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Schistosoma mansoni
cluster # 8922 cluster # 8922       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8922#0 length = 999 sequences # 8  

consensusID : consensus_8922#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 999
fasta sequence
                              [TGTGATTTGTTGCATGAATGTGGATAAAACCTTGCTTAACAGGACTTTTGTTCGTAGTTCAGTGTTGGAAACACTAAGATGTCCTGAAACTAGAACAAATGCGTCTCCAAAAGTTGAAAACATTAATCTCTCTGGCCAAGAGATAAAAAATTTCTATGAATCTCTTACACAGTGCGTAACTCAAAAAATTGAATACTCATCACTTGATTCAAATTTAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGGCTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTCAAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACTTTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAACTTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGGGTGCTCTCAGACAAGGTCGACGCTTTCCTGTAGCAACTGTCTTAAAACGCGATCGTCTTGGTTTTGGATGGCCAAATACAACAAATACTGCAAGAATTACACATTTCAACCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAGATGTGAGACGACTTCGTCACTCATCCATTAAAATGGACTCGAAATATTTGATAAGAAAAATGAATTTAGAGAAGAAAAAAGAACGTATTATAAGACAAGGGTTTAATTTGACTGATGAACAGTTAGCTTTGCTTTATGACAAATAAACGTTTGAATCATTTCATATTAAGTATAGCTATTTTCTTCAGTATATACTGTACATAACTATCGAATTTATTTAAATCTATGTCCCAATTCCTGTCAATTCTGTGTTAAATCTGTTACATTATTTGCTGCTGTTTTGTCGAAATCGAGATAAAGTGAGACAATAA-CCTGCGTGATGATGTCTATG-AAAT-AAATCAT-ACATGT-CCAATT-AAAGATATAT]

[+] EMBL AI977230             [TGTGATTTGTTGCATGAATGTGGATAAAACCTTGCTTAACAGGACTTTTGTTCGTAGTTCAGTGTTGGAAACACTAAGATGTCCTGAAACTAGAACAAATGCGTCTCCAAAAGTTGAAAACATTAATCTCTCTGGCCAAGAGATAAAAAATTTCTATGAATCTCTTACACAGTGCGTAACTCAAAAAATTGAATACTCATCACTTGATTCAAATTTAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGGCTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTCAAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACTTTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAACTTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGNGTGCTCTCAGACAAGGTCGACGCTTTCCTGTAGCAACTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AI976931             [   GATTTGTTGCATGAATGTGGATAAAACCTTGCTTAACAGGACTTTTGTTCGTAGTTCAGTGTTGGAAACACTAAGATGTCCTGAAACTAGAACAAATGCGTCTCCAAAAGTTGAAAACATTAATCTCTCTGGCCAAGAGATAAAAAATTTCTATGAATCTCTTACACAGTGCGTAACTCAAAAAATTGAATACTCATCACTTGATTCAAATTTAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGGCTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTCAAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACTTTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAACTTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGGGTGCTCTCAGACAAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD082604             [        GTTGCATGAATGTGGATAAAACCTTGCTTAACAGGACTTTTGTTCGTAGTTCAGTGTTGGAAACACTAAGATGTCCTGAAACTAGAACAAATGCGTCTCCAAAAGTTGAAAACATTAATCTCTCTGGCCAAGAGATAAAAAATTTCTATGAATCTCTTACACAGTGCGTAACTCAAAAAATTGAATACTCATCACTTGATTCAAATTTAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGGCTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTCAAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACTTTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAACTTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGGGTGCTCTCAGACAAGGTCGACGCTNTCCTGTAGCAACTGTCTTAAAACGCGATCGTCTTGGTTNTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD080081             [                                                                                                                                                                                     CAAAAAATTGAATACTCATCACTTGATTCAAATTTAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGGCTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTCAAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACTTTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAACTTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGGGTGCTCTCAGACAAGGTCGACGCTTTCCTGTAGCAACTGTCTTAAAACGCGATCGTCTTGGTTTTGGATGGCCAAATACAACAAATACTGCAAGAATTACACATTTCAACCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAGATGTGAGACGACTTCGTCACTCATCCATTAAAATGGACTCGAAATATTTGATAAGAAAAATGAATTTAGAGAAGAAAAAAGAACGTATTATAAGACAAGGGTTTAATTTGACTGATGAACAGTTAGCTTTGCTTTATGACAAATAAACGTTTGAATCATTTCATATTAAGTATAGCTATTTTCTTCAGTATATACTGTACATAACTATCGAATTTATTTAAATCTATGTCCC ATTCCTGTCAATTCTGTGTTAAATCTGTTACATTATTTGCTGCTGNTTTGTCG AATCGAGAT AAGTGAGAC ATAA CCTGCGTGATGATGTCTATG AAAT AAATCAT ACATGT CCAATT AAAGATA   ]
[-] EMBL BF936092             [                                                                                                                                                                                                                       TAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGGCTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTCAAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACTTTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAACTTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTTTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGGGTGCTTTCAGACAAGGTCGACGCTTTCCTGTAGCAACTGTCTTAAAACGCGATCGTCTTGGTTTTGGATGGCCAAATACAACAAATACTGCAAGAATTACACATTTCAACCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAAATGTGAGACGACTTCGTCACTCATCCATTAAAATGGACTCGAAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD076198             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGGGTGCTCTCAGACAAGGTCGACGCTTTCCTGTAGCAACTGTCTTAAAACGCGATCGTCTTGGTTTTGGATGGCCAAATACAACAAATACTGCAAGAATTACACATTTCAACCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAGATGTGAGACGACTTCGTCACTCATCCATTAAAATGGACTCGAAATATTTGATAAGAAAAATGAATTTAGAGAAGAAAAAAGAACGTATTATAAGACAAGGGTTTAATTTGACTGATGAACAGTTAGCTTTGCTTTATGACAAATAAACGTTTGAATCATTTCATATTAAGTATAGCTATTTTCTTCAGTATATACTGTACATAACTATCGAATTTATTTAAATCTATGTCCCAATTCCTGTCAATTCTGTGTTAAATCTGTTACATTATTTGCTGCTGTTTTGTCGAAATCGAGATAAAGTGAGACAATAACCCTGCGTGATGATGTCTATGAAAATAAAATCATAACATGTCCCAATTAAAAGA ATAT]
[-] EMBL CD147836             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGCAACTGTCTTAAAACGCGATCGTCTTGTTTTTGGATGGCCAAATACAACAAATACTGCAAGAATTACACATTTCAACCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAGATGTGAGACGACTTCGTCACACATCCATTAAAATGGACTCGAAATATTTGATAAGAAAAATGAATTTAGAGAAGAAAAAAGAACGTATTATAAGACAAGGGTTTAATTTGACTGATGAACAGTTAGCTTTGCTTTATGACAAATAAACGTTTGAATCATTTCATATTAAGTATAGCTATTTTCTTCAGTATATACTGTACATAACTATCGAATTTATTTAAATCTATGTCCCAATTCCTGTCAATTCTGTGTTAAATCTGTTACATTATTTGCTGCTGTTTTGTCGAAATCGAGATAAAGTGAGACAATAA CCctagttgc                                                ]
[-] EMBL CD111306             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCAACCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAGATGTGAGACGACTTCGTCACACATCCATTAAAATGGACTCGAAATATTTGATAAGAAAAATGAATTTAGAGAAGAAAAAAGAACGTATTATAAGACAAGGGTTTAATTTGACTGATGAACAGTTAGCTTTGCTTTATGACAAATAAACGTTTGAATCATTTCATATTAAGTATAGCTATTTTCTTCAGTATATACTGTACATAACTATCGAATTTATTTAAATCTATGTCCCAATTCCTGTCAATTCTGTGTTAAATCTGTTACATTATTTGCTGCTGTTTTGTCGAAATCGAGATAAAGTGA                                                                   ]


>consensus_8922#0 TGTGATTTGTTGCATGAATGTGGATAAAACCTTGCTTAACAGGACTTTTGTTCGTAGTTC AGTGTTGGAAACACTAAGATGTCCTGAAACTAGAACAAATGCGTCTCCAAAAGTTGAAAA CATTAATCTCTCTGGCCAAGAGATAAAAAATTTCTATGAATCTCTTACACAGTGCGTAAC TCAAAAAATTGAATACTCATCACTTGATTCAAATTTAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGG CTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTC AAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACT TTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAAC TTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAA CGGCGGTTTGGGTGCTCTCAGACAAGGTCGACGCTTTCCTGTAGCAACTGTCTTAAAACG CGATCGTCTTGGTTTTGGATGGCCAAATACAACAAATACTGCAAGAATTACACATTTCAA CCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAGATGTGAGACGACTTCGTCACTCATC CATTAAAATGGACTCGAAATATTTGATAAGAAAAATGAATTTAGAGAAGAAAAAAGAACG TATTATAAGACAAGGGTTTAATTTGACTGATGAACAGTTAGCTTTGCTTTATGACAAATA AACGTTTGAATCATTTCATATTAAGTATAGCTATTTTCTTCAGTATATACTGTACATAAC TATCGAATTTATTTAAATCTATGTCCCAATTCCTGTCAATTCTGTGTTAAATCTGTTACA TTATTTGCTGCTGTTTTGTCGAAATCGAGATAAAGTGAGACAATAACCTGCGTGATGATG TCTATGAAATAAATCATACATGTCCAATTAAAGATATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)