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Schistosoma mansoni
cluster # 894 cluster # 894       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_894#0 length = 589 sequences # 2  

consensusID : consensus_894#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 589
fasta sequence
                              [TAAAACTACGCCTTGCAAATGTATGCAAACTAACACAAAACCAGGTCCAGTGCTTTCTATCGGCTCTCTCCATCTACCTAACATCAAATATACTCTTTTTGTCAATCCACTAGTGGTCTTTGGTATGTTTCAACTTAATCGATGGTCATTTGAGTCTATATTGTGTGGCATCACGTGGGACCTGATGTAAAATATTATTTCAACAGATAAGTCACTACATGAATAGCTCATTGATGATCTCTTTGGGTGCAAAAAGATTGTGTGGGTTTAAATCTCATGGAAAGCATTAATTACATTAAGACTGGAGATGTCTTGGTAATTGGTGTCAACTAAAACAAAACTTGCTCTCCCCAACCAAATAACTGTGTTTTGTCTAGTCAGACAACTGTTTGAACTGTCACTTACTTCATCCATAATAATTNTATTCGAAAATTCGGCTACATTAGTATACAAGCTGAGAATACATCTTTGCTATCTACAACCTGTTAGTTGAAGTGGGGTCGAAGCTATCAACCTACCAGTTGATAGTTTAGTGATGAATCTGACGACTACTACAACTATTTCCATTAAACGAGTCGCAATTATTTAC]

[+] EMBL AI976632             [TAAAACTACGCCTTGCAAATGTATGCAAACTAACACAAAACCAGGTCCAGTGCTTTCTATCGGCTCTCTCCATCTACCTAACATCAAATATACTCTTTTTGTCAATCCACTAGTGGTCTTTGGTATGTTTCAACTTAATCGATGGTCATTTGAGTCTATATTGTGTGGCATCACGTGGGACCTGATGTAAAATATTATTTCAACAGATAAGTCACTACATGAATAGCTCATTGATGATCTCTTTGGGTGCAAAAAGATTGTGTGGGTTTAAATCTCATGGAAAGCATTAATTACATTAAGACTGGAGATGTCTTGGTAATTGGTGTCAACTAAAACAAAACTTGCTCTCCCCAACCAAATAACTGTGTTTTGTCTAGTCAGACAACTGTTTGAACTGTCACTTACTTCATCCATAATAATTNTATTCGAAAATTCGGCTACATTAGTATACAAGCTGAGAATACATCTTTGCTATCTACAACCTGTTAGTTGAAGTGGGGTCGAAGCTATCAACCTACCAGTTGATAGTTTAGTGATGAATCTGACGACTACTACAACTATTTCCATTAAACGAGTCGCAATTATTTAC]
[+] EMBL SM146                [                                  ACAAAACCAGGTCCAGTGCTTTCTATCGGCTCTCTCCATCTACCTAACATCAAATATACTCTTNNNGTCAATCCACTAGTGGTCTTTGGTATGTTTCAACTTAATCGATGGTCATTTGAGTCTATATTGTGTGGCATCACGTGGGACCTGATGTAAAATATTATTNCACCAGATANGTCACTACATGANTAGCTCATTGATGTTCTCTTTGGGTGCAAAAAGATTGTGTGGGTTTAAATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]


>consensus_894#0 TAAAACTACGCCTTGCAAATGTATGCAAACTAACACAAAACCAGGTCCAGTGCTTTCTAT CGGCTCTCTCCATCTACCTAACATCAAATATACTCTTTTTGTCAATCCACTAGTGGTCTT TGGTATGTTTCAACTTAATCGATGGTCATTTGAGTCTATATTGTGTGGCATCACGTGGGA CCTGATGTAAAATATTATTTCAACAGATAAGTCACTACATGAATAGCTCATTGATGATCT CTTTGGGTGCAAAAAGATTGTGTGGGTTTAAATCTCATGGAAAGCATTAATTACATTAAG ACTGGAGATGTCTTGGTAATTGGTGTCAACTAAAACAAAACTTGCTCTCCCCAACCAAAT AACTGTGTTTTGTCTAGTCAGACAACTGTTTGAACTGTCACTTACTTCATCCATAATAAT TNTATTCGAAAATTCGGCTACATTAGTATACAAGCTGAGAATACATCTTTGCTATCTACA ACCTGTTAGTTGAAGTGGGGTCGAAGCTATCAACCTACCAGTTGATAGTTTAGTGATGAA TCTGACGACTACTACAACTATTTCCATTAAACGAGTCGCAATTATTTAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)