCTGGTTACAAACGGATTGGTGAAATATGTCAAGATATTGATGAATGCCTATCTGGAGCTTACCAATGTGGTGAAAATGAACGATGCGTAAATATACCGGGCAGTTTTCGTTGTCAACCTACATGTCCCCAAGGATACCGTGCGATTGGTACACCT]

[+] EMBL CD064356             [TCGGTACCGGACGCA TCACAGTATAT ATTTAGAAAGAG   AATCACAAATGGAGCCTTATTCATGGA TTCTACAATTCAAATTGGTCCAGAGAGAAGACAAACTTATTTAACACAAGAACTTCATGTTAATGGAATAGAAAATAAAGCAAATTTACAAACTGGACAGATTGAGTTTCAAGCTGAAAGTATCATGAAAAAACCTATTGGTCCGGATGTTTGTCCATCTGGTTTTGAATTGAATCAAGCTAGAATTACTGGGACAAGTATTAGATTACAAAGAAGACGAGATTATTGTAAAGATGTAGACGAATGTGCTTTTCCAAATATGAATAAATGTGATCATGTATGTAAAAACACTGTACCATACTATACATGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD137175             [       caagaGCATTCACAGTATATAATTTAGAAAGAGAAAAATCACAAATGGAACCTTATTCATGGATTTCTACAATTCAAATTGGTCCAGAGAGAAGACAAACTTATTTAACACAAGAACTTCATGTTAATGGAATAGAAAATAAAGCAAATTTACAAACTGGACAGATTGAGTTTCAAGCTGAAAGTATCATGAAAAAACCTATTGGTCCAGATGTTTGTCCATCTGGTTTTGAATTGAATCAAGCTAGAATTACTGGGACAAGTATTAGATTACAAAGAAGACGAGATTATTGTAAAGATGTAGACGAATGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD064109             [                             TTTAGAAAGAGAAAAATCACAAATGGAACCTTATTCATGGATTTCTACAATTCAAATTGGTCCAGAGAGAAGACAAACTTATTTAACACAAGAACTTCATGTTAATGGAATAGAAAATAAAGCAAATTTACAAACTGGACAGATTGAGTTTCAAGCTGAAAGTATCATGGAAAAACCTATTGGTCCAGATGTTTGTCCATCTGGTTTTGAATTGAATCAAGCTAGAATTACTGGGACAAGTATTAGATTACAAAGAAGACGAGATTATTGTAAAGATGTAGACGAATGTGCTTTTCCAAATATGAATAAATGTGATCATGTATGTAAAAACACTGTACCATACTATACATGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD168714             [                                                                                                                                                                                                     GAAAAAACCTATTGGTCCAGATGTTTGTCCATCTGGTTTTGAATTGAATCAAGCTAGAATTACTGGGACAAGTATTAGATTACAAAGAAGACGAGATTATTGTAAAGATGTAGACGAATGTGCTTTTCCAAATATGAATAAATGTGATCATGTATGTAAAAACACTGTACCATACTATACATGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGTATTGATATTGATGAATGCGCTATAAGTGGAAATAATGAAACTATTTGTTCATATGGACAAAGATGTATTAATACTCATGGAAGTTATGAATGTAAACATGTTTGTGGACCAGGTTTAAAAGAAAATCCTATAACGAATCGTTGTGAAGATATTGATGAATGCCAAACTGCACCAGGTATTTGT                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD187988             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGTATTGATATTGATGAATGCGCTATAAGTGGAAATAATGAAACTATTTGTTCATATGGACAAAGATGCATTAATACTCATGGAAGTTATGAATGTAAACATGTTTGTGGACCAGGTTTAAAAGAAAATCCTATAACGAATCGTTGTGAAGATATTGATGAATGCCAAACTGCACCAGGTACTTGTGGACTACATACGTGTGTGAATACCTTTGGAGGTTATCAATGTATNTGTTTACCTGGTTACAAACGGATTGGTGAAATATGTCAAGATATTGATGAATGCCTATCTGGAGCTTACCAATGTGGTGAAAATGAACGATGCGTAAATATACCGGGCAGTTTTCGTTGTCAACCTACATGTCCCCAAGGATACCGTGCGATTGGTACACCT]
[+] EMBL CD187989             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGTATTGATATTGATGAATGCGCTATAAGTGGAAATAATGAAACTATTTGTTCATATGGACAAAGATGCATTAATACTCATGGAAGTTATGAATGTAAACATGTTTGTGGACCAGGTTTAAAAGAAAATCCTATAACGAATCGTTGTGAAGATATTGATGAATGCCAAACTGCACCAGGTACTTGTGGACTACATACGTGTGTGAATACCTTTGGAGGTTATCAATGTATTTGTTTACCTGGTTACAAACGGATTGGTGA                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD189660             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTATTAATACTCATGGAAGTTATGAATGTAAACATGTTTGTGGACCAGGTTTAAAAGAAAATCCTATAACGAATCGTTGTGAAGATATTGATGAATGCCAAACTGCACCAGGTATTTGTGGACTACATACGTGTGTGAATACCTTTGGAGGTTATCAATGTATTTGTTTACCTGGTTACAAACGGATTGGTGAAATATGTCAAGATATTGATGAATGTCTATCTGGAGCTTACCAATGTGGTGAAAATGAACGATG                                                                      ]


>consensus_8892#0 TCGGTACCGGACGCATCACAGTATATATTTAGAAAGAGAATCACAAATGGAACCTTATTC ATGGATTCTACAATTCAAATTGGTCCAGAGAGAAGACAAACTTATTTAACACAAGAACTT CATGTTAATGGAATAGAAAATAAAGCAAATTTACAAACTGGACAGATTGAGTTTCAAGCT GAAAGTATCATGAAAAAACCTATTGGTCCAGATGTTTGTCCATCTGGTTTTGAATTGAAT CAAGCTAGAATTACTGGGACAAGTATTAGATTACAAAGAAGACGAGATTATTGTAAAGAT GTAGACGAATGTGCTTTTCCAAATATGAATAAATGTGATCATGTATGTAAAAACACTGTA CCATACTATACATGTGCATGTCATAAAGGTTATCGCTTATCAGTTGATGGACATTCTTGT ATTGATATTGATGAATGCGCTATAAGTGGAAATAATGAAACTATTTGTTCATATGGACAA AGATGTATTAATACTCATGGAAGTTATGAATGTAAACATGTTTGTGGACCAGGTTTAAAA GAAAATCCTATAACGAATCGTTGTGAAGATATTGATGAATGCCAAACTGCACCAGGTATT TGTGGACTACATACGTGTGTGAATACCTTTGGAGGTTATCAATGTATTTGTTTACCTGGT TACAAACGGATTGGTGAAATATGTCAAGATATTGATGAATGCCTATCTGGAGCTTACCAA TGTGGTGAAAATGAACGATGCGTAAATATACCGGGCAGTTTTCGTTGTCAACCTACATGT CCCCAAGGATACCGTGCGATTGGTACACCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)