These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8988#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 553 fasta sequence [GATTCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAATTCATATTCTGTATTTGCTTCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTT-GGCAGTAAGTTGTTTTGGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACAAATAAGTAGCTCCTTCAGTTAATCCTGTGATACGATGTACAAATGGTTCTTCGTCATCAGATGTTTTCGATTTTGAACTAATATTTGCAATTGACTTCCACTCTTTAGCCTGAGAACGTAAAACACCTCCAGGTTCAGGAGCCAATTGACGTTGTTCAATTTTGTATCCTGTCAATGGGCTACCACCATCATCTTCAGGTGGTTTCCATAATA] [+] EMBL CD067130 [GATTCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACCAAATACATATTCTGTATTTGCTTGAAGATTATCAATTTGTGCCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGGCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACA ] [+] EMBL CD066512 [ TCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAATTCATATTCTGTATTTGCTTCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTC ATAGTGGAATGATTTATTGGTTTGGGCAGT AGTTGGTTTTGAATTTTCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACAAATAAGTAGCTCCTTCAGTTAATCCTGTGATACGATGTACAAATGGTTCTTCGTCATCAGATGTTTTCGATTTTGAACTAATATTTGCAATTGACTTCCACTCTTTAGCCTGAGAACGTAAAACACCT ] [+] EMBL CD066529 [ TCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAGTTCATATTCTGTATTTGCTTCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTT GGCAGTAAGTTGTTTTGGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACAAATAAGTAGCTCCTTCAGTTAATCCTGTGATACGATGTACAAATGGTTCTTCGTCATCAGATGTTTTCGATTTTGAACTAATAT ] [+] EMBL CD066414 [ TCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAATTCATATTCTGTATTTGCTTCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTT GGCAGTAAGTTGTTTTGGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACA ] [+] EMBL CD066775 [ TCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAATTCATATTCTGTATTTGCTTCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATCGAGTCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTT GGCAGTAAGTTGTTTTGGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAA ] [+] EMBL CD066643 [ TCACTTTTACCACCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAATTCATATTCTGTATTTGCTTCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGATACATCCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTG ] [-] EMBL CD184874 [ ATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTT GGCAGTAAGTTGTTTTGGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACAAATAAGTAGCTCCTTCAGTTAATCCTGTGATACGATGTACAAATGGTTCTTCGTCATCAGATGTTTTCGATTTTGAACTAATATTTGCAATTGACTTCCACTCTTTAGCCTGAGAACGTAAAACACCTCCAGGTTCAGGAGCCAATTGACGTTGTTCAATTTTGTATCCTGTCAATGGGCTACC ] [-] EMBL CD186918 [ TTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTT GGCAGTAAGTTGTTTTGGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACAAATAAGTAGCTCCTTCAGTTAATCCTGTGATACGATGTACAAATGGTTCTTCGTCATCAGATGTTTTCGATTTTGAACTAATATTTGCAATTGACTTCCACTCTTTAGCCTGAGAACGTAAAACACCTCCAGGTTCAGGAGCCAATTGACGTTGTTCAATTTTGTATCCTGTCAATGGGCTACCACCATCATCTTCAGGTGGTTTCCATAATA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||