Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9235 cluster # 9235       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9235#0 length = 988 sequences # 9  

consensusID : consensus_9235#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 988
fasta sequence
                              [CCTAGCTGGCCCAAGAAATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGACAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGGTGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACGAAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATCTCCAAATTAGCAAGTGGGATAAATTTACTTTAATGATAAAAATATACTAAAGGGAATTATGGACAACAAATGTCTTTAATGTAATAGTGTTTACTTGGTTCATTAAGATGAACAACCATTGTGACTCATTTGTCGAGAATCTTTCTATTTACTGAGCTTTGAGGAACTCAATTTGTGACTGATAATATCAAGCTGTTTGAAAAAATANGTGGGCTTGAGTTTGTCTTAACTACGGTTAACCTNCTATTATTTTCCGTTATAAATAGTCATACCAAGAATTTCTCTATTCAATTCGACCGGCGTTCCGTCACTCAACCGAGTATTATGCCACAAAATGTGACTACCATAAACTAAATTATACAGCCTATCGTTCTTATGACCAAAGTTGATTTGCAGGCAACGCTTGCAGATTGTTGATTGCCTTTGGGCTGATAAGGTGTAATCTTTAACTATAGAGAATGTGTAAAATCCAAGTATTCAGTGGTCCTCTCTGCTTATTGTCAACACAAATGAGCAGCGAACTCTATTGATGTAGGTATTTGGAGGCCCCCAAATGCCCTGGTACGGTCAGAGTGGATATAGTTAGCTCTCCCTCTC]

[+] EMBL CD093933             [CCTAGCTGGCCCAAGAAATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGGCAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGGTGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACGAAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATCTCCAAATTAGCAAGTGGGATAAATTTACTTTAATGATAAAAATATACTAAAGGGAATTATGGACAACAAATGTCTTTAATGTAATAGTGTTTACTTGGTTCATTAAGATGAACAACCATTGTGACTCATTTGTCGAGAATCTTTCTATTTACTGAGCTTTGAGGAACTCAATTTGTGACTGATAATATCAAGCTGTTTGAAAAAATANGTGGGCTTGAGTTTGTCTTAACTACGGTTAACCTNCTATTA TTTCCGgt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD093917             [           CAAGAAATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGGCAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGGTGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACGAAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATCTCCAAATTAGCAAGTGGGATAAATTTACTTTAATGATAAAAATATACTAAAGGGAATTATGGACAACAAATGTCTTTAATGTAATAGTGTTTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD093923             [                 ATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGACAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGGTGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACGAAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATCTCCAAATTAGCAAGTGGGATAAATTTACTTTAATGATAAAAATATACTAAAGGGAATTATGGACAACAAATGTCTTTAATGTAATAGTGTTTACTTGGTTCATTAAGATGAACAACCATTGTGACTCATTTGTCGAGAATCTTTCTATTTACTGAGCTTTGAGGAACTCAATTTGTGACTGATAATATCAAGCTGTTTGAAAAAATANGTGGGCTTGAGTTTGTCTTAACTACGGTTAACCTNCTATTATTTTCCGTTATAAATAGTCATACCAAGAATTTCTCTATTCAATTCGACCGGCGTTCCGTCACTCAACCGAGTATTATGCCACAAAATGTGACTACCATAA                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD130527             [                 ATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGACAAAAAAGCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD184116             [                 ATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGACAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGGTGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACGAAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD130488             [                 ATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGACAAGAAAGCGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD123359             [                          TAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAGGGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTTTTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATACTATAGGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATATGGATTTACAGATTTGGACAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGGTGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACGAAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATCTCCAAATTAGCAAGTGGGATAAATTTACTTTAATGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD156962             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTATCTCCAAGTTAGCAAGTGGGATAAATTTACTTTAATGATAAAAATATACTAAAGGGAATTATGGACAACGAATGTCTTTAATGTAATAGTGTTTACTTGGTTCATTAAGATGAACAACCATTGTGACTCATTTGTCGAGAATCTTTCTATTTACTGAGCTTTGAGGAACTCAATTTGTGACTGATAATATCAAGCTGTTTGAAAAAATAGGTGGGCTTGAGTTTGTCTTAACTACGGTTAACCTCCTATTATTTCCGGTTATAAATAGTCATACCAAGAATTTCTCTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD126824             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCA TGTGACTCATTTGTCGAGAATCTTTCTATTTACTGAGCTTTGAGGAACTCAATTTGTGACTGATAATATCAAGCTGTTTGAAAAAATAGGTGGGCTTGAGTTTGTCTTAACTACGGTTAACCTCCTATTATTTCCGGTTATAAATAGTCATACCAAGAATTTCTCTATTCAATTCGACCGGCGTTCCGTCACTCAACCGAGTATTATGCAACAAAATGTGACTACCATAAACTAAATTATACAGCCTATCGTTCTTATGACCAAAGTTGATTTGCAGGCAACGCTTGCAGATTGTTGATTGCCTTTGGGCTGATAAGGTGTAATCTTTAACTATAGAGAATGTGTAAAATCCAAGTATTCAGTGGTCCTCTCTGCTTATTGTCAACACAAATGAGCAGCGAACTCTATTGATGTAGGTATTTGGAGGCCCCCAAATGCCCTGGTACGGTCAGAGTGGATATAGTTAGCTCTCCCTCTC]


>consensus_9235#0 CCTAGCTGGCCCAAGAAATGGAATGTTAGGAAAAATCTCAGAATCAATAGTTATCGTAAG GGTTTTCATCTTAAGCGTAATGTCTTTTAGTTTTTCCCTGAATGAATTTCCGGTGAGTTT TTTTTATCTTGCCATCTGATTGCGAGAAATGATCCACAAAAGTACCCTAGACATAAATAC TATAAGCACACGCTTATTAGAGACTTCAAACTGCTAACGTGTTATAAGATCAAAAAATAT GGATTTACAGATTTGGACAAAAAAGCGGATCATTCATAAGACTAATAGCCTCTCCTGAGG TGAATAAGCCCTTCGTTTCCCAAATCAAGTCACGACTGACTTTGACAAAGAATGTTGACG AAGATGGGACATACTTCAATACAACACTATCTCCAAATTAGCAAGTGGGATAAATTTACT TTAATGATAAAAATATACTAAAGGGAATTATGGACAACAAATGTCTTTAATGTAATAGTG TTTACTTGGTTCATTAAGATGAACAACCATTGTGACTCATTTGTCGAGAATCTTTCTATT TACTGAGCTTTGAGGAACTCAATTTGTGACTGATAATATCAAGCTGTTTGAAAAAATANG TGGGCTTGAGTTTGTCTTAACTACGGTTAACCTNCTATTATTTTCCGTTATAAATAGTCA TACCAAGAATTTCTCTATTCAATTCGACCGGCGTTCCGTCACTCAACCGAGTATTATGCC ACAAAATGTGACTACCATAAACTAAATTATACAGCCTATCGTTCTTATGACCAAAGTTGA TTTGCAGGCAACGCTTGCAGATTGTTGATTGCCTTTGGGCTGATAAGGTGTAATCTTTAA CTATAGAGAATGTGTAAAATCCAAGTATTCAGTGGTCCTCTCTGCTTATTGTCAACACAA ATGAGCAGCGAACTCTATTGATGTAGGTATTTGGAGGCCCCCAAATGCCCTGGTACGGTC AGAGTGGATATAGTTAGCTCTCCCTCTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)