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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9092#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1112 fasta sequence
[GTTTGGCTTAAACTTTTCATTCATACAACCTTGACGATAGTGAATACCGGAAGTTAAATCTTTCTATTCAATTATCAATCAACTAATATAACACCCCTTCCATTTTTCTATTCTCATTTGGTATATGATTGTGATTGTTTATTGATCACGTTATACATTTGGTATCAAAAGTTTTAACCAATTTATTGTATTGTATAGTTACCTTATCAGAATATCACTTATACATATCCTCCTATTTTAATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGAGTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCAAGTGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAGACATCTATTTCAAAAAAAGATTTATACAACTTTTGCTATTCATTCTTTTTAGATTCTAAACTTATTATTATTAATAATTAGATCATTAGTTTGTATTCATTCAAATGTATGTAACTAACTAGTATCTATATTAATTTATTCAATGTACAATGTATTATCTATCATTCAATGGAATTATTCTTTGATCTGTATCTAGTTTATATGTTGTACTCTCTTAGACTTCATTTTCGAAAAAACACATGTTG]
[+] EMBL CD083840 [GTTTGGCTTAAACTTTTCATTCATACAACCTTGACGATAGTGAATACCGGAAGTTAAATCTTTCTATTCAATTATCAATCAACTAATATAACACCCCTTCCATTTTTCTATTCTCATTTGGTATATGATTGTGATTGTTTATTGATCACGTTATACATTTGGTATCAAAAGTTTTAACCAATTTATTGTATTGTATAGTTACCTTATCAGAATATCACTTATACATATCCTCCTATTTTAATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGAGTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTAC AAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCATGTAATAGT ]
[+] EMBL CD083550 [ TTACCTTATCAGAATATCACTTAT CATATCCTCCTATTTTAATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGAGTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTTATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGT ]
[+] EMBL CD077543 [ CTTATCAGAATATCACTTATACATATCCTCCTATTTTAATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGAGTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTANATGTTATC ]
[+] EMBL CD083054 [ gacTTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCAAGTGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAG ]
[-] EMBL CD185466 [ CACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGA ]
[+] EMBL CD185583 [ CACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTACCTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCAAGGGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAGAC ]
[-] EMBL CD076629 [ TCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCAAGTGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAGACATCTATTTCAAAAAAAGATTTATACAACTTTTGCTATTCATTCTTTTTAGATTCTAAACTTATTATTATTAATAATTAGATCATTAGTTTGTATTCATTCAAATGTATGTAACTAACTAGTATCTATATTAATTTATTCAATGTACAATGTATTATCTATCATTCAATGGAATTATTCTTTGATCTGTATCTAGTTTATATGTTGTACTCTCTTAGACTTCATTTTCGAAAAAACACATGTTG]
[+] EMBL SMRAP163 [ ATTCATTCTTTTTAGATTCTAAACTTATTATTATTAATAATTAGATCATTAGTTTGTATTCATTCAAATGTATGTAACTAACTAGTATCTATATTAATTTATT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||