cluster # 8957

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8957 cluster # 8957 Sequences # 8 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8957#0 length = 473 sequences # 8
consensusID : consensus_8957#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 473
fasta sequence
                              [TAGTTCAGTGTACATAGACTATCACGTATCATAGAGTTCGCCACAGCTCTGGGGTTCAATCCACATACTCAATTGTATGAACAAACCTGCAAACAAATTCAAAAACTGTACAAAATGTTCACAGCTTTAGATTGCGTTCAGGTTGAAGTTAATCCTTTTGGTG-AAACAAAGGATGGTCAGATTGTATGTTTTGATGCTAAATTAGCTTTCGATCAGAATGCAATATACCGCCAACCAGAAGTTCATAAAATGGCCTTGGAAGTTGAAGCTGTTGAAGTGGCTGCTTCTGGTCCGAAGAGTGCAGCAGCCTTAGAAGCAGATGCTACACACAATGGCTTAAACTATATCGGTCTAGATGATGGGAATATCGGTTGTATTGT-AAATGGAGCTGGATTGGCTATGGCTACTATGGATTTGATTCATTATCATCATGGTAAACCTGCTAATTTTCTTGATCTGGGGGGAAGTGTCAC]

[+] EMBL CD068274             [TAGTTCAGTGTACATAGACTATCACGTATCATAGAGTTCGCCACAGCTCTGGGGTTCAATCCACATACTCAATTGTATAAACAAACCTGCAAACAAATTCAAAAACTGTACAAAATGTTCACAGCTTTAGATTGCGTTCAGGTTGAAGTTAATCCTTTTGGTG AAACAAAGGATGGTCAGATTGTATGTTTTGATGCTAAATTAGCTTTCGATCAGAATGCAATATACCGCCAACCAGAAGTTCATAAAATGGCCTTGGAAGTTGAAGCTGTTGAAGTGGCTGCTTCTGGTCCGAAGAGTGCAGCAGCCTTAGAAGCAGATGCTACACACAATGGCTTAAACTATATCGGTCTAGATGATGGGAATATCGGTTGTATTGTCAAATGGAGCTGGATTGGCTATGGCTACTATGGATTTGATTCATTATCATCATGGTAAACCTGCTAATTTTCTTGATCTGGGGGGAAGTGTCAC]
[+] EMBL CD199526             [                                    TTCGCCACAGCTCTGGGGTTCAATCCACATACTCAATTGTATGAACAAACCTGCAAACAAATTCAAAAACTGTACAAAATGTTCACAGCTTTAGATTGCGTTCAGGTTGAAGTTAATCCTTTTGGTG AAACAAAGGATGGTCAGATTGTATGTTTTGATGCTAAATTAGCTTTCGATCAGAATGCAATATACCGCCAACCAGAAGTTCATAAAATGGCCTTGGAAGTTGAAGCTGTTGAAGTGGCTGCTTCTGGTCCGAAGAGTGCAGCAGCCTTAGAAGCAGATGCTACACACAATGGCTTAAACTATATCGGTCTAGATGATGGGAATATCGGTTGTATTGT AAATGGAGCTGGATTGGCTATGGCTACTATGGATTTGATTCATTATCATCATGGTAAACCTGCTAA                           ]
[+] EMBL CD199605             [                                    TTCGCCACAGCTCTGGGGTTCAATCCACATACTCAATTGTATGAACAAACCTGCAAACAAATTCAAAAACTGTACAAAATGTTCACAGCTTTAGATTGCGTTCAGGTTGAAGTTAATCCTTTTGGTG AAACAAAGGATGGTCAGATTGTATGTTTTGATGCTAAATTAGCTTTCGATCAGAATGCAATATACCGCCAACCAGAAGTTCATAAAATGGCCTTGGAAGTTGAAGCTGTTGAAGTGGCTGCTTCTGGTCCGAAGAGTGCAGCAGCCTTAGATGCAGATGCTACACACAATGGCTTAAACTATATCGGTCTAGATGATGGGAATACCGGTTGTATTGC AAATGGAGCTGGATTGGCTATGGCTACTATGGATTTGATTCATTATCATCATGGTAAACCTGCTAA                           ]
[+] EMBL CD199622             [                                    TTCGCCACAGCTCTGGGGTTCAATCCACATACTCAATTGTATGAACGAACCTGCAAACAAATTCAAAAACTGTACGAAATGTTCACAGCTTTAGATTGCGTTCAGGTTGAAGTTAATCCTTTTGGTG AAACAAAGGATGGTCAGATTGTATGTTTTGATGCTAAATTAGCTTTCGATCAGAATGCAATATACCGCCAACCAGAAGTTCATAAAATGGCCTTGGAAGTTGAAGCTGTTGAAGTGGCTGCTTCTGGTCCGAAGAGTGCAGCAGCCTTAGAAGCAGATGCTACACACAATGGCTTAAACTATATCGGTCTAGATGATGGGAATATCGGTTGTATTGT AAATGGAGCTGGATTGGCTATGGCTACTATGGATTTGATTCATTATCATCATGGTAAACCTGCTAA                           ]
[+] EMBL CD199461             [                                    TTCGCCACAGCTCTGGGGTTCAATCCACATACTCAATTGTATGAACAAACCTGCAAACAAATTCAAAAACTGTACAAAATGTTCACAGCTTTAGATTGCGTTCAGGTTGAAGTTAATCCTTTTGGTG AAACAAAGGATGGTCAGATTGTATGTTTTGATGCTAAATTAGCTTTCGATCAGAATGCAATATACCGCCAACCAGAAGTTCGTAAAATGGCCTTGGAAGTTGAAGCTGTTGAAGTGGCTGCTTCTGGTCCGAAGAGTGCAGCAGCCTTAGAAGCAGATGCTACACACAATGGCTTAAACTATATCGGTCTAGATGATGGGAATATCGGTTGTATTGT AAATGGAGCTGGATTGGCTATGGCTACTATGGATTTGATTCATTATCATCATGGTAAACCTGCTAA                           ]
[+] EMBL CD199466             [                                    TTCGCCACAGCTCTGGGGTTCAATCCACATACTCAATTGTATGAACAAACCTGCAAACAAATTCAAAAACTGTACAAAATGTTCACAGCTTTAGATTGCGTTCAGGTTGAAGTTAATCCTTTTGGTG AAACAAAGGATGGTCAGATTGTATGTTTTGATGCTAAATTAGCTTTCGATCAGAATGCAATATACCGCCAACCAGGAGTTCATAAAATGGCCTTGGAAGTTGAAGCTGTTGAAGTGGCTGCTTCTGGTCCGAAGAGTGCAGCAGCCTTAGAAGCAGATGCTACACACAATGGCTTAAACTATATCGGTCTAGATGATGGGAATATCGGTTGTATTGT AAATGGAGCTGGATTGGCTATGGCTACTATGGATTTGATTCATTATCATCATGGTAAACCTGCTAA                           ]
[+] EMBL CD177709             [                                                                      AATTGTATGAACAAACCCGCAAACAAATTCAAAAACTGTACAAAATGTTCACAGCTTTAGATTGCGTTCAGGTTGAAGTTAATCCTTTTGGTGAAAACAAAGGATGGTCAGATTGTATGTTTTGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD177809             [                                                                      AATTGTATGAACAAACCCGCAAACAAATTCAAAAACTGTACAAAATGTTCACAGCTTTAGATTGCGTTCAGGTTGAAGTTAATCCTTTTGGTG AAACAAAGGATGGCCAGATTGTATGTTTTGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]




>consensus_8957#0
TAGTTCAGTGTACATAGACTATCACGTATCATAGAGTTCGCCACAGCTCTGGGGTTCAAT
CCACATACTCAATTGTATGAACAAACCTGCAAACAAATTCAAAAACTGTACAAAATGTTC
ACAGCTTTAGATTGCGTTCAGGTTGAAGTTAATCCTTTTGGTGAAACAAAGGATGGTCAG
ATTGTATGTTTTGATGCTAAATTAGCTTTCGATCAGAATGCAATATACCGCCAACCAGAA
GTTCATAAAATGGCCTTGGAAGTTGAAGCTGTTGAAGTGGCTGCTTCTGGTCCGAAGAGT
GCAGCAGCCTTAGAAGCAGATGCTACACACAATGGCTTAAACTATATCGGTCTAGATGAT
GGGAATATCGGTTGTATTGTAAATGGAGCTGGATTGGCTATGGCTACTATGGATTTGATT
CATTATCATCATGGTAAACCTGCTAATTTTCTTGATCTGGGGGGAAGTGTCAC
clustalw multiple alignements is not computed in this case