These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9185#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1139 fasta sequence [TTATGGAGAGGTATGATTACCTGCTGAAGTTTCTGATCATTGGAAATGCTGCTACTGGCAAAACATGTTTGATGAGATGGTTTCTTGAGGGAAAGTTTAAACAGGATTCGCTACACACAATAGGTGTCGAGTTCGGAACAAAAGTGCTTAGAGTTGATTCAAAGTCTGTAAAGCTGCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA-GCTTATACA-TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG-ATGCATTCACCGCTGCTG-TTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACCCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTTTTCCCGGATCAAATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTAAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCGTTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCTTTCCACGTAAAGATCTTTGGACGTATGATAATTCAAAACATACTACTTATTATGTCTGTGATAAATTATGATTTTTATTGTTTATATGAATAATATCTAAATTTCATAAGTTTATATATAAACGTTCAACTGTAGGTGATCCAGTTGAAAAGAGAGAGAATTATANCATTTCATTTTGGAATCCGTTTGACTTCTATTCATTCATCATAATTTTNCTTCCCCCTCCCGCCTTTTTCTTTATTATCCTTTTTATATCGTTCAAGGAATTTCTCTCCAGTCATTGGTTCATTCATTATTGTGTTTTTTTTTAAAATAAAAAAAGTCTATTTTTTTGATTTTCTCATTTTCATTTCTTTTTTTTTGAAAAAAATAATCTATGATATTTTGAGTTGATAAGTTAGTTACTATTATGGTGATATATATATGATATGTTTAAAATACAGTTATATAC] [+] EMBL AI977151 [TTATGGAGAGGTATGATTACCTGCTGAAGTTTCTGATCATTGGAAATGCTGCTACTGGCAAAACATGTTTGATGAGATGGTTTCTTGAGGGAAAGTTTAAACAGGATTCGCTACACACAATAGGTGTCGAGTTCGGAACAAAAGTGCTTAGAGTTGATTCAAAGTCTGTAAAGCTGCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTC ] [+] EMBL CD186028 [ GATCATTGATAATGCTGCTACTGGCAAAACATGTTTGATGAGATGGTTTCTTGAGGGAAAGTTTAAACAGGATTCGCTACACACAATAGGTGTCGAGTTCGGAACAAAAGTGCTTAGAGTTGATTCAAAGTCTGTAAAGCTGCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGGTAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAATGTTCTAGAACAAATTCAAAtg ] [+] EMBL CD091376 [ CTGTAAAGCTGCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACTCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTNTTCCCGGATCAAATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTAAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCGTTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCTTTCCA ] [-] EMBL BG932590 [ AGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACCCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTG ] [+] EMBL CD078428 [ TGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACCCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTTTTCCCGGATCAAATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTAAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCGTTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCTTTCCACGTAAAGATCTTTGGACGTATGATAATTCAAAACATACTACTTATTATGTCTGTGATAAATTATGATTTTTATTGTTTATATGAATAATATCTAAATTTCATAAGTTTATATATAAACGTTCAACTGTAGGTGATCCAGTTGAAAAGAGAGAGAATTATANCATTTCATTTTGGAATCCGTTTGACTTCTATTCATTCATCATAATTTTN ] [+] EMBL AI381060 [ TACGTGAGGTCACTGAATTTGCAGGGGAACAGTGTGCTATTGATAATGGAGGCTTATACATTTTTTGGAAACATCCGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGGCATGCATTCACCGCTGCTGTTTCGGAGTGTTCTTGAACAGATTCAAAAT ] [+] EMBL CD177902 [ tggaaggCTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAGTGTTCTAAAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACCCAAATGCCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTTTTCCCGGATCAAATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTGAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCGTTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCCTTCC ] [-] EMBL SMAA25696 [ TAAATTTCATAAGGTTATATATAAACGTTCAACTGTAGGTGATCCAGTTGAAAAGNGNGGGAATTATACAATTTCA TTTGGAATCCGTTTGACTTCTATTCATTCATCATAATTTTCCTTCCCCCTCCCGCCTTTTTCTTTATTATCCTTTTTATATCGTTCAAGGAATTTCTCTCCAGTCATTGGTTCATTCATTATTGTGTTTTTTTTTAAAATAAAAAAAGTCTATTTTTTTGATTTTCTCATTTTCATTTCTTTTTTTTTGAAAAAAATAATCTATGATATTTTGAGTTGATAAGTTAGTTACTATTATGGTGATATATATATGATATGTTTAAAATACAGTTATATAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||