These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8977#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 589 fasta sequence [ATTGGGATTTATTCTAACTAGTTCGTGATTGGTAAAACCTCTTCGGGTCAAAAAGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT-AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT-CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC] [+] EMBL CD187442 [ATTGGGATTTATTCTAACTAGTTCGTGATTGGTAAAACCTCTTCGGGTCAAAAAGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAA ] [+] EMBL CD122342 [ AAAAAGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCAT ] [+] EMBL CD122318 [ AAAAGGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTTTATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCATAAAATACTtg ] [+] EMBL CD122304 [ AAAAAGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCATGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCA ] [-] EMBL CD122323 [ GTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC] [-] EMBL CD122332 [ GAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC] [-] EMBL CD122316 [ TTGTGGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCGATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC] [-] EMBL CD122298 [ TTATCTACAANACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACCACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCATAATAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||