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Schistosoma mansoni
cluster # 9220 cluster # 9220       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9220#0 length = 714 sequences # 9  

consensusID : consensus_9220#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 714
fasta sequence
                              [ATGGATGATGAATTCTGGAAATGATGATAGTTACAAGACATTAGGATTACCTACTCAACCATACTGTCGTATTCATTGCCATCAGTCAGCTGTACGTGCAGCACGTTTTAATGCAGATGGAAATTATTGTATGACAGCTGGTGGCGATAAAACGATAAAACTATGGAATCCTTATAATTTCCGTTTATTAAAGACTTATGCAGGGCATGGAGGCGAAGTTTCTGATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG-TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGAT-GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGACTATCCATGAGGCACGTGATAGTGTCACATGTTGTGCATTTCGTCGACATCAAATTGTTACTGGTTCTGTTGATCGATGTGTTCGGACTTATGATATTCGACGAGGTGAAATGACTGAGGACTATGTTGGATACCCAGTTACATCGGTTTCAATTACCATAGATTGTCAATGCTTTCTAGTTGGTACACAAGATTCAACTTTACGTCTATTCGATGCGTTAACCGGTGAACTTCT]

[+] EMBL CD140076             [ATGGATGATGAATTCTGGAAATGATGATAGTTACAAGACATTAGGATTACCTACTCAACCATACTGTCGTATTCATTGCCATCAGTCAGCTGTACGTGCAGCACGTTTTAATGCAGATGGAAATTATTGTATGACAGCTGGTGGCGATAAAACGATAAAACTATGGAAGCCTTATAATTTCCGTTTATTAAAGACTTATGCAGGGCATGGAGGCGAAGTTTCTGATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGATGGGAATGG TCTAGTTTGG                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD140240             [ATGGAT ATGAATTCTGGAAATGATGATAGTTACAAGACATTAGGATTACCTACTCAACCATACTGTCGTATTCATTGCCATCAGTCAGCTGTACGTGCAGCACGTTTTAATGCAGATGGAAATTATTGTATGACAGCTGGTGGCGATAGAACGATAAAACTATGGAATCCTTATAATTTCCGTTTATTAAAGACTTATGCAGGGCATGGAGGCGAAGTTTCTGATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD140096             [       ATGAATTCTGGAAATGATGATAGTTACAAGACATTAGGATTACCTACTCAACCATACTGTCGTATTCATTGCCATCAGTCAGCTGTACGTGCAGCACGTTTTAATGCAGATGGAAATTATTGTATGACAGCTGGTGGCGATAAAACGATAAAACTATGGAATCCTTATAATTTCCGTTTATTAAAGACTTATGCAGGGCATGGAGGCGAAGTTTCTGATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGAT GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAG                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD165302             [                                                                                                     CACGTTTTAATGCAGATGGAAATTATTGTATGACAGCTGGTGGCGATAAAACGATAAAACTATGGAATCCTTATAATTTCCGTTTATTAAAGACTTATGCAGGGCATGGAGGCGAAGTTTCTGATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCGTTTTCAC ATTCCGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD140206             [                                                                                                                                                                                                                             CTGATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGAT GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGACTATCCATGAGGCACGTGATAGTGTCACATGTTGTGCATTTCGTCGACATCAAATTGTTACTGGTTCTGTTGATCGATGTGTTCGGACTTATGATATTCGACGAGGTGAAATGACTGAGGACTATGTTGGATACCCAGTTACATCGGTTTCAATTACCATAGATTGTCAATGCTTTC                                                          ]
[-] EMBL CD140166             [                                                                                                                                                                                                                               GATGTACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGAT GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGACTATCCATGAGGCACGTGATAGTGTCACATGTTGTGCATTTCGTCGACATCAAATTGTTACTGGTTCTGTTGATCGATGTGTTCGGACTTATGATATTCGACGAGGTGAAATGACTGAGGACTATGTTGGATACCCAGTTACATCGGTTTCAATTACCATAGATTGTCAATGCTTTC                                                          ]
[-] EMBL CD140132             [                                                                                                                                                                                                                                   TACAGGCAGGGAAAGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATAATCTACTGGTGTAGAT GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGACTATCCATGAGGCACGTGATAGTGTCACATGTTGTGCATTTCGTCGACATCAAATTGTTACTGGTTCTGTTGATCGATGTGTTCGGACTTATGATATTCGACGAGGTGAAATGACTGAGGACTATGTTGGATACCCAGTTACATCGGTTTCAATTACCATAGATTGTCAATGCTTTC                                                          ]
[-] EMBL CD167189             [                                                                                                                                                                                                                                                        GTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGAT GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGgtaagcg                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD140198             [                                                                                                                                                                                                                                                                               GACTGTTAAGTTATATTATGGGATGTTTCTACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATTCATTGCACCG TTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGGTGTAGAT GGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGACTATCCATGAGGCACGTGATAGTGTCACATGTTGTGCATTTCGTCGACATCAAATTGTTACTGGTTCTGTTGATCGATGTGTTCGGACTTATGATATTCGACGAGGTGAAATGACTGAGGACTATGTTGGATACCCAGTTACATCGGTTTCAATTACCATAGATTGTCAATGCTTTCTAGTTGGTACACAAGATTCAACTTTACGTCTATTCGATGCGTTAACCGGTGAACTTCT]


>consensus_9220#0 ATGGATGATGAATTCTGGAAATGATGATAGTTACAAGACATTAGGATTACCTACTCAACC ATACTGTCGTATTCATTGCCATCAGTCAGCTGTACGTGCAGCACGTTTTAATGCAGATGG AAATTATTGTATGACAGCTGGTGGCGATAAAACGATAAAACTATGGAATCCTTATAATTT CCGTTTATTAAAGACTTATGCAGGGCATGGAGGCGAAGTTTCTGATGTACAGGCAGGGAA AGATAATAGTCAACTTGGTTCAGGTGGAGCAGACTGTTTAGTTATATTATGGGATGTTTC TACAGGACAATCTATTCGTCGATGGCGTCGTCATGCTGGTCGTGTGAATTCTGTATTATT CATTGCACCGTTTCACAATTCCGATTCATTAGACCCTAGTCCAATTTTATTATCTACTGG TGTAGATGGAATGGTTCTAGTTTGGGATGCCAGAGCGCGCACTCCTTATCCAGTTCAGAC TATCCATGAGGCACGTGATAGTGTCACATGTTGTGCATTTCGTCGACATCAAATTGTTAC TGGTTCTGTTGATCGATGTGTTCGGACTTATGATATTCGACGAGGTGAAATGACTGAGGA CTATGTTGGATACCCAGTTACATCGGTTTCAATTACCATAGATTGTCAATGCTTTCTAGT TGGTACACAAGATTCAACTTTACGTCTATTCGATGCGTTAACCGGTGAACTTCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)