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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9241#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 875 fasta sequence
[AGTTACTTTCGTATATAGAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATACTACTAATGGCTACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATATGATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTCAACGTAATGGATTTCAAGGTCCTGTCTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACAACCACGTCAATGGACTGAAGAAAAA-TACGTGCTGGTGAGGGTATTATTGGTTTACAAGCGGGAACAAATAAATTAGCATCACAAAAAGGCATGTCATTTGGTGCTTAACGTCATATTGCAGA-TATTCGATGTGATGATATGACACCAGAAGGTGCTGCTGTAATAAGTTTACAAATGGGTACAAAT-AAATTTGCATCACAAAAAGGCATG-AGTTTTAGTAATCAACGTCATATTGCCGATATAAAATGTGATGATTTATCACAAGAAGGTAAATCTGTAATCAATTTACAAATGGGTACAAATCAATTCGCTTCACAAAAGGGTATGCGAATTGGTAGTAGT]
[+] EMBL CD133767 [AGTTACTTTCGTATATAGAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATACTACTAATGGCTACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATATGATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTCAAC ]
[+] EMBL CD191555 [ CTTTCGTATATAGAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATTCTACTAATGGCTACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATATGATCCAGATGCAGAACGCCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTC ]
[+] EMBL CD185253 [ CTTTCGTATATAGAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATACTACTAATGGCTACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATATGATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACGATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTCAACGTAAT ]
[+] EMBL CD191509 [ CTTTCGTATAT GAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATACTACTAATGGCTACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATATGATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAGTGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGACTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAGACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTG ]
[+] EMBL AI977175 [ TTTCGTATATAGAATTAATAGAATTGACCAACACTACTAATACTACTAATGGCTACTCGTACACAAGATTTTGGAATTGATGTAGCAATTTCTAGAAAGTTGAATAGTAGATATGATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTCAACGTAATGGATTTCAAGGTCCTGTCTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACAACCACGTCAATGGACTGAAGAAAAA TACGTGCTGGTGAGGGTTTTATTGGTTTACAAGCGGGAACAAATAAA ]
[-] EMBL CD114681 [ ATGATCCAGATGCAGAACGTCAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTCGAAGCAGGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTCAACGTAATGGATTTCAAGGTCCTGTCTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACA ]
[-] EMBL CD114622 [ CAAGTTATGGGTTGGATACAACAATTAACTGGACAAAATATTCCACTTGGACGTGAAAATGTACAAAGAACATTAAAAAATGGTCAAATACTTGTTGAACTTATCAATGCTGTATATGAACGTACACCGAATTTACCACCAAAAGCTCAAACAATACGTAGACCAATAAAAGCAAATGCAGGAACTGCACCATTTAAACAAATGGAGAATATTCAACGATTTCTCGATTTATCCGAAGCTTATGGTGTACCACGTGAATGTTTATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACAGAATGTCAACGTAATGGATTTCAAGGTCCTGTCTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACA ]
[-] EMBL CD146898 [ TATTTCAAACTGTTGATTTATTTGAAGCAAGAAATATGGCACAAGTATTAGCTACTCTATTACAATTAGGAACTGAATGTCAACGTAATGGATTTCAAGGTCCTGTCTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACAACCACGTCAATGGACTGAAGAAAAATTACGTGCTGATGAGGGTATTATTGGTTTACAAGCGGGAACAAATAAATTAGCATCACAAAAAGGCATGTCATTTGGTGCTTAACGTCATATTGCAGA TATTCGATGTGATGATATGACACCAGAAGGTGCTGCTGTAATAAGTTTACAAATGGGTACAAAT AAATTTGCATCACAAAAAGGCATG AGTTTTAGTAATCAACGTCATATTGCCGATATAAAATGTGATGATTTATCACAAGAAGGTAAATCTGTAATCAATTTACAAATGGGTACAAATCAATTCGCTTCACAAAAGGGTATGCGAATTGGTAGTAGT]
[+] EMBL CD179857 [ CTGTGGACCAAAACCTACTTATTCACAACCACGTCAATGGACTGAAGAAAAATTACGTGCTGGTGAGGGTATTATTGGTTTACAAGCGGGAACAAATAAATTAGCATCACAAAAAGGCATGTCATTTGGTGCTCAACGTCATATTGCAGATTATTCGATGTGATGATATGACACCAGAAGGTGCTGCTGTAATAAGTTTACAAATGGGTACAAATAAAATTTGCATCACAAAAAGGTATGAAGTTTTAGTAATCAACGTCATAT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||