cluster # 9192

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9192 cluster # 9192 Sequences # 8 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9192#0 length = 1217 sequences # 8
consensusID : consensus_9192#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1217
fasta sequence
                              [ATATGATAGGTATCGGTACGGGTTTTCCGATTTAATGGTCCCCACACTCTACTCGATATCTCACTAGTGTAGTGACTTATTCAAAGGAGTCGGTTAAAGAGATAGGACCATCAAGTTTTCAACACTTCCTATCTCAGAGTATTGCCAGTTGGGATCCAGAACATAGAGCGAACGAAGTTCCGGCTAGTAGTGACTGTCTTCTCCGAATAACTAAAGACTTACGTTCCATTTGCAACGATCCAGCCCCTGGAATATGTGTCGTACCTGACAATGAGGATATGACAGAAATATACGCATTGATCACAGGTCCCTTCGATACACCATATGAAGGTGGTTTTTTCTTGTCTCTTATACGATGTCCACCCGAATATCCACTGATGCCGCCGAAGGTGAAATTAATGACTACTGGGAATGGTACTGTCAGATTTAATCCAAATTTCTATTCCAACGGGAAGGTTTGTCTAAGTGTTCTCGGTACTTGGCAAGGTCCCGAATGGACACCGGCACAAAGCCTATCCTCAGTTTTAATATCAATTCAATCTCTGATGAACGATAAACCGTATTTTAATGAGCCTGGATTCACCACTGAACGTAGCCCGGGTGATGCTCAACAATACAATGCAATAATTACACATGAAACTATTCGATGTGCAGTTTGTGATGTATTAGAGCGTCGTACAACATTTCCTTCAGATTTATACGCGGTAGTAGAATCTAGTTTTGAGGATTATTACGAATATTATATTAGCGTTTGTGAACGAAATATGCATTTGTCAGGTCAACCTATGGTTGATCCTTTCGAAGATGGACGAGGAATTTTCGATTATGCCAGTCTATTAAAGCGTTTAAAGGCTTTAAACAGTCAATTAAAACAAAGGCATTCTGGAACAGACGACGCCAATGTGAGGGGCATGTCCAGAGAAGACAAATGACTATCTATACAGTCATAACAATGAATTCTGGACTACAAATGACTACTAATCCGGAAGAACATGTGGGATGTTTTGTTGTATATCACCAAGTTTATCTTAAGTCTAGTTAACTTTATTCCTATCACTTTTTCTTTCCAAGTGTCTCCCTTTTGATAAAGTAAACATTTATCTTGATCTATCCACTTTAATTTGATTGTTTTCCATTCTCCTTTACGATTTTATTTTCTCATTTTGTTATTACTGTTATTGCTTATGAAGTGCGAAATGATGTTGAACATGTGTAAA]

[+] EMBL CD150207             [ATATGATAGGTATCGGTACGGGTTTTCCGATTTAATGGTCCCCACACTCTACTCGATATCTCACTAGTGTAGTGACTTATTCAAAGGAGTCGGTTAAAGAGATAGGACCATCAAGTTTTCAACACTTCCTATCTCAGAGTATTGCCAGTTGGGATCCAGAACATAGAGCGAACGAAGTTCCGGCTAGTAGTGACTGTCTTCTCCGAATAACTAAAGACTTACGTTCCATTTGCAACGATCCAGCCCCTGGAATATGTGTCGTACCTGACAATGAGGATATGACAGAAATATACGCATTGATCACAGGTCCCTTCGATACACCATATGAAGGTGGTTTTTTCTTGTCTCTTATACGATGTCCACCCGAATATCCACTGATGCCGCCGAAGGTGAAATTAATGACTACTGGGAATGGTTCTGTCAGATTTAATCCAAATTTCTATTCCAACGGGAAGGTTTGTCTAAGTGTTCTCGGTACTTGGCAAGGTCCCGAATGGACACCGGCACAAAGCCTATCCTCAGTTTTAATATCAATTCAATCTCTGATGAACGATAAACCGTATTTTAATGAGCCTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD094833             [    GATAGGTATCGGTACGGGTTTTCCGATTTAATGGTCCCCACACTCTACTCGATATCTCACTAGTGTAGTGACTTATTCAATGGAGTCGGTTAAAGAGATAGGACCATCAAGTTTTCAACACTTCCTATCTCAGAGTATTGCCAGTTGGGATCCAGAACATAGAGCGAACGAAGTTCCGGCTAGTAGTGACTGTCTTCTCCGAATAACTAAAGACTTACGTTCCATTTGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD135788             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCCACTGATGCCGCCGAAGGTGAAATTAATGACTACTGGGAATGGTACTGTCAGATTTAATCCAAATTTCTATTCCAACGGGAAGGTTTGTCTAAGTGTTCTCGGTACTTGGCAAGGTCCCGAATGGACACCGGCACAAAGCCTATCCTCAGTTTTAATATCAATTCAATCTCTGATGAACGATAAACCGTATTTTAATGAGCCTGGATTCTCCACTGACCGTAGCCCGGGTGATGCTCAACAATACAATGCAATAATTACACATGAAACTATTCGATGTGCAGTTTGTGATGTATTAGAGCGTCGTACAACATTTCCTTCAGATTTATACGCGGTAGTAGAATCTAGTTTTGAGGATTATTACGAATATTATATTAGCGTTTGTGAACGAAATATGCATTTGTCAGGTCAACCTATGGTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD118280             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CACTGATGCCGCCGAAGGTGAAATTAATGACTACTGGGAATGGTACTGTCAGATTTAATCCAAATTTCTATTCCAACGGGAAGGTTTGTCTAAGTGTTCTCGGTACTTGGCAAGGTCCCGAATGGACACCGGCACAAAGCCTATCCTCAGTTTTAATATCAATTCAATCTCTGATGAACGATAAACCGTATTTTAATGAGCCTGGATTCACCACTGAACGTAGCCCGGGTGATGCTCAACAATACAATGCAATAATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD078697             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTGCCAAGGTCCCGAATGGACACCGGCACAAAGCCTATCCTCAGTTTTAATATCAATTCAATCTCTGATGAACGATAAACCGTATTTTAATGAGCCTGGATTCACCACTGAACGTAGCCCGGGTGATGCTCAACAATACAATGCAATAATTACACATGAAACTATTCGATGTGCAGTTTGTGATGTATTAGAGCGTCGTACAACATTTCCTTCAGATTTATACGCGGTAGTAGAATCTAGTTTTGAGGATTATTACGAATATTATATTAGCGTTTGTGAACGAAATATGCATTTGTCAGGTCAACCTATGGTTGATCCTTTCGAAGATGGACGAGGAATTTTCGATTATGCCAGTCTATTAACGCGTTTAAAGGCTTTAAACAGTCAATTAAAACAAAGGCATTCTGGAACAGACGACGCCAATGTGAGGGGCATGTCCAGAGAAGACAAATGACTATCTATACAGTCATAACAATGAATTCTGGACTACAAATGACTACTAATCCGGAAGAACATGTGGGATGTTNTGTTGTATATCACCAAGTTTATCTTAAGTCTAGTTAACTTTATTn                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD198534             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CACTGAACGTAGCCCGGGTGATGCTCAACAATACAATGCAATAATTACACATGAAACTATTCGATGTGCAGTTTGTGATGTATTAGAGCGTCGTACAACATTTCCTTCAGATTTATACGCGGTAGTAGAATCTAGTTTTGAGGATTATTACGAATATTATATTAGCGTTTGTGAACGAAATATGCATTTGTCAGGTCAACCTATGGTTGATCCTTTCGAAGATGGACGAGGAATTTTCGATTATGCCAGTCTATTAAAGCGTTTAAAGGCTTTAAACAGTCAATTAAAACAAAGGCATTCTGGAACAGACGACGCCAATGTGAGGGGCATGTCCAGAGAAGACAAATGACTATCTATACAGTCATAACAATGAATTCTGGACTACAAATGACTACTAATCCGGAAGAACATGTGGGATGTTTTGTTGTATATCACCAAGTTTATCTTAAGTCTAGTTAACTTTATTCCTA                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD198432             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTATTACGAATATTATATNAGCGTTTGTGAACGAAATATGCATTTGTCAGGTCAACCTATGGTTGATCCTTTCGAAGATGGACGAGGAATTTTCGATTATGCCAGTCTATTAAAGCGTTTAAAGGCTTTAAACAGTCAATTAAAACAAAGGCATTCTGGAACAGACGACGCCAATGTGAGGGGCATGTCCAGAGAAGACAAATGACTATCTATACAGTCATAACAATGAATTCTGGACTACAAATGACTACTAATCCGGAAGAACATGTGGGATGTTTTGTTGTATATCACCAAGTTTATCTTAAGTCTAGTTAACTTTATTCCTA                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD136737             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTGGAACAGACGACGCCAATGTGAGGGGCATGTCCAGAGAAGACAAATGACTATCTATACAGTCATAACAATGAATTCTGGACTACAAATGACTACTAATCCGGAAGAACATGTGGGATGTTTTGTTGTATATCACCAAGTTTATCTTAAGTCTAGTTAACTTTATTCCTATCACTTTTTCTTTCCAAGTGTCTCCCTTTTGATAAAGTAAACATTTATCTTGATCTATCCACTTTAATTTGATTGTTTTCCATTCTCCTTTACGATTTTATTTTCTCATTTTGTTATTACTGTTATTGCTTATGAAGTGCGAAATGATGTTGAACATGTGTAAA]




>consensus_9192#0
ATATGATAGGTATCGGTACGGGTTTTCCGATTTAATGGTCCCCACACTCTACTCGATATC
TCACTAGTGTAGTGACTTATTCAAAGGAGTCGGTTAAAGAGATAGGACCATCAAGTTTTC
AACACTTCCTATCTCAGAGTATTGCCAGTTGGGATCCAGAACATAGAGCGAACGAAGTTC
CGGCTAGTAGTGACTGTCTTCTCCGAATAACTAAAGACTTACGTTCCATTTGCAACGATC
CAGCCCCTGGAATATGTGTCGTACCTGACAATGAGGATATGACAGAAATATACGCATTGA
TCACAGGTCCCTTCGATACACCATATGAAGGTGGTTTTTTCTTGTCTCTTATACGATGTC
CACCCGAATATCCACTGATGCCGCCGAAGGTGAAATTAATGACTACTGGGAATGGTACTG
TCAGATTTAATCCAAATTTCTATTCCAACGGGAAGGTTTGTCTAAGTGTTCTCGGTACTT
GGCAAGGTCCCGAATGGACACCGGCACAAAGCCTATCCTCAGTTTTAATATCAATTCAAT
CTCTGATGAACGATAAACCGTATTTTAATGAGCCTGGATTCACCACTGAACGTAGCCCGG
GTGATGCTCAACAATACAATGCAATAATTACACATGAAACTATTCGATGTGCAGTTTGTG
ATGTATTAGAGCGTCGTACAACATTTCCTTCAGATTTATACGCGGTAGTAGAATCTAGTT
TTGAGGATTATTACGAATATTATATTAGCGTTTGTGAACGAAATATGCATTTGTCAGGTC
AACCTATGGTTGATCCTTTCGAAGATGGACGAGGAATTTTCGATTATGCCAGTCTATTAA
AGCGTTTAAAGGCTTTAAACAGTCAATTAAAACAAAGGCATTCTGGAACAGACGACGCCA
ATGTGAGGGGCATGTCCAGAGAAGACAAATGACTATCTATACAGTCATAACAATGAATTC
TGGACTACAAATGACTACTAATCCGGAAGAACATGTGGGATGTTTTGTTGTATATCACCA
AGTTTATCTTAAGTCTAGTTAACTTTATTCCTATCACTTTTTCTTTCCAAGTGTCTCCCT
TTTGATAAAGTAAACATTTATCTTGATCTATCCACTTTAATTTGATTGTTTTCCATTCTC
CTTTACGATTTTATTTTCTCATTTTGTTATTACTGTTATTGCTTATGAAGTGCGAAATGA
TGTTGAACATGTGTAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case