These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9179#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 751 fasta sequence [GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGATTACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCACGTTTCACTAGTTTTCGTAACAGATAACGAGAATTATGTCCACACTTATTCATCTGAAACANACACCACATCTTGTAAATTAACTGTCTTGGATTTTACAAAGTTTTTACAGATGTACTACCCCACGCTCACAACCGCCAAACTTTTGTTTGATTCTTTGGATGTATCACTTCGTTCTATTCAATCCAAAGACCACAATTTACCAGAGCTCT] [+] EMBL AI068264 [GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGA TACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACA ] [+] EMBL AI067945 [GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACCAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGATTACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCACGTTTCACTAGTTTTCGTAA ] [+] EMBL AI068336 [GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCANACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTT ] [+] EMBL AI067876 [ TAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGATTACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCACGTTTCACTAGTTTTCGTAACAGATAACGAGAATTATGTCCACACTTATTCATCTGAAACANACACCACATCTTGTAAATTAACTGTCTTGGATTTTACAAAGTTTTTACAGA ] [+] EMBL AI067728 [ TAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTG ] [+] EMBL AI067113 [ TAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGC ] [+] EMBL AI068279 [ TAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCATGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGA ] [+] EMBL CD116173 [ AGAGACTTGGAAACGTACCTTTTAATCGATGGATTTTATGCGCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCAGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGATTACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCACGTTTCACTAGTTTTCGTAACAGATAACGAGAATTATGTCCACACTTATTCATCTGAAACAAACACCACATCTTGTAAATTAACTGTCTTGGATTTACCAGGGTTTTTACAGATGTACTACCCCACGCTCACAACCGCCAAACTTTTGTTTGATTCTTTGGATGTATCACTTCGTTCTATTCAATCCAAAGACCACAATTTACCAGAGCTCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||