These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9087#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 579 fasta sequence [TTTAATATTCGTGGTTGACAGTAATGACACTGATCGCATTGGGGAAGCAAAGGACGAGTTGTTCCGTATGTTACAAGAAGATGAGTTACGAGATA-CACTT--CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATA-GACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAAATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCATATTGCGATATCT-AATTGTAAACTTGACTAATACAATAT] [+] EMBL CD145791 [TTTAATATTCGTGGTTGACAGTAATGACACTGATCGCATTGGGGAAGCAAAGGACGAGTTGTTCCGTATGTTACAAGAAGATGAGTTACGAGATA CACTT CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATA GACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCANATTTGTTAATGTTTTAATGCANAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCATATTGCGATATCTAAATTG ] [+] EMBL CD142686 [ TATGTTACAAGAAGATGAGTTACGAGATA CACTT CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCAC ] [+] EMBL CD142547 [ TATGTTACAAGAAGATGAGTTACGAGATA CACTT CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTNCAAGTGCTGTGAGACAACGGC ] [+] EMBL CD145824 [ TTACGAGATA CACTC CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATA GACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAAATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCATATTGCGATATCT AATTGTAAA ] [+] EMBL CD080434 [ GAGATACCACTTNNCTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATA GACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAAATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCATATTGCGATATCT AATTGTAAACTTGACTAATACAATA ] [-] EMBL CD074347 [ AGATA CACTT CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATA GACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAAATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCATATTGCGATATCT AATTGTAAACTTGACTAATACAATAT] [-] EMBL CD074526 [ AGATA CACTT CTTTTGGTCTTTGCAAACAAACAAGATCTACCCAATGCTTTGAAACCTACGGAACTTACAGATAAATTAGGACTACATCAATTACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAACGGCGATTGGCCTTTTTTCTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAACCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATA GACAAGTGGATTTCGGCCCATTCGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAAATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACTAACGTTACATTTCATATTGCGATATCT AATTGTAAACTTGACTAATACAATAT] [-] EMBL AI976051 [ ACGGAACCGCACATGGTATATTCAAGGGACATGTGCTACAAACAGTTCCGGTTTATTTGAGGGTTTAGATTGGCTCTGTCAAAATTTAGGTGGAAAGAATTAATAAGTTTTTTGCATTTTCATTCAAAGTGCTGTGAGACAGCGGCGATTGGCCTTTTTTTTTCTTACTTCACATGTTTATTGGTTTCATAAAATCTGTTGTGTACATTTAATGTAGCCATTTAACTAGATTTCCGCAATAATATGACAAGTGGATTTCGGCCCATTGGTCGCTTGCATTTTTCCATTTTCTTTTCAAATTTGTTAATGTTTTAATGCAAAAATTCAATGTCTTATACGTGACCAGCGTTACATTTCATATTGCGATATTT AATTGTAAACTTGACTAATACAATAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||