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Schistosoma mansoni
cluster # 9159 cluster # 9159       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9159#0 length = 1595 sequences # 8  

consensusID : consensus_9159#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1595
fasta sequence
                              [AAACTGTTATTCAATCCTGTTACATCAGTAGTCTCTGCTCGTGGTAATGCAGACGGATTACAAAGTTGTTTTGTTTTAGCATGCCTATGGTGTATTCTAAACCGTCGTATCATTCCAGCTGGATTTTTATATGGGTTATGTATTCATGTACGTATATTTCCAATCATTTATGCACCATCTATCTATTTATGGCTAATGATGACTGATAATAGTCATAACAAAGATAATCAAAAGAAAAACAAAGGATCAACACCGCAATCTTAAAGTGTATTTTCAATTTTATTCAAATTACCAAATCGAAATCATTTTCTTTTTGGCATCAGCTGTTTACTCAGTTTGACGATGTTGACTGGATTATGTTATTTATATTTTGGTGGAATGTTGTTTCTGCAACAAGCCTATTTCTATCACTTTACTCGATCAGATTTTAAACATAATTTTGCTCCGCACTTTTTAAGTGTTTATTTACTCTCTGGAGAGAAATGGATAG-CTGAAAAGCAAATACTGCCTATATATAATTTACGTCAATGGTTGGATAATACTTGGAATAGTTTATCTACTTTAGTAGCTTACTCTGGTTATATTAATAATGCTGGATATTCTTACTCAATATGGAATTTATTGTTAAAAAGTCTTAGTACACCTGAGGTTTTGGAGCGTTTATTTAATGTGACTTCAATTATGCCGTGTATAATCCTAATTCCATGCCTGTCCTTTAAACTGTATTCCAACATAAGTCTGTGCTGGTTCGCGCTTACTTACACATTTGTCACATTTAATAGGGTATGCACGGCTCAGTATTTTCTATGGAGTATATGCCTTCTTCCAGTTGCTTTGGCTGATATACGTCTACCTTCAAGTATTACACCATATCGTGCTATAGTACAAAATTTAATGTTATGGTTCGGATCTCAAGGTATATGGCTTGCTTCTGCTTATGCACTAGAAATGTGTACATTAAAAGGACCATTTCTAAATCATATCATTTGGATAATCGTTTGGACAGCTTCACTAAACTTTTTTGCCTGTAATATTTTCATTTTATTTCGTTTGATAAGTTGGCGTAATAGATCTTTATCAGATCATTATCAAGAAGTTTCATCATCGAAAGTTATTAATTATAAAGCTGTTGTTTCCCCTATTATTGATTCTACTATTGCCGTAGCAACCAACACTAATACGACTTATCGAAAATATCGCATATCTAACAAGAAAACTTTGTGACAAAATGAATCGATTGCTTG-TTTTTTTTT-GTTTAAAAATTAATAATCCACTTAATTTTGGTTGTTGTTGTTGATAATATCGATGATTTATTAAAAGAATATTTATCTATTTATTTATTTACGTTCTTCATGAAGGAATGAACGTCAGTGAAATGATTAAAATATATTTTATTATTTGATAAATAATTGACTTTCTTTTTTTCTTACTAAATTGTATTTGTATAAGCATTAATTTTTTTTTTTTGATTTTCTTTTATATCCTTATACATATATATATATATGTGTGTGTTGTTGATAAATTGAACACAAATAGAACATTTGCCATGCATTAATTGTACATGTAACTAAAATGATCTGTATCATTAATAATCA]

[+] EMBL CD082393             [AAACTGTTATTCAATCCTGTTACATCAGTAGTCTCTGCTCGTGGTAATGCAGACGGATTACAAAGTTGTTTTGTTTTAGCATGCCTATGGTGTATTCTAAACCGTCGTATCATTCCAGCTGGATTTTTATATGGGTTATGTATTCATGTACGTATATTTCCAATCATTTATGCACCATCTATCTATTTATGGCTAATGATGACTGATAATAGTCATAACAAAGATAATCAAAAGAAAAACAAAGGATCAACACCGCAATCTTAAAGTGTATTTTCAATTTTATTCAAATTACCAAATCGAAATCATTTTCTTTTTGGCATCAGCTGTTTACTCAGTTTGACGATGTTGACTGGATTATGTTATTTATATTTTGGTGGAATGTTGTTTCTGCAACAAGCCTATTTCTATCACTTTACTCGATCAGATTTTAAACATAATTTTGCTCCGCACTTTTTAAGTGTTTATTTACTCTCTGGAGAGAAATGGATAG CTGAAAAGCAAATACTGCCTATATATAATTTACGTCAATGGTTGGATAATACTTGGAATAGTTTATCTACTTTAGTAGCTTACTCTGGTTATATTAATAATGCTGGATATTCTTACTCAATATGGAATTTATTGNTAAAAAGTCTTAGTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD081253             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGATTTTAAACATAATTTTGCTCCGCACTTTTTAAGTGTTTATTTACTCTCTGGAGAGAAATGGATAGNCTGAAAAGCAAATACTGCCTATATATAATTTACGTCAATGGTTGGATAATACTTGGAATAGTTTATCTACTTTAGTAGCTTACTCTGGTTATATTAATAATGCTGGATATTCTTACTCAATATGGAATTTATTGTTAAAAAGTCTTAGTACACCTGAGGTTTTGGAGCGTTTATTTAATGTGACTTCAATTATGCCGTGTATAATCCTAATTCCATGCCTGTCCTTTAAACTGTATTCCAACATAAGTCTGTGCTGGTTCGCGCTTACTTACACATTTGTCACATTTAATAGGGTATGCACGGCTCAGTATTTTCTATGGAGTATATGCCTTCTTCCAGTTGCTTTGGCTGATATACGTCTACCTTCAAGTATTACACCATATCGTGCTATAGTACAAAATTTAATGTTATGGTTCGGATCTCAAGGTATATGGCTTGCTTCTGCTTATGCACTAGAAATGTGTACATTAAAAGGACCATTTCTAAATCATATCATTTGGATAATCGTTTGGACAGCTTCACTAAACTTTTTTGCCTGTAATATTTTCATTTTATTTCGTTTGATAAGTTGGCGTAATAGATCTTTATCAGATCATTATCAAGAAGTTTCATCATCGAAAGTTATTAATTATAAAGCTGTTGTTTCCCCTATTATTGATTCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD082892             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttTTAAT ATGCTGGATATTCTTACTCAATATGGAATTTATTGTTAAAAAGTCTTAGTACACCTGAGGTTTTGGAGCGTTTATTTAATGTGACTTCAATTATGCCGTGTATAATCCTAATTCCATGCCTGTCCTTTAAACTGTATTCCAACATAAGTCTGTGCTGGTTCGCGCTTACTTACACATTTGTCACATTTAATAGGGTATGCACGGCTCAGTATTTTCTATGGAGTATATGCCTTCTTCCAGTTGCTTTGGCTGATATACGTCTACCTTCAAGTATTACACCATATCGTGCTATAGTACAAAATTTAATGTTATGGTTCGGATCTCAAGGTATATGGCTTGCTTCTGCTTATGCACTAGAAATGTGTACATTAAAAGGACCATTTCTAAATCATATCATTTGGATAATCGTTTGGACAGCTTCACTAAACTTTTTTGCCTGTAATATTTTCATTTTATTTCGTTTGATAAGTTGGCGTAATAGATCTTTATCAGATCATTATCAAGAAGTTTCATCATCGAAAGTTATTAATTATAAAGCTGTTGTTTCCCCTATTATTGATTCTACTATTGCCGTAGC ACCAACACTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD191888             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTGGACAGCTTCACTAAACTTTTTTGCCTGTAATATTTTCATTTTATTTCGTTTGATAAGTTGGCGTAATAGATCTTTATCAGATCATTATCAAGAAGTTTCATCATCGAAAGTTATTAATTATAAAGCTGTTGTTTCCCCTATTATTGATTCTACTATTGCCGTAGCAACCAACACTAATACGATTTATCGAAAATATCGCTCATCTAACAAGCTAACTTTGTGACAAAATGAATCGATTGCTTG TTTTTTTTT GTTTAAAAATTAATAATCCACTTAATTTTGGTTGTTGTTGTTGATAATATCGATGATTTATTAAAAGAATATTTATCTATTTATTTATTTACGTTCTTCAT                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD075993             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTGCCTGTAATATTTTCATTTTATTTCGTTTGATAAGTTGGCGTAATAGATCTTTATCAGATCATTATCAAGAAGTTTCATCATCGAAAGTTATTAATTATAAAGCTGTTGTTTCCCCTATTATTGATTCTACTATTGCCGTAGCAACCAACACTAATACGACTTATCGAAAATATCGCATATTTAACAAGAAAACTTTGTGACAAAATGAATCGATTGCTTG TTTTTTTTT GTTTAAAAATTAATAATCCACTTAATTTTGGTTGTTGTTGTTGATAATATCGATGATTTATTAAAAGAATATTTATCTATTTATTTATTTACGTTCTTCATGAAGGAATGAACGTCAGTGAAATGATTAAAATATATTTTATTATTTGATAAATAATTGACTTTCTTTTTTTCTTACTAAATTGTATTTGTAT                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD075083             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAAGTTGGCGTAATAGATCTTTATCAGATCATTATCAAGAAGTTTCATCATCGAAAGTTATTAATTATAAAGCTGTTGTTTCCCCTATTATTGATTCTACTATTGCCGTAGCAACCAACACTAATACGACTTATCGAAAATATCGCATATCTAACAAGAAAACTTTGTGACAAAATGAATCGATTGCTTG TTTTTTTTT GTTTAAAAATTAATAATCCACTTAATTTTGGTTGTTGTTGTTGATAATATCGATGATTTATTAAAAGAATATTTATCTATTTATTTATTTACGTTCTTCATGAAGGAATGAACGTCAGTGAAATGATTAAAATATATTTTATTATTTGATAAATAATTGACTTTCTTTTTTTCTTACTAAATTGTATTTGTAT                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD073249             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTATTGAAAATATGGCATATGTAACAAGAAAACTTTGTGACAAAATGAATCGATTGCTTG TTTTTTTTTCGTTCCCAAATTAATAATCCACTTAATTTTGGTTGTGGTTGTTGATAACATCGATGATTTACCAAAAGAATATTTATTTATTTATTTATTTACGTTCTTCATTAAGGAACGAACGTCAGTGAAATGATTAAAATATATTTTA                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL AW017273             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATATCGCATATCTAACAAGAAAACTTTGTGACAAAATGAATCGATTGCTTGTTTTTTTTTT GTTTAAAAATTAATAATCCACTTAATTTTGGTTGTTGTTGTTGATAATATCGATGATTTATTAAAAGAATATTTATCTATTTATTTATTTACGTTCTTCATGAAGGAACGAACGTCAGTGAAATGATTAAAATATATTTTATTATTTGATAAATAATTGACTTTCTTTTTTTCTTACTAAATTGTATTTGTATAAGCATTAATTTTTTTTTTTTGATTTTCTTTTATATCCTTATACATATATATATATATGTGTGTGTTGTTGATAAATTGAACACAAATAGAACATTTGCCATGCATTAATTGTACATGTAACTAAAATGATCTGTATCATTAATAATCA]


>consensus_9159#0 AAACTGTTATTCAATCCTGTTACATCAGTAGTCTCTGCTCGTGGTAATGCAGACGGATTA CAAAGTTGTTTTGTTTTAGCATGCCTATGGTGTATTCTAAACCGTCGTATCATTCCAGCT GGATTTTTATATGGGTTATGTATTCATGTACGTATATTTCCAATCATTTATGCACCATCT ATCTATTTATGGCTAATGATGACTGATAATAGTCATAACAAAGATAATCAAAAGAAAAAC AAAGGATCAACACCGCAATCTTAAAGTGTATTTTCAATTTTATTCAAATTACCAAATCGA AATCATTTTCTTTTTGGCATCAGCTGTTTACTCAGTTTGACGATGTTGACTGGATTATGT TATTTATATTTTGGTGGAATGTTGTTTCTGCAACAAGCCTATTTCTATCACTTTACTCGA TCAGATTTTAAACATAATTTTGCTCCGCACTTTTTAAGTGTTTATTTACTCTCTGGAGAG AAATGGATAGCTGAAAAGCAAATACTGCCTATATATAATTTACGTCAATGGTTGGATAAT ACTTGGAATAGTTTATCTACTTTAGTAGCTTACTCTGGTTATATTAATAATGCTGGATAT TCTTACTCAATATGGAATTTATTGTTAAAAAGTCTTAGTACACCTGAGGTTTTGGAGCGT TTATTTAATGTGACTTCAATTATGCCGTGTATAATCCTAATTCCATGCCTGTCCTTTAAA CTGTATTCCAACATAAGTCTGTGCTGGTTCGCGCTTACTTACACATTTGTCACATTTAAT AGGGTATGCACGGCTCAGTATTTTCTATGGAGTATATGCCTTCTTCCAGTTGCTTTGGCT GATATACGTCTACCTTCAAGTATTACACCATATCGTGCTATAGTACAAAATTTAATGTTA TGGTTCGGATCTCAAGGTATATGGCTTGCTTCTGCTTATGCACTAGAAATGTGTACATTA AAAGGACCATTTCTAAATCATATCATTTGGATAATCGTTTGGACAGCTTCACTAAACTTT TTTGCCTGTAATATTTTCATTTTATTTCGTTTGATAAGTTGGCGTAATAGATCTTTATCA GATCATTATCAAGAAGTTTCATCATCGAAAGTTATTAATTATAAAGCTGTTGTTTCCCCT ATTATTGATTCTACTATTGCCGTAGCAACCAACACTAATACGACTTATCGAAAATATCGC ATATCTAACAAGAAAACTTTGTGACAAAATGAATCGATTGCTTGTTTTTTTTTGTTTAAA AATTAATAATCCACTTAATTTTGGTTGTTGTTGTTGATAATATCGATGATTTATTAAAAG AATATTTATCTATTTATTTATTTACGTTCTTCATGAAGGAATGAACGTCAGTGAAATGAT TAAAATATATTTTATTATTTGATAAATAATTGACTTTCTTTTTTTCTTACTAAATTGTAT TTGTATAAGCATTAATTTTTTTTTTTTGATTTTCTTTTATATCCTTATACATATATATAT ATATGTGTGTGTTGTTGATAAATTGAACACAAATAGAACATTTGCCATGCATTAATTGTA CATGTAACTAAAATGATCTGTATCATTAATAATCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)