These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8976#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1096 fasta sequence [TATTTTTCTCTCACATTCACTTATTTATCTGTTTCACTTCTATAGTAACTTTTCTCATGTCACAAGTGTAAACTTTATTTACTCATAGTGTGTACGTTAACCTATTCAGCATATACAGAGAGTTGTCTGTGCTTTGTCGTTGATGTGAATATTGTTTTCAATGGAAATTGTTTACGTTATACGAGATCCATTCACAATTTTTAATTTCAAACGATTAATTTGCTTTACTATATTGTCCCTCTTCCAGCGTTTCTCTAGGCTGCACCTTGTTATATCAGTTTTAACTGCATATGAAAAGCATGTAATGGAATCTATCTTATTTTAATTTTCTTTGTTATCTGAAAATTAGAGAAAACTTACCGTATTCACATATTTTTAGTCCGACATTACGTTCTGTTTTTCCCCTGTGGAGATATTCGTGGTTACTATGACTTATTAAATCTAATGACTAATTTTTGCTTTGAAAGAAAACAGTTACGTAGCAAATTCATTATGTGTTCATCGTAAAATAGCATTTTCTTCCTCTTTAATCCCTGATATATGAACATAAAAGACAATTTGCTATGATATAAATCTATTTGTCTTTTTACTTGATGTGTGATATAAACATTAATTTCATTTCTTAAAGCGCCCCGTTCTCGTTTACGTAATCATGTATTTTTATTCTGTTCCCTTTCCTTTCTTCCTCCCTATCCATGTATAATCTGTTTATTGTTTTTGATTTCACTTCCCCTCCCTATTTTTTCCTGTTTTTGAATTTATAACTTCAGAAAACATTGATTCTATACATAGAGTGTGATTTTTCGATCTTAATTAATCCAGATTGTATTTCGCTATCGTAATTTTCAATTGAATCTTCTTTTTCCGTTCTGTCAGTACAGGAAATAATTTCATTTTGTTCTTTTTTGTTTTCTCTTGTTGTTTTATGATTTATTCTCTTTTAATATAAACTTATCTATCTGAGTTTTCTCAAATAGATGTTTTGCTCTGAACTATTATATTTACATGCATATGATTAAATAGTTTGATTCATCATATTTAGTTCCTTCTCATTTTGTTCTTCAGTCCATCTTTTGCTAGTTATATTCAAAACGTT] [-] EMBL CD169215 [TATTTTTCTCTCACATTCACTTATTTATCTGTTTCACTTCTATAGTAACTTTTCTCATGTCACAAGTGTAAACTTTATTTACTCATAGTGTGTACGTTAACCTATTCAGCATATACAGAGAGTTGTCTGTGCTTTGTCGTTGATGTGAATATTGTTTTCAATGGAAATTGTTTACGTTATACGAGATCCATTCACAATTTTTAATTTCAAACGATTAATTTGCTTTACTATATTGTCCCTCTTCCAGCGTTTCTCTAGGCTGCACCTTGTTATATCAGTTTTAACTGCATATGAAAAGCATGTAATGGAATCTATCTTATTTTAATTTTCTTTGTTATCTGAAAATTAGAGAAAACTTACCGTATTCACATATTTTTAGTCCGACATTACGTTCTGTTTTTCCCCTGTGGAGATATTCGTGGTTACTATGACTTATTAAATCTAATGACTAATTTTTGCTTTGAAAGAAAACAGTTACGTAGCAAATTCATTATGTGTTCATCGTAAAATAGCA ] [-] EMBL CD169462 [ CTTTTCTCATGTCACAAGTGTAAACTTTATTTACTCATAGTGTGTACGTTAACCTATTCAGCATATACAGAGAGTTGTCTGTGCTTTGTCGTTGATGTGAACATTGTTTTCAATGGAAATTGTTTACGCTATACGAGATCCATTCACAATTTTTAATTTCAAACGATTAATTTGCTTTACTATATTGTCCCTCTTCCAGCGTTTCTCTAGGCTGCACCTTGTTATATCAGTTTTAACTGCATATGAAAAGCATGTAATGGAATCTATCTTATTTTAATTTTCTTTGTTATCTGAAAATTAGAGAAAACTTACCGTATTCACATATTTTTAGTCCGACATTACGTTCTGTTTTTCCCCTGTGGAGATATTCGTGGTTACTATGACTTATTAAATCTAATGACTAATTTTTGCTTTGAAAGAAAACAGTTACGTAGCAAATTCATTATGTGTTCATCGTAAAATAGCA ] [+] EMBL CD091389 [ TGAGTACGTTAACCTATTCAGCATATACAGAGAGTTGTCTGTGCTTTGTCGCTGATGTGAATATTGTTTTCAATGGAAATTGTTTACGTTATACGAGATCCATTCACAATTTTTAATTTCAAACGATTAATTTGCTTTACTATATTGTCCCTCTTCCAGCGTTTCTCTAGGCTGCACCTTGTTATATCAGTTTTAACTGCATATGAAAAGCATGTAATGGAATCTATCTTATTTTAATTTTCTTTGTTATCTGAAAATTAGAGAAAACTTACCGTATTCACATATTTTTAGTCCGACATTACGTTCTGTTTTTCCCCTGTGGAGATATTCGTGGTTACTATGACTTATTAAATCTAATGACTAATTTTTGCTTTGAAAGAAAACAGTTACGTAGCAAATTCATTATGTGTTCATCGTAAAATAGCATTTTCTTCCTCTTTAATCCCTGATATATGAACATAAAAGACAATTTGCTATGATATAAATCTATTTGTCTTTTTACTTGATGTGTGATATAAACATTAATTTCATTTCTTAAAGCGCCCCGTTCTCGTTTACGTAATCATGTATNTTTATTCTGT ] [-] EMBL CD067240 [ ATGGAAATTGTTTACGTTATACGAGATCCATTCACAATTTTTAATTTCAAACGATTAATTTGCTTTACTATATTGTCCCTCTTCCAGCGTTTCTCTAGGCTGCACCTTGTTATATCAGTTTTAACTGCATATGAAAAGCATGTAATGGAATCTATCTTATTTTAATTTTCTTTGTTATCTGAAAATTAGAGAAAACTTACCGTATTCACATATTTTTAGTCCGACATTACGTTCTGTTTTTCCCCTGTGGAGATATTCGTGGTTACTATGACTTATTAAATCTAATGACTAATTTTTGCTTTGAAAGAAAACAGTTACGTAGCAAATTCATTATGCGTTCATCGTAAAATAGCATTTTCTTCCTCTTTAATCCCTGATATATGAACATAAAAGACAATTTGCTATGATATAAATCTATTTGTCTTTTTACTTGATGTGTGATATAAACATTAATTTCATTTCTTAAAGCGCCCCGTTCTCGTTTACGTAATCATGTATTTTTATTC ] [-] EMBL CD160720 [ TAGCAAATTCATANTGTGTTCATCGTAAAATAGCATTTTCTTCCTCTTTAATCCCTGATATATGAACATAAAAGACAATTTGCTATGATATAAATCTATTTGTCTTTTTACTTGATGTGTGATATAAACATTAATTTCATTTCTTAAAGCGCCCCGTTCTCGTTTACGTAATCATGTATTTTTATTCT ] [+] EMBL AI976368 [ GTGTTCATCGTAAAATAGCATTTTCTTCCTCTTTAATCACTGATATATGAACATAAAAGACAATTTGCTATGATATAAATCTATTTGTCTTTTTACTTGATGTGTGATATAAACATTAATTTCATTTCTTAAAGCGCCCCGTTCTCGTTTACGTAATCATGTATTTTTATTCTGTTCCCTTTCCTTTCTTCCTCCCTATCCATGTATAATCTGTTTATTGTTTTTGATTTCACTTCCCCTCCCTATTTTTTCCTGTTTTTGAATTTATAACTTCAGAAAACATTGATTCTATACATAGAGTGTGATTTTTCGATCTTAATTAATCCAGATTGTATTTCGCTATCGTAATTTTCAATTGAATCTTCTTTTTCCGTTCTGTCAGTACAGGAAATAATTTCATTTTGGTCTTTTTTGGTTTCTCTTGTTGTTCTATGATTTATTCTCTTTTAATATAAACTTATCTATCTGAGTTTTCTCAAATAGATGTTTTGCTCTGAACTATTATATTTA ] [-] EMBL CD090174 [ TTCCTGTTTTTGAATTTATAACTTCAGAAAACATTGATTCTATACATAGAGTGTGATTTTTCGATCTTAATTAATCCAGATTGTATTTCGCTATCGTGATTTTCAATTGAATCTTCTTTTTCCGTTCTGTCAGTACAGGAAATAATTTCATTTTGTTCTTTTTTGTTTTCTCTTGTTGTTTTATGATTTATTCTCTTTTAATATAAACTTATCTATCTGAGTTTTCTCAAATAGATGTTTTGCTCTGAACTATTACATTTACATGCATATGATTAAATAGTTTGATTCATCATATTTAGTTCCTTCTCATTTTGTTCTTCAGTCCATCTTTTGCTAGTTATATTCAAAACGTT] [+] EMBL SMAA69086 [ ATTTCGCTATCGTAATTTTCAATTGAATCTTCTTTTTCCGTTCTGTCAGTACAGGAAATAATTTCATTTTGTTCTTTTTTGTTTTCTCTTGTTGTTTTATGATTTATTCTCTTTTAATATAAACTTATCTATCTGAGTTTTCTCAAATAGATGTTTTGCTCTGAACTATTATATTTACATGCATATGATTAAGTAGTTTGATTCATCATATTTAGTTCCTTCTCATTTCGTTCTTCAGTCCATCTTTTGCTAGTTATATTCAAAACGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||