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consensusID : consensus_9047#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1139 fasta sequence
[CTCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGATTAAGGAGAAAAATGGGGAATGAAGCTTCTCTTCCAGATCTTTGCTCTACATTTGACGTTGAAGAAATAAAACGTTTGGCTAAACGGTTTAAAAAACTAGATCTTGATGGTTCTGGATCTTTAAGTGTAAAAGAGTTCATGAGTCTTCCTGAACTTCAACAAAACCCTTTAGTTGCAAGAGTTATCGAGATTTTTGATACGGATGGCAACGGAGAAGTTGACTTCAAGGAATTCATAGATGGAATGTCACAGTTCAGTGTAAAGGGTGAGAAAGAAGCCAAGTTGAAATTTGCGTTTAAAATATACGACATGGACAAAGATGGGTACATCAGTAATGGCGAATTATTTCAGGTTTTGAAAATGATGGTTGGAAACAACTTAAAAGATACTCAACTACAACAAATAGTGGATAAAACTATCATGTTTGCTGACAAAGACGGAGATGGTCGGATTTCGTTTGAGGAGTTTTGTGAAGTTGTTAGCGGTCTTGATGTGCATAAAAAAATGGTAGTTGATGTTTGATATTGTTTCGTAGTAAGTATGACAATAAAAATTGTATAGTTTTTATTCAGACTTGGA-TAACTGTTAGTATA-TTCACTTTTTGTATG-TCTTTATTAAACCTGGATTATAGAGGCTTACGCTTTACAAAC-GACAACCATACTATG-TC-TG-TGAAAAG-TTTATTCACTTGTTTGGACACTGCTCATCAGATTTGTCTTTCATTGTTTCTTGATTTTATTTTCATTTCTTTCAAATGTATTTTATTTCAAAGGTCTCTCCTCTTCCCGTAAATGTCTGTGTATGAATACGCACACG-TCAACTTAGTTACA-TCATTCGCTTTTACTGTTGTTACTCATGTCGCTGTTACTGCTTTAAATGCGCTAAT-CTTTGTTGTCCTAAACCACCAACATTAATAGAATTCGAGGATCGCTTCAGTTTTAAATGCTCTATGCTTCCCCACTTTCCTTTCTGTATTGTTTTGACTTTCAGTTTATCACTTAGTTGTTTCTAGCGCCCATGTTTTAAAATCACTGTGGATTTTCAT-CATGCTCAAATCTTTTTGAATGGTGCATGAATATTTCATTTTATTTCAGAAATAAACTTGTCACACGAGTG]
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[+] EMBL SMA276885 [ gaatATTAAGGAGAAAAATGGGGAATGAAGCTTCTCTTCCAGATCTTTGCTCTACATTTGACGTTGAAGAAATAAAACGTTTGGCTAAACGGTTTAAAAAACTAGATCTTGATGGTTCTGGATCTTTAAGTGTAAAAGAGTTCATGAGTCTTCCTGAACTTCAACAAAACCCTTTAGTTGCAAGGGTTATCGAGATTTTTGATACGGATGGCAACGGAGAAGTTGACTTCAAGGAATTCATAAATGGAATGTCACAGTTCAGCGCGAAGGGTGAGAAAGAAGCCAAGTTGAAATTTGCGTTTAAAATATACGACATGGACAAAGATGGGTACATCAGTAATGGCGAATTATTTCAGGTTTTGAAAATGATGGTTGGAAACAACTTAAAAGATACTCAACTACAACAAATAGTGGATAAAACTATAATGTTTCCTGACAAAGACGAAGATGGTCGAATTTCGTTTGAGGAGTTTTGTGAAGTTGTTAGCGGTCTTGATGTGCATAAAAAAATGGTAGTTGATGTTTGATATTGTTTCGTAGTAAGTATG CAATAAAAATTG ATAG TTTTATTCAGACTTGGA TAACTGTTAGTATA TTCACTTTTTGTATGATCTTTATTAAACCTGGATTATAGAGGCTTACACTTTACAAACAGACAACCATACTATGATCATGATGAAAAGTTTTATTCACTTGTTTGGACACTGCTCATCAGATTTGTCTTTCATTGTTTCTTGATTTTATTTTCATTTCTTTCAAATGTATTTTATTTC AAGGTCTCTCCTCTCCCGGTAAATGTCTGTGTATGAATACGCACACGTTCAACTTAGTTACATTCATTCGCTTTTACTGTTGTTACTCATGTCGCTGTTACTGCTTTAAATGCGCTAAT CTTTGTTGTCCTAAACCACCAACATT ]
[+] EMBL CD152610 [ GAGTCTTCCTGAACTTCAACAAAACCCTTTAGTTGCAAGAGTTATCGAGATTTTTGATACGGATGGCAACGGAGAAGTTGACTTCAAGGAATTCATAGATGGAATGTCACAGTTCAGTGTAAAGGGTGAGAAAGAAGCCAAGTTGAAATTTGCGTTTAAAATATACGACATGGACAAAGATGGGTACATCAGTAATGGCGAATTATTTCAGGTTTTGAAAATGATGGTTGGAAACAACTTACAAGATACTCAACTACAACAAATAGTGGATAAAACTATCATGTTTGCTGAC ]
[+] EMBL CD084356 [ acTGGATTAACTGTTAGTATATTTCACTTTTTGTATG TCTTTATTAAACCTGGATTATAGAGGCTTACGCTTTACAAAC GACAACCATACTATG TC TG TGAAAAG TTTATTCACTTGTTTGGACACTGCTCATCAGATTTGTCTTTCATTGTTTCTTGATTTTATTTTCATTTCTTTCAAATGTATTTTATTTCAAAGGTCTCTCCTCTTCCCGTAAATGTCTGTGTATGAATACGCACACG TCAACTTAGTTACA TCATTCGCTTTTACTGTTGTTACTCATGTCGCTGTTACTGCTTTAAATGCGCTAAT CTTTGTTGTCCTAAACCACCAACATTAATAGAATTCGAGGATCGCTTCAGTTTTAAATGCTCTATGCTTCCCCACTTTCCTTTCTGTATTGTTTTGACTTTCAGTTTATCACTTAGTTGTTTCTAGCGCCCATGTTTTAAAATCACTGTGGATTTTCAT CATGCTCAAATCTTTTTGAATGGTGCATGAATATTTCATTTTATTTCAGAAATAAACTT ]
[-] EMBL CD076293 [ CTGTTAGTATATTTCACTTTTTGTATG TCTTTATTAAACCTGGATTATAGAGGCTTACGCTTTACAAAC GACAACCATACTATG TC TG TGAAAAG TTTATTCACTTGTTTGGACACTGCTCATCAGATTTGTCTTTCATCGTTTCTTGATTTTATTTTCATTTCTTTCAAATGTATTTTATTTCAAAGGTCTCTCCTCTTCCCGTAAATGTCTGTGTATGAATACGCACACG TCAACTTAGTTACA TCATTCGCTTTTACTGTTGTTACTCATGTCGCTGTTACTGCTTTAAATGCGCTAAT CTTTGTTGTCCTAAACCACCAACATTAATAGAATTCGAGGATCGCTTCAGTTTTAAATGCTCTATGCTTCCCCACTTTCCTTTCTGTATTGTTTTGACTTTCAGTTTATCACTTAGTTGTTTCTAGCGCCCATGTTTTAAAATCACTGTGGATTTTCAT CATGCTCAAATCTTTTTGAATGGTGCATGAATATTTCATTTTATTTCAGAAATAAACTTGTCACACGAGTG]
[-] EMBL CD076287 [ CTTTACAAAC GACAACCATACTATG TC TG TGAAAAG TTTATTCACTTGTTTGGACACTGCTCATCAGATTTGTCTTTCATCGTTTCTTGATTTTATTTTCATTTCTTTCAAATGTATTTTATTTCAAAGGTCTCTCCTCTTCCCGTAAATGTCTGTGTATGAATACGCACACG TCAACTTAGTTACA TCATTCGCTTTTACTGTTGTTACTCATGTCGCTGTTACTGCTTTAAATGCGCTAAT CTTTGTTGTCCTAAACCACCAACATTAATAGAATTCGAGGATCGCTTCAGTTTTAAATGCTCTATGCTTCCCCACTTTCCTTTCTGTATTGTTTTGACTTTCAGTTTATCACTTAGTTGTTTCTAGCGCCCATGTTTTAAAATCACTGTGGATTTTCAT CATGCTCAAATCTTTTTGAATGGTGCATGAATATTTCATTTTATTTCAGAAATAAACTTGTC ]
[-] EMBL CD065113 [ gTGCTTTAAATGCGATAATGCTTTGTTGTCCTAAACCACCAACATTAATAGAATTCGAGGATCGCTTCAGTTTTAAATGCTCTATGCTTCCCCACTTTCCTTTCTGTATTGTTTTGACTTTCAGTTTATCACTTAGTTGTTTCTAGCGCCCATGTTTTAAAATCACTGTGGATTTTCATGCATGC ]
consensusID : consensus_9047#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 637 fasta sequence
[TCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGTGTGCATAAAAAAATGGTAGTTGATGTTTGATATTGTTTCGTAGTAAGTATGACAATAAAAATTGTATAGTTTTTATTCAGACTTGGATAACTGTTAGTATATTTCACTTTTTGTATGTCTTTATTAAACCTGGATTATAGAGGCTTACGCTTTACAAACGACAACCATACTATGTCTGTGAAAAGTTTATTCACTTGTTTGGACACTGCTCATCAGATTTGTCTTTCATCGTTTCTTGATTTTATTTTCATTTCTTTCAAATGTATTTTATTTCAAAGGTCTCTCCTCTTCCCGTAAATGTCTGTGTATGAATACGCACACGTCAACTTAGTTACATCATTCGCTTTTACTGTTGTTACTCATGTCGCTGTTACTGCTTTAAATGCGCTAATCTTTGTTGTCCTAAACCACCAACATTAATAGAATTCGAGGATCGCTTCAGTTTTAAATGCTCTATGCTTCCCCACTTTCCTTTCTGTATTGTTTTGACTNTCAGTTTATCACTTAGTTGTTTCTAGCGCCCATGTTTTAAAATCACTGTGGATTTTCATCATGCTCAAATCTTTTTGAATGGTGCATGAATATTTCATTTTATTTCAGAAATAAACTTGT]
[+] EMBL CD082696 [TCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGTGTGCATAAAAAAATGGTAGTTGATGTTTGATATTGTTTCGTAGTAAGTATGACAATAAAAATTGTATAGTTTTTATTCAGACTTGGATAACTGTTAGTATATTTCACTTTTTGTATGTCTTTATTAAACCTGGATTATAGAGGCTTACGCTTTACAAACGACAACCATACTATGTCTGTGAAAAGTTTATTCACTTGTTTGGACACTGCTCATCAGATTTGTCTTTCATCGTTTCTTGATTTTATTTTCATTTCTTTCAAATGTATTTTATTTCAAAGGTCTCTCCTCTTCCCGTAAATGTCTGTGTATGAATACGCACACGTCAACTTAGTTACATCATTCGCTTTTACTGTTGTTACTCATGTCGCTGTTACTGCTTTAAATGCGCTAATCTTTGTTGTCCTAAACCACCAACATTAATAGAATTCGAGGATCGCTTCAGTTTTAAATGCTCTATGCTTCCCCACTTTCCTTTCTGTATTGTTTTGACTNTCAGTTTATCACTTAGTTGTTTCTAGCGCCCATGTTTTAAAATCACTGTGGATTTTCATCATGCTCAAATCTTTTTGAATGGTGCATGAATATTTCATTTTATTTCAGAAATAAACTTGT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_9047#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9047#0 TG 1139
consensus_9047#1 --
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||