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Schistosoma mansoni
cluster # 9089 cluster # 9089       Sequences # 8       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9089#0 length = 1011 sequences # 4  
consensus_9089#1 length = 665 sequences # 3  
consensus_9089#2 length = 455 sequences # 1  

consensusID : consensus_9089#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1011
fasta sequence
                              [CGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAAAATTAATAATATATCATTTAATGGTCGACGTCATTATCATGTAGCATCATATTTACAAAGTATTCCAATAACAGATGTATTTTGTCTACGATTAATATCACCAGAACGTTGTCCAATGTATATGATCAATTCACGTTCAAAAAATAAAAATAATCATATTGGATCCGGTAAAAGAACTATTCGATTTAAACAAGATGGTAATATAGAAGAAAATGAGATTGTAGATGTTGAAATCGAAGGAATTCAAAGAATTAATGAAATACTTGATGATAAACTTGGTTTTGAAGATAATGAGCTTGCATTCTACATATATAAATTAGCTAAATCTTCAATGAATCCAAATGATTTAGATCAACATATTAATAAGAATAAATTATTTGATTTTATATTACCAAAATATTTAATTAGACAATTTTGGCAAACAGTTAATTGTATATGATGATCAGAAACTTTATATATATATATATATAACTTATTCTAATACAAATAGTTGATTAGTATATGAATCAAAATAATATACCTCTATTGATACAGTTCTACAATGTATGTGATCGATGATGTTGAAGAATTCAATCAGAATTTTCACTACCGGTGAAATAAGAAAAAGAGATTATTATCGCTCTCTCTGTCGTTATCTCTTGCCTATCCTTCCGCATGCGTTTGTCTACCCTTCTGTGCACGCGCTGTCTTTCTCTCTCTCTCGTTATCTCTTGCTTTTGCTTTCGCATGCGTTCACTTATTCTTATATCACGGGTACTCTTCTGCACGCGCGTTCTTTCTCTCTCCATCTCTCTCTAACCCTCGCTTATTCTTCTGAATTCTCTCTTTCTTCTTCTATTTCTTTGTAATTATAAGTTTCAAAAAGTATTCTCAACAGTTATCTTTAAATTGGAAACACTTTACTGAACATTGCATAATTTTATTTGGGATGCTTTAAACATGAATATCTATATATATAATTACATTCATTTAAAGTATAATTTG]

[+] EMBL CD080417             [CGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAAAATTAATAATATATCATTTAATGGTCGACGTCATTATCATGTAGCATCATATTTACAAAGTATTCCAATAACAGATGTATTTTGTCTACGATTAATATCACCAGAACGTTGTCCAATGTATATGATCAATTCACGTTCAAAAAATAAAAATAATCATATTGGATCCGGTAAAAGAACTATTCGATTTAAACAAGATGGTAATATAGAAGAAAATGAGATTGTAGATGTTGAAATCGAAGGAATTCAAAGAATTAATGAAATACTTGATGATAAACTTGGTTTTGAAGATAATGAGCTTGCATTCTACATATATAAATTAGCTAAATCTTCAATGAATCCAAATGATTTAGATCAACATATTAATAAGAATAAATTATTTGATTTTATATTACCAAAATATTTAATTAGACAATTTTGGCAAACAGTTAATTGTATATGATGATCAGAAACTTTATATATATATATATATAACTTATTCTAATACAAATAGTTGATTAGTATATGAATCAAAATAATATACCTCTATTGATACAGTTCTACAATGTATGTGATCGATGATGTTGAAGAATTCAATCAGAATTTTCACTACCGGTGAAATAAGAAAAAGAGATTATTATCGCTCTCTCTGTCGTTATCTCTTGCCTATCCTTCCGCATGCGTTTGTCTACCCTTCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD074331             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTCTACATATATAAATTAGCTAAATCTTCAATGAATCCAAATGATTTAGATCAACATATTAATAAGAATAAATTATTTGATTTTATATTACCAAAATATTTAATTAGACAATTTTGGCAAACAGTTAATTGTATATGATGATCAGAAACTTTATATATATATATATATAACTTATTCTAATACAAATAGTTGATTAGTATATGAATCAAAATAATATACCTCTATTGATACAGTTCTACAATGTATGTGATCGATGATGTTGAAGAATTCAATCAGAATTTTCACTACCGGTGAAATAAGAAAAAGAGATTATTATCGCTCTCTCTGTCGTTATCTCTTGCCTATCCTTCCGCATGCGTTTGTCTACCCTTCTGTGCACGCGCTGTCTTTCTCTCTCTCTCGTTATCTCTTGCTTTTGCTTTCGCATGCGTTCACTTATTCTTATATCACGGGTACTCTTCTGCACGCGCGTTCTTTCTCTCTCCATCTCTCTCTAACCCTCGCTTATTCTTCTGAATTCTCTCTTTCTTCTTCTATTTCTTTGTAATTATAAGTTTCAAAAAGTATTCTCAACAGTTATCTTTAAATTGGAAACACTTTACTGAACATTGCATAATTTTATTTGGGATGCTTTAAACATGAATATCTATATATATAATTACATTCATTTAAAGTATAATTTG]
[-] EMBL CD074509             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCTACATATATAAATTAGCTAAATCTTCAATGAATCCAAATGATTTAGATCAACATATTAATAAGAATAAATTATTTGATTTTATATTACCAAAATATTTAATTAGACAATTTTGGCAAACAGTTAATTGTATATGATGATCAGAAACTTTATATATATATATATATAACTTATTCTAATACAAATAGTTGATTAGTATATGAATCAAAATAATATACCTCTATTGATACAGTTCTACAATGTATGTGATCGATGATGTTGAAGAATTCAATCAGAATTTTCACTACCGGTGAAATAAGAAAAAGAGATTATTATCGCTCTCTCTGTCGTTATCTCTTGCCTATCCTTCCGCATGCGTTTGTCTACCCTTCTGTGCACGCGCTGTCTTTCTCTCTCTCTCGTTATCTCTTGCTTTTGCTTTCGCATGCGTTCACTTATTCTTATATCACGGGTACTCTTCTGCACGCGCGTTCTTTCTCTCTCCATCTCTCTCTAACCCTCGCTTATTCTTCTGAATTCTCTCTTTCTTCTTCTATTTCTTTGTAATTATAAGTTTCAAAAAGTATTCTCAACAGTTATCTTTAAATTGGAAACACTTTACTGAACATTGCATAATTTTATTTGGGATGCTTTAAACATGAATATCTATATATATAATTACATTCATTTAAAGTATAATTTG]
[-] EMBL CD076861             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATTACCAAAATATTTAATTAGACAATTTTGGCAAACAGTTAATTGTATATGATGATCAGAAACTTTATATATATATATATATAACTTATTCTAATACAAATAGTTGATTAGTATATGAATCAAAATAATATACCTCTATTGATACAGTTCTACAATGTATGTGATCGATGATGTTGAAGAATTCAATCAGAATTTTCACTACCGGTGAAATAAGAAAAAGAGATTATTATCGCTCTCTCTGTCGTTATCTCTTGCCTATCCTTCCGCATGCGTTTGTCTACCCTTCTGTGCACGCGCTGTCTTTCTCTCTCTCTCGTTATCTCTTGCTTTTGCTTTCGCATGCGTTCACTTATTCTTATATCACGGGTACTCTTCTGCACGCGCGTTCTTTCTCTCTCCATCTCTCTCTAACCCTCGCTTATTCTTCTGAATTCTCTCTTTCTTCTTCTATTTCTTTGTAATTATAAGTTTCAAAAAGTATTCTCAACAGTTATCTTTAAATTGGAAACACTTTACTGAACATTGCATAATTTTATTTGGGATGCTTTAAACATGAATATCTATATATATAATTACATTCATTTAAAGTATAATTTG]


>consensus_9089#0 CGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAAAATTAATAATATATCATTTAATGGTCGACGTCA TTATCATGTAGCATCATATTTACAAAGTATTCCAATAACAGATGTATTTTGTCTACGATT AATATCACCAGAACGTTGTCCAATGTATATGATCAATTCACGTTCAAAAAATAAAAATAA TCATATTGGATCCGGTAAAAGAACTATTCGATTTAAACAAGATGGTAATATAGAAGAAAA TGAGATTGTAGATGTTGAAATCGAAGGAATTCAAAGAATTAATGAAATACTTGATGATAA ACTTGGTTTTGAAGATAATGAGCTTGCATTCTACATATATAAATTAGCTAAATCTTCAAT GAATCCAAATGATTTAGATCAACATATTAATAAGAATAAATTATTTGATTTTATATTACC AAAATATTTAATTAGACAATTTTGGCAAACAGTTAATTGTATATGATGATCAGAAACTTT ATATATATATATATATAACTTATTCTAATACAAATAGTTGATTAGTATATGAATCAAAAT AATATACCTCTATTGATACAGTTCTACAATGTATGTGATCGATGATGTTGAAGAATTCAA TCAGAATTTTCACTACCGGTGAAATAAGAAAAAGAGATTATTATCGCTCTCTCTGTCGTT ATCTCTTGCCTATCCTTCCGCATGCGTTTGTCTACCCTTCTGTGCACGCGCTGTCTTTCT CTCTCTCTCGTTATCTCTTGCTTTTGCTTTCGCATGCGTTCACTTATTCTTATATCACGG GTACTCTTCTGCACGCGCGTTCTTTCTCTCTCCATCTCTCTCTAACCCTCGCTTATTCTT CTGAATTCTCTCTTTCTTCTTCTATTTCTTTGTAATTATAAGTTTCAAAAAGTATTCTCA ACAGTTATCTTTAAATTGGAAACACTTTACTGAACATTGCATAATTTTATTTGGGATGCT TTAAACATGAATATCTATATATATAATTACATTCATTTAAAGTATAATTTG



consensusID : consensus_9089#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 665
fasta sequence
                              [AGGGAGTGGAGTCAGATATTCTGAAAGGAATGATCCTAATTGTTCCAGGACATTTAACCAAAAAGTATCAGAACCTGTAACACGTCCAGATTACCATTTTTTCTGTCAACTTGCCCATGGAAGCCCCACTGGAATTATACATGGGTTTACTACAGTCCGTCAGCTCCACACGAAAATATCGGAGTGTTTTGATATAAATCCATCTCAGATAATGTTTTGTACCAGAAATACACATAAATTAGATATGGATAAATTATTAACTTATGAAATTGGTTTAAATGATTTTTTATTTGCTCATATAAAAGGACAACCAAAAGAGATTAAAATACGTAAAACAAATGATTTATTTGGTTTAACTCTAACAGATAATGGTTGTGGTATAGTTATTATAAAACGTATTAAACCTGGTAGTTTTATGGATAAAGTATCTAAAGCTTGTGGGGATTTTATACAACCTGGTGATCAAATTGAAAAAATTAATAATATATCATTTAATGGTCGACGTCATTATCATGTAGCATCATATTTACAAAGTATTCCAATAACAGATGTATTTTGTCTACGATTAATATCACCAGAACGTTGTCCAATGTATATGATCAATTTCACG-TCANAAAATAAAAATAATCATATTGGATCCGGGTAAAGAACTATTCGATTTAACA]

[+] EMBL CD083290             [AGGGAGTGGAGTCAGATATTCTGAAAGGAATGATCCTAATTGTTCCAGGACATTTAACCAAAAAGTATCAGAACCTGTAACACGTCCAGATTACCATTTTTTCTGTCAACTTGCCCATGGAAGCCCCACTGGAATTATACATGGGTTTACTACAGTCCGTCAGCTCCACACGAAAATATCGGAGTGTTTTGATATAAATCCATCTCAGATAATGTTTTGTACCAGAAATACACATAAATTAGATATGGATAAATTATTAACTTATGAAATTGGTTTAAATGATTTTTTATTTGCTCATATAAAAGGACAACCAAAAGAGATTAAAATACGTAAAACAAATGATTTATTTGGTTTAACTCTAACAGATAATGGTTGTGGTATAGTTATTATAAAACGTATTAAACCTGGTAGTTTTATGGATAAAGTATCTAAAGCTTGTGGGGATTTTATACAACCTGGTGATCAAATTGAAAAAATTAATAATATATCATTTAATGGTCGACGTCATTATCATGTAGCATCATATTTACAAAGTATTCCAATAACAGATGTATTTTGTCTACGATTAATATCACCAGAACGTTGTCCAATGTATATGATCAATTTCACG TCANAAAA                                               ]
[+] EMBL CD081936             [      gGGAGTCAGATATTCTGAAAGGAATGATCCTAATTGTTCCAGGACATTTAACCAAAAAGTATCAGAACCTGTAACACGTCCAGATTACCATTTTTTCTGTCAACTTGCCCATGGAAGCCCCACTGGAATTATACATGGGTTTACTACAGTCCGTCAGCTCCACACGAAAATATCGGAGTGTTTTGATATAAATCCATCTCAGATAATGTTTTGTACCAGAAATACACATAAATTAGATATGGATAAATTATTAACTTATGAAATTGGTTTAAATGATTTTTTATTTGCTCATATAAAAGGACAACCAAAAGAGATTAAAATACGTAAAACAAATGATTTATTTGGTTTAACTCTAACAGATAATGGTTGTGGTATAGTTATTATAAAACGTATTAAACCTGGTAGTTTTATGGATAAAGTATCTAAAGCTTGTGGGGATTTTATACAACCTGGTGATCAAATTGAAAAAATTAATAATATATCATTTAATGGTCGACGTCATTATCATGTAGCATCATATTTACAAAGTATTCCAATAACAGATGTATTTTGTCTACGATTAATATCACCAGAACGTTGTCCAATGTATATGATCAA TTCACGTTCAAAAAATAAAAATAATCATATTGGATCCGGGTAAAGAACTATTCGATTTAACA]
[+] EMBL BF936407             [                              TGATCCTAATTGTTCCAGGACATTTAACCAAAAAGTATCAGAACCTGTAACACGTCCAGATTACCATTTTTTCTGTCAACTTGCCCATGGAAGCCCCACTGGAATTATACATGGGTTTACTACAGTCCGTCAGCTCCACACGAAAATATCGGAGTGTTTTGATATAAATCCATCTCAGATAATGTTTTGTACCAGAAATACACATAAATTAGATATGGATAAATTATTAACTTATGAAATTGGTTTAAATGATTTTTTATTTGCTCATATAAAAGGACAACCAAAAGAGATTAAAATACGTAAAACAAATGATTTATTTGGTTTAACTCTAACAGATAATGGTTGTGGTATAGTTATTATAAAACGTATTAAACCTGGTAGTTTTATGGATAAAGTATCTAAAGCTTGTGGGGATTTTATACAACCTGGTGATCAAATTGAAAAAATTAATAATATATCATTTAATGGTCGACGTCATTATCATGTAGCATCATATTTACAAAGTATTCCAATAACAGATGTATTTTGTCTACGATTAATATCACCAGAACGTTGTCCAATGTATATGATCAA                                                               ]


>consensus_9089#1 AGGGAGTGGAGTCAGATATTCTGAAAGGAATGATCCTAATTGTTCCAGGACATTTAACCA AAAAGTATCAGAACCTGTAACACGTCCAGATTACCATTTTTTCTGTCAACTTGCCCATGG AAGCCCCACTGGAATTATACATGGGTTTACTACAGTCCGTCAGCTCCACACGAAAATATC GGAGTGTTTTGATATAAATCCATCTCAGATAATGTTTTGTACCAGAAATACACATAAATT AGATATGGATAAATTATTAACTTATGAAATTGGTTTAAATGATTTTTTATTTGCTCATAT AAAAGGACAACCAAAAGAGATTAAAATACGTAAAACAAATGATTTATTTGGTTTAACTCT AACAGATAATGGTTGTGGTATAGTTATTATAAAACGTATTAAACCTGGTAGTTTTATGGA TAAAGTATCTAAAGCTTGTGGGGATTTTATACAACCTGGTGATCAAATTGAAAAAATTAA TAATATATCATTTAATGGTCGACGTCATTATCATGTAGCATCATATTTACAAAGTATTCC AATAACAGATGTATTTTGTCTACGATTAATATCACCAGAACGTTGTCCAATGTATATGAT CAATTTCACGTCANAAAATAAAAATAATCATATTGGATCCGGGTAAAGAACTATTCGATT TAACA



consensusID : consensus_9089#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 455
fasta sequence
                              [GGACGAAGAGATTATTATCGCTCTCTCTGTCGTTATCTCTTGCCTATCCTTCCGCATGCGCGTGCACAGAAGGGTAGACAAACGCATGCGCTGTCTTTCTCTCTCTCTCGTTATCTCTTGCTTTTGCTTTCGCATGCGTTCACTTATTCTTATATCACGGGTACTCTTCTGCACGCGCGTTCTTTCTCTCTCCATCTCTCTCTAACCCTCGCTTATTCTTCTGAATTCTCTCTTTCTTCTTCTATTTCTTTGTAATTATAAGTTTCAAAAAGTATTCTCAACAGTTATCTTTAAATTGGAAACACTTTACTGAACATTGCATAATTTTATTTGGGATGCTTTAAACATGAATATCTATATATATAATTACATTCATTTAAAGTATAATTTGATTGATTTTAATTTGTATATTTCTTATGAATAATAATATTTGTTCAATTGAAAAAAACACAAAA]

[+] EMBL CD084329             [GGACGAAGAGATTATTATCGCTCTCTCTGTCGTTATCTCTTGCCTATCCTTCCGCATGCGCGTGCACAGAAGGGTAGACAAACGCATGCGCTGTCTTTCTCTCTCTCTCGTTATCTCTTGCTTTTGCTTTCGCATGCGTTCACTTATTCTTATATCACGGGTACTCTTCTGCACGCGCGTTCTTTCTCTCTCCATCTCTCTCTAACCCTCGCTTATTCTTCTGAATTCTCTCTTTCTTCTTCTATTTCTTTGTAATTATAAGTTTCAAAAAGTATTCTCAACAGTTATCTTTAAATTGGAAACACTTTACTGAACATTGCATAATTTTATTTGGGATGCTTTAAACATGAATATCTATATATATAATTACATTCATTTAAAGTATAATTTGATTGATTTTAATTTGTATATTTCTTATGAATAATAATATTTGTTCAATTGAAAAAAACACAAAA]


>consensus_9089#2 GGACGAAGAGATTATTATCGCTCTCTCTGTCGTTATCTCTTGCCTATCCTTCCGCATGCG CGTGCACAGAAGGGTAGACAAACGCATGCGCTGTCTTTCTCTCTCTCTCGTTATCTCTTG CTTTTGCTTTCGCATGCGTTCACTTATTCTTATATCACGGGTACTCTTCTGCACGCGCGT TCTTTCTCTCTCCATCTCTCTCTAACCCTCGCTTATTCTTCTGAATTCTCTCTTTCTTCT TCTATTTCTTTGTAATTATAAGTTTCAAAAAGTATTCTCAACAGTTATCTTTAAATTGGA AACACTTTACTGAACATTGCATAATTTTATTTGGGATGCTTTAAACATGAATATCTATAT ATATAATTACATTCATTTAAAGTATAATTTGATTGATTTTAATTTGTATATTTCTTATGA ATAATAATATTTGTTCAATTGAAAAAAACACAAAA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9089#0      CGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAAAATTAATAATATATCATTTAATGGTCGACGTCA 60
consensus_9089#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9089#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9089#0      TTATCATGTAGCATCATATTTACAAAGTATTCCAATAACAGATGTATTTTGTCTACGATT 120
consensus_9089#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9089#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9089#0      AATATCACCAGAACGTTGTCCAATGTATATGATCAATTCACGTTCAAAAAATAAAAATAA 180
consensus_9089#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9089#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9089#0      TCATATTGGATCCGGTAAAAGAACTATTCGATTTAAACAAGATGGTAATATAGAAGAAAA 240
consensus_9089#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9089#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9089#0      TGAGATTGTAGATGTTGAAATCGAAGGAATTCAAAGAATTAATGAAATACTTGATGATAA 300
consensus_9089#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9089#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9089#0      ACTTGGTTTTGAAGATAATGAGCTTGCATTCTACATATATAAATTAGCTAAATCTTCAAT 360
consensus_9089#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9089#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9089#0      GAATCCAAATGATTTAGATCAACATATTAATAAGAATAAATTATTTGATTTTATATTACC 420
consensus_9089#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9089#1      --------------AGGGAGTGGAGTCAGATATTCTGAAAGGAATGATCCTAATTGTTCC 46
                                                                                  

consensus_9089#0      AAAATATTTAATTAGACAATTTTGGCAAACAGTTAATTGTATATGATGATCAGAAACTTT 480
consensus_9089#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9089#1      AGGACATTTAACCAAAAAGTATCAG-AACCTGTAACACGTCCA-GATTACCATTTTTTCT 104
                                                                                  

consensus_9089#0      ATATATATATATATATAACTTATTCTAATACAAATAGTTGATTAGTATATGAATCAAAAT 540
consensus_9089#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9089#1      GTCAACTTGCCCATGGAAGCCCCACTGG----AATTATACATGGGTTTACTACAGTCCGT 160
                                                                                  

consensus_9089#0      AATATACCTCTATTGATACAGTTCTACAATGTATGTGATCGATGATGTTGAAGAATTCAA 600
consensus_9089#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9089#1      CAGCTCCACACGAAAATATCGGAGTGTTTTGATATAAATCCATCTCAGATAATGTTTTGT 220
                                                                                  

consensus_9089#0      TCAGAATTTTCACTACCGGTGAAATAAGAAAAAGAGATTA--TTATCGCTCTCTCTGTCG 658
consensus_9089#2      --------------------------GGACGAAGAGATTA--TTATCGCTCTCTCTGTCG 32
consensus_9089#1      ACCAGAAATACAC-ATAAATTAGATATGGATAAATTATTAACTTATGAAATTGGTTTAAA 279
                                                 *   **   ****  ****     *   *    

consensus_9089#0      TTATCTCTTGCCTATCCTTCCGCATGCGTTTGTCTACCCTTCTG------TGCACGCGCT 712
consensus_9089#2      TTATCTCTTGCCTATCCTTCCGCATGCGCGTGCACAGAAGGGTAGACAAACGCATGCGCT 92
consensus_9089#1      TGATTTTTTATTTGCTCATATAAAAGGACAACCAAAAGAGATTAAA-ATACGTAAAACAA 338
                      * ** * **   *   * *    * *         *      *        * *      

consensus_9089#0      GTCTTTCTCTCTCTCTCGTTATCTCTTGCTTTTGCTTTCGCATGCGTTCACTTATTCTTA 772
consensus_9089#2      GTCTTTCTCTCTCTCTCGTTATCTCTTGCTTTTGCTTTCGCATGCGTTCACTTATTCTTA 152
consensus_9089#1      ATGATTTATTTGGTTTAACTCTAACAGATAATGGTTGTGGTATAGTTATTATAAAACGTA 398
                       *  **   *   * *   * *  *      * * * * * **   *    * *  * **

consensus_9089#0      TATCACG-GGTACTCTTCTGCACGCGCGTTCTTTCTCTCTCCATCTCTCTCTAACCCTCG 831
consensus_9089#2      TATCACG-GGTACTCTTCTGCACGCGCGTTCTTTCTCTCTCCATCTCTCTCTAACCCTCG 211
consensus_9089#1      TTAAACCTGGTAGTTTTATGGATAAAGTATCTAAAGCTTGTGGGGATTTTATACAACCTG 458
                      *   **  **** * ** ** *       ***    **         * * **   *  *

consensus_9089#0      CTTATTCTTCTGAA-----------TTCTCTCTTTCTTCTTCTATTTCTTTGTAAT---- 876
consensus_9089#2      CTTATTCTTCTGAA-----------TTCTCTCTTTCTTCTTCTATTTCTTTGTAAT---- 256
consensus_9089#1      GTGATCAAATTGAAAAAATTAATAATATATCATTTAATGGTCGACGTCATTATCATGTAG 518
                       * **     ****           *      ***  *  ** *  ** ** * **    

consensus_9089#0      TATAAGTTTCAAAAAGTATTCT--CAACAGTTATCTTTAAATTGGAAACACT-TTACT-G 932
consensus_9089#2      TATAAGTTTCAAAAAGTATTCT--CAACAGTTATCTTTAAATTGGAAACACT-TTACT-G 312
consensus_9089#1      CATCATATTTACAAAGTATTCCAATAACAGATGTATTTTGTCTACGATTAATATCACCAG 578
                       ** *  ** * *********    ***** * * ***    *   *  * * * **  *

consensus_9089#0      AACATTGCATAATTTTATTTGGGATGCTTTAAACATGAATATCTATATATATA-ATTACA 991
consensus_9089#2      AACATTGCATAATTTTATTTGGGATGCTTTAAACATGAATATCTATATATATA-ATTACA 371
consensus_9089#1      AACGTTGTCCAATGT-ATATGATCAATTTCACGTCANAAAATAAAAATAATCATATTGGA 637
                      *** ***   *** * ** **      ** *      ** **  * ***   * ***  *

consensus_9089#0      TTCATTTAAAGTATAATTTG---------------------------------------- 1011
consensus_9089#2      TTCATTTAAAGTATAATTTGATTGATTTTAATTTGTATATTTCTTATGAATAATAATATT 431
consensus_9089#1      TCCGGGTAAAGAACTATTCGATTTAACA-------------------------------- 665
                      * *   ***** *  *** *                                        

consensus_9089#0      ------------------------
consensus_9089#2      TGTTCAATTGAAAAAAACACAAAA 455
consensus_9089#1      ------------------------
                                              




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)