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Schistosoma mansoni
cluster # 9090 cluster # 9090       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9090#0 length = 1300 sequences # 8  
consensusID : consensus_9090#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1300
fasta sequence 
                              [ACAAGGGGAGTGGGAGATTTGAGTACAGTTACCTACTGTG-CCGAAGAATTATG-AATCAGCTTGAGCAAGATTTACGAACTAAACCGATTTGTCTAATTGTCCTTGGTATGGCTGGCTCAGGCAAAACGACATTTGTAAAGAAGCTAAATGAGTATTTAACAGTTTCATCAAATTCGTCGTATACAATTAATTTAG-ACCCAGCAGTCCATCATATTCCGTACAATCCTAACATT-GATATTCGCG-ATACTGTCAAG-TTTAAAGAGGTTATG-AAACAATATGGTTATGGACCAAATGGAGCTATTATGACATCGTTGAATTTTTTCGCTTCACAATTTCATAAAGTTGTGGATATAATTAACAACAACTCCGGAAAGTATTCCTATGTAATAATTGATACGCCTGGACAAATCGAAGTGTTTACATGGTCTGCTTCAGGAAGTATTATTACAGAACTATTAGGCAATTCTTTTCCTACTCTGATTATCTACGTAATGGATACTCCACGAAGTCACAATCCTATCACATTCATGTCTAACATGCTCTATGCTTGCAGTGTGTTGTATAAAATGCAACTTCCGTTTATATTAGTTCTCAATAAAACTGATATTATAGACTGTGATTTCGCTATCCAATGGATGAGGGACTTTGAAACATTTCAAGATGCTCTAGCTGGTCATCATCAATCAACTGATGGACCGTCTGAATTAGAAGGTGATAATCCTTGTCCTGGGACATCACCATACATGAATAGTCTGGTTCATTCTATGTCATTAGTATTAGATGAATTCTATAGTACTTTGCGTTGTTGTGGTATCTCGTCGATAACTGGTGAAGGCATGACAAAGTTTGTGGAAGAGATTGATGAAGCCAAAGAAGAATACTTTAAGATAAATCTTCCAAGTTTGTATGCTAAACAAG-AAAAAAACAAGCAAAATCCAAGCGATAAATCTAGTAAGTCTCACTCATCTAAACATGGACCAATGCTTTTGGATTTGGCTGGTAATGATGACGAAGCTGAATATGATCCACTACCTGATGTTGATGGTATAGAAATTTGTCCGCACAGTGATTCAGATGATGATGATGAATTTGTGGAATCAAAAGATTTCACATCTATTCAAAATAAATTTCAACAGTCATGCTCTGTTGATCCTGTTAGTTTTACGAATTGTGAAAATTAACCGCCCCCCTTTTTATAAACGGCAATAATGATTTTGTACAAAATATTTGAGATTACTTTTTTGTGTTGAGATTATAACATTCCTATGATTAATGTTACCTCTTTTTTTAAATATACGTT]

[+] EMBL CD133477             [ACAAGGGGAGTGGGAGATTTGAGTACAGTTACCTACTGTG CCGAAGAATTATG AATCAGCTTGAGCAAGATTTACGAACTAAACCGATTTGTCTAATTGTCCTTGGTATGGCTGGCTCAGGCAAAACGACATTTGTAAAGAAGCTAAATGAGTATTTAACAGTTTCATCAAATTCGTCGTATACAATTAATTTAG ACCCAGCAGTCCATCATATTCCGTACAATCCTAACATT GATATTCGCG ATACTGTCAAG TTTAAAGAGGTTATG AAACAATATGGTTATGGACCAAATGGAGCTATTATGACATCGTTGAATTTTTTCGCTTCACAATTTCATAAAGTTGTGGATATAATTAACAACAACTCCGGAAAGTATTCCTATGTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD189368             [         GTGGGAGATTTGAGTACAGTTACCTGCTGTG CTGAAGAATTATG AATCAGCTTGAGCAAGATTTACGAACTGAACCGATTTGTCTAATTGTCCTTGGTATGGATGGCTCAGGCAAAACGACATTTGTAAAGAAGATAAATGAGTATTTAACAGTTTCATCAGATTCGTCGTATACAATTAATTTAG ACCCAGCAGTCCATCATATTCCGTGCAATCATAGCATT GATATTCGCG ATACTGTCAAG TTTAAAGAGGTTATG AAACAATATGGTTATGGACCATATGGAGCTATTATGACATCGTTGAATTTTTTCGCTTCCCAATTTCATAAAGATGTGGATATAATTAACAACAACTCCGGAAAGTATTCCTATGTAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AA559354             [                                    gGTGCCCGAAAAATTATGAAATCAGCTTGAGCAAGATTTACGAACTAAACCGATTTGTCTAATTGTCCTTGGTANGGCTGGCTCAGGCAAAACGACNTTTGTAAAGAAGCTAAATGAGTATTTAACAGTTTCATCAAATTCGTCGTATACAATTNNTTTAGAACCCAGCAGTCCATCATATNCCGTACAATCCTAACATTGGATATNCGCGAATACTGTCAAGTTTTAAAGAGGTTATGAAAACAATATGGTTATGGgac                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD082995             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaggCAAATGGAGCTATTATGACATCGTTGAATTTTTTCGCTTCACAATTTCATAAAGTTGTGGATATAATTAACAACAACTCCGGAAAGTATTCCTATGTAATAATTGATACGCCTGGACAAATCGAAGTGTTTACATGGTCTGCTTCAGGAAGTATTATTACAGAACTATTAGGCAATTCTTTTCCTACTCTGATTATCTACGTAATGGATACTCCACGAAGTCACAATCCTATCACATTCATGTCTAACATGCTCTATGCTTGCAGTGTGTTGTATAAAATGCAACTTCCGTTTATATTAGTTCTCAATAAAACTGATATTATAGACTGTGATTTCGCTATCCAATGGATGAGGGACTTTGAAACATTTCAAGATGCTCTAGCTGGTCATCATCAATCAACTGATGGACCGTCTGAATTAGAAGGTGATAATCCTTGTCCTGGGACATCACCATACATGAATAGTCTGGTTCATTCTATGTCATTAGTATTAGATGAATTCTATAGTACTTTGCGTTGTTGTGGTATCTCGTCGATAACTGGTGAAGGCATGACAAAGTTTGTGGAAGAGATTGATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD115416             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATGCTCTATGCTTGCAGTGTGTTGTATAAAATGCAACTTCCGTTTATATTAGTTCTCAATAAAACTGATATTATAGACTGTGATTTCGCTATCCAATGGATGATGGACTTTGAAACATTTCAAGATGCTCTAGCTGGTCATCATCAATCAACTGATGGACCGTCTGAATTAGAAGGTGATTATCCTTGTCCTGGGACATCACCATACATGAATAGTCTGGTTCATTCTATGTCATTAGTATTAGATGAATTCTATAGTACTTTGCGTTGTTGTGGTATCTCGTCGATAACTGGTGAAGGCATGACAAAGTTTGTGGAAGAGATTGATGAAGCCAAGGAAGAATACTTTAAGATAAATCTTCCAAGTTTGTATGCTAAACAAGAAAAAAAACAAGCAAAATCCAAGCGATAAATCTAGTAAGTCTCACTCATCTAAACATGGACCAATGCTTTTGGATTTGGCTGGTAATGATGACGAAGCTGAATATGATCCACT                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD159732             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gTGCTTGCAGTGTGTTGTATAAAATGCAACTTCCGTTTATATTAGTTCTCAATAAAACTGATATTATAGACTGTGATTTCGCTATCCAATGGATGAGGGACTTTGAAACATTTCAAGATGCTCTAGCTGGTCATCATCAATCAACTGATGGACCGTCTGAATTAGAAGGTGATAATCCTTGTCCTGGGACATCACCATACATGAATAGTCTGGTTCATTCTATGTCATTAGTATTAGATGAATTCTATAGTACTTTGCGTTGTTGTGGTATCTCGTCGATAACTGGTGAAGGCATGACAAAGTTTGTGGAAGAGATTGATGAAGCCAAAGAAGAATACTTTAAGATAAATCTTCCAAGTTTGTATGCTAAACCAG AAAAAAACAAGCTAAATCCAAGCaca                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD170724             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATAAAATGCAACTTCCGTTTATATTAGTTCTCAATAAAACTGATATTATAGACTGTGATTTCGCTATCCAATGGATGAGGGACTTTGAAACATTTCAAGATGCTCTAGCTGGTCATCATCAATCAACTGATGGACCGTCTGAATTAGAAGGTGATAATCCTTGTCCTGGGACATCACCATACATGAATAGTCTGGTTCATTCTATGTCATTAGTATTAGATGAATTCTATAGTACTTTGCGTTGTTGTGGTATCTCGTCGATAACTGGTGAAGGCATGACAAAGTTTGTGGAAGAGATTGATGAAGCCAAAGAAGAATACTTTAAGATAAATCTTCCAAGTTTGTATGCTAAACAAG AAAAAAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD076578             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCATTCTATGTCATTAGTATTAGATGAATTCTATAGTACTTTGCGTTGTTGTGGTATCTCGTCGATAACTGGTGAAGGCATGACAAAGTTTGTGGAAGAGATTGATGAAGCCAAAGAAGAATACTTTAAGATAAATCTTCCAAGTTTGTATGGTAAACAAG AAAAAAACAAGCAAAATCCAAGCGATAAATTTAGTAAGTTTCACTCATTTAAACATGGACCAATGCTTTTGGATTTGGCTGGTAATGATGACGAAGCTGAAAATGATCCACTACCTGATGTTGATGGTATAGAAATTTGTCCGCACAGTGATTCAGATGATGATGATGAATTTGTGGAATCAAAAGATTTCACATCTATTCAAAATAAATTTCAACAGTCATGCTCTGTTGATCCTGTTAGTTTTACGAATTGTGAAAATTAACCGCCCCCCTTTTTATAAACGGCAATAATGATTTTGTACAAAATATTTGAGATTACTTTTTTGTGTTGAGATTATAACATTCCTATGATTAATGTTACCTCTTTTTTTAAATATACGTT]




>consensus_9090#0
ACAAGGGGAGTGGGAGATTTGAGTACAGTTACCTACTGTGCCGAAGAATTATGAATCAGC
TTGAGCAAGATTTACGAACTAAACCGATTTGTCTAATTGTCCTTGGTATGGCTGGCTCAG
GCAAAACGACATTTGTAAAGAAGCTAAATGAGTATTTAACAGTTTCATCAAATTCGTCGT
ATACAATTAATTTAGACCCAGCAGTCCATCATATTCCGTACAATCCTAACATTGATATTC
GCGATACTGTCAAGTTTAAAGAGGTTATGAAACAATATGGTTATGGACCAAATGGAGCTA
TTATGACATCGTTGAATTTTTTCGCTTCACAATTTCATAAAGTTGTGGATATAATTAACA
ACAACTCCGGAAAGTATTCCTATGTAATAATTGATACGCCTGGACAAATCGAAGTGTTTA
CATGGTCTGCTTCAGGAAGTATTATTACAGAACTATTAGGCAATTCTTTTCCTACTCTGA
TTATCTACGTAATGGATACTCCACGAAGTCACAATCCTATCACATTCATGTCTAACATGC
TCTATGCTTGCAGTGTGTTGTATAAAATGCAACTTCCGTTTATATTAGTTCTCAATAAAA
CTGATATTATAGACTGTGATTTCGCTATCCAATGGATGAGGGACTTTGAAACATTTCAAG
ATGCTCTAGCTGGTCATCATCAATCAACTGATGGACCGTCTGAATTAGAAGGTGATAATC
CTTGTCCTGGGACATCACCATACATGAATAGTCTGGTTCATTCTATGTCATTAGTATTAG
ATGAATTCTATAGTACTTTGCGTTGTTGTGGTATCTCGTCGATAACTGGTGAAGGCATGA
CAAAGTTTGTGGAAGAGATTGATGAAGCCAAAGAAGAATACTTTAAGATAAATCTTCCAA
GTTTGTATGCTAAACAAGAAAAAAACAAGCAAAATCCAAGCGATAAATCTAGTAAGTCTC
ACTCATCTAAACATGGACCAATGCTTTTGGATTTGGCTGGTAATGATGACGAAGCTGAAT
ATGATCCACTACCTGATGTTGATGGTATAGAAATTTGTCCGCACAGTGATTCAGATGATG
ATGATGAATTTGTGGAATCAAAAGATTTCACATCTATTCAAAATAAATTTCAACAGTCAT
GCTCTGTTGATCCTGTTAGTTTTACGAATTGTGAAAATTAACCGCCCCCCTTTTTATAAA
CGGCAATAATGATTTTGTACAAAATATTTGAGATTACTTTTTTGTGTTGAGATTATAACA
TTCCTATGATTAATGTTACCTCTTTTTTTAAATATACGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)