cluster # 8985

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Schistosoma mansoni
cluster # 8985 cluster # 8985 Sequences # 8 consensus # 2

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consensus_8985#0 length = 898 sequences # 7

consensus_8985#1 length = 258 sequences # 1

consensusID : consensus_8985#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 898
fasta sequence

                              [GTGACTTTTAGAGTATCCGAATTTTTCTTACCAGTCAGTCTTCAGTCAGTCTGTCTTCAGTCAGTCTTCAGTAATAAGGATAATTTCCTTCCAGTGAAGGTCCAGCTTCTTTTTGAAAATGTTCACTGATGGTGCTGATACCACTTGTTCTGGGTGGTGCTGTGGGTGATATAATCAATCATAATGATCCTGTGTTTCTAATGATTTGCTTAAAGTTTTTAAATACATGTCCAAAATCCCCTTGTTTGATTACGTCAAATGTTCCAATAGTAATCAGACGTGATACCCTCAGTTTTGGTCCTACGTTTATCAAAAAATCACAATCTTACAAAGAAAGAAGACTGCTAGGTTATTCTCCGGAAAACATGTTTGATATTGCAATTGACGTTGGTCGTTATTCAGAATTTCTACCTTGGTGTAACCAATCAACTGTTTTGGAACAAGGTGAAAATAACATGCTAGCTTGTCTGGGTGTTGGATTTCCTCCACTTAGTGAATCATATATGTCTCGAATAACATTTCAGCGACCGAAGCACTTAAAGTCTGTCGCACAAAATACTGGAATGTTTCATCATTTAATTAATGAATGGTATTTTCATCCAGGTCTCCCAGACAATCCGAATTCTTGTTATGTAGAGTTTTCCGTGGATTTCGAATTTCGTTCACCACTTTATTCAAAAATTGCTGGATTATTTTTTGATCAAGTTGTTACTGTTATGGTAAATGCTTTTATGAATCGTGCTAAAGTACTACATGGTAAACCATCCATTGCTTCTCAAAAGCCAAACATATTAATTTATAATAAATAATACTATAATTTTTATATAGTTGTGATCATTTGTTCAATATATAAGCGAACAGATTATTATTTTTTTGTAAAATTATAAATAAAAACAAC]

[+] EMBL CD079048             [GTGACTTTTAGAGTATCCGAATTTTTCTTACCAGTCAGTCTTCAGTCAGTCTGTCTTCAGTCAGTCTTCAGTAATAAGGATAATTTCCTTCCAGTGAAGGTCCAGCTTCTTTTTGAAAATGTTCACTGATGGTGCTGATACCACTTGTTCTGGGTGGTGCTGTGGGTGATATAATCAATCATAATGATCCTGTGTTTCTAATGATTTGCTTAATGTTTTTAAATACATGTCCAAAATCCCCTTGTTTGATTACGTCAAATGTTCCAATAGTAATCAGACGTGATACCCTCAGTTTTGGTCCTACGTTTATCAAAAAATCACAATCTTACAAAGAAAGAAGACTGCTAGGTTATTCTCCGGAAAACATGTTTGATATTGCAATTGACGTTGGTCGTTATTCAGAATTTCTACCTTGGTGTAACCAATCAACTGTTTTGGAACAAGGTGAAAATAACATGCTAGCTTGTCTGGGTGTTGGATTTCCTCCACTTAGTGAATCATATATGTCTCGAATAACATTTCAGCGACCGAAGCACTTANAGTCTGTCGCACANAATACTGGAATGTTTCATCATTTAATTAATGAATGGTATTTTCATCCAGGTCTCCCAGACAATCCGAATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI976553             [                                                               GTCTTCAGTAATAAGGATAATTTCCTTCCAGTGAAGGTCCAGCTTCTTTTTGAAAATGTTCACTGATGGTGCTGATACCACTTGTTCTGGGTGGTGCTGTGGGTGATATAATCAATCATAATGATCCTGTGTTTCTAATGATTTGCTTAAAGTTTTTAAATACATGTCCAAAATCCCCTTGTTTGATTACGTCAAATGTTCCAATAGTAATCAGACGTGATACCCTCAGTTTTGGTCCTACGTTTATCAAAAAATCACAATCTTACAAAGAAAGAAGACTGCTAGGTTATTCTCCGGAAAACATGTTTGATATTGCAATTGACGTTGGTCGTTATTCAGAATTTCTACCTTGGTGTAACCAATCAACTGTTTTGGAACAAGGTGAAAATAACATGCTAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BF936669             [                                                                                                                                                                          ATAATCAATCATAATGATCCTGTGTTTCTAATGATTTGCTTAAAGTTTTTAAATACATGTCCAAAATCCCCTTGTTTGATTACGTCAAATGTTCCAATAGTAATCAGACGTGATACCCTCAGTTTTGGTCCTACGTTTATCAAAAAATCACAATCTTACAAAGAAAGAAGACTGCTAGGTTATTCTCCGGAAAACATGTTTGATATTGCAATTGACGTTGGTCGTTATTCAGAATTTCTACCTTGGTGTAACCAATCAACTGTTTTGGAACAAGGTGAAAATAACATGCTAGCTTGTCTGGGTGTTGGATTTCCTCCACTTAGTGAATCATATATGTCTCGAATAACATTTCAGCGACCGAAGCACTTAAAGTCTGTCGCACAAAATACTGGAATGTTTCATCATTTAATTAATGAATGGTATTTTCATCCAGGTCTCCCAGACAATCCGAATTCTTGTTATGTAGAGTTTTCCGTGGATTTCGAATTTCGTTCACCACTTTATTCAAAAATTGCTGGATTATTTTTTGATCAAGTTGTTACTGTTATGGTAAATGCTTTTATGAATCGTGCTAAAGTACTACATGGTAAACCATCCATTGC                                                                                                                              ]
[+] EMBL AI975591             [                                                                                                                                                                          ATAATCAATCATAATGATCCTGTGTTTCTAATGATTTGCTTAAAGTTTTTAAATACATGTCCAAAATCCCCTTGTTTGATTACGTCAAATGTTCCAATAGTAATCAGACGTGATACCCTCAGTTTTGGTCCTACGTTTATCAAAAAATCACAATCTTACAAAGAAAGAAGACTGCTAGGTTATTCTCCGGAAAACATGTTTGATATTGCAATTGACGTTGGTCGTTATTCAGAATTTCTACCTTGGTGTAACCAATCAACTGTTTTGGAACAAGGTGAAAATAACATGCTAGCTTGTCTGGGTGTTGGATTTCCTCCACTTAGTGAATCATATATGTCTCGAATAACATTTCAGCGACCGAAGCACTTAAAGTCTGTCGCACAAAATACTGGAATGTTTCATCATTTAATTAATGAATGGTATTTTCATCCAGGTCTCCCAGACAATCCGAATTCTTGTTATGTAGAGTTTTCCGTGGATTTCGAATTTCGTTCACCACTCTATTCAAAAAT                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BF936671             [                                                                                                                                                                          ATAATCAATCATAATGATCCTGTGTTTCTAATGATTTGCTTAAAGTTTTTAAATACATGTCCAAAATCCCCTTGTTTGATTACGTCAAATGTTCCAATAGTAATCAGACGTGATACCCTCAGTTTTGGGCCTACGTTTATCAAAAAATCACAATCTTACAAAGAAAGAAGACTGCTAGGTTATTCTCCGGAAAACATGTTTGATATTGCAATTGACGTTGGTCGTTATTCAGAATTTCTACCTTGGTGTAACCAATCAACTGTTTTGGAACAAGGTGAAAATAACATGCTAGCTTGTCTGGGTGTTGGATTTCCTCCACTTAGTGAATCATATATGTCTCGAATAACATTTCAGCGACCGAAGCACTTAAAGTCTGTCGCACAAAATACTGGAATGTTTCATCATTTAATTAATGAATGGTATTTTCATCCAGGTCTCCCAGACAATCCGAATTCTTGTTATGTAGAGTTTTCCGTGGATTTCGAATTTCGTTCACCACTTTATTCAAAAATTGCTGGATTATTTTTTGATCAAGTTGTTACTGTTATGGTAAATGCTTTTATGAATCGTGCTAAAGTACTACATGGTAAACCATCCATTGCTTCTCAAAAGCCAAACATATTAATTTATAATAAAT                                                                                           ]
[-] EMBL CD073501             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACTGCTAGGTTATTCTCCGGAAAACATGTTTGATATTGCAATTGACGTTGGTCGTTATTCAGAATTTCTACCTTGGTGTAACCAATCAACTGTTTTGGAACAAGGTGAAAATAACATGCTAGCTTGTCTGGGTGTTGGATTTCCTCCACTTAGTGAATCATATATGTCTCGAATAACATTTCAGCGACCGAAGCACTTAAAGTCTGTCGCACAAAATACTGGAATGTTTCATCATTTAATTAATGAATGGTATTTTCATCCAGGTCTCCCAGACAATCCGAATTCTTGTTATGTAGAGTTTTCCGTGGATTTCGAATTTCGTTCACCACTTTATTCAAAAATTGCTGGACTATTTTTTGATCAAGTTGTTACTGTTATGGTAAATGCTTTTATGAATCGTGCTAAAGTACTACATGGTAAACCATCCATTGCTTCTCAAAAGCCAAACATATTAATTTATAATAAATAATACTATAATTTTTATATAGTTGTGATCATTTGTTCAATATATAAGCGAACAGATTATTATTTTTTTGTAAAATTATAAATAAAAACAAC]
[+] EMBL BF936783             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAAAACATGTTTGATATTGCAATTGACGTTGGTCGTTATTCAGAATTTCTACCTTGGTGTAACCAATCAACTGTTTTGGAACAAGGTGAAAATAACATGCTACCTTGTCTGGGTGTTGGATTTCCTCCACTTATTGAATCATATATGTCTCGAATAACATTTCAGCGACCGAAGCACTTAAAGTCTGTCGCACAAAATACTGGAATGTTCCATCATTTAATTAATGAATGGTATTTTCATCCAGGTCTCCCAGACAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]




>consensus_8985#0
GTGACTTTTAGAGTATCCGAATTTTTCTTACCAGTCAGTCTTCAGTCAGTCTGTCTTCAG
TCAGTCTTCAGTAATAAGGATAATTTCCTTCCAGTGAAGGTCCAGCTTCTTTTTGAAAAT
GTTCACTGATGGTGCTGATACCACTTGTTCTGGGTGGTGCTGTGGGTGATATAATCAATC
ATAATGATCCTGTGTTTCTAATGATTTGCTTAAAGTTTTTAAATACATGTCCAAAATCCC
CTTGTTTGATTACGTCAAATGTTCCAATAGTAATCAGACGTGATACCCTCAGTTTTGGTC
CTACGTTTATCAAAAAATCACAATCTTACAAAGAAAGAAGACTGCTAGGTTATTCTCCGG
AAAACATGTTTGATATTGCAATTGACGTTGGTCGTTATTCAGAATTTCTACCTTGGTGTA
ACCAATCAACTGTTTTGGAACAAGGTGAAAATAACATGCTAGCTTGTCTGGGTGTTGGAT
TTCCTCCACTTAGTGAATCATATATGTCTCGAATAACATTTCAGCGACCGAAGCACTTAA
AGTCTGTCGCACAAAATACTGGAATGTTTCATCATTTAATTAATGAATGGTATTTTCATC
CAGGTCTCCCAGACAATCCGAATTCTTGTTATGTAGAGTTTTCCGTGGATTTCGAATTTC
GTTCACCACTTTATTCAAAAATTGCTGGATTATTTTTTGATCAAGTTGTTACTGTTATGG
TAAATGCTTTTATGAATCGTGCTAAAGTACTACATGGTAAACCATCCATTGCTTCTCAAA
AGCCAAACATATTAATTTATAATAAATAATACTATAATTTTTATATAGTTGTGATCATTT
GTTCAATATATAAGCGAACAGATTATTATTTTTTTGTAAAATTATAAATAAAAACAAC

consensusID : consensus_8985#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 258
fasta sequence

                              [ATAGATGGGCTGCGTGCACCAATGACAAGAACCCACTTCCTCCAGTTACAAGGCACTTGAGTAATATGGGTCCCCGCTAAACATATGGCTCAGGATACAGCTTAAACTCACAGAATTGCATCCATGCTAAATGCTTAACACTTAACCCCACCGGGATTGTTATGACTGACAAATGACTCCTGTAGTTACGCTCAATACCGCCTTCCATAGGAGTAGCCACCCACCACTAAGCTCAACGACCATATAGGAGACTGAGTG]

[+] EMBL CD122566             [ATAGATGGGCTGCGTGCACCAATGACAAGAACCCACTTCCTCCAGTTACAAGGCACTTGAGTAATATGGGTCCCCGCTAAACATATGGCTCAGGATACAGCTTAAACTCACAGAATTGCATCCATGCTAAATGCTTAACACTTAACCCCACCGGGATTGTTATGACTGACAAATGACTCCTGTAGTTACGCTCAATACCGCCTTCCATAGGAGTAGCCACCCACCACTAAGCTCAACGACCATATAGGAGACTGAGTG]




>consensus_8985#1
ATAGATGGGCTGCGTGCACCAATGACAAGAACCCACTTCCTCCAGTTACAAGGCACTTGA
GTAATATGGGTCCCCGCTAAACATATGGCTCAGGATACAGCTTAAACTCACAGAATTGCA
TCCATGCTAAATGCTTAACACTTAACCCCACCGGGATTGTTATGACTGACAAATGACTCC
TGTAGTTACGCTCAATACCGCCTTCCATAGGAGTAGCCACCCACCACTAAGCTCAACGAC
CATATAGGAGACTGAGTG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8985#0      GTGACTTTTAGAGTATCCGAATTTTTCTTACCAGTCAGTCTTCAGTCAGTCTGTCTTCAG 60
consensus_8985#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8985#0      TCAGTCTTCAGTAATAAGGATAATTTCCTTCCAGTGAAGGTCCAGCTTCTTTTTGAAAAT 120
consensus_8985#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8985#0      GTTCACTGATGGTGCTGATACCACTTGTTCTGGGTGGTGCTGTGGGTGATATAATCAATC 180
consensus_8985#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8985#0      ATAATGATCCTGTGTTTCTAATGATTTGCTTAAAGTTTTTAAATACATGTCCAAAATCCC 240
consensus_8985#1      -------------------------ATAGATGGGCTGCGTGCACCAATGACAAGAACCCA 35
                                                *   *    *   *  *   *** * * ** ** 

consensus_8985#0      CTTGTTTGATTACGTCAAATGTTCCAATAGTAATCAGACGTGATACCCTCAGTTTTGGTC 300
consensus_8985#1      CTTCCTCCAGT-TACAAGGCACTTGAGTAATATGGGTCCCCGCTAAACATA----TGGCT 90
                      ***  *  * *     *     *  * ** **      *  * **  *  *    ***  

consensus_8985#0      CTACGTTTATCAAAAAATCACAATCTTACAAAGAAAGAAGACTGCTAGGTTATTCTCCGG 360
consensus_8985#1      CAGGATACAGCTTAAACTCACAGAATTGCATCCATGCTAAATGCTTAACACTTAACCCCA 150
                      *    *  * *  *** *****   ** **   *    * *    **     *   **  

consensus_8985#0      AAAACATGTTTGATATTG-CAATTGACGTTGGTCGTTATTCAGAATTTCTACCTTGGTGT 419
consensus_8985#1      CCGGGATTGTTATGACTGACAAATGACTCCTGTAGTTACGCTCAATACCGCCTTCCATAG 210
                           **  **   * ** *** ****    ** ****  *  ***  *  * *   *  

consensus_8985#0      AACCAATCAACTGTTTTGGAACAAGGTGAAAATAACATGCTAGCTTGTCTGGGTGTTGGA 479
consensus_8985#1      GAGTAGCCACCCACC-----ACTAAGCTCAACGACCATATAGGA--GACTGAGTG----- 258
                       *  *  ** *         ** * *   **  * ***    *   * *** ***     

consensus_8985#0      TTTCCTCCACTTAGTGAATCATATATGTCTCGAATAACATTTCAGCGACCGAAGCACTTA 539
consensus_8985#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8985#0      AAGTCTGTCGCACAAAATACTGGAATGTTTCATCATTTAATTAATGAATGGTATTTTCAT 599
consensus_8985#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8985#0      CCAGGTCTCCCAGACAATCCGAATTCTTGTTATGTAGAGTTTTCCGTGGATTTCGAATTT 659
consensus_8985#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8985#0      CGTTCACCACTTTATTCAAAAATTGCTGGATTATTTTTTGATCAAGTTGTTACTGTTATG 719
consensus_8985#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8985#0      GTAAATGCTTTTATGAATCGTGCTAAAGTACTACATGGTAAACCATCCATTGCTTCTCAA 779
consensus_8985#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8985#0      AAGCCAAACATATTAATTTATAATAAATAATACTATAATTTTTATATAGTTGTGATCATT 839
consensus_8985#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8985#0      TGTTCAATATATAAGCGAACAGATTATTATTTTTTTGTAAAATTATAAATAAAAACAAC 898
consensus_8985#1      -----------------------------------------------------------