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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9235#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 988 fasta sequence
[CCTAGCTGGCCCAAGAAATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGACAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGGTGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACGAAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATCTCCAAATTAGCAAGTGGGATAAATTTACTTTAATGATAAAAATATACTAAAGGGAATTATGGACAACAAATGTCTTTAATGTAATAGTGTTTACTTGGTTCATTAAGATGAACAACCATTGTGACTCATTTGTCGAGAATCTTTCTATTTACTGAGCTTTGAGGAACTCAATTTGTGACTGATAATATCAAGCTGTTTGAAAAAATANGTGGGCTTGAGTTTGTCTTAACTACGGTTAACCTNCTATTATTTTCCGTTATAAATAGTCATACCAAGAATTTCTCTATTCAATTCGACCGGCGTTCCGTCACTCAACCGAGTATTATGCCACAAAATGTGACTACCATAAACTAAATTATACAGCCTATCGTTCTTATGACCAAAGTTGATTTGCAGGCAACGCTTGCAGATTGTTGATTGCCTTTGGGCTGATAAGGTGTAATCTTTAACTATAGAGAATGTGTAAAATCCAAGTATTCAGTGGTCCTCTCTGCTTATTGTCAACACAAATGAGCAGCGAACTCTATTGATGTAGGTATTTGGAGGCCCCCAAATGCCCTGGTACGGTCAGAGTGGATATAGTTAGCTCTCCCTCTC]
[+] EMBL CD093933 [CCTAGCTGGCCCAAGAAATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGGCAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGGTGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACGAAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATCTCCAAATTAGCAAGTGGGATAAATTTACTTTAATGATAAAAATATACTAAAGGGAATTATGGACAACAAATGTCTTTAATGTAATAGTGTTTACTTGGTTCATTAAGATGAACAACCATTGTGACTCATTTGTCGAGAATCTTTCTATTTACTGAGCTTTGAGGAACTCAATTTGTGACTGATAATATCAAGCTGTTTGAAAAAATANGTGGGCTTGAGTTTGTCTTAACTACGGTTAACCTNCTATTA TTTCCGgt ]
[+] EMBL CD093917 [ CAAGAAATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGGCAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGGTGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACGAAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATCTCCAAATTAGCAAGTGGGATAAATTTACTTTAATGATAAAAATATACTAAAGGGAATTATGGACAACAAATGTCTTTAATGTAATAGTGTTTAC ]
[+] EMBL CD093923 [ ATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGACAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGGTGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACGAAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATCTCCAAATTAGCAAGTGGGATAAATTTACTTTAATGATAAAAATATACTAAAGGGAATTATGGACAACAAATGTCTTTAATGTAATAGTGTTTACTTGGTTCATTAAGATGAACAACCATTGTGACTCATTTGTCGAGAATCTTTCTATTTACTGAGCTTTGAGGAACTCAATTTGTGACTGATAATATCAAGCTGTTTGAAAAAATANGTGGGCTTGAGTTTGTCTTAACTACGGTTAACCTNCTATTATTTTCCGTTATAAATAGTCATACCAAGAATTTCTCTATTCAATTCGACCGGCGTTCCGTCACTCAACCGAGTATTATGCCACAAAATGTGACTACCATAA ]
[+] EMBL CD130527 [ ATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGACAAAAAAGCGG ]
[+] EMBL CD184116 [ ATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGACAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGGTGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACGAAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATC ]
[+] EMBL CD130488 [ ATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGACAAGAAAGCGGAT ]
[-] EMBL CD123359 [ TAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAGGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGACAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGGTGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACGAAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATCTCCAAATTAGCAAGTGGGATAAATTTACTTTAATGATA ]
[+] EMBL CD156962 [ CTATCTCCAAGTTAGCAAGTGGGATAAATTTACTTTAATGATAAAAATATACTAAAGGGAATTATGGACAACGAATGTCTTTAATGTAATAGTGTTTACTTGGTTCATTAAGATGAACAACCATTGTGACTCATTTGTCGAGAATCTTTCTATTTACTGAGCTTTGAGGAACTCAATTTGTGACTGATAATATCAAGCTGTTTGAAAAAATAGGTGGGCTTGAGTTTGTCTTAACTACGGTTAACCTCCTATTATTTCCGGTTATAAATAGTCATACCAAGAATTTCTCTATT ]
[-] EMBL CD126824 [ CCA TGTGACTCATTTGTCGAGAATCTTTCTATTTACTGAGCTTTGAGGAACTCAATTTGTGACTGATAATATCAAGCTGTTTGAAAAAATAGGTGGGCTTGAGTTTGTCTTAACTACGGTTAACCTCCTATTATTTCCGGTTATAAATAGTCATACCAAGAATTTCTCTATTCAATTCGACCGGCGTTCCGTCACTCAACCGAGTATTATGCAACAAAATGTGACTACCATAAACTAAATTATACAGCCTATCGTTCTTATGACCAAAGTTGATTTGCAGGCAACGCTTGCAGATTGTTGATTGCCTTTGGGCTGATAAGGTGTAATCTTTAACTATAGAGAATGTGTAAAATCCAAGTATTCAGTGGTCCTCTCTGCTTATTGTCAACACAAATGAGCAGCGAACTCTATTGATGTAGGTATTTGGAGGCCCCCAAATGCCCTGGTACGGTCAGAGTGGATATAGTTAGCTCTCCCTCTC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||