These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9063#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1414 fasta sequence [CCCGAGGCCAANAATGCGGCACGAGGCTTAAAACTCACAACATTTGGGAAACGTACTTACACTTAGTCAAAATTGTATAAAGGAATAATATTTATCCTTTCAATACTCGTTTTTATGGTAGGTTGTTCATCTATATGACAAAAATCAAGTCATTCGTTGTTCAGTTGAAGTTGCTTTTCACATCAGACTTGAATCCGAAATTGACGTAACCCACCCCACAGAATCAAACTTGAAAATTCCAGAACCGGAAGTAAAAGTGACATCTTTACATCACTTATCAAAGACCCAGTGATCCATGCTTAGTTCAGCCAATTTGTAGTATAGTATGGTCATTGTTTACTACATATTAATGTATCTATCTCGATCAAATCTTACTATGTTGTACATATTTAGATTTGTTTCTATGGTCACCCTAATCTTAACACTTTTATGTAGTTAGAAGAAGCTGAGTGGATTGGTTTAACACTCGAAGAAGCTGTTAAAAAACAAATGAAAATAGAACATGAAATATCCAGAAGTCAGCTAAAGCCACTAAAATTCAGTTTAGCGGAAAAACTGATTGACAGTTTAAGAAACCCTGTCAAAGATAAGAATGAAGAAACTCCGTCCAGCTACTCGTCTCGAATTTT-CAGTTGATAAA-CCTTTGACAATAAACAAATATGATATGT-CT-CTTTT-CT-CAGAGAAG-CT-CAGATTTGTAATATA-CCAAGGAATTCACTAT-CATTTTGTATCTACTTTGCATGTACAGTCGCTAAAATAATTTCTAAAAAATCTACTGTTTGCAACTGTTGTTTGGAGTTTTAATTGCTTAGTAAACAAATATTTTATCTAAGGTTAGATAATATTGCTAATGTTGTTTTTCAACCGAAATTTTTATAAAAAATGTATGTAACCAATGTCTGTCCTACTTTATCTTGTACGGTCTCATCGACATACGGAGTTTATGTAACTCATCGTCTACTAAGAACTGAAACAGGGATTTGATAAACCGTTGGTCAACAAACTCACCACAATGAATGTTTTAGCTACACGTATGAAGACAAATATTCCATCCTTATCTTAATTGTATAATATTTAAAGTGTATATTTTCGATTGTGATTTTTGTTATTATGTTTTCTATTGAAAAACAAACTGAAATTCCATTGGTAATTATCCTCTGTTTGGACATCTTTCATTACCCAAACGTTCTATTCGAATCTGCTAAGAACGAAGTTTTAAACCCTATATGGGAGCACATTTAATTTTTTTCAAACCACATTATTAATAATAGATACTTAAACCCTGATGTGTTTTAGTGAATGAAATGTTATTGGTTACTAAGTGTGGACG-AATA-GACA-CTC-ATA-TACTG-ACTATTGAATATGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACGTACT] [+] EMBL CD081364 [CCCGAGGCCAANAATGCGGCACGAGGCTTAAAACTCACAACATTTGGGAAACGTACTTACACTTAGTCAAAATTGTATAAAGGAATAATATTTATCCTTTCAATACTCGTTTTTATGGTAGGTTGTTCATCTATATGACAAAAATCAAGTCATTCGTTGTTCAGTTGAAGTTGCTTTTCACATCAGACTTGAATCCGAAATTGACGTAACCCACCCCACAGAATCAAACTTGAAAATTCCAGAACCGGAAGTAAAAGTGACATCTTTACATCACTTATCAAAGACCCAGTGATCCATGCTTAGTTCAGCCAATTTGTAGTATAGTATGGTCATTGTTTACTACATATTAATGTATCTATCTCGATCAAATCTTACTATGTTGTACATATTTAGATTTGTTTCTATGGTCACCCTAATCTTAACACTTTTATGTAGTTAGAAGAAGCTGAGTGGATTGGTTTAACACTCGAAGAAGCTGTTAAAAAACAAATGAAAATAGAACATGAAATATCCAGAAGTCAGCTAAAGCCACTAAAATTCAGTTTAGCGGAAAAACTGATTGACAGTTTAAGAAACCCTGTCAAAGATAAGAATGAAGAAACTCCGTCCAGCTACTCGTCTCGAATTTT CAGTTGATAAA CCTTTGAC ATAAACCAATATGATATGT CT CTTTT CT CAGAGAAG CT CAGATTTGT ATATA AC AGGAATTCACTAT CATTTTGTATCTACTTTGCATGTACAGNCGCTTAAATAATTTCTAAAAAtc ] [-] EMBL CD075198 [ TTCACATCAGACTTGAATCCGAAATTGACGTAACCCACCCCACAGAATCAAACTTGAAAATTCCAGAACCGGAAGTAAAAGTGACATCTTTACATCACTTATCAAAGACCCAGTGATCCATGCTTAGTTCAGCCAATTTGTAGTATAGTATGGTCATTGTTTACTACATATTAATGTATCTATCTCGATCAAATCTTACTATGTTGTACATATTTAGATTTGTTTCTATGGTCACCCTAATCTTAACACTTTTATGTAGTTAGAAGAAGCTGAGTGGATTGGTTTAACACTCGAAGAAGCTGTTAAAAACCAAATGAAAATAGAACATGAAATATCCAGAAGTCAGCTAAAGCCACTAAAATTCAGTTTAGCGGAAAAACTGATTGACAGTTTAAGAAACCCTGTCAAAGATAAGAATGAAGAAACTCCGTCCAGCTACTCGTCTCGAATTTT CAGTTGATAAA CCTTTGCCAATAAACAAATATGATATGT CT CTTTT CT CAGAGAAG CT CAGATTTGTAATATA CCAAGGAATTCACTAT CATTTTGTATCTACTTTGCATGTACAGTCGCTAAAATAATTTCTAAAAAATCT ] [-] EMBL AA999374 [ CGAATTTTCCAGTTGATAAACCCTTTGACAATAAACAAATATGATATGTCCTCCTTTTCCTCCAGAGAAGCCTCCAGATTTGTAATATACCCAAGGAATTCACTATCCATTTTGTATCTACTTTGCATGTACAGTCGCTAAAATAATTTCTAAAAAATCTACTGTT ] [-] EMBL CD074764 [ TATCTACTTTGCATGTACAGTCGCTAAAATAATTTCTAAAAAATCTACTGTTTGCAACTGTTGTTTGGAGTTTTAATTGCTTAGTAAACAAATATTTTATCTAAGGTTAGATAATATTGCTAATGTTGTTTTTCAACCGAAATTTTTATAAAAAATGTATGTAACCAATGTCTGTCCTACTTTATCTTGTACGGTCTCATCGACATACGGAGTTTATGTAACTCATCGTCTACTAAGAACTGAAACAGGGATTTGATAAACCGTTGGTCAACAAACTCACCACAATGAATGTTTTAGCTACACGTATGAAGACAAATATTCCATCCTTATCTTAATTGTATAATATTTAAAGTGTATATTTTCGATTGTGATTTTTGTTATTATGTTTTCTATTGAAAAACAAACTGAAATTCCATTGGTAATTATCCTCTGTTTGGACATCTTTCATTACCCAAACGTTCTATTCGAATCTGCTAAGAACGAAGTTTTAAACCCTATATGGGAGCACATTTAATTTTTTTCAAACCACATTATTAATAATAGATACTTAAACCCTGATGTGTTTTAGTGAATGAAATGTTATTGGTTACTAAGTGTGGACG AATA GACA CTCAATA TACTG ACTAT ] [-] EMBL AI974994 [ ATGTAACTCATCGTCTATAAAGAACTGAAACAGGGATTTGATAAACCGTTGGTCAACAAACTCACCACAATGAATGTTTTAGCTACACGTATGAAGACAAATATTCCATCCTTATCTTAATTGTATAATATTTAAAGTGTATATTTTCGATTGTGATTTTTGTTATTATGTTTTCTATTGAAAAACAAACTGAAATTCCATTGGTAATTATCCTCTGTTTGGACATCTTTCATTACCCAAACGTTCTATTCGAATTTGCTAAGAACGAAGTTTTAAACCCTATATGGGAGCACATTTAATTTTTTTCAAACCACATTATTAATAATAGATACTTAAACCCTGATGTGTTTTAGTGAATGAAATGTTATTGGTTACTAAGTGTGGACG AATA GACA CTCAATA TACTG ACTATTGAATATGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACGTACT] [+] EMBL SM0281 [ TTATTAATAATAGATACTTAAACCCTGATGTGTTTTAGTGAATGAAATGTTATTGGTTACTAAGTGTGGACGTAATAGGACAGCTC ATATTACTGTACTAT ] [+] EMBL AA938827 [ TTATTAATAATAGATACTTAAACCCTGATGTGTTTTAGTGAATGAAATGTTATTGGTTACTAAGTGTGGACGTAATAGGACAGCTC ATATTACTGTACTAT ] consensusID : consensus_9063#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||