cluster # 9231

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Schistosoma mansoni
cluster # 9231 cluster # 9231 Sequences # 9 consensus # 2

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consensus_9231#0 length = 1251 sequences # 6

consensus_9231#1 length = 827 sequences # 3

consensusID : consensus_9231#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1251
fasta sequence

                              [TATTGGCTATTGGACCAGCGCGTTTATTTGCGACCCTCAGAGCTTGTGGTGGTATGTATCGTGGTTGGAAAGTCATTGTAAAAGCGGAATTGTGAGTATTGGTTACACGTTACTGTGACATGAATGGTGTAAAACGTTCATTTAAGTTATCCACATTCTTAATTTCTACTGGGATTCCTTCACTGGATGAGTTACTTGGTGGTGGTGTAACTTCAGGAAGTATAATTCTTATTGAGCCAGATTTTCACCAAACATATGCAAAACTGCTCTTAAATTTGTTCGTAGCTGAAGGTATATTATCGGGTCATAGTATATTCTATGGTGCAAAGGAAACATTTGACAGTTTACTATCTAAATTACCAGATCACATGATTTCTACAAATGAGATCAAAGAAGAAATTTCAGATCTTAAAATTGCTTGGCGTTATCAAAATGTCCCAAACGTTAAGAATGTCAATTCATCTGTGTCAAGTTTGGGACATCATTTCAATGTGACCATGCCTATGAATGCAACTGCTCGAATATCTGAGAAAAATGTGTCAACTTTTTATTTCCAACCGGATAGTAAAAAAACATTGCATACTAATCTCTCCAGTTTAATTCAAAAATTAACTATTTTCCGTTCGAACACAAAAGTGTCTTCAGTTATACAACGGATAGTGGTAAACTCATGCGGCTCTCCTATGTGGGGTTATTGCAAAGATACTCAACAGTTCTACAGGAATATGCTTAGTTTCTTTGCTACATTACGCCTGCTAATTCANAACGGTCACTGTACAGTTTTCATCACGTTACCTAC-ATAAAGCTACCGCCTGGTCTATTGACTCGTCTATCTCATTACTGGGATTATGTGTTTCGAGTACAAGGTCTGCGTGATCAGATACAAGCGAATCCAGTGTATTCAGAATATGATGGTCTACTCACAGTTATTCATATTCCTTGGTTAATCAGTGGAAATACACTTGAACCGGCTTTCAGATCAGCTACACTTGAATGGTGTTTCAAGATAAAGCGACATCAGCTAGTTGTTCAGCATTTTCACTTACCACCTTCTCTATCTGATACAGTAAATAGATCCAATGCACAGGAAACAGTTCTCACATGTTCCAAAATGCGTGAAAATCAGTTAGACTTTTAAATTTGCCTACTATTATGGAAGACAATGAAGAAGAAATAAACATACTTAGTGATTTGTACATTTCTGATAAAATAAATTCTCATATTAATTCAAAAAAAAGTAAAAAAAANCAG]

[+] EMBL CD184859             [TATTGGCTATTGGACCAGCGCGTTTATTTGCGACCCTCAGAGCTTGTGGTGGTATGTATCGTGGTTGGAAAGTCATTGTAAAAGCGGAATTGTGAGTATTGGTTACACGTTACTGTGACATGAATGGTGTAAAACGTTCATTTAAGTTATCCACATTCTTAATTTCTACTGGGATTCCTTCACTGGATGAGTTACTTGGTGGTGGTGTAACTTCAGGAAGTATAATTCTTATTGAGCCAGATTTTCACCAAACATATGCAAAACTGCTCTTAAATTTGTTCGTAGCTGAAGGTATATTATCGGGTCATAGTATATTCTATGGTGCAAAGGAAACATTTGACAGTTTACTATCTAAATTACCAGATCACATGATTTCTACAAATGAGATCAAAGAAGAAATTTCAGATCTTAAAATTGCTTGGCGTTATCAAAATGTCCCAAACGTTAAGAATGTCAATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI976681             [                                                    TATGTATCGTGGTTGGAAAGTCATTGTAAAAGCGGAATTGTGAGTATTGGTTACACGTTACTGTGACATGAATGGTGTAAAACGTTCATTTAAGTTATCCACATTCTTAATTTCTACTGGGATTCCTTCACTGGATGAGTTACTTGGTGGTGGTGTAACTTCAAGAAGTATAATTCTTATTGAGCCAGATTTTCACCAAACATATGCAAAACTGCTCTTAAATTTGTTCGTAGCTGAAGGTATATTATCGGGTCATAGTATATTCTATGGTGCAAAGGAAACATTTGACAGTTTACTATCTAAATTACCAGATCACATGATTTCTACAAATGAGATCAAAGAAGAAATTTCAGATCTTAAAATTGCTTGGCGTTATCAAAATGTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD183091             [                                                      TGTATCGTGGTTGGAAAGTCATTGTAAAAGCGGAATTGTGAGTATTGGTTACACGTTACTGTGACGTGAATGGTGTAAAACGTTCATTTAAGTTATCCACATTCTTAATTTCTACTGGGATTCCTTCACTGGATGAGTTACTTGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
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[-] EMBL CD093849             [                                                                                                                                                                                                                                                    TCACCAAACATATGCAAAACTGCTCTTAAATTTGTTCGTAGCTGAAGGTATATTATCGGGTCATAGTATATTCTATGGTGCAAAGGAAACATTTGACAGTTTACTATCTAAATTACCAGATCTCATGATTTCTACAAATGAGATCAAAGAAGAAATTTCAGATCTTAAAATTGCTTGGCGTTATCAAAATGTCCCAAACGTTAAGAATGTCAATTCATCTGTGTCAAGTTTGGGACATCATTTCAATGTGACCATGCCTATGAATGCAACTGCTCGAATATCTGAGAAAAATGTGTCAACTTTTTATTTCCAACCGGATAGTAAAAAAACATTGCATACTAATCTCTCCAGTTTAATTCAAAAATTAACTATTTTCCGTTCGAACACAAAAGTGTCTTCAGTTATACAACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD074569             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cTTTTATTTCCAACCGGATAGTAAAAAAACATTGCATACTAATCTCTCCAGTTTAATTCAAAAATTAACTATTTTCCGTTCGAACACAAAAGTGTCTTCAGTTATACAACGGATAGTGGTAAACTCATGCGGCTCTCCTATGTGGGGTTATTGCAAAGATACTCAACAGTTCTACAGGAATATGCTTAGTTTCTTTGCTACATTACGCCTGCTAATTCAAAACGGTCACTGTACAGTTTTCATCACGTTACCTACAATAAAGCTACCGCCTGGTCTATTGACTCGTCTATCTCATTACTGTGATTATGTGTTTCGAGTACAAGGTCTGCGTGATCAGATACAAGCGAATCCAGTGTATTCAGAATATGATGGTCTACTCACAGTTATTCATATTCCTTGGTTAATCAGTGGAAATACACTTGAACCGGCTTTCAGATCAGCTACACTTGAATGGTGTTTCAAGATAAAGCGACATCAGCTAGTTGTTCAGCATTTTCACTTACCACCTTCTCTATCTGATACAGTAAATAGATCCAATGCACAGGAAACAGTTCTCACATGTTCCAAAATGCGTGAAAATCAGTTAGACTTTTAAATTTGCCTACTATTATGGAAGACAATGAAGAAGAAATAAACATACTTAGTGATTTGTACATTTCTGATAAAATAAATTCTCATATTAATTCAAAAAAAAGTAAAAAAAANCAG]




>consensus_9231#0
TATTGGCTATTGGACCAGCGCGTTTATTTGCGACCCTCAGAGCTTGTGGTGGTATGTATC
GTGGTTGGAAAGTCATTGTAAAAGCGGAATTGTGAGTATTGGTTACACGTTACTGTGACA
TGAATGGTGTAAAACGTTCATTTAAGTTATCCACATTCTTAATTTCTACTGGGATTCCTT
CACTGGATGAGTTACTTGGTGGTGGTGTAACTTCAGGAAGTATAATTCTTATTGAGCCAG
ATTTTCACCAAACATATGCAAAACTGCTCTTAAATTTGTTCGTAGCTGAAGGTATATTAT
CGGGTCATAGTATATTCTATGGTGCAAAGGAAACATTTGACAGTTTACTATCTAAATTAC
CAGATCACATGATTTCTACAAATGAGATCAAAGAAGAAATTTCAGATCTTAAAATTGCTT
GGCGTTATCAAAATGTCCCAAACGTTAAGAATGTCAATTCATCTGTGTCAAGTTTGGGAC
ATCATTTCAATGTGACCATGCCTATGAATGCAACTGCTCGAATATCTGAGAAAAATGTGT
CAACTTTTTATTTCCAACCGGATAGTAAAAAAACATTGCATACTAATCTCTCCAGTTTAA
TTCAAAAATTAACTATTTTCCGTTCGAACACAAAAGTGTCTTCAGTTATACAACGGATAG
TGGTAAACTCATGCGGCTCTCCTATGTGGGGTTATTGCAAAGATACTCAACAGTTCTACA
GGAATATGCTTAGTTTCTTTGCTACATTACGCCTGCTAATTCANAACGGTCACTGTACAG
TTTTCATCACGTTACCTACATAAAGCTACCGCCTGGTCTATTGACTCGTCTATCTCATTA
CTGGGATTATGTGTTTCGAGTACAAGGTCTGCGTGATCAGATACAAGCGAATCCAGTGTA
TTCAGAATATGATGGTCTACTCACAGTTATTCATATTCCTTGGTTAATCAGTGGAAATAC
ACTTGAACCGGCTTTCAGATCAGCTACACTTGAATGGTGTTTCAAGATAAAGCGACATCA
GCTAGTTGTTCAGCATTTTCACTTACCACCTTCTCTATCTGATACAGTAAATAGATCCAA
TGCACAGGAAACAGTTCTCACATGTTCCAAAATGCGTGAAAATCAGTTAGACTTTTAAAT
TTGCCTACTATTATGGAAGACAATGAAGAAGAAATAAACATACTTAGTGATTTGTACATT
TCTGATAAAATAAATTCTCATATTAATTCAAAAAAAAGTAAAAAAAANCAG

consensusID : consensus_9231#1
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 827
fasta sequence

                              [AAAACGTTCATTTAAGTTATCCACATTCTTAATTTCTACTGGGATTCCTTCACTGGATGAGTTACTTGGTAATGCTTTTTTCTAACTAGTATCATCAATATTTATAGGTGGTGGTGTAACTTCAGGAAGTATAATTCTTATTGGTACAGTATATGAAGTATTTTTAATTTCAATTTTAATTTAAAGAGCCAGATTTTCACCAAACATATGCAAAACTGCTCTTAAATTTGTTCGTAGCTGAAGGTATATTATCGGGTCATAGTATATTCTATGGTGCAAAGGAAACATTTGACAGTNTACTATCTGTAAGAATAATTTAAAATATAGTCTAATGTGATATCTCTGTAATGTTTTAGAAATTACCAGATCACATGATTTCTACAAATGAGATCAAAGAAGAAATTTCAGATCTTAAAATTGCTTGGCGTTATCAAAATGTCCCAAACGTTAAGGTTTCAATCATCATTGTTATTCTTACATGACACTTTACTTCCAGAATGTCAATTCATCTGTGTCAAGTTTGGGACATCATTTCAATGTGACCATGCCTATG-AATGCAACTGCTCGAATATCTGAGAAAAATGTGTCAACTTTTTATTTCCAACCGGATAGTAAAAAAACGTAATGACTGTTTAATTCTAAAGTCTGTCATTTCACTCCTATAGATTGCATACTAATCTCTCCAGTTTAATTCAAAAATTAACTATTTTCCGTTCGAACACAAAAGTGTCTTCAGTTATACAACGGATAGGTTTGTTTCTTGCTGTTCATTCATTTATAGCATTCGAAATACTTTATCCTCAGTGGTAAACTCATGCGGCTCTCCT]

[+] EMBL CD089054             [AAAACGTTCATTTAAGTTATCCACATTCTTAATTTCTACTGGGATTCCTTCACTGGATGAGTTACTTGGTAATGCTTTTTTCTAACTAGTATCATCAATATTTATAGGTGGTGGTGTAACTTCAGGAAGTATAATTCTTATTGGTACAGTATATGAAGTATTTTTAATTTCAATTTTAATTTAAAGAGCCAGATTTTCACCAAACATATGCAAAACTGCTCTTAAATTTGTTCGTAGCTGAAGGTATATTATCGGGTCATAGTATATTCTATGGTGCAAAGGAAACATTTGACAGTTTACTATCTGTAAGAATAATTTAAAATATAGTCTAATGTGATATCTCTGTAATGTTTTAGAAATTACCAGATCACATGATCTCTACAAATGAGATCAAAGAAGAAATTTCAGATCTTAAAATTGCTTGGCGTTATCAAAATGTCCCAAACGTTAAGGTTTCAATCATCATTGTTATTCTTACATGACACTTTACTTCCAGAATGTCAATTCATCTGTGTCAAGTTTGGGACATCATTTCAATGTGACCATGCCTATGAAATGC ACTGCTCGAATATCTGA                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD089040             [                                                                                                                                                                                                                                                           TCGGGTCATAGTATATTCTATGGTGCAAAGGAAACATTTGACAGTNTACTATCTGTAAGAATAATTTAAAATATAGTCTAATGTGATATCTCTGTAATGTTTTAGAAATTACCAGATCACATGATTTCTACAAATGAGATCAAAGAAGAAATTTCAGATCTTAAAATTGCTTGGCGTTATCAAAATGTCCCAAACGTTAAGGTTTCAATCATCATTGTTATTCTTACATGACACTTTACTTCCAGAATGTCAATTCATCTGTGTCAAGTTTGGGACATCATTTCAATGTGACCATGCCTATG AATGCAACTGCTCGAATATCTGAGAAAAATGTGTCAACTTTTTATTTCCAACCGGATAGTAAAAAAACGTAATGACTGTTTAATTCTAAAGTCTGTCATTTCACTCCTATAGATTGCATACTAATCTCTCCAGTTTAATTCAAAAATTAACTATTTTCCGTTCGAACACAAAAGTGTCTTCAGTTATACAACGGATAGGTTTGTTTCTTGCTGTTCATTCATTTATAGCATTCGAAATACTTTATCCTCAGTGGTAAACTCATGCGGCTCTCCT]
[-] EMBL CD089211             [                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATTTGACAGTNTACTATCTGTAAGAATAATNTANAATATAGTCTAATGTGATATCTCTGTAATGTTTTAGAAATTACCAGATCACATGATTTCTACAAATGAGATCAAAGAAGAAATTTCAGATCTTAAAATTGCTTGGCGTTATCAAAATGTCCCAAACGTTAAGGTTTCAATCATCATTGTTATTCTTACATGACACTTTACTTCCAGAATGTCAATTCATCTGTGTCAAGTTTGGGACATCATTTCAATGTGACCATGCCTATG AATGCAACTGCTCGAATATCTGAGAAAAATGTGTCAACTTTTTATTTCCAACCGGATAGTAAAAAAACGTAATGACTGTTTAATTCTAAAGTCTGTCATTTCACTCCTATAGATTGCATACTAATCTCTCCAGTTTAATTCAAAAATTAACTATTTTCCGTTCGAACACAAAAGTGTCTTCAGTTATACAACGGATAGGTTTGTTTCTTGCTGTTCATTCATTTATAGCATTCGAAATACTTTATCCTCAGTGGTAAACTCATGCGGCTCTCCT]




>consensus_9231#1
AAAACGTTCATTTAAGTTATCCACATTCTTAATTTCTACTGGGATTCCTTCACTGGATGA
GTTACTTGGTAATGCTTTTTTCTAACTAGTATCATCAATATTTATAGGTGGTGGTGTAAC
TTCAGGAAGTATAATTCTTATTGGTACAGTATATGAAGTATTTTTAATTTCAATTTTAAT
TTAAAGAGCCAGATTTTCACCAAACATATGCAAAACTGCTCTTAAATTTGTTCGTAGCTG
AAGGTATATTATCGGGTCATAGTATATTCTATGGTGCAAAGGAAACATTTGACAGTNTAC
TATCTGTAAGAATAATTTAAAATATAGTCTAATGTGATATCTCTGTAATGTTTTAGAAAT
TACCAGATCACATGATTTCTACAAATGAGATCAAAGAAGAAATTTCAGATCTTAAAATTG
CTTGGCGTTATCAAAATGTCCCAAACGTTAAGGTTTCAATCATCATTGTTATTCTTACAT
GACACTTTACTTCCAGAATGTCAATTCATCTGTGTCAAGTTTGGGACATCATTTCAATGT
GACCATGCCTATGAATGCAACTGCTCGAATATCTGAGAAAAATGTGTCAACTTTTTATTT
CCAACCGGATAGTAAAAAAACGTAATGACTGTTTAATTCTAAAGTCTGTCATTTCACTCC
TATAGATTGCATACTAATCTCTCCAGTTTAATTCAAAAATTAACTATTTTCCGTTCGAAC
ACAAAAGTGTCTTCAGTTATACAACGGATAGGTTTGTTTCTTGCTGTTCATTCATTTATA
GCATTCGAAATACTTTATCCTCAGTGGTAAACTCATGCGGCTCTCCT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9231#0      TATTGGCTATTGGACCAGCGCGTTTATTTGCGACCCTCAGAGCTTGTGGTGGTATGTATC 60
consensus_9231#1      ----------------AAAACGTTCATTTAAGTTATCCACATTCT----TAATTTCTACT 40
                                      *   **** ****  *     ** *   *    *  * * **  

consensus_9231#0      GTGGTTGGAAAGTCATTGTAAAAGCGGAATTGTGAGTATTGGTTACACGTTACTGTGACA 120
consensus_9231#1      GGGATTCCT---TCACTGGATGAGTT-ACTTGGTAATGCTTTTTTCTAACTA--GTATCA 94
                      * * **      *** ** *  **   * ***  * *  *  ** *    **  **  **

consensus_9231#0      TGAATGGTGTAAAACGTTCATTTAAGTTATCCACATTCTTAATTTCTACTGGGATTCCTT 180
consensus_9231#1      TCAATATTTATAGGTGGTGGTGTAACTT--CAGGAAGTATAATTCTTATTGGTA------ 146
                      * ***  *   *   * *  * *** **  *   *    *****  ** *** *      

consensus_9231#0      CACTGGATGAGTTACTTGGTGGTGGTGTAACTTCAGGAAGTATAATTCTTATTGAGCCAG 240
consensus_9231#1      CAGTATATGAAGTATTTT---------TAATTTCA---ATTTTAATT--TAAAGAGCCAG 192
                      ** *  ****  ** **          *** ****   * * *****  **  *******

consensus_9231#0      ATTTTCACCAAACATATGCAAAACTGCTCTTAAATTTGTTCGTAGCTGAAGGTATATTAT 300
consensus_9231#1      ATTTTCACCAAACATATGCAAAACTGCTCTTAAATTTGTTCGTAGCTGAAGGTATATTAT 252
                      ************************************************************

consensus_9231#0      CGGGTCATAGTATATTCTATGGTGCAAAGGAAACATTTGACAGTTTACTATCT------- 353
consensus_9231#1      CGGGTCATAGTATATTCTATGGTGCAAAGGAAACATTTGACAGTNTACTATCTGTAAGAA 312
                      ******************************************** ********       

consensus_9231#0      --------------------------------------------AAATTACCAGATCACA 369
consensus_9231#1      TAATTTAAAATATAGTCTAATGTGATATCTCTGTAATGTTTTAGAAATTACCAGATCACA 372
                                                                  ****************

consensus_9231#0      TGATTTCTACAAATGAGATCAAAGAAGAAATTTCAGATCTTAAAATTGCTTGGCGTTATC 429
consensus_9231#1      TGATTTCTACAAATGAGATCAAAGAAGAAATTTCAGATCTTAAAATTGCTTGGCGTTATC 432
                      ************************************************************

consensus_9231#0      AAAATGTCCCAAACGTTAAG---------------------------------------- 449
consensus_9231#1      AAAATGTCCCAAACGTTAAGGTTTCAATCATCATTGTTATTCTTACATGACACTTTACTT 492
                      ********************                                        

consensus_9231#0      ----AATGTCAATTCATCTGTGTCAAGTTTGGGACATCATTTCAATGTGACCATGCCTAT 505
consensus_9231#1      CCAGAATGTCAATTCATCTGTGTCAAGTTTGGGACATCATTTCAATGTGACCATGCCTAT 552
                          ********************************************************

consensus_9231#0      GAATGCAACTGCTCGAATATCTGAGAAAAATGTGTCAACTTTTTATTTCCAACCGGATAG 565
consensus_9231#1      GAATGCAACTGCTCGAATATCTGAGAAAAATGTGTCAACTTTTTATTTCCAACCGGATAG 612
                      ************************************************************

consensus_9231#0      TAAAAAAAC--------------------------------------------ATTGCAT 581
consensus_9231#1      TAAAAAAACGTAATGACTGTTTAATTCTAAAGTCTGTCATTTCACTCCTATAGATTGCAT 672
                      *********                                            *******

consensus_9231#0      ACTAATCTCTCCAGTTTAATTCAAAAATTAACTATTTTCCGTTCGAACACAAAAGTGTCT 641
consensus_9231#1      ACTAATCTCTCCAGTTTAATTCAAAAATTAACTATTTTCCGTTCGAACACAAAAGTGTCT 732
                      ************************************************************

consensus_9231#0      TCAGTTATACAACGGATAGTGGTAAACTCATGCGGCTCTCCTATGTGGGGTTATTGCAAA 701
consensus_9231#1      TCAGTTATACAACGGATAG-GTTTGTTTCTTGCTGTTCATTCATTTATAGCATTCG---A 788
                      ******************* * *    ** *** * **    ** *   *   * *   *

consensus_9231#0      GATACTCAACAGTTCTACAGGAATATGCTTA-GTTTCTTTGCTACATTACGCCTGCTAAT 760
consensus_9231#1      AATACTTTA----TCCTCAGTGGTAAACTCATGCGGCTCTCCT----------------- 827
                       *****  *    **  ***   **  ** * *   ** * **                 

consensus_9231#0      TCANAACGGTCACTGTACAGTTTTCATCACGTTACCTACATAAAGCTACCGCCTGGTCTA 820
consensus_9231#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9231#0      TTGACTCGTCTATCTCATTACTGGGATTATGTGTTTCGAGTACAAGGTCTGCGTGATCAG 880
consensus_9231#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9231#0      ATACAAGCGAATCCAGTGTATTCAGAATATGATGGTCTACTCACAGTTATTCATATTCCT 940
consensus_9231#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9231#0      TGGTTAATCAGTGGAAATACACTTGAACCGGCTTTCAGATCAGCTACACTTGAATGGTGT 1000
consensus_9231#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9231#0      TTCAAGATAAAGCGACATCAGCTAGTTGTTCAGCATTTTCACTTACCACCTTCTCTATCT 1060
consensus_9231#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9231#0      GATACAGTAAATAGATCCAATGCACAGGAAACAGTTCTCACATGTTCCAAAATGCGTGAA 1120
consensus_9231#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9231#0      AATCAGTTAGACTTTTAAATTTGCCTACTATTATGGAAGACAATGAAGAAGAAATAAACA 1180
consensus_9231#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9231#0      TACTTAGTGATTTGTACATTTCTGATAAAATAAATTCTCATATTAATTCAAAAAAAAGTA 1240
consensus_9231#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9231#0      AAAAAAANCAG 1251
consensus_9231#1      -----------