These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9183#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 736 fasta sequence [ATGAAGTGGTCCCGTCTGATGTACGTNTATCTCGTNTAGTACAATGGACATTAGCCAAAAAAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCAAGTTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT-GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTAAATTTTTTCGTCTTTCCCCCTCTGCCCATTACCAATATGTTTAATTTTATTGTTACAATATTAAAAATACAAATGAAATGCTTGTTGTATATTATTTGGAATTAAAATGCTTACTGCTTATCCCTGGAATACATATCGCTTAGTACACTTAAATAACCTCGGGCTTTTGAATTGGGTCTGC] [-] EMBL CD148284 [ATGAAGTGGTCCCGTCTGATGTACGTNTATCTCGTNTAGTACAATGGACATTAGCCAAAAAAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCAAGCTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTA ] [-] EMBL CD202054 [ ATGGACATTAGCCAAAAAAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCAAGTTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTACAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTA ] [+] EMBL CD202075 [ TTAGCC AAAAAATCATGGTTAGATCGTGTACTAGACTTGGAATTACGTGCAGATGAACCATGTTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTAT CACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACANTCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTG ACATATATATNTTCTTCT ] [-] EMBL CD143095 [ GTGCAGATGAANCAAGTTGGTTATCGTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATCTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTcgaccc ] [+] EMBL CD178531 [ GTATGTACCAGAAGAACGTGAGATTAAAATGAAATTAGCTCGTGAACTATGGGAGGATATACTAGACGAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTAAATTTTTTCGTCTTTCCCCCTCTGCCCATTACCAATATGTTTAATTTTATTGTTACAATATTAAAAATACAAATGAAATGCTTGTTGTATATTATTTGGAATTAAAATGCTTACTGCTTATCCCTGGAATACATATCGCTTAGTACACTTAAATAACCTCGGGCTTTTGAATTGGGTCTGC] [-] EMBL CD095712 [ GAGGTTTTGAATTCTGTTCTAGCCTCAAATGCTTGCCATTTGTCAAAGTAATTTATACACTATCATTCTATTTAGGGTGTCTTATTTTATTGAAACTGTAATTTGATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATATTTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATTTTCTTCTAAATTTTT ] [-] EMBL CD072160 [ GATTTTTTTCTAATATCTAAAATATCAATCTGAAACT GCTGTGATATA TTCTTTTAGTGATTAAATGCTNTTATACAAAAAATATATGACCATCAAATGTCTAGAACAGAGTAAATATTGCCTCTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCCTATTAGCTTTTGTACATATATATCTTCTTCTA ] [-] EMBL CD201941 [ AACTGGCTGTGATATA TTCTTTTAGTGATTAAATGCTTTTATACAGACAATATATAACCATCAAATGTTTAGAACAGAGTAAATATTGCCTTTATCTCAGATCTCACCTTGTGTTGTTCCCACTTCCTTTCAACCATATCAATTATTCGTAAACCGAATAGAATAGCAACAATCATACACATACATAATTTATATCGTATTAGCTTTTGTACATAGATATTTTCTTat ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||