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Schistosoma mansoni
cluster # 9015 cluster # 9015       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9015#0 length = 1461 sequences # 8  

consensusID : consensus_9015#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1461
fasta sequence
                              [TTCACCGACCCTACACCATATTCCGAATGCGGCCTCACAAAATTTGTTTGGAAGCGAAATGAAATACTTGATTCCCAAAATCTAATTGCATGAACCTATTTTGGCTGTTTAACCATAAAATTTTACTAATACGTCTTAAATATTTGCAGTTTATTGTATACTCAATCCAGTCCTCGAGTTTTACCAACATTTACCAAAACTTTATCTTTTACTGTATCATTTACTTGGTGGCCATTAAAATTATGGAAAAAGAAAGATATACATGAACAGTGTCAACAACTATTCAATGATTCCTTATTTCATATATCTATGGGTGAATTTAGTGTGGCAAATGATAAGTTACATGAACTATTGTGGTTTATCAACCAATCTTATCAAAATAATGAGTTAACCAATCGCGACTACATCAATAAACGTGCACG-AATATGTTCCGAGATGGCAAATCTAAATCTACTTATGGGAAATTATTCAGAAGTAGAAAAATTAATTAAACAGACAATGGAGGATTGTTTAACAGCCCAAATATCACCAAACGATGCAATGTTTATTGAGCTGTCACTTAAAATGTCCATGCTTTTCGAAAAGTTTGGTAGATTAGGTGA-GCTCAAAGATNCTTTCGATTCTGTATAGAAAATCA-GGAGAAA-AAGATGACAAGTTTCGATGAAAATATTGACCATATAAATGAAAAAGCTTTACTAGGAATGTGTTGTAATTATTTTAGCAAATTTCTCTTTGCGAATCAAAGACAAACAGAAGCTTTAGTTTATGCCCAACGAGCTTATGAAATCGCCAGTCAAATTTATCCTTTAGACCATGCGAATTGTTTAAATTTATTAATTGATATTAGCGTTATCCATGCTGATTTAAATGAATTTATGGAGTCTCAACGTATTCTTAAACAAGTTATTCAAACAAGTCAAACCAAGTATCAATCTTTCGTTGATAATTACTCTAATGATAATGAACTACTGAAATCAAACCTTTCAAAAC-ACATGAAATGCACGAAACTGTGTATACTCTAATACATTCAATATTACAATTAGCCGCTGTTGATTTAATGTTGGGAAAACCAGAATCTGTGAAGCAGTTATTGTTACAAGCTGATCACATCATAAATCAAATTGACCAATTGGGTTTGAAAGTCTCTATGTACCGCAAACATATTAACGATTTCAAAATGGAACATCATTTTCAAATCTAAAAATATCTTCGTCCCCTTCATCCTTGTTGTTTTCTCGTTGAATTTTTCTCTATAAAGATNTATATGAATGTATTTTAAAGTGAGTTATATTACAAATGACTAGAATTGTCTGTATATTTGAGTGACTTGACGAGGCTACTTTCTTATGTTCATGATAATTGCTGTAAGTCATTCTTTTCTCCTATCTTTTTACCATTATATCTTGTCGATTAGTACCGCTAAAATGCTCTTTTTAGTTTTACAATTCACATTGTTTTACT]

[+] EMBL AI977722             [TTCACCGACCCTACACCATATTCCGAATGCGGCCTCACAAAATTTGTTTGGAAGCGAAATGAAATACTTGATTCCCAAAATCTAATTGCATGAACCTATTTTGGCTGTTTAACCATAAAATTTTACTAATACGTCTTAAATATTTGCAGTTTATTGTATACTCAATCCAGTCCTCGAGTTTTACCAACATTTACCAAAACTTTATCTTTTACTGTATCATTTACTTGGTGGCCATTAAAATTATGGAAAAAGAAAGATATACATGAACAGTGTCAACAACTATTCAATGATTCCTTATTTCATATATCTATGGGTGAATTTAGTGTGGCAAATGATAAGTTACATGAACTATTGTGGTTTATCAACCAATCTTATCAAAATAATGAGTTAACCAATCGCGACTACATCAATAAACGTGCACG AATATGTTCCGAGATGGCAAATCTAAATCTACTTATGGGAAATTATTCAGAAGTAGAAAAATTAATTAAACAGACAATGGAGGATTGTTTAACAGCCCAAATATCACCAAACGATGCAATGTTTATTGAGCTGTCACTTAAAATGTCCATGCTNTTCGAAAAGTTTGGTAGATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI976999             [                        GAATGCGGCCTCACAAAATTTGTTTGGAAGCGAAATGAAATACTTGATTCCCAAAATCTAATTGCATGAACCTATTTTGGCTGTTTAACCATAAAATTTTACTAATACGTCTTAAATATTTGCAGTTTATTGTATACTCAATCCAGTCCTCGAGTTTTACCAACATTTACCAAAACTTTATCTTTTACTGTATCATTTACTTGGTGGCCATTAAAATTATGGAAAAAGAAAGATATACATGAACAGTGTCAACAACTATTCAATGATTCCTTATTTCATATATCTATGGGTGAATTTAGTGTGGCAAATGATAAGTTACATGAACTATTGTGGTTTATCAACCAATCTTATCAAAATAATGAGTTAACCAATCGCGACTACATCAATAAACGTGCACGCAAT TGTTCCGAGATGGCAAATCTAAATCTACTTATGGGAAATTATTCAGAAGTAGAAAAATTAATTAAACAGACAATGGAGGATTGTTTAACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD128881             [                                                                                                                                                                                                             CTCTTACTGTATCATTTACTTGGTGGCCATTAAAATTATGGAAAAAGAAAGATATACATGAACAGTGTCAACAACTATTCAATGATTCCTTATTTCATATATCTATGGGTGAATTTAGTGTGGCAAATGATAAGTTACATGAACTATTGTGGTTTATCAACCAATCTTATCAAAATAATGAGTTAACCAATCGCGACTACATCAATAAACGTGCACG AATATGTTCCGAGATGGCAAATCTAAATCTACTTATGGGAAATTATTCAGAAGTAGAAAAATTAATTAAACAGACAATGGAGGATTGTTTAACAGCCCAAATATCACCAAACGATGCAATGTTTATTGAGCTGTCACTTAAAATGTCCA GCTTTTCGAAAAGTTTGGTAGATTAGGTGA GCTCAAAGATNC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD078430             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCAATCGCGACTACATCAATAAACGTGCACG AATATGTTCCGAGATGGCAAATCTAAATCTACTTATGGGAAATTATTCAGAAGTAGAAAAATTAATTAAACAGACAATGGAGGATTGTTTAACAGCCCAAATATCACCAAACGATGCAATGTTTATTGAGCTGTCACTTAAAATGTCCATGCTTTTCGAAAAGTTTGGTAGATTAGATGATGCTGAGACGGGTTTTCGATTCTGTATAGAAAATCA GGAGAAA AAGATGACAAGTTTCGATGAAAATATTGACCATATAAATGAAAAAGCTTTACTAGGAATGTGTTGTAATTATTTTAGCAAATTTCTCTTTGCGAATCAAAGACAAACAGAAGCTTTAGTTTATGCCCAACGAGCTTATGAAATCGCCAGTCAAATTTATCCTTTAGACCATGCGAATTGTTTAAATTTATTAATTGATATTAGCGTTATCCATGCTGATTTAAATGAATTTATGGAGTCTCAACGTATTCTTAAACAAGTTATTCANACAAGTCAAACCAAGTATCAATCTTTCGTTGATAATTACTCTAATGATAATGAACTACTGAAATCAAACCTTTCAAAAC ACATGAAATGCACGAAACTGTGTATACTCTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD061292             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAATCAGGGAGAAATAAGATGACAAGTTTCGATGAAAATATTGACCATATAAATGAAAAAGCTTTACTAGGAATGTGTTGTAATTATTTTAGCAAATTTCTCTTTGCGAATCAAAGACATACAGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD084334             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGCTTATGAAATCGCCAGTCAAA TTATCCTTTA ACCATGCGAATTGTTTAAATTTATTAATTGATATTAGCGTTATCCATGCTGATTTAAATGAATTTATGGAGTCTCAACGTATTCTTAAACAAGTTATTCAAACAAGTCAAACCAAGTATCAATCTTTCGTTGATAATTACTCTAATGATAATGAACTACTGAAATCAAACCTTTCAAAACAACATGAAATGCACGAAACTGTGTATACTCTAATACATTCAATATTACAATTAGCCGCTGTTGATTTAATGTTGGGAAAACTAGAATCTGTGAAGCAGTTATTGTTACAAGCTGATCACATCATAAATCAAATTGACCAATTGGGTTTGAAAGTCTCTATGTACCGCAAACATATTAACGATTTCAAAATGGAACATCATTTTCAAATCTAAAAATATCTTCGTCCCCTTCATCCTTGTTGTTTTCTCGTTGAATTTTTCTCTATAAAGATNTATATGAATGTATTTT                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD138209             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTTTAAATTTATTAATTGATATTAGCGTTATCCATGCTGATTTAAATGAATTTATGGAGTCTCAACGTATTGTTAAACAAGTTATTCAAACAAGTCAAACCGAGTAAGAATCTTTCGTTGATAATTACTCTAATGATAATGAACTACTGAAATCAAACCTTTCAAAACAACATGAAATGCACGAAACTGTGTATACTCTAATACATTCAATATTACAATTAGCCGCTGTTGATTTAATGTTGGGAAAACCAGAATCTGTGAAGCAGTTATTGTTACAAGCTGATCACATCATAAATCAAATTGACCAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD083967             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gcacgaggTTACAATTAGCCGCTGTTGATTTAATGTTGGGAAAACCAGAATCTGTGAAGCAGTTATTGTTACAAGCTGATCACATCATAAATCAAATTGACCAATTGGGTTTGAAAGTCTCTATGTACCGCAAACATATTAACGATTTCAAAATGGAACATCATTTTCAAATCTAAAAATATCTTCGTCCCCTTCATCCTTGTTGTTTTCTCGTTGAATTTTTCTCTATAAAGATTTATATGAATGTATTTTAAAGTGAGTTATATTACAAATGACTAGAATTGTCTGTATATTTGAGTGACTTGACGAGGCTACTTTCTTATGTTCATGATAATTGCTGTAAGTCATTCTTTTCTCCTATCTTTTTACCATTATATCTTGTCGATTAGTACCGCTAAAATGCTCTTTTTAGTTTTACAATTCACATTGTTTTACT]


>consensus_9015#0 TTCACCGACCCTACACCATATTCCGAATGCGGCCTCACAAAATTTGTTTGGAAGCGAAAT GAAATACTTGATTCCCAAAATCTAATTGCATGAACCTATTTTGGCTGTTTAACCATAAAA TTTTACTAATACGTCTTAAATATTTGCAGTTTATTGTATACTCAATCCAGTCCTCGAGTT TTACCAACATTTACCAAAACTTTATCTTTTACTGTATCATTTACTTGGTGGCCATTAAAA TTATGGAAAAAGAAAGATATACATGAACAGTGTCAACAACTATTCAATGATTCCTTATTT CATATATCTATGGGTGAATTTAGTGTGGCAAATGATAAGTTACATGAACTATTGTGGTTT ATCAACCAATCTTATCAAAATAATGAGTTAACCAATCGCGACTACATCAATAAACGTGCA CGAATATGTTCCGAGATGGCAAATCTAAATCTACTTATGGGAAATTATTCAGAAGTAGAA AAATTAATTAAACAGACAATGGAGGATTGTTTAACAGCCCAAATATCACCAAACGATGCA ATGTTTATTGAGCTGTCACTTAAAATGTCCATGCTTTTCGAAAAGTTTGGTAGATTAGGT GAGCTCAAAGATNCTTTCGATTCTGTATAGAAAATCAGGAGAAAAAGATGACAAGTTTCG ATGAAAATATTGACCATATAAATGAAAAAGCTTTACTAGGAATGTGTTGTAATTATTTTA GCAAATTTCTCTTTGCGAATCAAAGACAAACAGAAGCTTTAGTTTATGCCCAACGAGCTT ATGAAATCGCCAGTCAAATTTATCCTTTAGACCATGCGAATTGTTTAAATTTATTAATTG ATATTAGCGTTATCCATGCTGATTTAAATGAATTTATGGAGTCTCAACGTATTCTTAAAC AAGTTATTCAAACAAGTCAAACCAAGTATCAATCTTTCGTTGATAATTACTCTAATGATA ATGAACTACTGAAATCAAACCTTTCAAAACACATGAAATGCACGAAACTGTGTATACTCT AATACATTCAATATTACAATTAGCCGCTGTTGATTTAATGTTGGGAAAACCAGAATCTGT GAAGCAGTTATTGTTACAAGCTGATCACATCATAAATCAAATTGACCAATTGGGTTTGAA AGTCTCTATGTACCGCAAACATATTAACGATTTCAAAATGGAACATCATTTTCAAATCTA AAAATATCTTCGTCCCCTTCATCCTTGTTGTTTTCTCGTTGAATTTTTCTCTATAAAGAT NTATATGAATGTATTTTAAAGTGAGTTATATTACAAATGACTAGAATTGTCTGTATATTT GAGTGACTTGACGAGGCTACTTTCTTATGTTCATGATAATTGCTGTAAGTCATTCTTTTC TCCTATCTTTTTACCATTATATCTTGTCGATTAGTACCGCTAAAATGCTCTTTTTAGTTT TACAATTCACATTGTTTTACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)