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Schistosoma mansoni
cluster # 9185 cluster # 9185       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9185#0 length = 1139 sequences # 8  

consensusID : consensus_9185#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1139
fasta sequence
                              [TTATGGAGAGGTATGATTACCTGCTGAAGTTTCTGATCATTGGAAATGCTGCTACTGGCAAAACATGTTTGATGAGATGGTTTCTTGAGGGAAAGTTTAAACAGGATTCGCTACACACAATAGGTGTCGAGTTCGGAACAAAAGTGCTTAGAGTTGATTCAAAGTCTGTAAAGCTGCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA-GCTTATACA-TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG-ATGCATTCACCGCTGCTG-TTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACCCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTTTTCCCGGATCAAATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTAAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCGTTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCTTTCCACGTAAAGATCTTTGGACGTATGATAATTCAAAACATACTACTTATTATGTCTGTGATAAATTATGATTTTTATTGTTTATATGAATAATATCTAAATTTCATAAGTTTATATATAAACGTTCAACTGTAGGTGATCCAGTTGAAAAGAGAGAGAATTATANCATTTCATTTTGGAATCCGTTTGACTTCTATTCATTCATCATAATTTTNCTTCCCCCTCCCGCCTTTTTCTTTATTATCCTTTTTATATCGTTCAAGGAATTTCTCTCCAGTCATTGGTTCATTCATTATTGTGTTTTTTTTTAAAATAAAAAAAGTCTATTTTTTTGATTTTCTCATTTTCATTTCTTTTTTTTTGAAAAAAATAATCTATGATATTTTGAGTTGATAAGTTAGTTACTATTATGGTGATATATATATGATATGTTTAAAATACAGTTATATAC]

[+] EMBL AI977151             [TTATGGAGAGGTATGATTACCTGCTGAAGTTTCTGATCATTGGAAATGCTGCTACTGGCAAAACATGTTTGATGAGATGGTTTCTTGAGGGAAAGTTTAAACAGGATTCGCTACACACAATAGGTGTCGAGTTCGGAACAAAAGTGCTTAGAGTTGATTCAAAGTCTGTAAAGCTGCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD186028             [                                  GATCATTGATAATGCTGCTACTGGCAAAACATGTTTGATGAGATGGTTTCTTGAGGGAAAGTTTAAACAGGATTCGCTACACACAATAGGTGTCGAGTTCGGAACAAAAGTGCTTAGAGTTGATTCAAAGTCTGTAAAGCTGCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGGTAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAATGTTCTAGAACAAATTCAAAtg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD091376             [                                                                                                                                                                     CTGTAAAGCTGCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACTCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTNTTCCCGGATCAAATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTAAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCGTTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCTTTCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL BG932590             [                                                                                                                                                                                                         AGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACCCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD078428             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACCCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTTTTCCCGGATCAAATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTAAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCGTTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCTTTCCACGTAAAGATCTTTGGACGTATGATAATTCAAAACATACTACTTATTATGTCTGTGATAAATTATGATTTTTATTGTTTATATGAATAATATCTAAATTTCATAAGTTTATATATAAACGTTCAACTGTAGGTGATCCAGTTGAAAAGAGAGAGAATTATANCATTTCATTTTGGAATCCGTTTGACTTCTATTCATTCATCATAATTTTN                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI381060             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TACGTGAGGTCACTGAATTTGCAGGGGAACAGTGTGCTATTGATAATGGAGGCTTATACATTTTTTGGAAACATCCGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGGCATGCATTCACCGCTGCTGTTTCGGAGTGTTCTTGAACAGATTCAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD177902             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tggaaggCTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAGTGTTCTAAAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACCCAAATGCCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTTTTCCCGGATCAAATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTGAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCGTTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCCTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL SMAA25696            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATTTCATAAGGTTATATATAAACGTTCAACTGTAGGTGATCCAGTTGAAAAGNGNGGGAATTATACAATTTCA TTTGGAATCCGTTTGACTTCTATTCATTCATCATAATTTTCCTTCCCCCTCCCGCCTTTTTCTTTATTATCCTTTTTATATCGTTCAAGGAATTTCTCTCCAGTCATTGGTTCATTCATTATTGTGTTTTTTTTTAAAATAAAAAAAGTCTATTTTTTTGATTTTCTCATTTTCATTTCTTTTTTTTTGAAAAAAATAATCTATGATATTTTGAGTTGATAAGTTAGTTACTATTATGGTGATATATATATGATATGTTTAAAATACAGTTATATAC]


>consensus_9185#0 TTATGGAGAGGTATGATTACCTGCTGAAGTTTCTGATCATTGGAAATGCTGCTACTGGCA AAACATGTTTGATGAGATGGTTTCTTGAGGGAAAGTTTAAACAGGATTCGCTACACACAA TAGGTGTCGAGTTCGGAACAAAAGTGCTTAGAGTTGATTCAAAGTCTGTAAAGCTGCAGA TTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTG CGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATT CATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAA ACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTG CTATTGATAATGGAGCTTATACATTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTT TGGATGCATTCACCGCTGCTGTTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACC CAACCCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTTTTCCCGGATCAA ATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTAAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCG TTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCTTTCCACGTAAAGATCTTTGGACGTATGATAAT TCAAAACATACTACTTATTATGTCTGTGATAAATTATGATTTTTATTGTTTATATGAATA ATATCTAAATTTCATAAGTTTATATATAAACGTTCAACTGTAGGTGATCCAGTTGAAAAG AGAGAGAATTATANCATTTCATTTTGGAATCCGTTTGACTTCTATTCATTCATCATAATT TTNCTTCCCCCTCCCGCCTTTTTCTTTATTATCCTTTTTATATCGTTCAAGGAATTTCTC TCCAGTCATTGGTTCATTCATTATTGTGTTTTTTTTTAAAATAAAAAAAGTCTATTTTTT TGATTTTCTCATTTTCATTTCTTTTTTTTTGAAAAAAATAATCTATGATATTTTGAGTTG ATAAGTTAGTTACTATTATGGTGATATATATATGATATGTTTAAAATACAGTTATATAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)