cluster # 9233

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Schistosoma mansoni
cluster # 9233 cluster # 9233 Sequences # 9 consensus # 2

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consensus_9233#0 length = 1179 sequences # 6

consensus_9233#1 length = 772 sequences # 3

consensusID : consensus_9233#0
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1179
fasta sequence

                              [GAAAATTTCAGAAGTTGGTATTACATTTTTATTTACACCATACTGGGGTAGCATGTTTACTCCTAGTTTATGGGTTGCTGCTGCTAGTCAAAATGCATTCGATACTGGCGCAGCTATGGCTTTATTCATTTCATATTCATCATATTTTAGTCGGAAAAATGGTGCTGTACGCCTCGGTACCATGATTCCAATATGTAACAATATGGTCAGTTTACACTGTGCGCTAACAATTTTCTCAACTGTCTTCTCAACTTTAATACAAACATCACCAACACTAACACGTTCTGGCATCTTGAAAATAATGCAATCAAATGGACCTGGTAGCACAGGTCTCACATTTACCTGGATCCCTGTCCTATTCGCCTATGTTGGTGGTTTGGGAAGAGTTCTATGTTCATTGTTCTTCTTATGTCTCTCCTTCGCGGGGATTACTTCATTAATTGGTCATGTCCAATTGACAGTTGTAACAGCTAAGGACTTGGGTTTAAGTCATAGAAAAGCTGCATTTGCTGGTTTATTCCTCACTCTTGTATTTGGTATGCCTTCTGCTATTAGCATAAACGTTCTTACGAATCANGACAATGTTTGGGGGTTTTGCACTTATGTTATCCGGTTTATCTATGGCTGGTCTAATATTGATTTATGGTCCAATGAAATATAGAAGGGTCATTGTGAATGATTTTGGAATCGATGATTGGAAACTTTCAGTTGTTTGGGTCTTTATGATAAGTG-TTTTGGTGCCTTTATCTGGAACCGGGTTGATTATTTGGTGGGCATATGATTTAATAAAATCTAATCCAAAATGGTATCAACTTACTTTGGATTCAATGACTACTACATTACTTGAGTGGTTCATTGTATTTCTCATTTTAATAACTGTAAACGCTATAGCAGTATGGCGTAATATTGATTTCTTTCATAAACATAAACAAAATGGTTATGATCCTCACAATCCAGATTATATACCAAAAGATGAATTGGAGTCATTTAATGAATTCTTTGTTGTATCCTCAGATAGTGTAAATATCAATCGAAATCAAATGAGAACACACTTGTAATTAGTATATTTATATATTGTCTCATAAATGTATTTGATTAACACAATCTAATTATTTCGCTTATACATATATATTATGTAGACATATATATACCCTATTTTAAATAAAATGAAAGTTTTTT]

[+] EMBL CD087690             [GAAAATTTCAGAAGTTGGTATTACATTTTTATTTACACCATACTGGGGTAGCATGTTTACTCCTAGTTTATGGGTTGCTGCTGCTAGTCAAAATGCATTCGATACTGGCGCAGCTATGGCTTTATTCATTTCATATTCATCATATTTTAGTCGGAAAAATGGTGCTGTACGCCTCGGTACCATGATTCCAATATGTAACAATATGGTCAGTTTACACTGTGCGCTAACAATTTTCTCAACTGTCTTCTCAACTTTAATACAAACATCACCAACACTAACACGTTCTGGCATCTTGAAAATAATGCAATCAAATGGACCTGGTAGCACAGGTCTCACATTTACCTGGATCCCTGTCCTATTCGCCTATGTTGGTGGTTTGGGAAGAGTTCTATGTTCATTGTTCTTCTTATGTCTCTCCTTCGCGGGGATTACTTCATTAATTGGTCATGTCCAATTGACAGTTGTAACAGCTAAGGACTTGGGTTTAAGTCATAGAAAAGCTGCATTTGCTGGTTTATTCCTCACTCTTGTATTTGGTATGCCTTCTGCTATTAGCATAAACGTTCTTACGAATCANGACAATGTTTGGGGGTTTTGCACTTATGTTATCCGGTTTATCTATGGCTGGTCTAATATTGATTTATGGTCCAATGAAATATAGAAGGGTCATTGTGAATGATTTTGGAATCGATGATTGGAAACTTTCAGTTGTTTGGGTCTTTATGATAAGTGTTTTTGGTGCCTTTATCTGGAACCGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
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[+] EMBL CD182093             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTATTTGGTGGGCATATGATTTAATAAAATCTAATCCAAAATGGTAACAACTTACTTTGGATTCAATGACTACTACATTACTTGAGTGGTTCATTGTATTTCTCATTTTAATAACTGTAAACGCTATAGCAGTATGGCGTAATATTGATTTCTTTCATAAACATAAACAAAATGGTTAT                                                                                                                                                                                                                                              ]
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>consensus_9233#0
GAAAATTTCAGAAGTTGGTATTACATTTTTATTTACACCATACTGGGGTAGCATGTTTAC
TCCTAGTTTATGGGTTGCTGCTGCTAGTCAAAATGCATTCGATACTGGCGCAGCTATGGC
TTTATTCATTTCATATTCATCATATTTTAGTCGGAAAAATGGTGCTGTACGCCTCGGTAC
CATGATTCCAATATGTAACAATATGGTCAGTTTACACTGTGCGCTAACAATTTTCTCAAC
TGTCTTCTCAACTTTAATACAAACATCACCAACACTAACACGTTCTGGCATCTTGAAAAT
AATGCAATCAAATGGACCTGGTAGCACAGGTCTCACATTTACCTGGATCCCTGTCCTATT
CGCCTATGTTGGTGGTTTGGGAAGAGTTCTATGTTCATTGTTCTTCTTATGTCTCTCCTT
CGCGGGGATTACTTCATTAATTGGTCATGTCCAATTGACAGTTGTAACAGCTAAGGACTT
GGGTTTAAGTCATAGAAAAGCTGCATTTGCTGGTTTATTCCTCACTCTTGTATTTGGTAT
GCCTTCTGCTATTAGCATAAACGTTCTTACGAATCANGACAATGTTTGGGGGTTTTGCAC
TTATGTTATCCGGTTTATCTATGGCTGGTCTAATATTGATTTATGGTCCAATGAAATATA
GAAGGGTCATTGTGAATGATTTTGGAATCGATGATTGGAAACTTTCAGTTGTTTGGGTCT
TTATGATAAGTGTTTTGGTGCCTTTATCTGGAACCGGGTTGATTATTTGGTGGGCATATG
ATTTAATAAAATCTAATCCAAAATGGTATCAACTTACTTTGGATTCAATGACTACTACAT
TACTTGAGTGGTTCATTGTATTTCTCATTTTAATAACTGTAAACGCTATAGCAGTATGGC
GTAATATTGATTTCTTTCATAAACATAAACAAAATGGTTATGATCCTCACAATCCAGATT
ATATACCAAAAGATGAATTGGAGTCATTTAATGAATTCTTTGTTGTATCCTCAGATAGTG
TAAATATCAATCGAAATCAAATGAGAACACACTTGTAATTAGTATATTTATATATTGTCT
CATAAATGTATTTGATTAACACAATCTAATTATTTCGCTTATACATATATATTATGTAGA
CATATATATACCCTATTTTAAATAAAATGAAAGTTTTTT

consensusID : consensus_9233#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 772
fasta sequence

                              [AATGATTTTGGAATCGATGATTGGAAACTTTCAGTTGTTTGGGTCTTTATGATAAGGTTTGTTAAGCGTTATAATAATCTTGTCATTAAACGTTTAGTAATATCAAAAAGATTATGTATTTGAAAGCTAGTATACACAAACTTTTCTCATCAAGAATGTGGTTAATATTGCACAAAACTATGAGTGACTGAGTAAGCCATTTGATAAGTATTCAATTATTTAAGTAACGTTTATGGGTATTTAACTAATCGAAGTGTTAAAAGCCTGTTTTATCCTGGTTAAGGATTTCAGAACTGGACACCCACGATTCATTTGCATATAGAATTGAGAATGTACGGATACATATTGTGAAATCAGTTATGTAACAAAACAACGGCAGTTATCATTGCTAATGATGAATGTTAGTCACGACATGACATGAGTTAACTTCAGATTTAATTGTAGACCATTGTATTTCGATTCAGTACTTTCAACGCATCTAAATCAGCATAAGTATTTGGCTCGCTTTCATATAAGTNTTTCAGCTTATAATACTGAGATTGGAATTAGATCAAAACAGTTGTCTAATATTGTATAGTTTTCTAAAACCAACATCAGTCTGTGAACAAGAAAATGTTTTCTCAATATGAGATTTTAGGTTTACCATTATTATCAATCACAACTAACAAAAAAAGAAAA-CTGTTTACAAATAGTGTACCACATGCTATTGTGGTAGATTTTCAAAATCCTTAGATTAAATTAAAATCCAAATAATAACCCGAAGT-GTTCAATG]

[+] EMBL CD091337             [AATGATTTTGGAATCGATGATTGGAAACTTTCAGTTGTTTGGGTCTTTATGATAAGGTTTGTTAAGCGTTATAATAATCTTGTCATTAAACGTTTAGTAATATCAAAAAGATTATGTATTTGAAAGCTAGTATACACAAACTTTTCTCATCAAGAATGTGGTTAATATTGCACAAAACTATGAGTGACTGAGTAAGCCATTTGATAAGTATTCAATTATTTAAGTAACGTTTATGGGTATTTAACTAATCGAAGTGTTAAAAGCCTGTTTTATCCTGGTTAAGGATTTCAGAACTGGACACCCACGATTCATTTGCATATAGAATTGAGAATGTACGGATACATATTGTGAAATCAGTTATGTAACAAAACAACGGCAGTTATCATTGCTAATGATGAATGTTAGTCACGACATGACATGAGTTAACTTCAGATTTAATTGTAGACCATTGTATTTCGATTCAGTACTTTCAACGCATCTAAATCAGCATAAGTATTTGGCTCGCTTTCATATAAGTNTTTCAGCTTATAATACTGAGATTGGAATTAGATCAAAACAGTTGTCTAATATTGTATAGTTTTCTAAAACCAACATCAGTCTGTGAACAAGAAAATGTTTTCTCAATATGAGATTTTAGGTTTACCATTATTATCAATCACAACTAACAAAAAAAGAAAA CTGTTTACAAATAGTGTACCACATGCTATTGTGGTAGATTTTCAAAATCCTTAGATTAAATTAAAATCCAAATAATAACCCGAAGT GTTCAATG]
[+] EMBL CD091417             [AATGATTTTGGAATCGATGATTGGAAACTTTCAGTTGTTTGGGTCTTTATGATAAGGTTTGTTAAACGTTATAATAATCTTGTCATTAAACGTTTAGTAATATCAAAAAGATTATGTATTTGGAACCTAGTATACACAAACTTTTCTCATCAAGAATGTGGTTAATATTGCACAAAACTATGAGTGACTGAGTAAGCCATTTGATAAGTATTCAATTATTTAAGTAACGTTTATGGGTATTTAACTAATCGAAGTGTTAAAAGCCTGTTTTATCCTGGTTAAGGATTTCAGAACTGGACACCCACGATTCATTTGCATATAGAATTGAGAATGTACGGATACATATTGTGAAATCAGTTATGTAACAAAACAACGGCAGTTATCATTGCTAATGATGAATGTTAGTCACGACATGACATGAGTTAACTTCAGATTTAATTGTAGACCATTGTATTTCGATTCAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD091346             [                                                                                                                                                                                                                                                                TTAAAAGCCTGTTTTATCCTGGTTAAGGATTTCAGAACTGGACACCCACGATTCATTTGCATATAGAATTGAGAATGTACGGATACATATTGTGAAATCAGTTATGTAACAAAACAACGGCAGTTATCATTGCCAATGATGAATGTTAGTCACGACATGACATGAGTTAACTTCAGATTTAATTGTAGACCATTGTATTTCGATTCAGTACTTTCAACGCATCTAAATCAGCATAAGTATTTGGCTCGCTTTCATATAAGTTTTTCAGCTTATAATACTGAGATTGGAATTAGATCAAAACAGTTGTCTAATATTGTATAGTTTTCTAAAACCAACATCAGTCTGTGAACAAGAAAATGTTTTCTCAATATGAGATTTTAGGTTTACCATTATTATCAATCACAACTAACAAAAAAAGAAAACCTGTTAACAAATAGTGTACCACATGCTA TGTGGTAGATTTTCAAAATTCTCAGATTAAATTAAAATACAAATAATAA CCGAAGTAGTACAATG]




>consensus_9233#1
AATGATTTTGGAATCGATGATTGGAAACTTTCAGTTGTTTGGGTCTTTATGATAAGGTTT
GTTAAGCGTTATAATAATCTTGTCATTAAACGTTTAGTAATATCAAAAAGATTATGTATT
TGAAAGCTAGTATACACAAACTTTTCTCATCAAGAATGTGGTTAATATTGCACAAAACTA
TGAGTGACTGAGTAAGCCATTTGATAAGTATTCAATTATTTAAGTAACGTTTATGGGTAT
TTAACTAATCGAAGTGTTAAAAGCCTGTTTTATCCTGGTTAAGGATTTCAGAACTGGACA
CCCACGATTCATTTGCATATAGAATTGAGAATGTACGGATACATATTGTGAAATCAGTTA
TGTAACAAAACAACGGCAGTTATCATTGCTAATGATGAATGTTAGTCACGACATGACATG
AGTTAACTTCAGATTTAATTGTAGACCATTGTATTTCGATTCAGTACTTTCAACGCATCT
AAATCAGCATAAGTATTTGGCTCGCTTTCATATAAGTNTTTCAGCTTATAATACTGAGAT
TGGAATTAGATCAAAACAGTTGTCTAATATTGTATAGTTTTCTAAAACCAACATCAGTCT
GTGAACAAGAAAATGTTTTCTCAATATGAGATTTTAGGTTTACCATTATTATCAATCACA
ACTAACAAAAAAAGAAAACTGTTTACAAATAGTGTACCACATGCTATTGTGGTAGATTTT
CAAAATCCTTAGATTAAATTAAAATCCAAATAATAACCCGAAGTGTTCAATG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9233#0      GAAAATTTCAGAAGTTGGTATTACATTTTTATTTACACCATACTGGGGTAGCATGTTTAC 60
consensus_9233#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9233#0      TCCTAGTTTATGGGTTGCTGCTGCTAGTCAAAATGCATTCGATACTGGCGCAGCTATGGC 120
consensus_9233#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9233#0      TTTATTCATTTCATATTCATCATATTTTAGTCGGAAAAATGGTGCTGTACGCCTCGGTAC 180
consensus_9233#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9233#0      CATGATTCCAATATGTAACAATATGGTCAGTTTACACTGTGCGCTAACAATTTTCTCAAC 240
consensus_9233#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9233#0      TGTCTTCTCAACTTTAATACAAACATCACCAACACTAACACGTTCTGGCATCTTGAAAAT 300
consensus_9233#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9233#0      AATGCAATCAAATGGACCTGGTAGCACAGGTCTCACATTTACCTGGATCCCTGTCCTATT 360
consensus_9233#1      ----------AATGATTTTGGAATCGATGATTGGAAACTTTCAGTTGTTTGGGTCTT--- 47
                                ****    *** * *   * *   * * ** *     *    *** *   

consensus_9233#0      CGCCTATGTTGGTGGTTTGGGAAGAGTTCTATGTTCATTGTTCTTCT-TATGTCTCTCCT 419
consensus_9233#1      ----TATGATAA-GGTTTGTTAAGCGTTATAATAATCTTGTCATTAAACGTTTAGTAATA 102
                          **** *   ******  *** *** **      ****  **     * *       

consensus_9233#0      TCGCGGGGATTACTTCATTAATTGGTCATGTCCAATTGACAGTTGTAACAGCTAAGGACT 479
consensus_9233#1      TCAAAAAGATTATGTATTTGAAAGCTAGTATACAC---AAACTTTTCTCATC--AAGAAT 157
                      **     *****  *  ** *  * *  * * **    * * ** *  ** *  * ** *

consensus_9233#0      TGGGTTTAAGTCATAGAAAAGCTGCATTTGCTGGTTTATTCCTCACTCTTGTATTTGGTA 539
consensus_9233#1      GTGGTTAATATTGCACAAAACTATGAGTGACTGAGTAAGCC-----------ATTTGATA 206
                        **** *  *   * ****     * *  ***  * *  *           ***** **

consensus_9233#0      TGCCTTCTGCTATTAGCATAAACGTTCTTACGAATCANGACAATGTTTGGGGGTTTTGCA 599
consensus_9233#1      AGTATTCAATTATTTAAGTAA-CGTTTATGGGTATTTAACTAA--TCGAAGTGTTAAAAG 263
                       *  ***   ****    *** ****  *  * **      **  *    * ***     

consensus_9233#0      CTTATGTTATCCGGTTTATCTATGGCTGGTCTAATATTGATTTATGGTCCAATGAAATAT 659
consensus_9233#1      CCTGTTTTATCCTGGTTAAGGATTTCAGAACTGGAC---ACCCACGATTCATTTGCATAT 320
                      * * * ****** * ***   **  * *  **       *   * * * ** *   ****

consensus_9233#0      AGAAGGGTCATTGTGAATGATTTTGGAATCGATGATTGGAAACTTTCAGTTGTTTGGGTC 719
consensus_9233#1      AGAA------TTGAGAATG---TACGGATACATATTGTGAAA---TCAGTTATGTAA--C 366
                      ****      *** *****   *  * **  **  *  ****   ****** * *    *

consensus_9233#0      TTTATGATAAGTGTTTTGGTGCCTTTATCTGGAACCGGGTTGATTATTTGGTGGGCATAT 779
consensus_9233#1      AAAACAACGGCAGTTATCAT-TGCTAATGATGAAT---GTTAGTCACGACATG---ACAT 419
                         *  *     *** *  *    * **   ***    ***  * *     **   * **

consensus_9233#0      GATTTAATAAAATCTAATCCAAAATGGTATCAACTTACTTTGGATTCAATGACTACTACA 839
consensus_9233#1      GAGTTAAC----TTCAGATTTAATTGTAGACCATTGTATTTCGATTCAGTACTTTCAACG 475
                      ** ****     *  *     ** **    * * *   *** ****** *   * * ** 

consensus_9233#0      TTACTTGAGTGGT-TCATTGTATTTCTCATTTTAATAACTGTAAACGCTATAGC--AGTA 896
consensus_9233#1      CATCTAAATCAGCATAAGTATTTGGCTCGCTTTCATA----TAAGTNTTTCAGCTTATAA 531
                         **  *   *  * * * * *  ***  *** ***    ***    *  ***  *  *

consensus_9233#0      TGGCGTAATATTGATTTCTTTCATAAACATAAACAAAATGGTTATGATCCTCACAATCCA 956
consensus_9233#1      TACTGAGATTGGAATTAGATCAAAACAGTTGTCTAATATTGTATAGTTTTCTAAAACCAA 591
                      *   *  **    ***   *  * * *  *    ** ** **   * *    * ** * *

consensus_9233#0      GATTATATACCAAAAGATGAATTGGAGTCATTTAATGAATTCTTTGTTGTATCCTCAGAT 1016
consensus_9233#1      CATCAGTCTGTGAACAAGAAAATGTTTTCTCAATATGAGATTTTAGGTTTACCAT----T 647
                       ** *       **  *  ** **   **     ****  * ** * * ** * *    *

consensus_9233#0      AGTGTAAATATCAATCGAAATCAAATGAGAACACACTTGTAATTAGTATATTTATATATT 1076
consensus_9233#1      ATTATCAATCACAACTAACAAAAAAAGAAAAC-TGTTTACAAATAGTGTACC-ACATGCT 705
                      * * * ***  ***   * *  *** ** ***    **  ** **** **   * **  *

consensus_9233#0      GTCTCATAAATGTATTTGATTAACACAATCTAATTATTTCGCTTATACATATATATTATG 1136
consensus_9233#1      AT--------TGTGGTAGATTTTCAAAATCCTTAGATTAAATTAAAATCCAAATAATAAC 757
                       *        ***  * ****  ** ****     ***    * * *   * *** **  

consensus_9233#0      TAGACATATATATACCCTATTTTAAATAAAATGAAAGTTTTTT 1179
consensus_9233#1      CCGAAGTGTTCAATG---------------------------- 772
                        **  * *  *