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Schistosoma mansoni
cluster # 9033 cluster # 9033       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9033#0 length = 815 sequences # 8  
consensusID : consensus_9033#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 815
fasta sequence 
                              [CGGTAGGAGTTGTGGATTGGCTTCATAATTAAAGGGAGTCACCCATCCCAAAAGTCTACATATTCGGAATTGCCTTTAATTCCAATAACTTCTCTGATGGTTTTAGCTCAGCGTCAAAAAGAGGAGCTCAACAGAGCTATTGCCGATTATTTATTTGCTAATGGATACGTCAAAGCTCTGAATGCCTTCAGAGAAGAGTCGCAACTGGCAGGAGAAAATGACCGAAAATATGACGGCCTACTAGAGAAGAAGTGGACTTCCGTCATCAGGCTTCAGAAAAAGGTCATGGATTTAGAAGCTAAGCTTAACGAGGCTGAGAAGGAGTTTCAGTCCATGCAAAATGCTATTGGTTTTGGTGTAGCAGGTGCTGCACCTGGAAGTGGTCTTTCAGACAGAAGTGATCGACGTGATGTTGATGCTATTCCAAGACCTCCAGCTAAGTTTACACTTACAGGTCATCGTTCTCCGATAACTCGTGTACTCTTTCATCCACACTACAATGTTTTTGTTTCGGCAAGTGAAGATGCCTCAATCAAAGTTTGGGATTATGAAACTGGAGAGTTTGAGCATACCTTAAAGGGCCATACAGATTCCGTGCAAGACGTAGCCTTTGATCCGTCAGGAAAGTTTTTGGCTTCATGCTCCGCCGACATGCAAGTTAAATTATGGGATTTTACAATCTATCAGTGCATCAAAACTCTGACTGGTCATGATCATAATGTATCCAGTGTAGCGTTTCTACCTTCTGGTGACTTCTTAGTCAGTGCAAGTAGAGATAAAACGATTAAAATGTGGGAAGTATCTACAGGATATTG]

[+] EMBL CD189690             [CGGTAGGAGTTGTGGATTGGCTTCATAATTAAAGGGAGTCACCCATCCCAAAAGTCTACATATTCGGAATTGCCTTTAATTCCAATAACTTCTCTGATGGTTTTAGCTCAGCGTCAAAAAGAGGAGCTCAACAGAGCTATTGCCGATTATTTATTTGCTAATGGATACGTCAAAGCTCTGAATGCCTTCAGAGAAGAGTCGCAACTGGCAGGAGAAAATGACCGAAAATATGACGGCCTACTAGAGAAGAAGTGGACTTCCGTCATCAGGCTTCAGAAAAAGGTCATGGATTTAGAAGCTAAGCTTAACGAGGCTGAGAAGGAGTTTCAGTCCATGCAAAATGCTATTGGTTTTGGTGTAGCAGGTGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD129910             [                                                                                                                                   CAGAGCTATTGCCGATTATTTATTTGCTAATGGATACGTCAAAGCTCTGAATGCCTTCAGAGAAGAGTCGCAACTGGCAGGAGAAAATGACCGAAAATATGACGGCCTACTAGAGAAGAAGTGGACTTCCGTCATCAGGCTTCAGAAAAAGGTCATGGATTTAGAAGCTAAGCTTAACGAGGCTGAGAAGGAGTTTCAGTCCATGCAAAATGCTATTGGTTTTGGTGTAGCAGGTGCTGCACCTGGAAGTGGTCTTTCAGACAGAAGTGATCGACGTGATGTTGATGCTATTCCAAGACCTCCAGCTAAGTTTACACTTACAGGTCATCGTTCTCCGATAACTCGTGTACTCTTTCATCCACACTACAATGTTTTTGTTTCGGCAAGTGAAGATGCCTCAATCAAAGTTTGGGATTATGAAACTGGAGAGTTTGAGCATACCTTAAAGGGCCATACAGATTCCGTGCAAGACGTAGCCTTTGATCCGTCAGGAAAGTTTTTGGCTTCATGCTCCGCCGACATGCAAGTTAAATTATGGGATTNTACAATCTATCAGTGCATCAAAACTCTGACTGGTCATGATCATAATGTATCCAGTGTAGCGTTTCTACCTTCTGGTGAC                                                              ]
[+] EMBL CD169718             [                                                                                                                                   CAGAGCTATTGCCGATTATTTATTTGCTAATGGATACGTCAAAGCTCTGAATGCCTTCAGAGAAGAGTCGCAACTGGCAGGAGAAAATGACCGAAAATATGACGGCCTACTAGAGAAGAAGTGGACTTCCGTCATCAGGCTTCAGAAAAAGGTCATGGATTTAGAAGCTAAGCTTAACGAGGCTGAGAAGGAGTTTCAGTCCATGCAAAATGCTATTGGTTTTGGTGTAGCGGGTGCTGCACCTGGAAGTGGTCTTTTAGACAGAAGTGATCGACGTGATGTTGATGCTATTCCAAGACCTCCAGCTAAGTTTACACTTACAGGTCATCGTTCTCCGATAACTCGTGTACTCTTTCATCCACACTACAATGTTTTTGTTTCGGCAAGTGAAGATGCCTCAATCAAAGTTTGGGATTATGAAACTGGAGAGTTTGAGCATACCTTAAAGGGCCATACAGATTCCGTGCAAGACGTAGCCTTTGATCCGTCAGGAAAGTTTTTGGCTTCATGCTCCGCCGACATGCAAGTTAAATTATGGGATTTTACAATCTATCAGGGCATCAAAACTCTGACTGGgc                                                                                                          ]
[-] EMBL CD063185             [                                                                                                                                     GAGCTATTGCCGATTATTTATTTGCTAATGGATACGTCAAAGCTCTGAATGCCTTCAGAGAAGAGTCGCAACTGGCAGGAGAAAATGACCGAAAATATGACGGCCTACTAGAGAAGAAGTGGACTTCCGTCATCAGGCTTCAGAAAAAGGTCATGGATTTAGAAGCTAAGCTTAACGAGGCTGAGAAGGAGTTTCAGTCCATGCAAAATGCTATTGGTTTTGGTGTAGCAGGTGCTGCACCTGGAAGTGGTCTTTCAGACAGAAGTGATCGACGTGATGTTGATGCTATTCCAAGCCCTCCAGCTAAGTTTACACTTACAGGTCATCGTTCTCCGATAACTCGTGTACTCTTTCATCCACACTACAATGTTTTTGTTTCGGCAAGTGAAGATGCCTCAATCAAAGTTTGGGATTATGAAACTGGAGAGTTTGAGCATACCTTAAAGGGCCATACGGATTCCGTGCAAGAAATAGCa                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD188051             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTCATGGATTTAGAAGCTAAGCTTAACGAGGCTGAGAAGGAGTTTCAGTCCATGCAAAATGCTATTGGTTTTGGTGTAGCAGGTGCTGCACCTGGAAGTGGTCTTTCAGACAGAAGTGATCGACGTGATGTTGATGCTATTCCAAGACCTCCAGCTAAGTTTACACTTACAGGTCATCGTTCTCCGATAACTCGTGTACCCTTTCATCCACACTACAATGTTTTTGTTTCGGCAAGTGAAGATGCCTCAATCAAAGTTTGGGATTATGAAACTGGAGAGTTTGAGCATACCTTAAAGGGCCATATAGATTCCGTGCAAGACGTAG                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD063730             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTCAGACAGAAGTGATCGACGTGATGTTGATGCTATTCCAAGACCTCCAGCTAAGTTTACACTTACAGGTCATCGTTCTCCGATAACTCGTGTACTCTTTCATCCACACTACAATGTTTTTGTTTCGGCAAGTGAAGATGCCTCAATCAAAGTTTGGGATTATGAAACTGGAGAGTTTGAGCATACCTTAAAGGGCCATACAGATTCCGTGCAAGACGTAGCCTTTGATCCGTCAGGAAAGTTTTTGGCTTCATGCTCCGCCGACATGCAAGTTAAATTATGGGATTTTACAATCTATCAGTGCATCAAAACTCTGACTGGTCATGATCATAATGTATCCAGTGTAGCGTTTCTACCTTCTGGTGACTTCTTAGTCAGTGCAAGTAGAGATAAAACGATTAAAATGTGGGAAGTATCTACAGGATATTG]
[-] EMBL CD093294             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGACAGAAGTGATCGACGTGATGTTGATGCTATTCCAAGACCTCCAGCTAAGTTTACACTTACAGGTCATCGTTCTCCGATAACTCGTGTACTCTTTCATCCACACTACAATGTTTTTGTTTCGGCAAGTGAAGATGCCTCAATCAAAGTTTGGGATCATGAAACTGGAGAGTTTGAGCATACCTTAAAGGGCCATACAGATTCCGTGCAAGACGTAGCCTTTGATCCGTCAGGAAAGTTTTTGGCTTCATGCTCCGCCGACATGCAAGTTAAATTATGGGATTTTACAATCTATCAGTGCATCAAAACTCTGACTGGTCATGATCATAATGT                                                                                             ]
[-] EMBL CD093303             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGACAGAAGTGATCGACGTGATGTTGATGCTATTCCAAGACCTCCAGCTAAGTTTACACTTACAGGTCATCGTTCTCCGATAACTCGTGTACTCTTTCATCCACACTACAATGTTTTTGTTTCGGCAAGTGAAGATGCCTCAATCAAAGTTTGGGATTATGAAACTGGAGAGTTTGAGCATACCTTAAAGGGCCATACAGATTCCGTGCAAGACGTAGCCTTTGATCCGTCAGGAAAGTTTTTGGCTTCATGCTCCGCCGACATGCAATTTAtgttc                                                                                                                                                     ]




>consensus_9033#0
CGGTAGGAGTTGTGGATTGGCTTCATAATTAAAGGGAGTCACCCATCCCAAAAGTCTACA
TATTCGGAATTGCCTTTAATTCCAATAACTTCTCTGATGGTTTTAGCTCAGCGTCAAAAA
GAGGAGCTCAACAGAGCTATTGCCGATTATTTATTTGCTAATGGATACGTCAAAGCTCTG
AATGCCTTCAGAGAAGAGTCGCAACTGGCAGGAGAAAATGACCGAAAATATGACGGCCTA
CTAGAGAAGAAGTGGACTTCCGTCATCAGGCTTCAGAAAAAGGTCATGGATTTAGAAGCT
AAGCTTAACGAGGCTGAGAAGGAGTTTCAGTCCATGCAAAATGCTATTGGTTTTGGTGTA
GCAGGTGCTGCACCTGGAAGTGGTCTTTCAGACAGAAGTGATCGACGTGATGTTGATGCT
ATTCCAAGACCTCCAGCTAAGTTTACACTTACAGGTCATCGTTCTCCGATAACTCGTGTA
CTCTTTCATCCACACTACAATGTTTTTGTTTCGGCAAGTGAAGATGCCTCAATCAAAGTT
TGGGATTATGAAACTGGAGAGTTTGAGCATACCTTAAAGGGCCATACAGATTCCGTGCAA
GACGTAGCCTTTGATCCGTCAGGAAAGTTTTTGGCTTCATGCTCCGCCGACATGCAAGTT
AAATTATGGGATTTTACAATCTATCAGTGCATCAAAACTCTGACTGGTCATGATCATAAT
GTATCCAGTGTAGCGTTTCTACCTTCTGGTGACTTCTTAGTCAGTGCAAGTAGAGATAAA
ACGATTAAAATGTGGGAAGTATCTACAGGATATTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)