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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9015#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1461 fasta sequence
[TTCACCGACCCTACACCATATTCCGAATGCGGCCTCACAAAATTTGTTTGGAAGCGAAATGAAATACTTGATTCCCAAAATCTAATTGCATGAACCTATTTTGGCTGTTTAACCATAAAATTTTACTAATACGTCTTAAATATTTGCAGTTTATTGTATACTCAATCCAGTCCTCGAGTTTTACCAACATTTACCAAAACTTTATCTTTTACTGTATCATTTACTTGGTGGCCATTAAAATTATGGAAAAAGAAAGATATACATGAACAGTGTCAACAACTATTCAATGATTCCTTATTTCATATATCTATGGGTGAATTTAGTGTGGCAAATGATAAGTTACATGAACTATTGTGGTTTATCAACCAATCTTATCAAAATAATGAGTTAACCAATCGCGACTACATCAATAAACGTGCACG-AATATGTTCCGAGATGGCAAATCTAAATCTACTTATGGGAAATTATTCAGAAGTAGAAAAATTAATTAAACAGACAATGGAGGATTGTTTAACAGCCCAAATATCACCAAACGATGCAATGTTTATTGAGCTGTCACTTAAAATGTCCATGCTTTTCGAAAAGTTTGGTAGATTAGGTGA-GCTCAAAGATNCTTTCGATTCTGTATAGAAAATCA-GGAGAAA-AAGATGACAAGTTTCGATGAAAATATTGACCATATAAATGAAAAAGCTTTACTAGGAATGTGTTGTAATTATTTTAGCAAATTTCTCTTTGCGAATCAAAGACAAACAGAAGCTTTAGTTTATGCCCAACGAGCTTATGAAATCGCCAGTCAAATTTATCCTTTAGACCATGCGAATTGTTTAAATTTATTAATTGATATTAGCGTTATCCATGCTGATTTAAATGAATTTATGGAGTCTCAACGTATTCTTAAACAAGTTATTCAAACAAGTCAAACCAAGTATCAATCTTTCGTTGATAATTACTCTAATGATAATGAACTACTGAAATCAAACCTTTCAAAAC-ACATGAAATGCACGAAACTGTGTATACTCTAATACATTCAATATTACAATTAGCCGCTGTTGATTTAATGTTGGGAAAACCAGAATCTGTGAAGCAGTTATTGTTACAAGCTGATCACATCATAAATCAAATTGACCAATTGGGTTTGAAAGTCTCTATGTACCGCAAACATATTAACGATTTCAAAATGGAACATCATTTTCAAATCTAAAAATATCTTCGTCCCCTTCATCCTTGTTGTTTTCTCGTTGAATTTTTCTCTATAAAGATNTATATGAATGTATTTTAAAGTGAGTTATATTACAAATGACTAGAATTGTCTGTATATTTGAGTGACTTGACGAGGCTACTTTCTTATGTTCATGATAATTGCTGTAAGTCATTCTTTTCTCCTATCTTTTTACCATTATATCTTGTCGATTAGTACCGCTAAAATGCTCTTTTTAGTTTTACAATTCACATTGTTTTACT]
[+] EMBL AI977722 [TTCACCGACCCTACACCATATTCCGAATGCGGCCTCACAAAATTTGTTTGGAAGCGAAATGAAATACTTGATTCCCAAAATCTAATTGCATGAACCTATTTTGGCTGTTTAACCATAAAATTTTACTAATACGTCTTAAATATTTGCAGTTTATTGTATACTCAATCCAGTCCTCGAGTTTTACCAACATTTACCAAAACTTTATCTTTTACTGTATCATTTACTTGGTGGCCATTAAAATTATGGAAAAAGAAAGATATACATGAACAGTGTCAACAACTATTCAATGATTCCTTATTTCATATATCTATGGGTGAATTTAGTGTGGCAAATGATAAGTTACATGAACTATTGTGGTTTATCAACCAATCTTATCAAAATAATGAGTTAACCAATCGCGACTACATCAATAAACGTGCACG AATATGTTCCGAGATGGCAAATCTAAATCTACTTATGGGAAATTATTCAGAAGTAGAAAAATTAATTAAACAGACAATGGAGGATTGTTTAACAGCCCAAATATCACCAAACGATGCAATGTTTATTGAGCTGTCACTTAAAATGTCCATGCTNTTCGAAAAGTTTGGTAGATTA ]
[+] EMBL AI976999 [ GAATGCGGCCTCACAAAATTTGTTTGGAAGCGAAATGAAATACTTGATTCCCAAAATCTAATTGCATGAACCTATTTTGGCTGTTTAACCATAAAATTTTACTAATACGTCTTAAATATTTGCAGTTTATTGTATACTCAATCCAGTCCTCGAGTTTTACCAACATTTACCAAAACTTTATCTTTTACTGTATCATTTACTTGGTGGCCATTAAAATTATGGAAAAAGAAAGATATACATGAACAGTGTCAACAACTATTCAATGATTCCTTATTTCATATATCTATGGGTGAATTTAGTGTGGCAAATGATAAGTTACATGAACTATTGTGGTTTATCAACCAATCTTATCAAAATAATGAGTTAACCAATCGCGACTACATCAATAAACGTGCACGCAAT TGTTCCGAGATGGCAAATCTAAATCTACTTATGGGAAATTATTCAGAAGTAGAAAAATTAATTAAACAGACAATGGAGGATTGTTTAACAG ]
[-] EMBL CD128881 [ CTCTTACTGTATCATTTACTTGGTGGCCATTAAAATTATGGAAAAAGAAAGATATACATGAACAGTGTCAACAACTATTCAATGATTCCTTATTTCATATATCTATGGGTGAATTTAGTGTGGCAAATGATAAGTTACATGAACTATTGTGGTTTATCAACCAATCTTATCAAAATAATGAGTTAACCAATCGCGACTACATCAATAAACGTGCACG AATATGTTCCGAGATGGCAAATCTAAATCTACTTATGGGAAATTATTCAGAAGTAGAAAAATTAATTAAACAGACAATGGAGGATTGTTTAACAGCCCAAATATCACCAAACGATGCAATGTTTATTGAGCTGTCACTTAAAATGTCCA GCTTTTCGAAAAGTTTGGTAGATTAGGTGA GCTCAAAGATNC ]
[+] EMBL CD078430 [ CCAATCGCGACTACATCAATAAACGTGCACG AATATGTTCCGAGATGGCAAATCTAAATCTACTTATGGGAAATTATTCAGAAGTAGAAAAATTAATTAAACAGACAATGGAGGATTGTTTAACAGCCCAAATATCACCAAACGATGCAATGTTTATTGAGCTGTCACTTAAAATGTCCATGCTTTTCGAAAAGTTTGGTAGATTAGATGATGCTGAGACGGGTTTTCGATTCTGTATAGAAAATCA GGAGAAA AAGATGACAAGTTTCGATGAAAATATTGACCATATAAATGAAAAAGCTTTACTAGGAATGTGTTGTAATTATTTTAGCAAATTTCTCTTTGCGAATCAAAGACAAACAGAAGCTTTAGTTTATGCCCAACGAGCTTATGAAATCGCCAGTCAAATTTATCCTTTAGACCATGCGAATTGTTTAAATTTATTAATTGATATTAGCGTTATCCATGCTGATTTAAATGAATTTATGGAGTCTCAACGTATTCTTAAACAAGTTATTCANACAAGTCAAACCAAGTATCAATCTTTCGTTGATAATTACTCTAATGATAATGAACTACTGAAATCAAACCTTTCAAAAC ACATGAAATGCACGAAACTGTGTATACTCTAAT ]
[-] EMBL CD061292 [ AAATCAGGGAGAAATAAGATGACAAGTTTCGATGAAAATATTGACCATATAAATGAAAAAGCTTTACTAGGAATGTGTTGTAATTATTTTAGCAAATTTCTCTTTGCGAATCAAAGACATACAGAAG ]
[+] EMBL CD084334 [ AGCTTATGAAATCGCCAGTCAAA TTATCCTTTA ACCATGCGAATTGTTTAAATTTATTAATTGATATTAGCGTTATCCATGCTGATTTAAATGAATTTATGGAGTCTCAACGTATTCTTAAACAAGTTATTCAAACAAGTCAAACCAAGTATCAATCTTTCGTTGATAATTACTCTAATGATAATGAACTACTGAAATCAAACCTTTCAAAACAACATGAAATGCACGAAACTGTGTATACTCTAATACATTCAATATTACAATTAGCCGCTGTTGATTTAATGTTGGGAAAACTAGAATCTGTGAAGCAGTTATTGTTACAAGCTGATCACATCATAAATCAAATTGACCAATTGGGTTTGAAAGTCTCTATGTACCGCAAACATATTAACGATTTCAAAATGGAACATCATTTTCAAATCTAAAAATATCTTCGTCCCCTTCATCCTTGTTGTTTTCTCGTTGAATTTTTCTCTATAAAGATNTATATGAATGTATTTT ]
[+] EMBL CD138209 [ TGTTTAAATTTATTAATTGATATTAGCGTTATCCATGCTGATTTAAATGAATTTATGGAGTCTCAACGTATTGTTAAACAAGTTATTCAAACAAGTCAAACCGAGTAAGAATCTTTCGTTGATAATTACTCTAATGATAATGAACTACTGAAATCAAACCTTTCAAAACAACATGAAATGCACGAAACTGTGTATACTCTAATACATTCAATATTACAATTAGCCGCTGTTGATTTAATGTTGGGAAAACCAGAATCTGTGAAGCAGTTATTGTTACAAGCTGATCACATCATAAATCAAATTGACCAATT ]
[+] EMBL CD083967 [ gcacgaggTTACAATTAGCCGCTGTTGATTTAATGTTGGGAAAACCAGAATCTGTGAAGCAGTTATTGTTACAAGCTGATCACATCATAAATCAAATTGACCAATTGGGTTTGAAAGTCTCTATGTACCGCAAACATATTAACGATTTCAAAATGGAACATCATTTTCAAATCTAAAAATATCTTCGTCCCCTTCATCCTTGTTGTTTTCTCGTTGAATTTTTCTCTATAAAGATTTATATGAATGTATTTTAAAGTGAGTTATATTACAAATGACTAGAATTGTCTGTATATTTGAGTGACTTGACGAGGCTACTTTCTTATGTTCATGATAATTGCTGTAAGTCATTCTTTTCTCCTATCTTTTTACCATTATATCTTGTCGATTAGTACCGCTAAAATGCTCTTTTTAGTTTTACAATTCACATTGTTTTACT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||