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Schistosoma mansoni
cluster # 9183 cluster # 9183       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9183#0 length = 736 sequences # 8  

consensusID : consensus_9183#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 736
fasta sequence
                              [ATGAAGTGGTCCCGTCTGATGTACGTNTATCTCGTNTAGTACAATGGACATTAGCCAAAAAAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCAAGTTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT-GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTAAATTTTTTCGTCTTTCCCCCTCTGCCCATTACCAATATGTTTAATTTTATTGTTACAATATTAAAAATACAAATGAAATGCTTGTTGTATATTATTTGGAATTAAAATGCTTACTGCTTATCCCTGGAATACATATCGCTTAGTACACTTAAATAACCTCGGGCTTTTGAATTGGGTCTGC]

[-] EMBL CD148284             [ATGAAGTGGTCCCGTCTGATGTACGTNTATCTCGTNTAGTACAATGGACATTAGCCAAAAAAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCAAGCTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTA                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD202054             [                                           ATGGACATTAGCCAAAAAAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCAAGTTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTACAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTA                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD202075             [                                                  TTAGCC AAAAAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCATGTTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTAT CACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACANTCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTG ACATATATATNTTCTTCT                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD143095             [                                                                                                 GTGCAGATGAANCAAGTTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATCTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTcgaccc                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD178531             [                                                                                                                          GTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTAAATTTTTTCGTCTTTCCCCCTCTGCCCATTACCAATATGTTTAATTTTATTGTTACAATATTAAAAATACAAATGAAATGCTTGTTGTATATTATTTGGAATTAAAATGCTTACTGCTTATCCCTGGAATACATATCGCTTAGTACACTTAAATAACCTCGGGCTTTTGAATTGGGTCTGC]
[-] EMBL CD095712             [                                                                                                                                                                                             GAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTAAATTTTT                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD072160             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATA TTCTTTTAGTGATTAAATGCTNTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATCTTCTTCTA                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD201941             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AACTGGCTGTGATATA TTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAGACAATATATAACCATCAAATGTTTAGAACAGAGTAAATATTGCCTTTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCGTATTAGCTTTTGTACATAGATATTTTCTTat                                                                                                                                                                                      ]


>consensus_9183#0 ATGAAGTGGTCCCGTCTGATGTACGTNTATCTCGTNTAGTACAATGGACATTAGCCAAAA AAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCAAGTTGGTTA TCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGAT ATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAA TTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTT TTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACTGCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAAT GCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTA TCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAAC CGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACAT ATATATTTTCTTCTAAATTTTTTCGTCTTTCCCCCTCTGCCCATTACCAATATGTTTAAT TTTATTGTTACAATATTAAAAATACAAATGAAATGCTTGTTGTATATTATTTGGAATTAA AATGCTTACTGCTTATCCCTGGAATACATATCGCTTAGTACACTTAAATAACCTCGGGCT TTTGAATTGGGTCTGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)