These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9220#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 714 fasta sequence [ATGGATGATGAATTCTGGAAATGATGATAGTTACAAGACATTAGGATTACCTACTCAACCATACTGTCGTATTCATTGCCATCAGTCAGCTGTACGTGCAGCACGTTTTAATGCAGATGGAAATTATTGTATGACAGCTGGTGGCGATAAAACGATAAAACTATGGAATCCTTATAATTTCCGTTTATTAAAGACTTATGCAGGGCATGGAGGCGAAGTTTCTGATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG-TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGAT-GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGACTATCCATGAGGCACGTGATAGTGTCACATGTTGTGCATTTCGTCGACATCAAATTGTTACTGGTTCTGTTGATCGATGTGTTCGGACTTATGATATTCGACGAGGTGAAATGACTGAGGACTATGTTGGATACCCAGTTACATCGGTTTCAATTACCATAGATTGTCAATGCTTTCTAGTTGGTACACAAGATTCAACTTTACGTCTATTCGATGCGTTAACCGGTGAACTTCT] [+] EMBL CD140076 [ATGGATGATGAATTCTGGAAATGATGATAGTTACAAGACATTAGGATTACCTACTCAACCATACTGTCGTATTCATTGCCATCAGTCAGCTGTACGTGCAGCACGTTTTAATGCAGATGGAAATTATTGTATGACAGCTGGTGGCGATAAAACGATAAAACTATGGAAGCCTTATAATTTCCGTTTATTAAAGACTTATGCAGGGCATGGAGGCGAAGTTTCTGATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGATGGGAATGG TCTAGTTTGG ] [+] EMBL CD140240 [ATGGAT ATGAATTCTGGAAATGATGATAGTTACAAGACATTAGGATTACCTACTCAACCATACTGTCGTATTCATTGCCATCAGTCAGCTGTACGTGCAGCACGTTTTAATGCAGATGGAAATTATTGTATGACAGCTGGTGGCGATAGAACGATAAAACTATGGAATCCTTATAATTTCCGTTTATTAAAGACTTATGCAGGGCATGGAGGCGAAGTTTCTGATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTC ] [+] EMBL CD140096 [ ATGAATTCTGGAAATGATGATAGTTACAAGACATTAGGATTACCTACTCAACCATACTGTCGTATTCATTGCCATCAGTCAGCTGTACGTGCAGCACGTTTTAATGCAGATGGAAATTATTGTATGACAGCTGGTGGCGATAAAACGATAAAACTATGGAATCCTTATAATTTCCGTTTATTAAAGACTTATGCAGGGCATGGAGGCGAAGTTTCTGATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGAT GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAG ] [+] EMBL CD165302 [ CACGTTTTAATGCAGATGGAAATTATTGTATGACAGCTGGTGGCGATAAAACGATAAAACTATGGAATCCTTATAATTTCCGTTTATTAAAGACTTATGCAGGGCATGGAGGCGAAGTTTCTGATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCGTTTTCAC ATTCCGATT ] [-] EMBL CD140206 [ CTGATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGAT GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGACTATCCATGAGGCACGTGATAGTGTCACATGTTGTGCATTTCGTCGACATCAAATTGTTACTGGTTCTGTTGATCGATGTGTTCGGACTTATGATATTCGACGAGGTGAAATGACTGAGGACTATGTTGGATACCCAGTTACATCGGTTTCAATTACCATAGATTGTCAATGCTTTC ] [-] EMBL CD140166 [ GATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGAT GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGACTATCCATGAGGCACGTGATAGTGTCACATGTTGTGCATTTCGTCGACATCAAATTGTTACTGGTTCTGTTGATCGATGTGTTCGGACTTATGATATTCGACGAGGTGAAATGACTGAGGACTATGTTGGATACCCAGTTACATCGGTTTCAATTACCATAGATTGTCAATGCTTTC ] [-] EMBL CD140132 [ TACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATAATCTACTGGTGTAGAT GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGACTATCCATGAGGCACGTGATAGTGTCACATGTTGTGCATTTCGTCGACATCAAATTGTTACTGGTTCTGTTGATCGATGTGTTCGGACTTATGATATTCGACGAGGTGAAATGACTGAGGACTATGTTGGATACCCAGTTACATCGGTTTCAATTACCATAGATTGTCAATGCTTTC ] [-] EMBL CD167189 [ GTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGAT GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGgtaagcg ] [-] EMBL CD140198 [ GACTGTTAAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGAT GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGACTATCCATGAGGCACGTGATAGTGTCACATGTTGTGCATTTCGTCGACATCAAATTGTTACTGGTTCTGTTGATCGATGTGTTCGGACTTATGATATTCGACGAGGTGAAATGACTGAGGACTATGTTGGATACCCAGTTACATCGGTTTCAATTACCATAGATTGTCAATGCTTTCTAGTTGGTACACAAGATTCAACTTTACGTCTATTCGATGCGTTAACCGGTGAACTTCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||