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Schistosoma mansoni
cluster # 8977 cluster # 8977       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8977#0 length = 589 sequences # 8  

consensusID : consensus_8977#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 589
fasta sequence
                              [ATTGGGATTTATTCTAACTAGTTCGTGATTGGTAAAACCTCTTCGGGTCAAAAAGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT-AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT-CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC]

[+] EMBL CD187442             [ATTGGGATTTATTCTAACTAGTTCGTGATTGGTAAAACCTCTTCGGGTCAAAAAGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAA                                                                                                              ]
[+] EMBL CD122342             [                                                 AAAAAGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCAT ]
[+] EMBL CD122318             [                                                 AAAAGGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTTTATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCATAAAATACTtg                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD122304             [                                                 AAAAAGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCATGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCA                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD122323             [                                                                                                                                                                   GTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC]
[-] EMBL CD122332             [                                                                                                                                                                                                                                              GAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC]
[-] EMBL CD122316             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTGTGGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCGATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC]
[-] EMBL CD122298             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTATCTACAANACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACCACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCATAATAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC]


>consensus_8977#0 ATTGGGATTTATTCTAACTAGTTCGTGATTGGTAAAACCTCTTCGGGTCAAAAAGTTATC TGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGT GATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTT GCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGA AATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAAT ACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCA TCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCATAAATACTGTAAATGAACAACCAACA AAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAA CATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCATCTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAG CTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)