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Schistosoma mansoni
cluster # 9067 cluster # 9067       Sequences # 8       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9067#0 length = 933 sequences # 4  
consensus_9067#1 length = 827 sequences # 3  
consensus_9067#2 length = 703 sequences # 1  

consensusID : consensus_9067#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 933
fasta sequence
                              [GATTGGGCGCTCCAAATGCTTCATCTTTTCCACTGTTTTTGATTGATTGACCGAATGACAGGAGTTTCGTGTGTGTTATTACTCAATTCATCTGAAGGAAACAGTGATCCACAGATTCTTGAGAATCTTATGAAGAAATTAGAACTTCTTGGTGCACAAAAGTGCGGTCGAATACATATAGAAAGCGCAGTTTACTTTTCAAACTTTTCCAGGTCTCAGTGTAAAACATTTCAAGTTCTCACATCAACTGAATATCCAGCATCATGTTTTGTATTCTCTGACAATCA-AACAGCTCTTGTTGCCGATATATCTTTTCGTGAATTCCCAGGGTGCTTAAAAGCCTTTTATCAACGTAAGAAGAAATTACAAGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTATCAGTTGGGTGATTTTACAATTAATTTTATCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGATATTTAATCGAGGTTTGTTTTCATGCATCCAGCATGATACATTTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCTTTTATTACCCAAGTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCGTTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTAGCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATTATCTCATGTTTGCGTTCGACTAACAATGACACAATATGCAGAACATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCAAGGCAAACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCAACTCCTTCAAATATTCCGTCTAATCAAGCTAACAAGAACATTCCATCTAACTATTCAACATAATAACTTCAATGTTTATTTGTTTTTAATTAATAAAATATTATA]

[+] EMBL CD079290             [GATTGGGCGCTCCAAATGCTTCATCTTTTCCACTGTTTTTGATTGATTGACCGAATGACAGGAGTTTCGTGTGTGTTATTACTCAATTCATCTGAAGGAAACAGTGATCCACAGATTCTTGAGAATCTTATGAAGAAATTAGAACTTCTTGGTGCACAAAAGTGCGGTCGAATACATATAGAAAGCGCAGTTTACTTTTCAAACTTTTCCAGGTCTCAGTGTAAAACATTTCAAGTTCTCACATCAACTGAATATCCAGCATCATGTTTTGTATTCTCTGACAATCA AACAGCTCTTGTTGCCGATATATCTTTTCGTGAATTCCCAGGGTGCTTAAAAGCCTTTTATCAACGTAAGAAGAAATTACAAGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTATCAGTTGGGTGATTTTACAATTAATTTTATCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGATATTTAATCGAGGTTTGTTTTCATGCATCCAGCATGATACATTTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCTTTTATTACCCAAGTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCGTTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD189851             [                                                                                                                                                                                                                                 ACATTTCAAGTTCTCACATCAACTGAATATCCAGCATCATGTTTTGTATTCTCTGACAATCA AACAGCTCTTGTTGCCGATATATCTTTTCGTGAATTCCCAGGGTGCTTAAAAGCCTTTTATCAACGTAAGAAGAAATTACAAGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTATCAGTTGGGTGATTTTACAATTAATTTTATCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGATATTTAATCGAGGTTTGTTTTCATGCATCCAGCATGATACATTTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCTTTTATTACCCAA  AATACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD081481             [                                                                                                                                                                                                                                                                         gagcctTATTC   GGCACGCAGAACAGCTCTTGTTGCCGATATATCTTTTCGTGAATTCCCAGGGTGCTTAAAAGCCTTTTATCAACGTAAGAAGAAATTACAAGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTATCAGTTGGGTGATTTTACAATTAATTTTATCACTATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGATATTTAATCGAGGTTTGTTTTCATGCATCCAGCATGATACATTTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCTTTTATTACCCAAGTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCGTTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTAGCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATTATCTCATGTTTGCGTTCGACTAACAATGACACAATATGCAGAACATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCAAGGCAAACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCAACTCCTTCAAATATTCCGTCTAATCAAGCTAACAAGAACATTCCATCTAACTATTCAACATAATAACTTCAATGTTTATTTGTTTTTAATTAATAAAATATTAT ]
[-] EMBL CD075305             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGTTGTTTTTCATGCATCCAGCATGATACATNTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCTTTTATTACCCAAGTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCGTTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTAGCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATTATCTCATGTTTGCGTTCGACTAACAATGACACAATATGCAGAACATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCAAGGCAAACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCAACTCCTTCAAATATTCCGTCTAATCAAGCTAACAAGAACATTCCATCTAACTATTCAACATAATAACTTCAATGTTTATTTGTTTTTAATTAATAAAATATTATA]


>consensus_9067#0 GATTGGGCGCTCCAAATGCTTCATCTTTTCCACTGTTTTTGATTGATTGACCGAATGACA GGAGTTTCGTGTGTGTTATTACTCAATTCATCTGAAGGAAACAGTGATCCACAGATTCTT GAGAATCTTATGAAGAAATTAGAACTTCTTGGTGCACAAAAGTGCGGTCGAATACATATA GAAAGCGCAGTTTACTTTTCAAACTTTTCCAGGTCTCAGTGTAAAACATTTCAAGTTCTC ACATCAACTGAATATCCAGCATCATGTTTTGTATTCTCTGACAATCAAACAGCTCTTGTT GCCGATATATCTTTTCGTGAATTCCCAGGGTGCTTAAAAGCCTTTTATCAACGTAAGAAG AAATTACAAGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTATCAGTTGGGTGATTTTACAATTAATTTT ATCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGATATTTAATCGAGGTTTGTTTT CATGCATCCAGCATGATACATTTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCTTTTATTACCCAAGTA TTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCGTTT TTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTAGCT TTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATTATCTCATGTTTGCGTTCGA CTAACAATGACACAATATGCAGAACATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCAAGGCAAACT GTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCAACTCCTTCAAAT ATTCCGTCTAATCAAGCTAACAAGAACATTCCATCTAACTATTCAACATAATAACTTCAA TGTTTATTTGTTTTTAATTAATAAAATATTATA



consensusID : consensus_9067#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 827
fasta sequence
                              [AGGCAACAGCTCTTGTTGCCGATATATCTTTTCGTGCAATTCCCAGGGGTGGCTTAAAANGCCTTTTATCAACGTAAGAAGAAATTAC-AGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTATCAGTTGGGTGATTTTACAATTAATTTTATCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGATATTTAATCGAGGGTGTCTACAGCGATTAATTCTTTATGCTGGTGTTTCTTGGAGCCCAGGATTTCCTAGCATGCTGAAGTTATTCGTGCTTTAATCTTTTCCAGTTCTCCATGCTGTTTTCCTCTTTTAATGGAATTTGTTGTTGAGATCTCTTTTGAACTCATTAAGCTTGTTACCATCTGGAAGGTTTGTTTTCATGCATCCAGCATGATACATTTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCTTTTATTACCCAAGTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCGTTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTAGCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATTATCTCATGTTTGCGTTCGACTAACAATGACACAATATGCAGAACATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCAAGGCAAACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCAACTCCTTCAAATATTCCGTCTAATCAAGCTAACAAGAACATTCCATCTAACTATTCAACATAATAACTT-CAATGTTTATTTGTTTTTAATTAAT-A-AATATTATA]

[+] EMBL CD081193             [AGGCAACAGCTCTTGTTGCCGATATATCTTTTCGTGCAATTCCCAGGGGTGGCTTAAAANGCCTTTTATCAACGTAAGAAGAAATTAC AGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTATCAGTTGGGTGATTTTACAATTAATTTTATCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGATATTTAATCGAGGGTGTCTACAGCGATTAATTCTTTATGCTGGTGTTTCTTGGAGCCCAGGATTTCCTAGCATGCTGAAGTTATTCGTGCTTTAATCTTTTCCAGTTCTCCATGCTGTTTTCCTCTTTTAATGGAATTTGTTGTTGAGATCTCTTTTGAACTCATTAAGCTTGTTACCATCTGGAAGGTTTGTTTTCATGCATCCAGCATGATACATTTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCTTTTATTACCCAAGTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCGTTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTAGCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATTATCTCATGTTTGCGTTCGACTAACAATGACACAATATGCAGAACATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCAAGGCAAACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCAACTCCTTC AATATTCCGTCTAAT AAGCTAAC AGAACATTCCATCT ACTATT AACATAATAACTT C ATGTTTATTTGTTTTT ATTAAT A AATATTA  ]
[-] EMBL CD075021             [                                            caGGGT GCTTAAAA GCCTTTTATCAACGTAAGAAGAAATTACAAGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTATCAGTTGGGTGATTTTACAATTAATTTTATCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGATATTTAATCGAGGGTGTCTACAGCGATTAATTCTTTATGCTGGTGTTTCTTGGAGCCCAGGATTTCCTAGCATGCTGAAGTTATTCGTGCTTTAATCTTTTCCAGTTCTCCATGCTGTTTTCCTCTTTTAATGGAATTTGTTGTTGAGATCTCTTTTGAACTCATTAAGCTTGTTACCATCTGGAAGGTTTGTTTTCATGCATCCAGCATGATACATTTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCTTTTATTACCCAAGTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCGTTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTAGCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATTATCTCATGTTTGCGTTCGACTAACAATGACACAATATGCAGAACATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCAAGGCAAACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCAACTCCTTCAAATATTCCGTCTAATCAAGCTAACAAGAACATTCCATCTAACTATTCAACATAATAACTTCCAATGTTTATTTGTTTTTAATTAAT AGAATATTATA]
[-] EMBL CD074739             [                                                                                                                                                                                                            GATTAATTCTTTATGCTGGTGTTTCTTGGAGCCCAGGATTTCCTAGCATGCTGAAGTTATTCGTGCTTTAATCTTTTCCAGTTCTCCATGCTGTTTTCCTCTTTTAATGGAATTTGTTGTTGAGATCTCTTTTGAACTCATTAAGCTTGTTACCATCTGGAAGGTTTGTTTTCATGCATCCAGCATGATACATTTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCTTTTATTACCCAAGTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCGTTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTAGCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATTATCTCATGTTTGCGTTCGACTAACAATGACACAATATGCAGAACATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCAAGGCAAACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCAACTCCTTCAAATATTCCGTCTAATCAAGCTAACAAGAACATTCCATCTAACTATTCAACATAATAACTT CAATGTTTATTTGTTTTTAATTAATAA AATATTATA]


>consensus_9067#1 AGGCAACAGCTCTTGTTGCCGATATATCTTTTCGTGCAATTCCCAGGGGTGGCTTAAAAN GCCTTTTATCAACGTAAGAAGAAATTACAGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTATCAGTTGG GTGATTTTACAATTAATTTTATCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGAT ATTTAATCGAGGGTGTCTACAGCGATTAATTCTTTATGCTGGTGTTTCTTGGAGCCCAGG ATTTCCTAGCATGCTGAAGTTATTCGTGCTTTAATCTTTTCCAGTTCTCCATGCTGTTTT CCTCTTTTAATGGAATTTGTTGTTGAGATCTCTTTTGAACTCATTAAGCTTGTTACCATC TGGAAGGTTTGTTTTCATGCATCCAGCATGATACATTTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCT TTTATTACCCAAGTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATA TTCAGCCCATCGTTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCG CCTAGTCAATTAGCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATTATCT CATGTTTGCGTTCGACTAACAATGACACAATATGCAGAACATATCAACGTTGTTAGACGT TTATCAAGGCAAACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATAT GCAACTCCTTCAAATATTCCGTCTAATCAAGCTAACAAGAACATTCCATCTAACTATTCA ACATAATAACTTCAATGTTTATTTGTTTTTAATTAATAAATATTATA



consensusID : consensus_9067#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 703
fasta sequence
                              [NNNNNNNNNNNNNNNAGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTATCAGTTGGGTGATTTTACAATTAATTTTATCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGATATTTAATCGAGGGTGTCTACAGCGATTAATTCTTTATGCTGGTGTTTCTTGGAGCCCAGGATTTNNNNNNNNCTGAAGTTATTCGTGCTTTAATCTTTTCCAGTTCTCCATGCTGTTTTCCTCTTTTAATGGAATTTGTTGTTGAGATCTCTTTTGAACTCATTAAGCTTGTTACCATCTGGAAGGTTTGTTTTCATGCATCCAGCATGATACATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAGTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCGTTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTAGCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATGCAGACATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCAGGCANACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCCACTCCTTTCAATATTCCGTCTAATAAGCTAACAGGACATTCCATCTACTATTCACATATAACTTCATGTTTATTTGTTTTAATTATAAATATA]

[+] EMBL CD080906             [NNNNNNNNNNNNNNNAGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTATCAGTTGGGTGATTTTACAATTAATTTTATCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGATATTTAATCGAGGGTGTCTACAGCGATTAATTCTTTATGCTGGTGTTTCTTGGAGCCCAGGATTTNNNNNNNNCTGAAGTTATTCGTGCTTTAATCTTTTCCAGTTCTCCATGCTGTTTTCCTCTTTTAATGGAATTTGTTGTTGAGATCTCTTTTGAACTCATTAAGCTTGTTACCATCTGGAAGGTTTGTTTTCATGCATCCAGCATGATACATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAGTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCGTTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTAGCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATGCAGACATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCAGGCANACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCCACTCCTTTCAATATTCCGTCTAATAAGCTAACAGGACATTCCATCTACTATTCACATATAACTTCATGTTTATTTGTTTTAATTATAAATATA]


>consensus_9067#2 NNNNNNNNNNNNNNNAGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTATCAGTTGGGTGATTTTACAAT TAATTTTATCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGATATTTAATCGAGGG TGTCTACAGCGATTAATTCTTTATGCTGGTGTTTCTTGGAGCCCAGGATTTNNNNNNNNC TGAAGTTATTCGTGCTTTAATCTTTTCCAGTTCTCCATGCTGTTTTCCTCTTTTAATGGA ATTTGTTGTTGAGATCTCTTTTGAACTCATTAAGCTTGTTACCATCTGGAAGGTTTGTTT TCATGCATCCAGCATGATACATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAG TATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCGT TTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTAG CTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATGCAGACATATCAACGTTG TTAGACGTTTATCAGGCANACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATC ATCATATGCCACTCCTTTCAATATTCCGTCTAATAAGCTAACAGGACATTCCATCTACTA TTCACATATAACTTCATGTTTATTTGTTTTAATTATAAATATA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9067#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9067#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9067#0      GATTGGGCGCTCCAAATGCTTCATCTTTTCCACTGTTTTTGATTGATTGACCGAATGACA 60
                                                                                  

consensus_9067#1      -----------AGGCAACAGCTCTTGTTGCCGATATATCTTTTCGTGCAATTCCCAGGGG 49
consensus_9067#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9067#0      GGAGTTTCGTGTGTGTTATTACTCAATTCATCTGAAGGAAACAGTGATCCACAGATTCTT 120
                                                                                  

consensus_9067#1      TGGCTTAAAANGCCTTTTATCAACGTAAGAAGAAATTACAGTTGAAGCTAAAGGAATAAA 109
consensus_9067#2      ------------------------NNNNNNNNNNNNNNNAGTTGAAGCTAAAGGAATAAA 36
consensus_9067#0      GAGAATCTTATGAAGAAATTAGAACTTCTTGGTGCACAAAAGTGCGGTCGAATACATATA 180
                                                             *  **  *   **   *** *

consensus_9067#1      GTATCAGTTGGGTGATTTTACAATTAATTTTA-TCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTT 168
consensus_9067#2      GTATCAGTTGGGTGATTTTACAATTAATTTTA-TCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTT 95
consensus_9067#0      GAAAGCGCAGTTTACTTTTCAAACTTTTCCAGGTCTCAGTGTAAAACATTTCAAGTTCTC 240
                      * *   *  *  *  ****  ** *  *     ** ** * *  *        *** ** 

consensus_9067#1      CCGTTAAA-GGATATTTA--ATCGAGGGTG----TCTACAGCGATTAA----TTCTTTAT 217
consensus_9067#2      CCGTTAAA-GGATATTTA--ATCGAGGGTG----TCTACAGCGATTAA----TTCTTTAT 144
consensus_9067#0      ACATCAACTGAATATCCAGCATCATGTTTTGTATTCTCTGACAATCAAACAGCTCTTGTT 300
                       * * **  * ****  *  ***  *  *     ***    * ** **     ****  *

consensus_9067#1      GCTGGTGTTTCTT---------------GGAGCCCAGGA---TTTCCTAGCATGCTGAAG 259
consensus_9067#2      GCTGGTGTTTCTT---------------GGAGCCCAGGA---TTTNNNNNNNN-CTGAAG 185
consensus_9067#0      GCCGATATATCTTTTCGTGAATTCCCAGGGTGCTTAAAAGCCTTTTATCAACGTAAGAAG 360
                      ** * * * ****               ** **  *  *   ***           ****

consensus_9067#1      TTATTCGTGCTTTAATCTTTTCCAGTTCTCCATGCTGTTTTCCTCTTTTAATGGAATTTG 319
consensus_9067#2      TTATTCGTGCTTTAATCTTTTCCAGTTCTCCATGCTGTTTTCCTCTTTTAATGGAATTTG 245
consensus_9067#0      AAATTACAAGTTGAAGCTAAAGGAATAAAGTAT-CAGTTGGGTGATTTTACAATTAATT- 418
                        ***     ** ** **     * *     ** * ***      *****     * ** 

consensus_9067#1      TTGTTGAGATCTCTTTTGAACTCATTAAGCTTGTTAC----CATCTGG--AAGGTTTGTT 373
consensus_9067#2      TTGTTGAGATCTCTTTTGAACTCATTAAGCTTGTTAC----CATCTGG--AAGGTTTGTT 299
consensus_9067#0      TTATCACAATATTCATGGGACAGAGTGCTTCCGTTAAAGGATATTTAATCGAGGTTTGTT 478
                      ** *    ** *   * * **  * *      ****      ** *     *********

consensus_9067#1      TTCATGCATCCAGCATGATACATTTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCTTTTATTACCC-AA 432
consensus_9067#2      TTCATGCATCCAGCATGATACATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAA 359
consensus_9067#0      TTCATGCATCCAGCATGATACATTTGTGTCGTGACGTATTAAAAGCTTTTATTACCC-AA 537
                      **************************                              * **

consensus_9067#1      GTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCG 492
consensus_9067#2      GTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCG 419
consensus_9067#0      GTATTACCGGACATTTGTCCACCAGCTAATAGTTCGACAGAACATATATTCAGCCCATCG 597
                      ************************************************************

consensus_9067#1      TTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTA 552
consensus_9067#2      TTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTA 479
consensus_9067#0      TTTTTACAAGCTGTTGAAACGGGCACATTTGATGCACCACGTTGGCCGCCTAGTCAATTA 657
                      ************************************************************

consensus_9067#1      GCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATTATCTCATGTTTGCGTT 612
consensus_9067#2      GCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCAT----------------- 522
consensus_9067#0      GCTTTCCCAGTGGAAAATAACTTCCTGCAAGATGATTCTCCATTATCTCATGTTTGCGTT 717
                      *******************************************                 

consensus_9067#1      CGACTAACAATGACACAATATGCAGAACATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCAAGGCAA 672
consensus_9067#2      ---------------------GCAGA-CATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCA-GGCAN 559
consensus_9067#0      CGACTAACAATGACACAATATGCAGAACATATCAACGTTGTTAGACGTTTATCAAGGCAA 777
                                           ***** *************************** **** 

consensus_9067#1      ACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCAACTCCTTCA 732
consensus_9067#2      ACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCCACTCCTTTC 619
consensus_9067#0      ACTGTAAACACACCAAGTACGCTTGCTACAAATGGTTCATCATCATATGCAACTCCTTCA 837
                      ************************************************** *******  

consensus_9067#1      AATATTCCGTCTAATCAAGCTAACAAGAACATTCCATCTAACTATTCAACATAATAACTT 792
consensus_9067#2      AATATTCCGTCTAAT-AAGCTAACAGGA-CATTCCATCTA-CTATTCA-CATA-TAACTT 674
consensus_9067#0      AATATTCCGTCTAATCAAGCTAACAAGAACATTCCATCTAACTATTCAACATAATAACTT 897
                      *************** ********* ** *********** ******* **** ******

consensus_9067#1      CAATGTTTATTTGTTTTTAATTAATAAA-TATTATA 827
consensus_9067#2      CA-TGTTTATTTGTTTT-AATTA-TAAA-TATA--- 703
consensus_9067#0      CAATGTTTATTTGTTTTTAATTAATAAAATATTATA 933
                      ** ************** ***** **** ***    




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)