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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9072#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 486 fasta sequence
[GATATTGGTCATATTCTTCCTGTAGTTGGTCTAAACTCCTCTTATAAAACATAGCATCAGCCCGTAATTTTGATTTGATTGATTCCCATTCTCTGGTTACTAAATCATCTTCTGGTTCAGTGTATTCACGTAATTCAGCTAATTGTTGTTCCAATTCTTTGTTNTGTTGTTCAAGTTTTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA-TCTAATA-TAGATATTTTATCATA-TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC-AGTTG-TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[+] EMBL CD197826 [GATATTGGTCATATTCTTCCTGTAGTTGGTCTAAACTCCTCTTATAAAACATAGCATCAGCCCGTAATTTTGATTTGATTGATTCCCATTCTCTGGTTACTAAATCATCTTCTGGTTCAGTGTATTCACGTAATTCAGCTAATTGTTGTTCCAATTCTTTGTTTTGTTGTTCAAGTTTTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTGTTTTTTTCATTTCAGCTA ]
[-] EMBL CD171357 [ TGGTTACTAAATCATCTTCTGGTTCATTGTATTCACGTAATTCAGCTAATTGTTGTTCCAATTCTTTATTNTGTTGTTCAAGTTTTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACCTAGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[-] EMBL CD171252 [ tnNTGTGTTTCAAGTTNTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTACCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGTGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[-] EMBL CD171269 [ CAAGTTNTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[-] EMBL CD171207 [ AACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[-] EMBL CD171395 [ ACGCAATTGTCTATTCTAATAGTAGATATTTTTTCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATGTCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTGTTTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[-] EMBL CD171268 [ ATAGTAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATGTCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[-] EMBL CD171439 [ AACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATTTCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||