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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8991#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 801 fasta sequence
[AAGACTCTTCATTAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCGAAGTAGATTTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTACGTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCAGAAATTGAAACTAAGCTGACAGCGTCAATCGCTATTTTCAAGTATATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAGTAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATGCTGCTATCCTACTATTTTTTG]
[+] EMBL BF936105 [AAGACTCTTCATTAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCACAGTATATTTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTATGTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCATAAATTGAAACTAATCTGACAGCGTCAATCGCTATTTTCAAGTGTATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGA ]
[+] EMBL CD150054 [ CTTGATTAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCGAAGTAGATTTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAAT GTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTG ]
[+] EMBL CD118532 [ TAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCGAAGTAGATTTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTACGTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCAGAAACTGAAACTAAGCTGACAGCGTCAATCGCTATTTTCAAGTATATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTC ]
[+] EMBL CD083421 [ CTTAAATCTCCGAAGTAGA TTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTACGTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCAGAAATTGAAACTAAGCTGACAGCGTCAATCGCTATTTTCAAGTATATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCTGAGTTAA ]
[+] EMBL CD156128 [ TGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCTACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTCACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAG ]
[+] EMBL CD161869 [ GTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAGTAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATGCTGCTATCCTACTATTTTTTG]
[+] EMBL CD161791 [ GTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCAGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCCAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAGTAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATGCTGCTATCCTACTATTTTTTG]
[+] EMBL CD161884 [ GTGATTAATCAGCTAAAAACTGGGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAGTAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATGCTGCTATCCTACTATTTTTTG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||