These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9013#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 848 fasta sequence [GGTTTTCGTGCTTCCAGTGAAGTTGATACCAGCAAGTTGAGGGTGCTCACAAATTACTTTACCAAATGTTGGGCCATCTGCTGGGACAAAGTTGATTACGCCAGGGGGTAAACCTGCTTCGCGGAATAACCTGTAAACAAGGTAATTAGAATATACGGATGTATCAGAGGGTTTCCAAATCACAACATTCCCCATTAAAGCTGGGGCACTTGCTAGGTTCCCTGCAATAGCGGTAAAATTAAATGGTGATATAGCAGCCCAAAACCCTTCATTTGCTCGGTAAACTACTTTATTCTTTGCATCCTGGGTATTGATTGGTTTATATCGCAGAGCTTCTGAGGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAATTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCATCAAAACTTGTACGTGACCACGTTTTGCGAGCTATTAAACAAGACTCAATTGCACTTTTGATTTGCTCTCCTGAGGCATGATAAAAATTGGCCAATGTTTTCGAATGCTCAAATGGCAAAATCTGCCTTCGAGGTTGTCCGGATGATAACTCGTTTGAATCAATGCATATAGGCACATGATAAGGCCCGTTCGAAATCATAGTATCCAACGTACTATCCAACCTCTGACGTTCCGTACTACCAGGCTTATGCAACAGAACTGGTTCGTTTGTGACCTGGAAAAGTCTGCTCAGTAGTTTTTGATACTGCCATTTCGGAACACAACGACAAACGTTACACGACC] [+] EMBL CD060833 [GGTTTTCGTGCTTCCAGTGAAGTTGATACCAGCAAGTTGAGGGTGCTCACAAATTACTTTACCAAATGTTGGGCCATCTGCTGGGACAAAGTTGATTACGCCAGGGGGTAAACCTGCTTCGCGGAATAACCTGTAAACAAGGTAATTAGAATATACGGATGTATCAGAGGGTTTCCAAATCACAACATTCCCCATTAAAGCTGGGGCACTTGCTAGGTTCCCTGCAATAGCGGTAAAATTAAATGGTGATATAGCAGCCCAAAACCCTTCATTTGCTCGGTAAACTACTTTATTCTTTGCATCCTGGGTATTGATTGGTTTATATCGCAGAGCTTCTGAGGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAATTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTC ] [-] EMBL CD159215 [ ATTACGCCAGGGGGTAAACCTGCTTCGCGGAATAACCTGTAAACAAGGTAATTAGAATATACGGATGTATCAGAGGGTTTCCAAATCACAACATTCCCCATTAAAGCTGGGGCACTTGCTAGGTTCCCTGCAATAGCGGTAAAATTAAATGGTGATATAGCAGCCCAAAACCCTTCATTTGCTCGGTAAACTACTTTATTCTTTGCATCCTGGGTATTGATTGGTTTATATCGCAGAGCTTCTGAGGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAATTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCATCAAAACTTGTACGTGACCACGTTTTGCGAGCTATTAAACAAGACT ] [+] EMBL CD166544 [ tccatTCAGAGGGTT CAAATCACAACATTCCCCATT AAGCTGGGGCACTTGCTAGGTTCCCTGCAATAGCGGTAAAATTAAATGGTGATATAGCAGCCCAAAACCCTTCATTTGCTCGGTAAACTACTTTATTCTTTGCATCCTGGGTATTGATTGGTTTATATCGCAGAGCTTCTGAGGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAATTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCATCAAAACTTGTACGTGACCACGTTTTGCGAGCTATTAAACAAGACTCAATTGCACTTTTGATTTGCTCTCCTGAGGCATGATAAAAATTGGCCAATGTTTTCGAATGCTCAAATGGCAAAATCTGCCTTCGAGGTTGTCCGGATGATAACTCGT ] [+] EMBL CD152895 [ ATCACAACATTCCCCATTAAAGCTGGGGCACTTGCTAGGTTCCCTGCAATAGCGGTAAAATTAAATGGTGATATAGCAGCCCAAAACCCTTCATTTGCTCGGTAAACTACTTTATTCTTTGCATCCTGGGTATTGATTGGTTTATATCGCAGAGCTTCTGAGGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAATTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCAACAAAACTTGTACGTGACCACGTTTTGCGAGCTATTAAACAAGACTCAATTGCACTNTTGATTTGCTCTCCTGAGGCATGATAAAA ] [+] EMBL CD189580 [ GGTTTATATCGCAGAGCTTCTGAAGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAGTTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCATCAAAACTTGTACGTGACCACGTTTTGCGAGCTATTAAACAAGACTCAATTGCACTTTTGATTTGCTCTCCTGAGGCATGATAAAAATTGGCCAATGTTTTCGAATGCTCAAATGGCAAAATCTGCCTTCGAGGTTGTCCGGATGATAACTCGTTTGAATCAATGCATATAGGCACATGATAAGGCCCGTTCGAAATCATAGTATCCAACGTACTATCCAACCTCTGACGTTCCGTACTACCAGGCTTATGCAACAGAACTGGT ] [-] EMBL CD133457 [ GTTTATATCGCAGAGCTTCTGAGGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAATTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCATCAAAACTTGTACGTGACCACGTTTTGCGAGCTATTAAACAAGACTCAATTGCACTTTTGATTTGCTCTCCTGAGGCATGATAAAAATTGGCCAATGTTTTCGAATGCTCAAATGGCAAAATCTGCCTTCGAGGTTGTCCGGATGATAACTCGTTTGAATCAATGCATATAGGCACATGATAAGGCCCGTTCGAAATCATAGTATCCAACGTACTATCCGACCTCTGACGTTCCGTACTACCAGGCTTATGCAACAGAACTGGTT ] [+] EMBL CD189221 [ TTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCATCAAAACTTGT ] [-] EMBL CD152685 [ GAATCAATGCATATAGGCACATGATAAGGCCCGTTCAAAATCATAGTATCCAACGTACTATCCAACCTCTGACGTTCCGTACTACCAGGCTTATGCAACAGAAATGGTTCGTTTGTGACCTGGAAAAGTCTGCTCAGTAGTTTTTGATACTGCCATTTCGGAACACAACGACAAACGTTACACGACC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||